MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 55954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019902	CTT	2	6	66	71	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759340
2	NC_019902	CTG	2	6	82	87	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759340
3	NC_019902	CAT	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759340
4	NC_019902	GTG	2	6	235	240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759340
5	NC_019902	GCC	2	6	259	264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
6	NC_019902	GTG	2	6	265	270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759340
7	NC_019902	GCT	2	6	354	359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759340
8	NC_019902	GAA	2	6	398	403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759340
9	NC_019902	CAA	2	6	453	458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759340
10	NC_019902	GAT	2	6	480	485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759340
11	NC_019902	TGC	3	9	515	523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759340
12	NC_019902	ACT	2	6	549	554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759340
13	NC_019902	CAT	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759340
14	NC_019902	CGC	2	6	634	639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
15	NC_019902	GCC	2	6	664	669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
16	NC_019902	TGG	2	6	809	814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759340
17	NC_019902	GCC	2	6	916	921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
18	NC_019902	GCC	2	6	982	987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
19	NC_019902	AGC	2	6	1105	1110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759340
20	NC_019902	CAT	2	6	1170	1175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759340
21	NC_019902	ATC	2	6	1213	1218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759340
22	NC_019902	CTG	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759340
23	NC_019902	CGA	2	6	1257	1262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759340
24	NC_019902	GCC	2	6	1351	1356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
25	NC_019902	CTG	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759340
26	NC_019902	GGA	2	6	1380	1385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759340
27	NC_019902	GGC	2	6	1407	1412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759340
28	NC_019902	CCG	2	6	1552	1557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
29	NC_019902	CGA	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759340
30	NC_019902	AAG	2	6	1607	1612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759340
31	NC_019902	GGC	2	6	1617	1622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759340
32	NC_019902	TCG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759340
33	NC_019902	GTG	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759341
34	NC_019902	GGT	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759341
35	NC_019902	CGG	2	6	3625	3630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759341
36	NC_019902	GGC	3	9	3635	3643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759341
37	NC_019902	GCC	2	6	3702	3707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759341
38	NC_019902	ACG	2	6	3757	3762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759341
39	NC_019902	GCC	2	6	3773	3778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759341
40	NC_019902	CAG	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759341
41	NC_019902	ATC	2	6	4887	4892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759342
42	NC_019902	ATG	2	6	4953	4958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759342
43	NC_019902	GCA	2	6	4987	4992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759342
44	NC_019902	GCC	2	6	5324	5329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759343
45	NC_019902	TTG	2	6	5382	5387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759343
46	NC_019902	CAG	2	6	5438	5443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759343
47	NC_019902	CTC	2	6	5444	5449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759343
48	NC_019902	TGG	2	6	5452	5457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759343
49	NC_019902	CGC	2	6	5479	5484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759343
50	NC_019902	TCA	2	6	5686	5691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759344
51	NC_019902	AGC	2	6	5809	5814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759344
52	NC_019902	CCT	2	6	5918	5923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759344
53	NC_019902	GTG	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759344
54	NC_019902	TCC	2	6	6070	6075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759344
55	NC_019902	ACC	3	9	6247	6255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759344
56	NC_019902	CAC	2	6	6258	6263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759344
57	NC_019902	GCA	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759344
58	NC_019902	AGT	2	6	6299	6304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759344
59	NC_019902	TCT	2	6	6343	6348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759344
60	NC_019902	AGC	2	6	6397	6402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759344
61	NC_019902	GCT	2	6	6446	6451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759344
62	NC_019902	GCC	2	6	6502	6507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759344
63	NC_019902	CGA	2	6	7076	7081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759345
64	NC_019902	GTT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759345
65	NC_019902	GGC	2	6	7153	7158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759345
66	NC_019902	GCC	3	9	7266	7274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759345
67	NC_019902	CGG	2	6	7360	7365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759345
68	NC_019902	GCG	2	6	7524	7529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759345
69	NC_019902	ACG	2	6	7780	7785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759346
70	NC_019902	CAT	2	6	7837	7842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759346
71	NC_019902	TCA	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759346
72	NC_019902	TTC	2	6	7997	8002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759347
73	NC_019902	TCA	2	6	8494	8499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759349
74	NC_019902	CGC	2	6	8569	8574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759349
75	NC_019902	GGC	2	6	8775	8780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759349
76	NC_019902	GGC	2	6	8786	8791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759349
77	NC_019902	CAG	2	6	8831	8836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759349
78	NC_019902	CCG	2	6	8846	8851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759349
79	NC_019902	CCT	2	6	8941	8946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759349
80	NC_019902	CGA	2	6	9000	9005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759349
81	NC_019902	CTG	2	6	9104	9109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759349
82	NC_019902	ACC	2	6	9123	9128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759349
83	NC_019902	ACC	2	6	9172	9177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759349
84	NC_019902	GCA	2	6	9193	9198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759349
85	NC_019902	CGC	2	6	9206	9211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759349
86	NC_019902	GGC	2	6	9216	9221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759349
87	NC_019902	ACC	2	6	9243	9248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759349
88	NC_019902	GAA	2	6	9266	9271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759349
89	NC_019902	ACC	2	6	9315	9320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759349
90	NC_019902	CGG	2	6	9404	9409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759349
91	NC_019902	CGT	2	6	9557	9562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759349
92	NC_019902	TGG	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759349
93	NC_019902	GCA	2	6	9790	9795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759349
94	NC_019902	GCA	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759349
95	NC_019902	GAT	2	6	10269	10274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759350
96	NC_019902	CGG	2	6	10275	10280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759350
97	NC_019902	AGC	2	6	10385	10390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759350
98	NC_019902	CCT	2	6	10458	10463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759350
99	NC_019902	TCC	2	6	10610	10615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759350
100	NC_019902	ACC	3	9	10787	10795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759350
101	NC_019902	ACC	2	6	10799	10804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759350
102	NC_019902	GAT	2	6	10973	10978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759351
103	NC_019902	GAG	2	6	10996	11001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759351
104	NC_019902	GCG	2	6	11372	11377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759352
105	NC_019902	ACG	2	6	11389	11394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759352
106	NC_019902	GGC	2	6	11558	11563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759352
107	NC_019902	CAG	2	6	11579	11584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759352
108	NC_019902	CGA	2	6	11722	11727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759352
109	NC_019902	GCA	2	6	11728	11733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759352
110	NC_019902	GGC	2	6	11735	11740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759352
111	NC_019902	CAG	2	6	11771	11776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759352
112	NC_019902	TCC	2	6	11903	11908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759352
113	NC_019902	TTC	2	6	11929	11934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759352
114	NC_019902	GGC	2	6	11949	11954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759352
115	NC_019902	TTC	2	6	12092	12097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759352
116	NC_019902	GGA	2	6	12167	12172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759352
117	NC_019902	GCA	2	6	12186	12191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759352
118	NC_019902	ACC	2	6	12278	12283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759352
119	NC_019902	CAC	2	6	12352	12357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759352
120	NC_019902	ACC	2	6	12415	12420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759352
121	NC_019902	GCT	2	6	12456	12461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759352
122	NC_019902	TCC	2	6	13267	13272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759353
123	NC_019902	GTC	2	6	13287	13292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759353
124	NC_019902	GTG	2	6	13334	13339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759353
125	NC_019902	CAA	2	6	13341	13346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759353
126	NC_019902	GTC	2	6	13432	13437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759353
127	NC_019902	CTG	2	6	13680	13685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759354
128	NC_019902	CGG	2	6	13768	13773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759354
129	NC_019902	CGG	2	6	13828	13833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759354
130	NC_019902	GCC	2	6	13855	13860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759354
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133	NC_019902	GGT	2	6	13974	13979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759355
134	NC_019902	GGC	2	6	14043	14048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759355
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142	NC_019902	GGT	2	6	15495	15500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759358
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161	NC_019902	CGA	2	6	16385	16390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759358
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498	NC_019902	CCA	2	6	47154	47159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759398
499	NC_019902	TCG	2	6	47287	47292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759399
500	NC_019902	TGG	2	6	47429	47434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759399

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