MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermobacillus composti KWC4 chromosome

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019897	ATCATT	2	12	44379	44390	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019897	CCCTCA	2	12	51355	51366	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019897	TAAAAC	2	12	88826	88837	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019897	ATGCGA	2	12	100891	100902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019897	ATGCGG	2	12	108216	108227	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019897	CCCAAT	2	12	110068	110079	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019897	ATTTAT	2	12	118971	118982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019897	CCGTTG	2	12	121800	121811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019897	CGCTTG	2	12	122196	122207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019897	TGCAGC	2	12	245751	245762	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019897	GCTTGC	2	12	253957	253968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019897	ATTGCC	2	12	272508	272519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019897	CTTTGT	2	12	309231	309242	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019897	CTGGGA	2	12	336445	336456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019897	TTGCGT	2	12	340080	340091	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019897	CGTCAT	2	12	351611	351622	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019897	GCACAT	2	12	351895	351906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019897	AGATGA	2	12	365890	365901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019897	GCCTGC	2	12	370791	370802	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019897	GGGACG	2	12	385597	385608	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019897	CCGTGC	2	12	471538	471549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019897	CGCCGG	2	12	485050	485061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019897	CCGGCA	2	12	485066	485077	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019897	GGCCGC	2	12	502046	502057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019897	CAGTTG	2	12	514333	514344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019897	ATCCGA	2	12	527495	527506	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019897	AATCGC	2	12	539038	539049	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019897	GATAAC	2	12	547043	547054	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019897	CTGAAA	2	12	547856	547867	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019897	TCCAGA	2	12	559164	559175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019897	GAACCC	2	12	582684	582695	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019897	GCGGAG	2	12	591103	591114	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019897	TGGGAG	2	12	618385	618396	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019897	GGTCCA	2	12	674461	674472	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019897	AACGGA	2	12	674907	674918	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019897	CCATTG	2	12	679384	679395	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019897	GCGGGT	2	12	690607	690618	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019897	TTCGTT	2	12	699306	699317	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019897	CACCTC	2	12	760073	760084	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_019897	GATCCT	2	12	764692	764703	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019897	CGGACT	2	12	797316	797327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019897	GCTGGC	2	12	822360	822371	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019897	TCGGGA	2	12	842050	842061	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019897	CGCCCG	2	12	847050	847061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_019897	CGGCCG	2	12	849424	849435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019897	TTTCAT	2	12	891519	891530	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019897	AGGAAA	2	12	912332	912343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019897	GTATCA	2	12	917062	917073	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019897	GAAGAG	2	12	919821	919832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019897	CGAACA	2	12	941887	941898	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019897	AACGAA	2	12	960810	960821	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019897	ACACAA	2	12	967527	967538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019897	GCCGGT	2	12	970786	970797	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019897	TGAGGA	2	12	1024541	1024552	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019897	GCAGCT	2	12	1133273	1133284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019897	CGCCGA	2	12	1133340	1133351	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019897	CGGGTG	2	12	1199687	1199698	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019897	GAAGCC	2	12	1199911	1199922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019897	CATGTG	2	12	1207510	1207521	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019897	ATAGAC	2	12	1222150	1222161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019897	AACACG	2	12	1244171	1244182	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019897	GTCGAC	2	12	1256476	1256487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019897	CGTCCG	2	12	1281157	1281168	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019897	CGGGCG	2	12	1350458	1350469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019897	ATGTTC	2	12	1405619	1405630	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019897	GCATTT	2	12	1407426	1407437	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019897	CAATAT	2	12	1456740	1456751	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_019897	CATTAT	2	12	1494198	1494209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019897	CTGGAC	2	12	1512855	1512866	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019897	GCTGGA	2	12	1531618	1531629	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019897	CGTGAT	2	12	1560144	1560155	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019897	AGTCCG	2	12	1560214	1560225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019897	TGCGAT	2	12	1576926	1576937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019897	GTTGGA	2	12	1600607	1600618	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019897	TTGCGT	2	12	1605142	1605153	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019897	ATTATA	2	12	1639227	1639238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019897	CCGGAA	2	12	1686282	1686293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019897	GCAGCG	2	12	1698454	1698465	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019897	CGGTTT	2	12	1715022	1715033	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019897	CTGAAA	2	12	1724665	1724676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_019897	GAACAA	2	12	1792598	1792609	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019897	AAACAA	2	12	1832994	1833005	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019897	TTTATG	2	12	1853359	1853370	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019897	AAATGA	2	12	1929106	1929117	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019897	CCTTCG	2	12	1968084	1968095	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019897	AACGAA	2	12	2010456	2010467	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019897	CAAACG	2	12	2017308	2017319	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019897	ATCATT	2	12	2027249	2027260	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019897	ATGCCG	2	12	2067055	2067066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019897	GAAAAA	2	12	2067708	2067719	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019897	ATCATT	2	12	2074768	2074779	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_019897	TAATCG	2	12	2080950	2080961	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019897	CCGATC	2	12	2125880	2125891	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019897	GAGAAA	2	12	2286761	2286772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019897	ATAGGA	2	12	2289655	2289666	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019897	ACGGCG	2	12	2302861	2302872	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019897	CAAAAA	2	12	2311978	2311989	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019897	TTCTTT	2	12	2328010	2328021	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019897	GGAAAA	2	12	2345475	2345486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019897	GTCGCC	2	12	2369314	2369325	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019897	GCCTGT	2	12	2380989	2381000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019897	ATTGAA	2	12	2385063	2385074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019897	TCCGCC	2	12	2389841	2389852	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_019897	GGCAGC	2	12	2436584	2436595	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019897	AAAACC	2	12	2460560	2460571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019897	TTTCAG	2	12	2464284	2464295	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019897	TTTCAG	2	12	2535524	2535535	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_019897	CCGTTA	2	12	2536177	2536188	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019897	GTCGAC	2	12	2539521	2539532	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019897	CAAAAA	2	12	2540325	2540336	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_019897	TGCCGA	2	12	2571856	2571867	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019897	GCGGAT	2	12	2609658	2609669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019897	CCTTCC	2	12	2694406	2694417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_019897	CTTCCT	2	12	2696065	2696076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019897	TCGACA	2	12	2768572	2768583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019897	CGATTG	2	12	2777633	2777644	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_019897	CGTCAC	2	12	2835225	2835236	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019897	GATGAG	2	12	2849491	2849502	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019897	TTGTCC	2	12	2878330	2878341	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019897	ATGAAG	2	12	2927405	2927416	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019897	CATTTC	2	12	3004496	3004507	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019897	ATTTCT	2	12	3008183	3008194	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_019897	ACGCAA	2	12	3036783	3036794	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019897	ATATAA	2	12	3066683	3066694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.