MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermobacillus composti KWC4 chromosome

Total Repeats: 3362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019897	ATCGA	2	10	209	218	40 %	20 %	20 %	20 %	430748350
2	NC_019897	CCGCT	2	10	1054	1063	0 %	20 %	20 %	60 %	430748350
3	NC_019897	GGCGC	2	10	2980	2989	0 %	0 %	60 %	40 %	430748351
4	NC_019897	CATCT	2	10	3282	3291	20 %	40 %	0 %	40 %	430748351
5	NC_019897	CGCGG	2	10	4065	4074	0 %	0 %	60 %	40 %	430748352
6	NC_019897	GTCCG	2	10	4296	4305	0 %	20 %	40 %	40 %	430748352
7	NC_019897	GCCGA	2	10	4669	4678	20 %	0 %	40 %	40 %	430748352
8	NC_019897	AGATC	2	10	4685	4694	40 %	20 %	20 %	20 %	430748352
9	NC_019897	CGCGC	2	10	5900	5909	0 %	0 %	40 %	60 %	430748353
10	NC_019897	GAAGC	2	10	7450	7459	40 %	0 %	40 %	20 %	430748354
11	NC_019897	CCGCG	2	10	7591	7600	0 %	0 %	40 %	60 %	430748355
12	NC_019897	TGCCC	2	10	7978	7987	0 %	20 %	20 %	60 %	430748355
13	NC_019897	CGGGG	2	10	10387	10396	0 %	0 %	80 %	20 %	430748358
14	NC_019897	CGTTC	2	10	10989	10998	0 %	40 %	20 %	40 %	430748358
15	NC_019897	GCCGC	2	10	11688	11697	0 %	0 %	40 %	60 %	430748358
16	NC_019897	TCGTC	2	10	14327	14336	0 %	40 %	20 %	40 %	430748360
17	NC_019897	CGGAG	2	10	15340	15349	20 %	0 %	60 %	20 %	430748360
18	NC_019897	GTCCG	2	10	16641	16650	0 %	20 %	40 %	40 %	430748360
19	NC_019897	GACGG	2	10	18315	18324	20 %	0 %	60 %	20 %	430748361
20	NC_019897	CGCGC	2	10	21417	21426	0 %	0 %	40 %	60 %	430748363
21	NC_019897	GGATC	2	10	22030	22039	20 %	20 %	40 %	20 %	430748364
22	NC_019897	CGGCG	2	10	22193	22202	0 %	0 %	60 %	40 %	430748364
23	NC_019897	TCCGC	2	10	23940	23949	0 %	20 %	20 %	60 %	430748365
24	NC_019897	TTTCA	2	10	24877	24886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019897	GCCCG	2	10	25313	25322	0 %	0 %	40 %	60 %	430748366
26	NC_019897	CGCGG	2	10	25988	25997	0 %	0 %	60 %	40 %	430748366
27	NC_019897	GACCA	2	10	27268	27277	40 %	0 %	20 %	40 %	430748367
28	NC_019897	CCGAG	2	10	28541	28550	20 %	0 %	40 %	40 %	430748367
29	NC_019897	GCCCC	2	10	30932	30941	0 %	0 %	20 %	80 %	430748369
30	NC_019897	GCATG	2	10	35958	35967	20 %	20 %	40 %	20 %	430748372
31	NC_019897	GTCCT	2	10	36898	36907	0 %	40 %	20 %	40 %	430748373
32	NC_019897	GGACG	2	10	37688	37697	20 %	0 %	60 %	20 %	430748373
33	NC_019897	GTTCC	2	10	39650	39659	0 %	40 %	20 %	40 %	430748376
34	NC_019897	ATCAG	2	10	40562	40571	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019897	AAGAG	2	10	40770	40779	60 %	0 %	40 %	0 %	430748377
36	NC_019897	ACAAT	3	15	40985	40999	60 %	20 %	0 %	20 %	430748377
37	NC_019897	GCCCG	2	10	41680	41689	0 %	0 %	40 %	60 %	430748378
38	NC_019897	CGCTG	2	10	42383	42392	0 %	20 %	40 %	40 %	430748378
39	NC_019897	GACCG	2	10	42921	42930	20 %	0 %	40 %	40 %	430748379
40	NC_019897	TCCCC	2	10	44022	44031	0 %	20 %	0 %	80 %	430748380
41	NC_019897	GACCG	2	10	44609	44618	20 %	0 %	40 %	40 %	430748381
42	NC_019897	CGGCG	2	10	45521	45530	0 %	0 %	60 %	40 %	430748382
43	NC_019897	AGCCG	2	10	46957	46966	20 %	0 %	40 %	40 %	430748383
44	NC_019897	CCCGC	2	10	48117	48126	0 %	0 %	20 %	80 %	430748384
45	NC_019897	GGCCA	2	10	48483	48492	20 %	0 %	40 %	40 %	430748385
46	NC_019897	TGTCC	2	10	49713	49722	0 %	40 %	20 %	40 %	430748387
47	NC_019897	CGCTG	2	10	49964	49973	0 %	20 %	40 %	40 %	430748387
48	NC_019897	GGCCG	2	10	50881	50890	0 %	0 %	60 %	40 %	430748387
49	NC_019897	GCGCC	2	10	50894	50903	0 %	0 %	40 %	60 %	430748387
50	NC_019897	ACCGC	2	10	51828	51837	20 %	0 %	20 %	60 %	430748389
51	NC_019897	GCGCT	2	10	57453	57462	0 %	20 %	40 %	40 %	430748393
52	NC_019897	GCCGG	2	10	57972	57981	0 %	0 %	60 %	40 %	430748394
53	NC_019897	TGCCG	2	10	59198	59207	0 %	20 %	40 %	40 %	430748395
54	NC_019897	GCCGA	2	10	59501	59510	20 %	0 %	40 %	40 %	430748396
55	NC_019897	GCCGC	2	10	62671	62680	0 %	0 %	40 %	60 %	430748398
56	NC_019897	CCAGC	2	10	63234	63243	20 %	0 %	20 %	60 %	430748399
57	NC_019897	CATCG	2	10	65576	65585	20 %	20 %	20 %	40 %	430748401
58	NC_019897	GACGG	2	10	66672	66681	20 %	0 %	60 %	20 %	430748402
59	NC_019897	TCCCC	2	10	67025	67034	0 %	20 %	0 %	80 %	430748403
60	NC_019897	ACCCG	2	10	68128	68137	20 %	0 %	20 %	60 %	430748404
61	NC_019897	GAGGT	2	10	69970	69979	20 %	20 %	60 %	0 %	430748405
62	NC_019897	CGACA	2	10	70395	70404	40 %	0 %	20 %	40 %	430748405
63	NC_019897	GCGGA	2	10	70515	70524	20 %	0 %	60 %	20 %	430748405
64	NC_019897	GCGCC	2	10	71702	71711	0 %	0 %	40 %	60 %	430748406
65	NC_019897	GCTCC	2	10	71785	71794	0 %	20 %	20 %	60 %	430748406
66	NC_019897	CCGGA	2	10	72225	72234	20 %	0 %	40 %	40 %	430748406
67	NC_019897	GACGA	2	10	72975	72984	40 %	0 %	40 %	20 %	430748407
68	NC_019897	GTCCT	2	10	73779	73788	0 %	40 %	20 %	40 %	430748407
69	NC_019897	GGGGA	2	10	75974	75983	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019897	TTGCC	2	10	77790	77799	0 %	40 %	20 %	40 %	430748411
71	NC_019897	GGTTT	2	10	77813	77822	0 %	60 %	40 %	0 %	430748411
72	NC_019897	CTTCG	2	10	79698	79707	0 %	40 %	20 %	40 %	430748412
73	NC_019897	TCGTC	2	10	80608	80617	0 %	40 %	20 %	40 %	430748413
74	NC_019897	TCATT	2	10	81784	81793	20 %	60 %	0 %	20 %	430748415
75	NC_019897	TGGTT	2	10	89615	89624	0 %	60 %	40 %	0 %	430748422
76	NC_019897	CGGTT	2	10	91682	91691	0 %	40 %	40 %	20 %	430748424
77	NC_019897	GGACA	2	10	92040	92049	40 %	0 %	40 %	20 %	430748424
78	NC_019897	ATTTT	2	10	92626	92635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019897	CGGCG	2	10	96341	96350	0 %	0 %	60 %	40 %	430748426
80	NC_019897	AAGCA	2	10	96927	96936	60 %	0 %	20 %	20 %	430748426
81	NC_019897	ATCGA	2	10	97770	97779	40 %	20 %	20 %	20 %	430748427
82	NC_019897	AGTCA	2	10	98406	98415	40 %	20 %	20 %	20 %	430748427
83	NC_019897	CGCGG	2	10	99354	99363	0 %	0 %	60 %	40 %	430748428
84	NC_019897	ATTTC	2	10	100740	100749	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_019897	GAACC	2	10	101788	101797	40 %	0 %	20 %	40 %	430748430
86	NC_019897	CGCGG	2	10	102497	102506	0 %	0 %	60 %	40 %	430748431
87	NC_019897	TCCGC	2	10	103534	103543	0 %	20 %	20 %	60 %	430748431
88	NC_019897	GACGG	2	10	104636	104645	20 %	0 %	60 %	20 %	430748431
89	NC_019897	CTTCC	2	10	104972	104981	0 %	40 %	0 %	60 %	430748432
90	NC_019897	GTGCT	2	10	107715	107724	0 %	40 %	40 %	20 %	430748434
91	NC_019897	GCGAA	2	10	109523	109532	40 %	0 %	40 %	20 %	430748435
92	NC_019897	TGCGG	2	10	109922	109931	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_019897	ATCCG	2	10	111438	111447	20 %	20 %	20 %	40 %	430748438
94	NC_019897	TTTCG	2	10	111885	111894	0 %	60 %	20 %	20 %	430748439
95	NC_019897	CTTGC	2	10	116228	116237	0 %	40 %	20 %	40 %	430748443
96	NC_019897	TTCCT	2	10	119262	119271	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_019897	AATGA	2	10	120562	120571	60 %	20 %	20 %	0 %	430748445
98	NC_019897	GACGA	2	10	122038	122047	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019897	GAAGA	2	10	123019	123028	60 %	0 %	40 %	0 %	430748446
100	NC_019897	GCATT	2	10	123108	123117	20 %	40 %	20 %	20 %	430748446
101	NC_019897	CTCGT	2	10	123154	123163	0 %	40 %	20 %	40 %	430748446
102	NC_019897	CGGGA	2	10	125715	125724	20 %	0 %	60 %	20 %	430748450
103	NC_019897	CGGGA	2	10	125739	125748	20 %	0 %	60 %	20 %	430748450
104	NC_019897	GGGGC	2	10	126054	126063	0 %	0 %	80 %	20 %	430748450
105	NC_019897	TCCTT	2	10	127506	127515	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_019897	TGTCT	2	10	127907	127916	0 %	60 %	20 %	20 %	430748453
107	NC_019897	TTCCG	2	10	128531	128540	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_019897	CGGCG	2	10	130737	130746	0 %	0 %	60 %	40 %	430748454
109	NC_019897	CGCTC	2	10	131282	131291	0 %	20 %	20 %	60 %	430748454
110	NC_019897	GCGGA	2	10	131362	131371	20 %	0 %	60 %	20 %	430748454
111	NC_019897	CCTTC	2	10	131478	131487	0 %	40 %	0 %	60 %	430748455
112	NC_019897	GCCAG	2	10	131524	131533	20 %	0 %	40 %	40 %	430748455
113	NC_019897	CCGCG	2	10	131824	131833	0 %	0 %	40 %	60 %	430748455
114	NC_019897	CGGCG	2	10	133791	133800	0 %	0 %	60 %	40 %	430748456
115	NC_019897	ACGCC	2	10	134852	134861	20 %	0 %	20 %	60 %	430748458
116	NC_019897	TCCGG	2	10	136297	136306	0 %	20 %	40 %	40 %	430748459
117	NC_019897	TTGTT	2	10	136534	136543	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019897	CCGAT	2	10	138992	139001	20 %	20 %	20 %	40 %	430748461
119	NC_019897	GCCCG	2	10	139014	139023	0 %	0 %	40 %	60 %	430748461
120	NC_019897	GGACA	2	10	139677	139686	40 %	0 %	40 %	20 %	430748462
121	NC_019897	CGAAC	2	10	140516	140525	40 %	0 %	20 %	40 %	430748463
122	NC_019897	GCTCG	2	10	140678	140687	0 %	20 %	40 %	40 %	430748463
123	NC_019897	TGATC	2	10	143824	143833	20 %	40 %	20 %	20 %	430748466
124	NC_019897	CGCTT	2	10	145088	145097	0 %	40 %	20 %	40 %	430748469
125	NC_019897	TTTGC	2	10	149487	149496	0 %	60 %	20 %	20 %	430748473
126	NC_019897	CCCCG	2	10	150164	150173	0 %	0 %	20 %	80 %	430748474
127	NC_019897	GTCCG	2	10	150551	150560	0 %	20 %	40 %	40 %	430748475
128	NC_019897	CCGCT	2	10	152283	152292	0 %	20 %	20 %	60 %	430748477
129	NC_019897	TCCGC	2	10	152371	152380	0 %	20 %	20 %	60 %	430748477
130	NC_019897	ACCGC	2	10	152585	152594	20 %	0 %	20 %	60 %	430748477
131	NC_019897	GCTGC	2	10	153135	153144	0 %	20 %	40 %	40 %	430748477
132	NC_019897	TGATC	2	10	153572	153581	20 %	40 %	20 %	20 %	430748477
133	NC_019897	CGACG	2	10	155150	155159	20 %	0 %	40 %	40 %	430748478
134	NC_019897	GGCGG	2	10	155207	155216	0 %	0 %	80 %	20 %	430748478
135	NC_019897	CCATT	2	10	159487	159496	20 %	40 %	0 %	40 %	430748482
136	NC_019897	GTTGT	2	10	160590	160599	0 %	60 %	40 %	0 %	430748482
137	NC_019897	TGGGA	2	10	160626	160635	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019897	GGCTA	2	10	162537	162546	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019897	TGCGC	2	10	162893	162902	0 %	20 %	40 %	40 %	430748484
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171	NC_019897	GCGAC	2	10	207508	207517	20 %	0 %	40 %	40 %	430748522
172	NC_019897	TGCGC	2	10	213917	213926	0 %	20 %	40 %	40 %	430748528
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176	NC_019897	GAAGA	2	10	216933	216942	60 %	0 %	40 %	0 %	430748531
177	NC_019897	CGATG	2	10	217443	217452	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_019897	GAAGA	2	10	218653	218662	60 %	0 %	40 %	0 %	430748532
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242	NC_019897	CTGGT	2	10	292467	292476	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
243	NC_019897	GCACG	2	10	292808	292817	20 %	0 %	40 %	40 %	430748601
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246	NC_019897	CCGGG	2	10	294970	294979	0 %	0 %	60 %	40 %	430748604
247	NC_019897	CGAAG	2	10	295081	295090	40 %	0 %	40 %	20 %	430748604
248	NC_019897	GCAAG	2	10	295556	295565	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
249	NC_019897	GGGGT	2	10	295584	295593	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
250	NC_019897	TCCGC	2	10	295864	295873	0 %	20 %	20 %	60 %	430748605
251	NC_019897	ACCGG	2	10	300157	300166	20 %	0 %	40 %	40 %	430748606
252	NC_019897	CGCGA	2	10	302188	302197	20 %	0 %	40 %	40 %	430748606
253	NC_019897	TTCGC	2	10	302789	302798	0 %	40 %	20 %	40 %	430748606
254	NC_019897	CCGGC	2	10	302975	302984	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
255	NC_019897	GCGCC	2	10	306725	306734	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
256	NC_019897	ACGAA	2	10	307537	307546	60 %	0 %	20 %	20 %	430748611
257	NC_019897	CCACG	2	10	308863	308872	20 %	0 %	20 %	60 %	430748612
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259	NC_019897	TGACG	2	10	310744	310753	20 %	20 %	40 %	20 %	430748614
260	NC_019897	CCGGC	2	10	312053	312062	0 %	0 %	40 %	60 %	430748617
261	NC_019897	GTCCG	2	10	312373	312382	0 %	20 %	40 %	40 %	430748617
262	NC_019897	TCGGT	2	10	312597	312606	0 %	40 %	40 %	20 %	430748617
263	NC_019897	CGCGC	2	10	313364	313373	0 %	0 %	40 %	60 %	430748619
264	NC_019897	GACGC	2	10	314007	314016	20 %	0 %	40 %	40 %	430748620
265	NC_019897	ACGGC	2	10	314224	314233	20 %	0 %	40 %	40 %	430748620
266	NC_019897	GAACC	2	10	314990	314999	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
267	NC_019897	TCCGA	2	10	316964	316973	20 %	20 %	20 %	40 %	430748628
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