MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermobacillus composti KWC4 chromosome

Total Repeats: 524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019897	TTTCA	2	10	24877	24886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019897	ATCAG	2	10	40562	40571	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019897	GGGGA	2	10	75974	75983	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019897	ATTTT	2	10	92626	92635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019897	ATTTC	2	10	100740	100749	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019897	TGCGG	2	10	109922	109931	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019897	TTCCT	2	10	119262	119271	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019897	GACGA	2	10	122038	122047	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019897	TCCTT	2	10	127506	127515	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019897	TTCCG	2	10	128531	128540	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_019897	TTGTT	2	10	136534	136543	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019897	TGGGA	2	10	160626	160635	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019897	GGCTA	2	10	162537	162546	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019897	TTCGA	2	10	197745	197754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019897	CCGGA	2	10	215809	215818	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019897	CGATG	2	10	217443	217452	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019897	TTTTC	2	10	219971	219980	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019897	TCAAC	2	10	220060	220069	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_019897	AAACA	2	10	223350	223359	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019897	GATGA	2	10	223637	223646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019897	CAAGG	2	10	246157	246166	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019897	AAAGA	2	10	262501	262510	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019897	GGCAG	2	10	268735	268744	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019897	TGACT	2	10	289257	289266	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019897	CTGGT	2	10	292467	292476	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019897	GCAAG	2	10	295556	295565	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019897	GGGGT	2	10	295584	295593	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019897	CCGGC	2	10	302975	302984	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_019897	GCGCC	2	10	306725	306734	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_019897	GAACC	2	10	314990	314999	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_019897	GCCGC	2	10	317928	317937	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_019897	CGCGG	2	10	326714	326723	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_019897	GGCCG	2	10	336627	336636	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_019897	CGTTC	2	10	336849	336858	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019897	TCGTG	2	10	338273	338282	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019897	CGTTA	2	10	347768	347777	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019897	AAAAT	2	10	353847	353856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019897	CTGGT	2	10	361010	361019	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019897	ACTTA	2	10	361134	361143	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019897	ACCTT	2	10	361701	361710	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_019897	GATCT	2	10	362305	362314	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019897	TTCAC	2	10	362415	362424	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_019897	GGGAG	2	10	362470	362479	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019897	TTTTA	2	10	372443	372452	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019897	AAGGA	2	10	374272	374281	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019897	TTATA	2	10	385903	385912	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019897	GAGAT	2	10	397091	397100	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019897	CCGGA	2	10	397731	397740	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019897	GCGCC	2	10	398180	398189	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_019897	GGCAT	2	10	400548	400557	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019897	TAAAA	2	10	406471	406480	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019897	GCCTT	2	10	432139	432148	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_019897	GGTGA	2	10	436167	436176	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019897	GAAAA	2	10	438224	438233	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019897	GCCGT	2	10	471240	471249	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_019897	GCCGT	2	10	471354	471363	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_019897	AATGA	2	10	474118	474127	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019897	GCGCT	2	10	487254	487263	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_019897	GGAGC	2	10	496954	496963	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019897	ACCGG	2	10	506832	506841	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_019897	CGGAA	2	10	527551	527560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019897	ACCGG	2	10	539223	539232	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_019897	ATCGG	2	10	541336	541345	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019897	CGGAT	2	10	546969	546978	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_019897	GTCTC	2	10	549951	549960	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019897	TTTTG	2	10	553319	553328	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019897	AACGG	2	10	558950	558959	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019897	CGGCG	2	10	558984	558993	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_019897	AACGA	2	10	559458	559467	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019897	CGTTC	2	10	559517	559526	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_019897	GGACG	2	10	576717	576726	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_019897	ATCTG	2	10	580067	580076	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019897	GGAGA	2	10	582703	582712	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019897	GCGGA	2	10	587284	587293	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019897	AGCGG	2	10	604139	604148	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019897	TAAAA	2	10	605268	605277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019897	GTTCC	2	10	611895	611904	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_019897	CGCTT	2	10	646178	646187	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_019897	GCGCG	2	10	650263	650272	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_019897	TCCCA	2	10	662996	663005	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_019897	AACGG	2	10	691250	691259	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019897	AAAGA	2	10	704079	704088	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019897	CGCGG	2	10	711573	711582	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_019897	AGTTT	2	10	717590	717599	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019897	TCCAT	2	10	727799	727808	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_019897	AGGAT	2	10	733367	733376	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019897	CCTTG	2	10	746337	746346	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_019897	AGCGA	2	10	747140	747149	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019897	TTTGT	2	10	751818	751827	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019897	ATTAA	2	10	755161	755170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019897	GAGAG	2	10	764836	764845	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019897	ATTTT	2	10	770719	770728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019897	TCGCT	2	10	771488	771497	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_019897	CATCC	2	10	797405	797414	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_019897	CAAGA	2	10	801317	801326	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_019897	TCCTG	2	10	803057	803066	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_019897	TCAAG	2	10	803681	803690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019897	TAATG	2	10	803711	803720	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019897	TAATA	2	10	805130	805139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019897	TATCA	2	10	813382	813391	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019897	TGCGG	2	10	821246	821255	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019897	GGAAG	2	10	822221	822230	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019897	CCGGC	2	10	822423	822432	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_019897	CGGAC	2	10	833358	833367	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_019897	TCCGT	2	10	844003	844012	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_019897	CCGGC	2	10	844066	844075	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_019897	GCACG	2	10	845024	845033	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_019897	GATAG	2	10	848193	848202	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019897	ATTGC	2	10	861898	861907	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019897	GGCTC	2	10	869710	869719	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_019897	GCCAG	2	10	870728	870737	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_019897	ACACC	2	10	882853	882862	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
113	NC_019897	AAGGG	2	10	882872	882881	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019897	TAATG	2	10	893765	893774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019897	CGGAT	2	10	896740	896749	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019897	GACCG	2	10	898645	898654	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_019897	GCTCA	2	10	900026	900035	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_019897	ATGTC	2	10	906161	906170	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019897	GCCGG	2	10	911963	911972	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_019897	ATTTC	2	10	912600	912609	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019897	TGAAG	2	10	914450	914459	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019897	CAATT	2	10	914727	914736	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019897	TTTGT	2	10	921636	921645	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019897	CCGGT	2	10	933090	933099	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019897	AAGGG	2	10	933927	933936	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019897	ATTTT	2	10	937058	937067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019897	CAGAA	2	10	938892	938901	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_019897	AGCAA	2	10	944417	944426	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_019897	CCTTG	2	10	961353	961362	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_019897	ACGAA	2	10	967218	967227	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019897	ATGCG	2	10	970625	970634	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019897	GCGGG	2	10	986562	986571	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019897	GTATT	2	10	1008656	1008665	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019897	GAGGG	2	10	1012385	1012394	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019897	GCCGC	2	10	1013214	1013223	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_019897	CCGGG	2	10	1014482	1014491	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_019897	ATAGA	2	10	1020752	1020761	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019897	CGAAT	2	10	1023515	1023524	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019897	CCGCG	2	10	1030754	1030763	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_019897	TCCCG	2	10	1044931	1044940	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_019897	GTCCG	2	10	1046973	1046982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_019897	CGATT	2	10	1048644	1048653	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_019897	CCACT	2	10	1048788	1048797	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
144	NC_019897	AAGGA	2	10	1055843	1055852	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019897	AGGAG	2	10	1072160	1072169	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019897	CGGGA	2	10	1079352	1079361	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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289	NC_019897	CGGCC	2	10	2056229	2056238	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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