MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. BSP1 chromosome

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019896	ATTTCT	2	12	2599	2610	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019896	ATTTGT	2	12	12113	12124	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019896	TTTTGC	2	12	27791	27802	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019896	TTTAGA	2	12	31043	31054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019896	TATCTC	2	12	33441	33452	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019896	AGGAAA	2	12	33700	33711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019896	GAAAAA	2	12	45773	45784	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019896	TTGTTT	2	12	57235	57246	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019896	ACGAAA	2	12	95282	95293	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019896	GAGCGA	2	12	109313	109324	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019896	ATTATC	2	12	145389	145400	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019896	CCGCAT	2	12	167358	167369	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019896	AAAAGA	2	12	172566	172577	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019896	TGTTAT	2	12	177621	177632	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019896	GGTGCA	2	12	178449	178460	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019896	ATCACT	2	12	222560	222571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019896	AGGAAG	2	12	253867	253878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019896	AGAAAA	2	12	258157	258168	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019896	TAAGAA	2	12	274268	274279	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019896	AATAAA	2	12	285382	285393	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019896	GATGAG	2	12	295897	295908	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019896	ATTTTG	2	12	404567	404578	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019896	TCCTCA	2	12	418625	418636	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019896	AAACAC	2	12	519147	519158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019896	AATCAA	2	12	565105	565116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019896	ACATTT	2	12	565192	565203	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019896	CATATA	2	12	593267	593278	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019896	GTTTTT	2	12	594027	594038	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019896	GTACTG	2	12	609395	609406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019896	CGAAAT	2	12	622275	622286	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019896	AAAAAG	2	12	657795	657806	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019896	ATGTTT	2	12	663713	663724	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019896	AAGATA	2	12	742062	742073	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019896	TCCCTT	2	12	744440	744451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019896	GTTTTT	2	12	784948	784959	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019896	TTTTAA	2	12	787288	787299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019896	AATTAA	2	12	836465	836476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019896	TCAGCG	2	12	914155	914166	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019896	GAAGGC	2	12	919441	919452	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019896	AAGAAA	2	12	920058	920069	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019896	TGATAA	2	12	934581	934592	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019896	CTTTTT	2	12	1003546	1003557	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019896	AAACAA	2	12	1022978	1022989	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019896	TATAAG	2	12	1055282	1055293	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019896	GTCAAT	2	12	1113546	1113557	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019896	ATTACG	2	12	1151448	1151459	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019896	TGATAA	2	12	1172189	1172200	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019896	GATAAG	2	12	1181632	1181643	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019896	CAAATC	2	12	1236568	1236579	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019896	GAAAAA	2	12	1237302	1237313	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019896	TGAATA	2	12	1243744	1243755	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019896	CTTAAA	2	12	1244388	1244399	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019896	TTTTAT	2	12	1260500	1260511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019896	CTTTTT	2	12	1260531	1260542	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019896	AAAGAG	2	12	1271170	1271181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019896	TGAAAC	2	12	1293738	1293749	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019896	CGCGTA	2	12	1314690	1314701	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019896	AGAGGG	2	12	1318723	1318734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019896	CATCTG	2	12	1327555	1327566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019896	TTTGTT	2	12	1339153	1339164	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019896	TCCGGC	2	12	1361517	1361528	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019896	GAAAAA	2	12	1385334	1385345	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019896	GTGAAC	2	12	1408994	1409005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019896	AAAATC	2	12	1412258	1412269	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019896	GATCCA	2	12	1479892	1479903	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019896	ACAAAA	2	12	1528926	1528937	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019896	ACAAAC	2	12	1530074	1530085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019896	AGTTTC	2	12	1530940	1530951	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019896	ACATTT	2	12	1534239	1534250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019896	GATATT	2	12	1534478	1534489	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019896	AAAGTC	2	12	1575145	1575156	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019896	TTAGAA	2	12	1601248	1601259	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019896	GACAAG	2	12	1606376	1606387	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019896	CTTTTT	2	12	1633836	1633847	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019896	GGAGGG	2	12	1657857	1657868	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019896	GAAAAG	2	12	1675468	1675479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019896	GAAAAA	2	12	1683482	1683493	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019896	TAAAAA	2	12	1724296	1724307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019896	TCGAAA	2	12	1756146	1756157	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019896	ATTTTT	2	12	1765264	1765275	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019896	AAATCG	2	12	1809190	1809201	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019896	CGGCCG	2	12	1820867	1820878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019896	ACATAA	2	12	1895353	1895364	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019896	AAATAA	2	12	1907680	1907691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019896	GATAAG	2	12	1918910	1918921	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019896	CCATAC	2	12	1928579	1928590	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019896	AACAGC	2	12	1972125	1972136	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019896	AGCATT	2	12	1993260	1993271	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019896	AAAATA	2	12	2011378	2011389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019896	TGTTAT	2	12	2022808	2022819	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019896	TGGAGC	2	12	2027157	2027168	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_019896	TAATGA	2	12	2032192	2032203	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019896	TCTCTT	2	12	2066955	2066966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019896	GAAATT	2	12	2127114	2127125	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019896	TTAAAA	2	12	2136485	2136496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019896	AGCTTT	2	12	2150102	2150113	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_019896	ATTTCA	2	12	2152372	2152383	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019896	CTAAGC	2	12	2185509	2185520	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019896	AAGCAT	2	12	2189428	2189439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_019896	TCATAA	2	12	2208582	2208593	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019896	TTTTTC	2	12	2320471	2320482	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019896	ACCATA	2	12	2338314	2338325	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019896	TCATAT	2	12	2347072	2347083	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_019896	AGAAAA	2	12	2493880	2493891	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019896	GACATT	2	12	2535684	2535695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_019896	AGCAAA	2	12	2574439	2574450	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019896	AATGAT	2	12	2582929	2582940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019896	TTTTCA	2	12	2584473	2584484	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_019896	AAATCG	2	12	2584607	2584618	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_019896	ATGCAA	2	12	2585268	2585279	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_019896	AATGAT	2	12	2586334	2586345	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019896	TCCTTT	2	12	2608128	2608139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019896	AATTAT	2	12	2618663	2618674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019896	TGAATT	2	12	2683999	2684010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019896	TTTGCT	2	12	2733983	2733994	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019896	TTCTTT	2	12	2738213	2738224	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_019896	GTTAAC	2	12	2770240	2770251	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_019896	AGTATA	2	12	2800057	2800068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019896	GCTTTT	2	12	2812962	2812973	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019896	GTATAC	2	12	2813002	2813013	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019896	CTTTTT	2	12	2822733	2822744	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_019896	CTTCAG	2	12	2839576	2839587	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019896	CTTAAC	2	12	2846472	2846483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019896	CTTTTT	2	12	2850314	2850325	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019896	CACAAA	2	12	2971994	2972005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019896	AAATTC	2	12	2972367	2972378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.