MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. BSP1 chromosome

Total Repeats: 601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019896	GGTAT	2	10	95	104	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019896	ATAGA	2	10	8401	8410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019896	GAGAA	2	10	12405	12414	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019896	AATGG	2	10	14470	14479	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019896	TATAA	2	10	15781	15790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019896	TTAAC	2	10	24427	24436	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019896	TGTGA	2	10	27996	28005	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019896	GAAGG	2	10	31776	31785	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019896	CGTTT	2	10	32152	32161	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019896	ATCAA	2	10	34509	34518	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019896	CTATT	2	10	34772	34781	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019896	ATAAG	2	10	34896	34905	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019896	AAAGA	2	10	41245	41254	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019896	ATGTA	2	10	44593	44602	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019896	TACTT	2	10	57742	57751	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019896	ATGAA	2	10	58192	58201	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019896	GAGAA	2	10	67554	67563	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019896	TCAAC	2	10	67817	67826	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_019896	ACAGT	2	10	78498	78507	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019896	CCGAA	2	10	79176	79185	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_019896	GTATT	2	10	86559	86568	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019896	TATGT	2	10	90869	90878	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019896	TCTTT	2	10	91519	91528	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019896	TGATC	2	10	92506	92515	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019896	GTGCT	2	10	96815	96824	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019896	TGCCC	2	10	101328	101337	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_019896	TCATG	2	10	103246	103255	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019896	ATGGT	2	10	114562	114571	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019896	TTTAT	2	10	125876	125885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019896	TAATA	2	10	127883	127892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019896	CATCC	2	10	163532	163541	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_019896	TAACT	2	10	164545	164554	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019896	AGGGT	2	10	165151	165160	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019896	AACGG	2	10	167880	167889	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019896	TGCTT	2	10	168060	168069	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019896	GGAAT	2	10	169264	169273	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019896	TCAGC	2	10	170126	170135	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_019896	CAATC	2	10	170673	170682	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_019896	TCCGA	2	10	171007	171016	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_019896	TTTTA	2	10	171615	171624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019896	ATTAT	2	10	171999	172008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019896	ATCTC	2	10	173331	173340	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_019896	GTGAG	2	10	175254	175263	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019896	AACAG	2	10	175998	176007	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_019896	GTAAC	2	10	176375	176384	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019896	TTATT	2	10	177534	177543	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019896	ATATA	2	10	185336	185345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019896	GAATG	2	10	192418	192427	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019896	TGGCT	2	10	195131	195140	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019896	TCTTT	2	10	196673	196682	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019896	CGGAA	2	10	208962	208971	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019896	AGAAC	2	10	216750	216759	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019896	ATGGG	2	10	224360	224369	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019896	AAAAG	2	10	232213	232222	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019896	TTCCC	2	10	253441	253450	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_019896	GAATG	2	10	253580	253589	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019896	CGACG	2	10	266068	266077	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_019896	CCTTT	2	10	270325	270334	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_019896	CAGCG	2	10	283658	283667	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_019896	TTTCA	2	10	299676	299685	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019896	TTACA	2	10	325018	325027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019896	TTTTC	2	10	345652	345661	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_019896	GTGAT	2	10	345774	345783	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019896	GTATA	2	10	385308	385317	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019896	CCGGC	2	10	391029	391038	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_019896	TTCCC	2	10	408101	408110	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_019896	ACTAT	2	10	408639	408648	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019896	TCTTT	2	10	416217	416226	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019896	TAAAT	2	10	416259	416268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019896	TAGAC	2	10	429049	429058	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_019896	CTTTT	2	10	441835	441844	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_019896	AAATA	2	10	445094	445103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019896	CTGTC	2	10	445135	445144	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_019896	TTCAA	2	10	447643	447652	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019896	AAATG	2	10	449091	449100	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019896	TGAGG	2	10	461261	461270	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019896	TATCA	2	10	465788	465797	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019896	GAAAA	2	10	478266	478275	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019896	AGGAG	2	10	479411	479420	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019896	ATATA	2	10	491767	491776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019896	ATTAA	2	10	507585	507594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019896	TCCTC	2	10	512912	512921	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_019896	AGGGG	2	10	531488	531497	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019896	TTAAT	2	10	546402	546411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019896	TTTCT	2	10	552124	552133	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019896	AAAAT	2	10	564431	564440	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019896	AAAAT	2	10	565694	565703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019896	TTTAA	2	10	590045	590054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019896	TATGA	2	10	594072	594081	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019896	CCGTT	2	10	601072	601081	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_019896	GATGC	2	10	604675	604684	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_019896	CCCGC	2	10	606675	606684	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
93	NC_019896	ATCAG	2	10	609612	609621	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019896	TCTTT	2	10	623126	623135	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019896	GACCC	2	10	623372	623381	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_019896	ATGGG	2	10	626240	626249	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019896	AATGT	2	10	626724	626733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019896	ACCAG	2	10	626920	626929	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_019896	ATTTG	2	10	635409	635418	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019896	ATTCT	2	10	643323	643332	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019896	TCTTA	2	10	651812	651821	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019896	ACAAT	2	10	670189	670198	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019896	TGAAA	2	10	679176	679185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019896	TAAAA	2	10	680433	680442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019896	TTTCA	2	10	683264	683273	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_019896	AGGTG	2	10	692745	692754	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019896	ACGGA	2	10	734604	734613	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019896	ATTAG	2	10	734737	734746	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019896	AAGGG	2	10	744423	744432	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019896	TTTTA	2	10	754977	754986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019896	GTGCC	2	10	756768	756777	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_019896	GAATT	2	10	761971	761980	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019896	TTTTA	2	10	762704	762713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019896	AAATT	2	10	762754	762763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019896	GATCA	2	10	774846	774855	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019896	CTTGT	2	10	787241	787250	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019896	TAAAA	2	10	789202	789211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019896	TCATA	2	10	789790	789799	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019896	GAAAT	2	10	798537	798546	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019896	TACAC	2	10	799207	799216	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_019896	CTGTG	2	10	799287	799296	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019896	GAAAG	2	10	800881	800890	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019896	ATTTA	2	10	816920	816929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019896	CCTTC	2	10	829162	829171	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_019896	TTATA	2	10	838978	838987	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019896	TGCTT	2	10	841441	841450	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_019896	ATGTT	2	10	854279	854288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019896	TTATT	2	10	862405	862414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019896	CTTTT	2	10	862631	862640	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019896	CTTTT	2	10	874236	874245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019896	CTTTT	2	10	877248	877257	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019896	GAGAT	2	10	877265	877274	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019896	TTATA	2	10	880711	880720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019896	AGCTT	2	10	883073	883082	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019896	CAAAA	2	10	899968	899977	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019896	AAAGA	2	10	905635	905644	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019896	TTTCA	2	10	916476	916485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019896	GTTTG	2	10	916558	916567	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019896	TCTGC	2	10	917245	917254	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_019896	AATAC	2	10	917355	917364	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_019896	AGAAA	2	10	918813	918822	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019896	TAAGA	2	10	918831	918840	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019896	ATTGT	2	10	920023	920032	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019896	GGATC	2	10	920217	920226	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019896	CTGCG	2	10	920324	920333	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_019896	AAATG	2	10	925538	925547	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019896	GATAC	2	10	930640	930649	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_019896	GCCTT	2	10	934502	934511	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_019896	GAAGA	2	10	950345	950354	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019896	TTTAC	2	10	950372	950381	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_019896	CAAAT	2	10	950822	950831	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_019896	TTTTA	2	10	1268456	1268465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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