MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. BSP1 chromosome

Total Repeats: 44238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019896	GCA	2	6	252	257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756781
2	NC_019896	GTC	2	6	297	302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756781
3	NC_019896	CGC	2	6	320	325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430756781
4	NC_019896	TAT	2	6	339	344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756781
5	NC_019896	GAA	2	6	506	511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756780
6	NC_019896	ATG	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756780
7	NC_019896	CAT	2	6	743	748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430756780
8	NC_019896	GCA	2	6	803	808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756780
9	NC_019896	TGT	2	6	1000	1005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756779
10	NC_019896	GTA	2	6	1122	1127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756779
11	NC_019896	TTA	2	6	1144	1149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756779
12	NC_019896	ATT	2	6	1191	1196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756779
13	NC_019896	TTA	2	6	1218	1223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756779
14	NC_019896	TGA	2	6	1234	1239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756779
15	NC_019896	AGC	2	6	1243	1248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756779
16	NC_019896	GCA	2	6	1331	1336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756779
17	NC_019896	CAG	2	6	1344	1349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756779
18	NC_019896	CTT	2	6	1481	1486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756779
19	NC_019896	TTC	2	6	1522	1527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756779
20	NC_019896	TGA	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756779
21	NC_019896	GCA	2	6	1586	1591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756779
22	NC_019896	GAT	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756779
23	NC_019896	CGG	2	6	1660	1665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430756779
24	NC_019896	GGA	2	6	1767	1772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430756779
25	NC_019896	CTG	2	6	1794	1799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756778
26	NC_019896	GCA	2	6	2075	2080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756778
27	NC_019896	TTG	2	6	2081	2086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756778
28	NC_019896	ATT	2	6	2306	2311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756778
29	NC_019896	ACC	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430756778
30	NC_019896	AAC	2	6	2712	2717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430756777
31	NC_019896	ATG	3	9	3265	3273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756777
32	NC_019896	CCG	2	6	3313	3318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430756777
33	NC_019896	ATT	2	6	3393	3398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756777
34	NC_019896	ATC	2	6	3419	3424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430756777
35	NC_019896	TCT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756777
36	NC_019896	ACG	2	6	3480	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756777
37	NC_019896	CAG	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756777
38	NC_019896	TTG	2	6	3571	3576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756777
39	NC_019896	GAA	2	6	3663	3668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756777
40	NC_019896	GTT	2	6	3786	3791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756777
41	NC_019896	GAA	2	6	3831	3836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756777
42	NC_019896	ATA	2	6	4094	4099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430756777
43	NC_019896	CGG	2	6	4273	4278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430756776
44	NC_019896	GTC	2	6	4295	4300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756776
45	NC_019896	CGG	2	6	4318	4323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430756776
46	NC_019896	GAA	2	6	4332	4337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756776
47	NC_019896	TGC	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756776
48	NC_019896	TTA	2	6	4533	4538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756776
49	NC_019896	GAC	2	6	4579	4584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756776
50	NC_019896	CAG	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756776
51	NC_019896	GGA	2	6	4681	4686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430756776
52	NC_019896	CGC	2	6	4722	4727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430756776
53	NC_019896	ATT	2	6	4877	4882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756776
54	NC_019896	AGA	2	6	5068	5073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756776
55	NC_019896	ATG	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756776
56	NC_019896	ATG	2	6	5151	5156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756776
57	NC_019896	GAA	2	6	5249	5254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756776
58	NC_019896	AGA	2	6	5311	5316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756776
59	NC_019896	TGC	2	6	5427	5432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756776
60	NC_019896	TGA	2	6	5494	5499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756776
61	NC_019896	GAA	2	6	5518	5523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756776
62	NC_019896	GCG	2	6	5528	5533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430756776
63	NC_019896	TGA	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756776
64	NC_019896	GCC	2	6	5698	5703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430756776
65	NC_019896	GAA	2	6	5800	5805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756776
66	NC_019896	CGG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430756776
67	NC_019896	GAA	2	6	6027	6032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756775
68	NC_019896	GCT	2	6	6198	6203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756775
69	NC_019896	ACA	2	6	6378	6383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430756775
70	NC_019896	GAA	2	6	6506	6511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756775
71	NC_019896	TTG	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756775
72	NC_019896	CAG	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756775
73	NC_019896	AAG	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756775
74	NC_019896	ACG	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756775
75	NC_019896	GGA	2	6	6591	6596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430756775
76	NC_019896	GAA	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756775
77	NC_019896	AAG	2	6	6684	6689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756775
78	NC_019896	TAA	2	6	6713	6718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430756775
79	NC_019896	TTC	2	6	6880	6885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756774
80	NC_019896	AGA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756774
81	NC_019896	ATT	2	6	7054	7059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756774
82	NC_019896	TTG	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756774
83	NC_019896	AGA	3	9	7083	7091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756774
84	NC_019896	ATT	2	6	7168	7173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756774
85	NC_019896	GAA	2	6	7231	7236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756774
86	NC_019896	TCT	2	6	7240	7245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756774
87	NC_019896	GCT	2	6	7272	7277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756774
88	NC_019896	AGG	2	6	7298	7303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430756774
89	NC_019896	TTA	2	6	7357	7362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756774
90	NC_019896	GAA	2	6	7398	7403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756774
91	NC_019896	ATT	2	6	7477	7482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756774
92	NC_019896	GTG	2	6	7519	7524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430756774
93	NC_019896	CAG	2	6	7575	7580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756774
94	NC_019896	TGG	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430756774
95	NC_019896	GAA	4	12	7657	7668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756774
96	NC_019896	GAA	2	6	7672	7677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756774
97	NC_019896	ATT	2	6	7780	7785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756773
98	NC_019896	ATA	2	6	7869	7874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430756773
99	NC_019896	ATG	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756773
100	NC_019896	CAG	2	6	8064	8069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756773
101	NC_019896	ATC	2	6	8158	8163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430756773
102	NC_019896	ACG	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756772
103	NC_019896	CTG	2	6	8552	8557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756772
104	NC_019896	TAG	2	6	8640	8645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756772
105	NC_019896	ATG	2	6	8646	8651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756772
106	NC_019896	ATT	2	6	8666	8671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756772
107	NC_019896	CGA	2	6	8709	8714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756772
108	NC_019896	CCG	2	6	8828	8833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430756772
109	NC_019896	TTA	2	6	8930	8935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756772
110	NC_019896	CAT	2	6	9133	9138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430756772
111	NC_019896	GAA	2	6	9273	9278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756771
112	NC_019896	TGA	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756771
113	NC_019896	TGC	2	6	9364	9369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756771
114	NC_019896	TTC	2	6	9379	9384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756771
115	NC_019896	TTG	2	6	9424	9429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756771
116	NC_019896	TTA	2	6	9528	9533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756771
117	NC_019896	TTG	2	6	9591	9596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756771
118	NC_019896	AGC	2	6	9619	9624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756771
119	NC_019896	CTG	2	6	9675	9680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756771
120	NC_019896	AGC	2	6	9805	9810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756771
121	NC_019896	AGC	2	6	9829	9834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756771
122	NC_019896	CAG	2	6	9840	9845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756771
123	NC_019896	ATT	2	6	9931	9936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756771
124	NC_019896	AAC	2	6	9941	9946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430756771
125	NC_019896	AGA	2	6	9964	9969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756771
126	NC_019896	TTG	2	6	14669	14674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756770
127	NC_019896	GAT	2	6	14791	14796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756770
128	NC_019896	GAA	2	6	14829	14834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756770
129	NC_019896	CAA	2	6	14910	14915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430756770
130	NC_019896	ACA	2	6	14978	14983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430756770
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