MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC03

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019895	GGGC	2	8	14	21	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019895	GCCC	2	8	28	35	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_019895	CAGC	2	8	114	121	25 %	0 %	25 %	50 %	430748168
4	NC_019895	TGCG	2	8	577	584	0 %	25 %	50 %	25 %	430748168
5	NC_019895	GCTT	2	8	1295	1302	0 %	50 %	25 %	25 %	430748168
6	NC_019895	GGGC	2	8	2308	2315	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019895	GCCC	2	8	2322	2329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_019895	TTCC	2	8	2476	2483	0 %	50 %	0 %	50 %	430748170
9	NC_019895	CTTG	2	8	2496	2503	0 %	50 %	25 %	25 %	430748170
10	NC_019895	TTCA	2	8	2746	2753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019895	TGAT	2	8	2765	2772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019895	GCCG	2	8	2901	2908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019895	GGCT	2	8	3027	3034	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019895	CCTG	2	8	3694	3701	0 %	25 %	25 %	50 %	430748171
15	NC_019895	CCCG	2	8	4020	4027	0 %	0 %	25 %	75 %	430748171
16	NC_019895	CCGC	2	8	4891	4898	0 %	0 %	25 %	75 %	430748172
17	NC_019895	CGAT	2	8	4956	4963	25 %	25 %	25 %	25 %	430748172
18	NC_019895	CCGC	2	8	5687	5694	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_019895	CTGC	2	8	5745	5752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019895	CTGC	2	8	6054	6061	0 %	25 %	25 %	50 %	430748173
21	NC_019895	GGTT	2	8	6706	6713	0 %	50 %	50 %	0 %	430748174
22	NC_019895	CCGC	2	8	6826	6833	0 %	0 %	25 %	75 %	430748174
23	NC_019895	CGTG	2	8	7203	7210	0 %	25 %	50 %	25 %	430748174
24	NC_019895	CGAT	2	8	7502	7509	25 %	25 %	25 %	25 %	430748174
25	NC_019895	CGGG	2	8	8051	8058	0 %	0 %	75 %	25 %	430748175
26	NC_019895	GGCA	2	8	8443	8450	25 %	0 %	50 %	25 %	430748175
27	NC_019895	GCAA	2	8	8818	8825	50 %	0 %	25 %	25 %	430748175
28	NC_019895	CCGG	2	8	9118	9125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019895	GCGG	2	8	10030	10037	0 %	0 %	75 %	25 %	430748177
30	NC_019895	CCTG	2	8	10246	10253	0 %	25 %	25 %	50 %	430748177
31	NC_019895	TGGG	2	8	10292	10299	0 %	25 %	75 %	0 %	430748177
32	NC_019895	TGGC	2	8	10644	10651	0 %	25 %	50 %	25 %	430748177
33	NC_019895	CGGC	2	8	10846	10853	0 %	0 %	50 %	50 %	430748177
34	NC_019895	CGGG	2	8	10947	10954	0 %	0 %	75 %	25 %	430748177
35	NC_019895	GCCG	2	8	10972	10979	0 %	0 %	50 %	50 %	430748177
36	NC_019895	CGGG	2	8	11097	11104	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019895	GAAG	2	8	11271	11278	50 %	0 %	50 %	0 %	430748178
38	NC_019895	GGCA	2	8	11299	11306	25 %	0 %	50 %	25 %	430748178
39	NC_019895	CCGC	3	12	11725	11736	0 %	0 %	25 %	75 %	430748179
40	NC_019895	TCCC	2	8	12042	12049	0 %	25 %	0 %	75 %	430748179
41	NC_019895	CCAA	2	8	12062	12069	50 %	0 %	0 %	50 %	430748179
42	NC_019895	GGCT	2	8	12467	12474	0 %	25 %	50 %	25 %	430748180
43	NC_019895	GGCG	2	8	12527	12534	0 %	0 %	75 %	25 %	430748180
44	NC_019895	CAAG	2	8	12801	12808	50 %	0 %	25 %	25 %	430748181
45	NC_019895	CGCC	2	8	12850	12857	0 %	0 %	25 %	75 %	430748181
46	NC_019895	CGGA	3	12	13706	13717	25 %	0 %	50 %	25 %	430748182
47	NC_019895	CAAA	2	8	13917	13924	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019895	GAAA	2	8	14593	14600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019895	GGGC	2	8	14721	14728	0 %	0 %	75 %	25 %	430748183
50	NC_019895	TCTT	2	8	15002	15009	0 %	75 %	0 %	25 %	430748183
51	NC_019895	CGGT	2	8	15556	15563	0 %	25 %	50 %	25 %	430748183
52	NC_019895	GCGG	2	8	15654	15661	0 %	0 %	75 %	25 %	430748183
53	NC_019895	GGGT	2	8	16904	16911	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019895	CATC	2	8	17162	17169	25 %	25 %	0 %	50 %	430748184
55	NC_019895	TGGC	2	8	17259	17266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019895	CCGC	2	8	17429	17436	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_019895	GGCA	2	8	17762	17769	25 %	0 %	50 %	25 %	430748185
58	NC_019895	AAGG	2	8	18138	18145	50 %	0 %	50 %	0 %	430748185
59	NC_019895	ATCG	2	8	20397	20404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019895	GCAC	2	8	20456	20463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019895	CCGG	2	8	21182	21189	0 %	0 %	50 %	50 %	430748189
62	NC_019895	TCCC	2	8	21688	21695	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_019895	CTGT	2	8	22396	22403	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019895	CGGG	2	8	22743	22750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019895	TCAT	2	8	22987	22994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019895	TCCT	2	8	23011	23018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019895	CAAC	2	8	23130	23137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019895	GCCA	2	8	25019	25026	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019895	GTTC	2	8	25041	25048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019895	GATC	2	8	25511	25518	25 %	25 %	25 %	25 %	430748191
71	NC_019895	TGGC	2	8	25567	25574	0 %	25 %	50 %	25 %	430748191
72	NC_019895	GCGG	2	8	25997	26004	0 %	0 %	75 %	25 %	430748192
73	NC_019895	GCCC	2	8	26047	26054	0 %	0 %	25 %	75 %	430748192
74	NC_019895	AGGC	2	8	26076	26083	25 %	0 %	50 %	25 %	430748192
75	NC_019895	GTTG	2	8	26267	26274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019895	TTCC	2	8	26295	26302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019895	TAGC	2	8	26360	26367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019895	CCAT	2	8	26487	26494	25 %	25 %	0 %	50 %	430748193
79	NC_019895	ATCG	2	8	26566	26573	25 %	25 %	25 %	25 %	430748193
80	NC_019895	AAAG	2	8	27203	27210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019895	GCGG	2	8	27700	27707	0 %	0 %	75 %	25 %	430748195
82	NC_019895	GAAG	2	8	28610	28617	50 %	0 %	50 %	0 %	430748195
83	NC_019895	CGAT	2	8	28695	28702	25 %	25 %	25 %	25 %	430748195
84	NC_019895	CGCC	2	8	28794	28801	0 %	0 %	25 %	75 %	430748195
85	NC_019895	GCGG	2	8	28810	28817	0 %	0 %	75 %	25 %	430748195
86	NC_019895	ACGC	2	8	29639	29646	25 %	0 %	25 %	50 %	430748195
87	NC_019895	CGGC	2	8	29652	29659	0 %	0 %	50 %	50 %	430748195
88	NC_019895	CCAG	2	8	30579	30586	25 %	0 %	25 %	50 %	430748196
89	NC_019895	GAAG	2	8	30965	30972	50 %	0 %	50 %	0 %	430748196
90	NC_019895	CGAC	2	8	31384	31391	25 %	0 %	25 %	50 %	430748197
91	NC_019895	GACG	2	8	32033	32040	25 %	0 %	50 %	25 %	430748198

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.