MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC03

Total Repeats: 420

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019895	GGC	2	6	48	53	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
2	NC_019895	GCT	2	6	137	142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
3	NC_019895	AGG	2	6	247	252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748168
4	NC_019895	AGC	2	6	268	273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748168
5	NC_019895	GGC	2	6	336	341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
6	NC_019895	CGG	2	6	548	553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
7	NC_019895	CCG	2	6	566	571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748168
8	NC_019895	TTG	2	6	616	621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748168
9	NC_019895	GCC	2	6	694	699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748168
10	NC_019895	GCT	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
11	NC_019895	AGC	2	6	857	862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748168
12	NC_019895	CCG	2	6	938	943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748168
13	NC_019895	TCG	2	6	970	975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
14	NC_019895	CGG	2	6	1047	1052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
15	NC_019895	CGG	2	6	1142	1147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
16	NC_019895	GGT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748168
17	NC_019895	CGG	2	6	1256	1261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
18	NC_019895	CGA	2	6	1280	1285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748168
19	NC_019895	TCG	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
20	NC_019895	TCC	2	6	1360	1365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748168
21	NC_019895	GGC	2	6	1473	1478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
22	NC_019895	GCT	2	6	1496	1501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
23	NC_019895	TCG	2	6	1588	1593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
24	NC_019895	CCA	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748168
25	NC_019895	CTT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748168
26	NC_019895	GCG	2	6	1723	1728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
27	NC_019895	CGG	2	6	1732	1737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
28	NC_019895	CTT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748168
29	NC_019895	GTC	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
30	NC_019895	CGG	3	9	1838	1846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
31	NC_019895	CTT	2	6	1878	1883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748168
32	NC_019895	ATC	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748168
33	NC_019895	TAT	2	6	1898	1903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748168
34	NC_019895	TCC	2	6	1977	1982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748169
35	NC_019895	GGT	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748169
36	NC_019895	TGA	2	6	2020	2025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748169
37	NC_019895	GCC	2	6	2039	2044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748169
38	NC_019895	ACA	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748169
39	NC_019895	GGC	2	6	2143	2148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748169
40	NC_019895	CTG	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748169
41	NC_019895	TGG	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748169
42	NC_019895	CGC	2	6	2346	2351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748170
43	NC_019895	AGC	2	6	2429	2434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748170
44	NC_019895	GTC	2	6	2452	2457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748170
45	NC_019895	TCG	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748170
46	NC_019895	TGG	2	6	2562	2567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748170
47	NC_019895	CCG	2	6	3249	3254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748171
48	NC_019895	AAC	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748171
49	NC_019895	TCC	2	6	3390	3395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748171
50	NC_019895	CAT	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748171
51	NC_019895	GTA	2	6	3433	3438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748171
52	NC_019895	CTG	2	6	3501	3506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748171
53	NC_019895	ATT	2	6	3631	3636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748171
54	NC_019895	CCG	2	6	3710	3715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748171
55	NC_019895	TCA	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748171
56	NC_019895	TCA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748171
57	NC_019895	GCG	2	6	4004	4009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748171
58	NC_019895	ATG	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748171
59	NC_019895	GAT	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748171
60	NC_019895	CGG	2	6	4102	4107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748171
61	NC_019895	CAC	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748172
62	NC_019895	AAG	2	6	4691	4696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748172
63	NC_019895	GCC	2	6	4702	4707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748172
64	NC_019895	CAC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748172
65	NC_019895	GCC	2	6	4793	4798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748172
66	NC_019895	CTC	2	6	4805	4810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748172
67	NC_019895	CGG	2	6	4815	4820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748172
68	NC_019895	CCG	2	6	4859	4864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748172
69	NC_019895	CGG	2	6	4885	4890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748172
70	NC_019895	GCT	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748172
71	NC_019895	GAA	2	6	5102	5107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748172
72	NC_019895	TGC	2	6	5121	5126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748172
73	NC_019895	GGC	2	6	5177	5182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748172
74	NC_019895	GGA	2	6	5224	5229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748172
75	NC_019895	GCA	2	6	5491	5496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748172
76	NC_019895	ATC	2	6	5546	5551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748172
77	NC_019895	CGC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748172
78	NC_019895	GCT	2	6	5674	5679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748172
79	NC_019895	GAA	2	6	5902	5907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748173
80	NC_019895	GCC	2	6	5920	5925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748173
81	NC_019895	CGA	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748173
82	NC_019895	TGG	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748173
83	NC_019895	GCT	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748173
84	NC_019895	GCC	2	6	6122	6127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748173
85	NC_019895	GCT	2	6	6252	6257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748173
86	NC_019895	GGC	2	6	6292	6297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748173
87	NC_019895	CGG	2	6	6377	6382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748173
88	NC_019895	CGG	2	6	6480	6485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748173
89	NC_019895	CGG	2	6	6503	6508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748173
90	NC_019895	GAC	2	6	6526	6531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748173
91	NC_019895	AGG	2	6	6560	6565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748173
92	NC_019895	GGC	2	6	6583	6588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748173
93	NC_019895	CGT	2	6	6623	6628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748173
94	NC_019895	CGT	2	6	6748	6753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748174
95	NC_019895	CTG	2	6	6790	6795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748174
96	NC_019895	GCC	2	6	6799	6804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748174
97	NC_019895	CCG	2	6	6805	6810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748174
98	NC_019895	ACC	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748174
99	NC_019895	AAG	2	6	6841	6846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748174
100	NC_019895	CGC	2	6	6993	6998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748174
101	NC_019895	GCA	2	6	7082	7087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748174
102	NC_019895	CGA	2	6	7146	7151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748174
103	NC_019895	CGA	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748174
104	NC_019895	CGA	2	6	7254	7259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748174
105	NC_019895	GCA	2	6	7369	7374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748174
106	NC_019895	GTG	2	6	7513	7518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748174
107	NC_019895	CGG	2	6	7667	7672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748174
108	NC_019895	TGC	2	6	7677	7682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748174
109	NC_019895	CGC	2	6	7711	7716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748174
110	NC_019895	GAA	2	6	7873	7878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748174
111	NC_019895	ATC	2	6	7879	7884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748174
112	NC_019895	GCC	2	6	7891	7896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748174
113	NC_019895	CTT	2	6	7908	7913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748174
114	NC_019895	TGA	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748174
115	NC_019895	GCT	2	6	7949	7954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748175
116	NC_019895	GCC	2	6	7956	7961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748175
117	NC_019895	CCG	2	6	8026	8031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748175
118	NC_019895	TGA	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748175
119	NC_019895	CGG	2	6	8104	8109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748175
120	NC_019895	CGA	2	6	8123	8128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748175
121	NC_019895	CGC	2	6	8197	8202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748175
122	NC_019895	TGC	2	6	8206	8211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748175
123	NC_019895	GCC	2	6	8221	8226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748175
124	NC_019895	CGA	2	6	8291	8296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748175
125	NC_019895	GGT	2	6	8339	8344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748175
126	NC_019895	GCC	2	6	8401	8406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748175
127	NC_019895	CAA	2	6	8510	8515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748175
128	NC_019895	CGG	2	6	8528	8533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748175
129	NC_019895	GCC	2	6	8544	8549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748175
130	NC_019895	GCC	2	6	8628	8633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748175
131	NC_019895	GGC	2	6	8669	8674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748175
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.