MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC02

Total Repeats: 439

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019894	CCG	2	6	101	106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740976
2	NC_019894	GTC	2	6	229	234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740976
3	NC_019894	CGG	2	6	279	284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740976
4	NC_019894	ATC	2	6	342	347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430740976
5	NC_019894	TCG	2	6	349	354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740976
6	NC_019894	CTC	2	6	363	368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740976
7	NC_019894	TCC	2	6	415	420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740976
8	NC_019894	GCG	2	6	490	495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740976
9	NC_019894	CTC	2	6	571	576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740977
10	NC_019894	TTG	2	6	674	679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430740977
11	NC_019894	CTT	2	6	1151	1156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430740978
12	NC_019894	GAC	2	6	1281	1286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740978
13	NC_019894	GCG	2	6	1306	1311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740978
14	NC_019894	TCC	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740978
15	NC_019894	AGT	2	6	1396	1401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740978
16	NC_019894	ACA	2	6	1648	1653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430740979
17	NC_019894	TGT	2	6	1716	1721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430740979
18	NC_019894	GAG	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430740980
19	NC_019894	GAC	2	6	3076	3081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740980
20	NC_019894	CGC	2	6	3155	3160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740981
21	NC_019894	TGA	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740981
22	NC_019894	AAG	2	6	3389	3394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740981
23	NC_019894	CTT	2	6	3404	3409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430740981
24	NC_019894	TCG	2	6	3550	3555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740981
25	NC_019894	CGC	2	6	3580	3585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740981
26	NC_019894	GTC	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740981
27	NC_019894	CAA	2	6	3604	3609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430740981
28	NC_019894	TTA	2	6	3666	3671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430740981
29	NC_019894	TTA	2	6	3682	3687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430740981
30	NC_019894	GCC	2	6	3801	3806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740981
31	NC_019894	CGT	2	6	3846	3851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740981
32	NC_019894	CGG	2	6	3898	3903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740981
33	NC_019894	CGA	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740981
34	NC_019894	ATG	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740981
35	NC_019894	GAC	2	6	4125	4130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740981
36	NC_019894	GTA	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740982
37	NC_019894	TCG	3	9	4355	4363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740982
38	NC_019894	CGA	2	6	4396	4401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740982
39	NC_019894	TCC	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740982
40	NC_019894	CTG	2	6	4567	4572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740982
41	NC_019894	GGC	2	6	4726	4731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740983
42	NC_019894	CCG	2	6	4795	4800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740983
43	NC_019894	CGT	2	6	4860	4865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740983
44	NC_019894	GCC	2	6	4917	4922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740983
45	NC_019894	CTT	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430740983
46	NC_019894	TCG	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740984
47	NC_019894	CGC	2	6	5355	5360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740984
48	NC_019894	CAC	2	6	5385	5390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430740984
49	NC_019894	CGA	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740984
50	NC_019894	CGC	2	6	5421	5426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740984
51	NC_019894	GGA	2	6	5430	5435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430740984
52	NC_019894	ACG	2	6	5444	5449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740984
53	NC_019894	GAC	2	6	5596	5601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740985
54	NC_019894	CGA	2	6	5698	5703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740985
55	NC_019894	GGT	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430740985
56	NC_019894	GTC	2	6	5765	5770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740985
57	NC_019894	GTC	2	6	5792	5797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740985
58	NC_019894	TCG	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740986
59	NC_019894	GCG	2	6	6136	6141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740986
60	NC_019894	CTC	2	6	6194	6199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740986
61	NC_019894	GGC	2	6	6220	6225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740986
62	NC_019894	TCG	2	6	6231	6236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740986
63	NC_019894	TCC	2	6	6285	6290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740986
64	NC_019894	ACG	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740986
65	NC_019894	GGA	2	6	6325	6330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430740986
66	NC_019894	GCC	2	6	6359	6364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740986
67	NC_019894	CGC	2	6	6394	6399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740986
68	NC_019894	CGA	2	6	6589	6594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740986
69	NC_019894	CCT	2	6	6660	6665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740986
70	NC_019894	ATC	2	6	6713	6718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430740987
71	NC_019894	AGC	2	6	6801	6806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740987
72	NC_019894	AAC	2	6	6883	6888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430740987
73	NC_019894	CGC	2	6	6921	6926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740988
74	NC_019894	TCG	2	6	6956	6961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740988
75	NC_019894	GCC	2	6	7016	7021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740988
76	NC_019894	GAC	2	6	7045	7050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740988
77	NC_019894	TCA	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430740988
78	NC_019894	CCG	2	6	7081	7086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740988
79	NC_019894	GCC	2	6	7093	7098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740988
80	NC_019894	CGA	2	6	7436	7441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740989
81	NC_019894	GAT	2	6	7512	7517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740989
82	NC_019894	GCC	2	6	7533	7538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740989
83	NC_019894	CCG	2	6	7585	7590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740989
84	NC_019894	GAC	2	6	7683	7688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740989
85	NC_019894	CGA	2	6	7714	7719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740989
86	NC_019894	GCG	2	6	7753	7758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740989
87	NC_019894	GTC	2	6	7800	7805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740989
88	NC_019894	TGC	2	6	7933	7938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740990
89	NC_019894	GCC	2	6	8153	8158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740990
90	NC_019894	CGA	2	6	8212	8217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740990
91	NC_019894	GAC	2	6	8273	8278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740990
92	NC_019894	CGA	2	6	8418	8423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740991
93	NC_019894	AGA	3	9	8487	8495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740991
94	NC_019894	CGA	2	6	8538	8543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740991
95	NC_019894	AGA	2	6	9488	9493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740993
96	NC_019894	TCG	2	6	9523	9528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740993
97	NC_019894	ACG	2	6	9703	9708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740993
98	NC_019894	GGC	2	6	9762	9767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740993
99	NC_019894	TCG	2	6	9958	9963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740993
100	NC_019894	CAA	2	6	10010	10015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430740993
101	NC_019894	CCA	2	6	10321	10326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430740994
102	NC_019894	CGA	2	6	10416	10421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740994
103	NC_019894	TGG	2	6	10524	10529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430740994
104	NC_019894	GTC	2	6	10712	10717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740994
105	NC_019894	CCG	2	6	10785	10790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740994
106	NC_019894	ACT	2	6	10810	10815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430740994
107	NC_019894	CCA	2	6	10855	10860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430740994
108	NC_019894	AGC	2	6	10872	10877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740994
109	NC_019894	CGA	2	6	10894	10899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740994
110	NC_019894	GCG	2	6	10988	10993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740994
111	NC_019894	GAA	2	6	11018	11023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740994
112	NC_019894	TGG	2	6	11037	11042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430740994
113	NC_019894	AGG	2	6	11061	11066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430740994
114	NC_019894	GAT	2	6	11093	11098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740995
115	NC_019894	GCG	2	6	11101	11106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740995
116	NC_019894	GTC	2	6	11140	11145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740995
117	NC_019894	CGG	2	6	11183	11188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740995
118	NC_019894	CCG	2	6	11230	11235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740995
119	NC_019894	CGA	2	6	11288	11293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740995
120	NC_019894	ACC	2	6	11305	11310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430740995
121	NC_019894	CGC	2	6	11403	11408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740995
122	NC_019894	GAG	2	6	11682	11687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430740995
123	NC_019894	GCC	2	6	11757	11762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740995
124	NC_019894	TCG	2	6	11764	11769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740995
125	NC_019894	GAA	2	6	11831	11836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740995
126	NC_019894	CGG	2	6	11888	11893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740995
127	NC_019894	GTC	2	6	11901	11906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740995
128	NC_019894	GAA	2	6	11915	11920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740995
129	NC_019894	GGC	2	6	11960	11965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740995
130	NC_019894	AGC	2	6	12002	12007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740995
131	NC_019894	GAT	2	6	12039	12044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740996
132	NC_019894	CTT	2	6	12129	12134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430740996
133	NC_019894	GGT	2	6	12151	12156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430740996
134	NC_019894	AAC	2	6	12178	12183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430740996
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139	NC_019894	GAA	2	6	13078	13083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740997
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143	NC_019894	CGA	2	6	13531	13536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740998
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149	NC_019894	GTC	2	6	14465	14470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741000
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151	NC_019894	CGA	2	6	14652	14657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741000
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153	NC_019894	CCT	2	6	14730	14735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741000
154	NC_019894	AGG	2	6	14741	14746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741000
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158	NC_019894	TCC	2	6	15000	15005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741000
159	NC_019894	TCC	2	6	15618	15623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741001
160	NC_019894	TCG	2	6	15647	15652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741001
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162	NC_019894	GCC	2	6	15683	15688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741001
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238	NC_019894	GCG	3	9	21642	21650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741009
239	NC_019894	GCT	2	6	21746	21751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741009
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242	NC_019894	GAC	2	6	21954	21959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741009
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247	NC_019894	TGA	2	6	22782	22787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741011
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249	NC_019894	CCG	2	6	22897	22902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741012
250	NC_019894	GGA	2	6	22934	22939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741012
251	NC_019894	ACT	2	6	23061	23066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741012
252	NC_019894	GCG	2	6	23089	23094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741012
253	NC_019894	GCC	2	6	23165	23170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741012
254	NC_019894	CGA	2	6	23179	23184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741012
255	NC_019894	TCG	2	6	23212	23217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741012
256	NC_019894	GAT	2	6	23240	23245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741012
257	NC_019894	CTG	2	6	23256	23261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741012
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261	NC_019894	TCC	2	6	23419	23424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741012
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371	NC_019894	ACG	2	6	33484	33489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741022
372	NC_019894	GGC	2	6	33493	33498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741022
373	NC_019894	CGG	2	6	33576	33581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741022
374	NC_019894	CGA	2	6	33876	33881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741023
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377	NC_019894	CCT	2	6	34353	34358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741023
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379	NC_019894	CCG	2	6	34428	34433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741023
380	NC_019894	CGA	2	6	34497	34502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741023
381	NC_019894	GGA	2	6	34542	34547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741023
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389	NC_019894	CGG	2	6	34893	34898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741023
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402	NC_019894	GAA	2	6	36111	36116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430741024
403	NC_019894	CGC	2	6	36289	36294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741025
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412	NC_019894	ATC	2	6	36995	37000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741026
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415	NC_019894	TCA	2	6	37168	37173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741026
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.