MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC01

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019893	GTCG	2	8	2287	2294	0 %	25 %	50 %	25 %	430740945
2	NC_019893	GCCA	2	8	3243	3250	25 %	0 %	25 %	50 %	430740946
3	NC_019893	CTTC	2	8	3474	3481	0 %	50 %	0 %	50 %	430740946
4	NC_019893	CCGA	2	8	3627	3634	25 %	0 %	25 %	50 %	430740946
5	NC_019893	GCTG	2	8	4020	4027	0 %	25 %	50 %	25 %	430740946
6	NC_019893	AATG	2	8	4051	4058	50 %	25 %	25 %	0 %	430740946
7	NC_019893	AGCC	2	8	4136	4143	25 %	0 %	25 %	50 %	430740946
8	NC_019893	CATG	2	8	4299	4306	25 %	25 %	25 %	25 %	430740946
9	NC_019893	GACG	2	8	4325	4332	25 %	0 %	50 %	25 %	430740947
10	NC_019893	GGAA	2	8	4464	4471	50 %	0 %	50 %	0 %	430740947
11	NC_019893	ACTT	2	8	5196	5203	25 %	50 %	0 %	25 %	430740948
12	NC_019893	CGGC	2	8	5713	5720	0 %	0 %	50 %	50 %	430740948
13	NC_019893	ACCC	2	8	6262	6269	25 %	0 %	0 %	75 %	430740948
14	NC_019893	TCGA	2	8	7799	7806	25 %	25 %	25 %	25 %	430740949
15	NC_019893	TCGC	2	8	7874	7881	0 %	25 %	25 %	50 %	430740949
16	NC_019893	AATC	2	8	8139	8146	50 %	25 %	0 %	25 %	430740950
17	NC_019893	GCCT	2	8	8165	8172	0 %	25 %	25 %	50 %	430740950
18	NC_019893	CAAC	2	8	8280	8287	50 %	0 %	0 %	50 %	430740950
19	NC_019893	CCGA	2	8	8541	8548	25 %	0 %	25 %	50 %	430740950
20	NC_019893	GTCG	2	8	8688	8695	0 %	25 %	50 %	25 %	430740950
21	NC_019893	GCCG	2	8	9975	9982	0 %	0 %	50 %	50 %	430740951
22	NC_019893	GCCA	2	8	10147	10154	25 %	0 %	25 %	50 %	430740951
23	NC_019893	AGGA	2	8	12601	12608	50 %	0 %	50 %	0 %	430740953
24	NC_019893	GCGG	2	8	13265	13272	0 %	0 %	75 %	25 %	430740954
25	NC_019893	ACGG	2	8	13769	13776	25 %	0 %	50 %	25 %	430740954
26	NC_019893	TGAA	2	8	14211	14218	50 %	25 %	25 %	0 %	430740954
27	NC_019893	GCCG	2	8	14349	14356	0 %	0 %	50 %	50 %	430740954
28	NC_019893	TGGA	2	8	14366	14373	25 %	25 %	50 %	0 %	430740954
29	NC_019893	CCGC	2	8	14392	14399	0 %	0 %	25 %	75 %	430740954
30	NC_019893	CTGC	2	8	14867	14874	0 %	25 %	25 %	50 %	430740955
31	NC_019893	CAAC	2	8	15034	15041	50 %	0 %	0 %	50 %	430740955
32	NC_019893	CGGC	2	8	15322	15329	0 %	0 %	50 %	50 %	430740955
33	NC_019893	CGCC	2	8	15379	15386	0 %	0 %	25 %	75 %	430740955
34	NC_019893	CGGG	2	8	15391	15398	0 %	0 %	75 %	25 %	430740955
35	NC_019893	AAGG	2	8	15570	15577	50 %	0 %	50 %	0 %	430740955
36	NC_019893	GCGG	2	8	15729	15736	0 %	0 %	75 %	25 %	430740955
37	NC_019893	AGCA	2	8	16353	16360	50 %	0 %	25 %	25 %	430740956
38	NC_019893	GGGC	2	8	16538	16545	0 %	0 %	75 %	25 %	430740956
39	NC_019893	TCGA	2	8	16755	16762	25 %	25 %	25 %	25 %	430740956
40	NC_019893	GATT	2	8	16967	16974	25 %	50 %	25 %	0 %	430740956
41	NC_019893	CAGG	2	8	17688	17695	25 %	0 %	50 %	25 %	430740957
42	NC_019893	GAAG	2	8	18014	18021	50 %	0 %	50 %	0 %	430740957
43	NC_019893	AGCA	2	8	18269	18276	50 %	0 %	25 %	25 %	430740957
44	NC_019893	CGAA	2	8	19317	19324	50 %	0 %	25 %	25 %	430740958
45	NC_019893	GCTT	2	8	19732	19739	0 %	50 %	25 %	25 %	430740958
46	NC_019893	TCGC	2	8	19814	19821	0 %	25 %	25 %	50 %	430740958
47	NC_019893	GGGA	2	8	19949	19956	25 %	0 %	75 %	0 %	430740958
48	NC_019893	GAGC	2	8	20985	20992	25 %	0 %	50 %	25 %	430740959
49	NC_019893	CGAC	2	8	22047	22054	25 %	0 %	25 %	50 %	430740960
50	NC_019893	GACC	2	8	22140	22147	25 %	0 %	25 %	50 %	430740960
51	NC_019893	AGAA	2	8	22377	22384	75 %	0 %	25 %	0 %	430740960
52	NC_019893	GGCG	2	8	22465	22472	0 %	0 %	75 %	25 %	430740960
53	NC_019893	GGTC	2	8	23384	23391	0 %	25 %	50 %	25 %	430740961
54	NC_019893	ATCG	2	8	23546	23553	25 %	25 %	25 %	25 %	430740961
55	NC_019893	GTCG	2	8	23922	23929	0 %	25 %	50 %	25 %	430740961
56	NC_019893	CCGA	2	8	23998	24005	25 %	0 %	25 %	50 %	430740961
57	NC_019893	GCCG	2	8	24478	24485	0 %	0 %	50 %	50 %	430740961
58	NC_019893	GACC	2	8	24907	24914	25 %	0 %	25 %	50 %	430740962
59	NC_019893	GGCA	2	8	24937	24944	25 %	0 %	50 %	25 %	430740962
60	NC_019893	GACC	2	8	25198	25205	25 %	0 %	25 %	50 %	430740962
61	NC_019893	GGGT	2	8	25367	25374	0 %	25 %	75 %	0 %	430740962
62	NC_019893	CAGC	2	8	25375	25382	25 %	0 %	25 %	50 %	430740962
63	NC_019893	TCTT	2	8	25652	25659	0 %	75 %	0 %	25 %	430740962
64	NC_019893	CCAG	2	8	25823	25830	25 %	0 %	25 %	50 %	430740962
65	NC_019893	GCTC	2	8	26027	26034	0 %	25 %	25 %	50 %	430740962
66	NC_019893	TGCC	2	8	26210	26217	0 %	25 %	25 %	50 %	430740962
67	NC_019893	GGCG	2	8	26884	26891	0 %	0 %	75 %	25 %	430740962
68	NC_019893	CCCG	2	8	27066	27073	0 %	0 %	25 %	75 %	430740963
69	NC_019893	TGCC	2	8	27240	27247	0 %	25 %	25 %	50 %	430740963
70	NC_019893	CGAT	2	8	27417	27424	25 %	25 %	25 %	25 %	430740963
71	NC_019893	CGGG	2	8	27786	27793	0 %	0 %	75 %	25 %	430740963
72	NC_019893	GTTT	2	8	28039	28046	0 %	75 %	25 %	0 %	430740963
73	NC_019893	CTGG	2	8	28267	28274	0 %	25 %	50 %	25 %	430740963
74	NC_019893	CCCA	2	8	28951	28958	25 %	0 %	0 %	75 %	430740964
75	NC_019893	CAGC	2	8	29169	29176	25 %	0 %	25 %	50 %	430740964
76	NC_019893	ACGC	2	8	29396	29403	25 %	0 %	25 %	50 %	430740964
77	NC_019893	CCGG	2	8	29466	29473	0 %	0 %	50 %	50 %	430740964
78	NC_019893	GCCG	2	8	29742	29749	0 %	0 %	50 %	50 %	430740964
79	NC_019893	TTGA	2	8	30345	30352	25 %	50 %	25 %	0 %	430740964
80	NC_019893	GAAC	2	8	30717	30724	50 %	0 %	25 %	25 %	430740964
81	NC_019893	TCCA	2	8	30839	30846	25 %	25 %	0 %	50 %	430740964
82	NC_019893	TCGA	2	8	30889	30896	25 %	25 %	25 %	25 %	430740964
83	NC_019893	GATC	2	8	31065	31072	25 %	25 %	25 %	25 %	430740964
84	NC_019893	TGGA	2	8	31988	31995	25 %	25 %	50 %	0 %	430740965
85	NC_019893	GCCG	2	8	32315	32322	0 %	0 %	50 %	50 %	430740965
86	NC_019893	AGTC	2	8	32382	32389	25 %	25 %	25 %	25 %	430740965
87	NC_019893	TGGC	2	8	32846	32853	0 %	25 %	50 %	25 %	430740966
88	NC_019893	GTTG	2	8	32893	32900	0 %	50 %	50 %	0 %	430740966
89	NC_019893	GATT	2	8	33921	33928	25 %	50 %	25 %	0 %	430740966
90	NC_019893	GCCC	2	8	34012	34019	0 %	0 %	25 %	75 %	430740966
91	NC_019893	TCGA	2	8	34135	34142	25 %	25 %	25 %	25 %	430740966
92	NC_019893	CTTT	2	8	34267	34274	0 %	75 %	0 %	25 %	430740966
93	NC_019893	GATG	2	8	34582	34589	25 %	25 %	50 %	0 %	430740967
94	NC_019893	CTCG	2	8	34771	34778	0 %	25 %	25 %	50 %	430740967
95	NC_019893	GCTG	2	8	34800	34807	0 %	25 %	50 %	25 %	430740967
96	NC_019893	ACCT	2	8	34898	34905	25 %	25 %	0 %	50 %	430740967
97	NC_019893	CGAT	2	8	35250	35257	25 %	25 %	25 %	25 %	430740967
98	NC_019893	ACCG	2	8	36020	36027	25 %	0 %	25 %	50 %	430740967
99	NC_019893	CGTG	2	8	36040	36047	0 %	25 %	50 %	25 %	430740967
100	NC_019893	TCGT	2	8	36074	36081	0 %	50 %	25 %	25 %	430740967
101	NC_019893	TCGA	2	8	36839	36846	25 %	25 %	25 %	25 %	430740967
102	NC_019893	CTTG	2	8	36937	36944	0 %	50 %	25 %	25 %	430740967
103	NC_019893	CAGC	2	8	37077	37084	25 %	0 %	25 %	50 %	430740967
104	NC_019893	TCGG	2	8	38461	38468	0 %	25 %	50 %	25 %	430740968
105	NC_019893	GCTC	2	8	39004	39011	0 %	25 %	25 %	50 %	430740968
106	NC_019893	CAGC	2	8	39086	39093	25 %	0 %	25 %	50 %	430740968
107	NC_019893	GCTC	2	8	39743	39750	0 %	25 %	25 %	50 %	430740969
108	NC_019893	GGTG	2	8	39847	39854	0 %	25 %	75 %	0 %	430740969
109	NC_019893	GCCG	2	8	39999	40006	0 %	0 %	50 %	50 %	430740969
110	NC_019893	GCCG	2	8	40868	40875	0 %	0 %	50 %	50 %	430740970
111	NC_019893	CGGC	2	8	41879	41886	0 %	0 %	50 %	50 %	430740970
112	NC_019893	CCGC	2	8	42678	42685	0 %	0 %	25 %	75 %	430740972
113	NC_019893	TACA	2	8	43655	43662	50 %	25 %	0 %	25 %	430740973
114	NC_019893	CTCG	2	8	43778	43785	0 %	25 %	25 %	50 %	430740973
115	NC_019893	TTTC	2	8	44125	44132	0 %	75 %	0 %	25 %	430740973
116	NC_019893	GAGC	2	8	44428	44435	25 %	0 %	50 %	25 %	430740974
117	NC_019893	GTTG	2	8	44482	44489	0 %	50 %	50 %	0 %	430740974
118	NC_019893	GCGG	2	8	44504	44511	0 %	0 %	75 %	25 %	430740974
119	NC_019893	CCGG	2	8	44776	44783	0 %	0 %	50 %	50 %	430740974
120	NC_019893	CCGG	2	8	44899	44906	0 %	0 %	50 %	50 %	430740974
121	NC_019893	CGAC	2	8	44925	44932	25 %	0 %	25 %	50 %	430740974
122	NC_019893	AACC	2	8	45278	45285	50 %	0 %	0 %	50 %	430740974
123	NC_019893	TCGG	2	8	45298	45305	0 %	25 %	50 %	25 %	430740974
124	NC_019893	GTTC	2	8	45572	45579	0 %	50 %	25 %	25 %	430740974
125	NC_019893	CGGC	2	8	45751	45758	0 %	0 %	50 %	50 %	430740974
126	NC_019893	CACC	2	8	45820	45827	25 %	0 %	0 %	75 %	430740974
127	NC_019893	GAAC	2	8	46102	46109	50 %	0 %	25 %	25 %	430740974
128	NC_019893	CCCG	2	8	46211	46218	0 %	0 %	25 %	75 %	430740974
129	NC_019893	GGCT	2	8	46644	46651	0 %	25 %	50 %	25 %	430740974
130	NC_019893	TGGC	2	8	46909	46916	0 %	25 %	50 %	25 %	430740974
131	NC_019893	GGTC	2	8	47158	47165	0 %	25 %	50 %	25 %	430740974
132	NC_019893	AGCC	2	8	47348	47355	25 %	0 %	25 %	50 %	430740974
133	NC_019893	CGAG	2	8	47560	47567	25 %	0 %	50 %	25 %	430740974
134	NC_019893	CCGG	2	8	48009	48016	0 %	0 %	50 %	50 %	430740974
135	NC_019893	CGGC	2	8	48129	48136	0 %	0 %	50 %	50 %	430740974
136	NC_019893	GGTC	2	8	48379	48386	0 %	25 %	50 %	25 %	430740974
137	NC_019893	GGCA	2	8	49016	49023	25 %	0 %	50 %	25 %	430740974
138	NC_019893	CCGA	2	8	49170	49177	25 %	0 %	25 %	50 %	430740974
139	NC_019893	CCGG	2	8	49520	49527	0 %	0 %	50 %	50 %	430740974
140	NC_019893	GTCG	2	8	49754	49761	0 %	25 %	50 %	25 %	430740974
141	NC_019893	CGTG	2	8	49771	49778	0 %	25 %	50 %	25 %	430740974
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143	NC_019893	GTCG	2	8	50039	50046	0 %	25 %	50 %	25 %	430740974
144	NC_019893	GCCG	2	8	50228	50235	0 %	0 %	50 %	50 %	430740974
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.