MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 chromosome

Total Repeats: 6537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019892	GAAGC	2	10	2830	2839	40 %	0 %	40 %	20 %	430741033
2	NC_019892	AGAGG	2	10	4428	4437	40 %	0 %	60 %	0 %	430741035
3	NC_019892	CCGAC	2	10	4775	4784	20 %	0 %	20 %	60 %	430741035
4	NC_019892	CGTGG	2	10	5548	5557	0 %	20 %	60 %	20 %	430741035
5	NC_019892	CATAT	2	10	9056	9065	40 %	40 %	0 %	20 %	430741037
6	NC_019892	TCCGC	2	10	10647	10656	0 %	20 %	20 %	60 %	430741038
7	NC_019892	TCGAA	2	10	12574	12583	40 %	20 %	20 %	20 %	430741039
8	NC_019892	CCGGC	2	10	12728	12737	0 %	0 %	40 %	60 %	430741039
9	NC_019892	GCCCC	2	10	13286	13295	0 %	0 %	20 %	80 %	430741040
10	NC_019892	CGCCA	2	10	13458	13467	20 %	0 %	20 %	60 %	430741040
11	NC_019892	CCCAG	2	10	14941	14950	20 %	0 %	20 %	60 %	430741042
12	NC_019892	GACCT	2	10	17767	17776	20 %	20 %	20 %	40 %	430741044
13	NC_019892	AGGCC	2	10	20066	20075	20 %	0 %	40 %	40 %	430741045
14	NC_019892	CGGGC	2	10	22592	22601	0 %	0 %	60 %	40 %	430741047
15	NC_019892	GCCGA	2	10	22746	22755	20 %	0 %	40 %	40 %	430741047
16	NC_019892	GGCGT	2	10	22761	22770	0 %	20 %	60 %	20 %	430741047
17	NC_019892	GGTCG	2	10	22778	22787	0 %	20 %	60 %	20 %	430741047
18	NC_019892	GGCCA	2	10	23439	23448	20 %	0 %	40 %	40 %	430741047
19	NC_019892	AAATC	2	10	26928	26937	60 %	20 %	0 %	20 %	430741048
20	NC_019892	AGTCG	2	10	28439	28448	20 %	20 %	40 %	20 %	430741050
21	NC_019892	GCTTC	2	10	28519	28528	0 %	40 %	20 %	40 %	430741050
22	NC_019892	GCTGA	2	10	30727	30736	20 %	20 %	40 %	20 %	430741053
23	NC_019892	CCGCA	2	10	30882	30891	20 %	0 %	20 %	60 %	430741053
24	NC_019892	TCGGC	2	10	33771	33780	0 %	20 %	40 %	40 %	430741056
25	NC_019892	GGCCC	2	10	34161	34170	0 %	0 %	40 %	60 %	430741056
26	NC_019892	CGGCC	2	10	34218	34227	0 %	0 %	40 %	60 %	430741056
27	NC_019892	GGCGA	2	10	35796	35805	20 %	0 %	60 %	20 %	430741057
28	NC_019892	CAAAC	2	10	37744	37753	60 %	0 %	0 %	40 %	430741058
29	NC_019892	ATCGC	2	10	38748	38757	20 %	20 %	20 %	40 %	430741059
30	NC_019892	AGCCC	2	10	39250	39259	20 %	0 %	20 %	60 %	430741059
31	NC_019892	CGACC	2	10	40463	40472	20 %	0 %	20 %	60 %	430741059
32	NC_019892	GCTCC	2	10	40621	40630	0 %	20 %	20 %	60 %	430741060
33	NC_019892	CGCCC	2	10	43546	43555	0 %	0 %	20 %	80 %	430741062
34	NC_019892	TACCG	2	10	44667	44676	20 %	20 %	20 %	40 %	430741064
35	NC_019892	AATCC	2	10	45069	45078	40 %	20 %	0 %	40 %	430741064
36	NC_019892	GAAGC	2	10	45686	45695	40 %	0 %	40 %	20 %	430741065
37	NC_019892	TGAAC	2	10	47274	47283	40 %	20 %	20 %	20 %	430741067
38	NC_019892	TGAGC	2	10	50664	50673	20 %	20 %	40 %	20 %	430741070
39	NC_019892	GGTCG	2	10	50971	50980	0 %	20 %	60 %	20 %	430741070
40	NC_019892	GCCCC	2	10	52042	52051	0 %	0 %	20 %	80 %	430741070
41	NC_019892	GCGAG	2	10	52119	52128	20 %	0 %	60 %	20 %	430741070
42	NC_019892	CGACC	2	10	53614	53623	20 %	0 %	20 %	60 %	430741071
43	NC_019892	GCAGC	2	10	53665	53674	20 %	0 %	40 %	40 %	430741071
44	NC_019892	ACCCG	2	10	53964	53973	20 %	0 %	20 %	60 %	430741072
45	NC_019892	CCAGG	2	10	55361	55370	20 %	0 %	40 %	40 %	430741073
46	NC_019892	GGGCC	2	10	55447	55456	0 %	0 %	60 %	40 %	430741073
47	NC_019892	CACTG	2	10	56052	56061	20 %	20 %	20 %	40 %	430741074
48	NC_019892	CCCTG	2	10	58544	58553	0 %	20 %	20 %	60 %	430741077
49	NC_019892	GCTTG	2	10	59759	59768	0 %	40 %	40 %	20 %	430741077
50	NC_019892	CAGCC	2	10	60433	60442	20 %	0 %	20 %	60 %	430741077
51	NC_019892	GGCCG	2	10	60677	60686	0 %	0 %	60 %	40 %	430741077
52	NC_019892	CCAGC	2	10	64521	64530	20 %	0 %	20 %	60 %	430741081
53	NC_019892	CCGAC	2	10	66149	66158	20 %	0 %	20 %	60 %	430741082
54	NC_019892	ACGGG	2	10	67167	67176	20 %	0 %	60 %	20 %	430741083
55	NC_019892	GGCGT	2	10	67285	67294	0 %	20 %	60 %	20 %	430741083
56	NC_019892	GCGGA	2	10	70531	70540	20 %	0 %	60 %	20 %	430741084
57	NC_019892	GAACC	2	10	70695	70704	40 %	0 %	20 %	40 %	430741084
58	NC_019892	CGGGG	2	10	74483	74492	0 %	0 %	80 %	20 %	430741087
59	NC_019892	CGCCT	2	10	77750	77759	0 %	20 %	20 %	60 %	430741089
60	NC_019892	CGCGA	2	10	78095	78104	20 %	0 %	40 %	40 %	430741089
61	NC_019892	GGATC	2	10	83064	83073	20 %	20 %	40 %	20 %	430741092
62	NC_019892	TCGAA	2	10	84911	84920	40 %	20 %	20 %	20 %	430741093
63	NC_019892	CGAAC	2	10	85149	85158	40 %	0 %	20 %	40 %	430741093
64	NC_019892	GATGG	2	10	85209	85218	20 %	20 %	60 %	0 %	430741093
65	NC_019892	ACCCC	2	10	88767	88776	20 %	0 %	0 %	80 %	430741096
66	NC_019892	GGCCT	2	10	89154	89163	0 %	20 %	40 %	40 %	430741096
67	NC_019892	GCGAC	2	10	90474	90483	20 %	0 %	40 %	40 %	430741098
68	NC_019892	GGCCG	2	10	90913	90922	0 %	0 %	60 %	40 %	430741098
69	NC_019892	CGCCC	2	10	93454	93463	0 %	0 %	20 %	80 %	430741100
70	NC_019892	GCCAG	2	10	96689	96698	20 %	0 %	40 %	40 %	430741102
71	NC_019892	CTGAT	2	10	97531	97540	20 %	40 %	20 %	20 %	430741102
72	NC_019892	CCCGA	2	10	103309	103318	20 %	0 %	20 %	60 %	430741108
73	NC_019892	GCCTG	2	10	104729	104738	0 %	20 %	40 %	40 %	430741110
74	NC_019892	AAGCT	2	10	107010	107019	40 %	20 %	20 %	20 %	430741112
75	NC_019892	GGCCG	2	10	108877	108886	0 %	0 %	60 %	40 %	430741114
76	NC_019892	CTGGC	2	10	109531	109540	0 %	20 %	40 %	40 %	430741114
77	NC_019892	CCGGG	2	10	109572	109581	0 %	0 %	60 %	40 %	430741114
78	NC_019892	AGGCC	2	10	110122	110131	20 %	0 %	40 %	40 %	430741115
79	NC_019892	TTCGT	2	10	110570	110579	0 %	60 %	20 %	20 %	430741115
80	NC_019892	TCCAG	2	10	112202	112211	20 %	20 %	20 %	40 %	430741116
81	NC_019892	GGCCA	2	10	112312	112321	20 %	0 %	40 %	40 %	430741116
82	NC_019892	GATCG	2	10	112357	112366	20 %	20 %	40 %	20 %	430741116
83	NC_019892	GATCG	2	10	119378	119387	20 %	20 %	40 %	20 %	430741122
84	NC_019892	CTCAG	2	10	119849	119858	20 %	20 %	20 %	40 %	430741123
85	NC_019892	GGCCG	2	10	120660	120669	0 %	0 %	60 %	40 %	430741124
86	NC_019892	GCGAG	2	10	120941	120950	20 %	0 %	60 %	20 %	430741124
87	NC_019892	ACCCG	2	10	124059	124068	20 %	0 %	20 %	60 %	430741125
88	NC_019892	GGGCT	2	10	125140	125149	0 %	20 %	60 %	20 %	430741126
89	NC_019892	AGGCA	2	10	127685	127694	40 %	0 %	40 %	20 %	430741128
90	NC_019892	TTGAA	2	10	128571	128580	40 %	40 %	20 %	0 %	430741128
91	NC_019892	CGGAG	2	10	130110	130119	20 %	0 %	60 %	20 %	430741128
92	NC_019892	TCGAG	2	10	130161	130170	20 %	20 %	40 %	20 %	430741128
93	NC_019892	GCGGT	2	10	132885	132894	0 %	20 %	60 %	20 %	430741129
94	NC_019892	CCCCT	2	10	133179	133188	0 %	20 %	0 %	80 %	430741129
95	NC_019892	GTCGA	2	10	140823	140832	20 %	20 %	40 %	20 %	430741137
96	NC_019892	CGTCG	2	10	142506	142515	0 %	20 %	40 %	40 %	430741140
97	NC_019892	CTCGA	2	10	143618	143627	20 %	20 %	20 %	40 %	430741141
98	NC_019892	CGGGT	2	10	143811	143820	0 %	20 %	60 %	20 %	430741141
99	NC_019892	GCGAA	2	10	145652	145661	40 %	0 %	40 %	20 %	430741141
100	NC_019892	CGGGT	2	10	149042	149051	0 %	20 %	60 %	20 %	430741142
101	NC_019892	CGCGG	2	10	149168	149177	0 %	0 %	60 %	40 %	430741142
102	NC_019892	GAACC	2	10	149531	149540	40 %	0 %	20 %	40 %	430741142
103	NC_019892	GGGGC	2	10	150338	150347	0 %	0 %	80 %	20 %	430741143
104	NC_019892	GGGTC	2	10	153067	153076	0 %	20 %	60 %	20 %	430741145
105	NC_019892	CCCCG	2	10	155622	155631	0 %	0 %	20 %	80 %	430741146
106	NC_019892	GCCTG	2	10	157235	157244	0 %	20 %	40 %	40 %	430741147
107	NC_019892	GGCCC	2	10	158863	158872	0 %	0 %	40 %	60 %	430741150
108	NC_019892	TGGGC	2	10	160977	160986	0 %	20 %	60 %	20 %	430741151
109	NC_019892	TCGGG	2	10	162491	162500	0 %	20 %	60 %	20 %	430741152
110	NC_019892	GTCGA	2	10	162537	162546	20 %	20 %	40 %	20 %	430741152
111	NC_019892	CCAGG	2	10	162725	162734	20 %	0 %	40 %	40 %	430741152
112	NC_019892	TTCGA	2	10	164873	164882	20 %	40 %	20 %	20 %	430741155
113	NC_019892	CCCTG	2	10	166450	166459	0 %	20 %	20 %	60 %	430741156
114	NC_019892	GGATC	2	10	168828	168837	20 %	20 %	40 %	20 %	430741158
115	NC_019892	TGCTC	2	10	170983	170992	0 %	40 %	20 %	40 %	430741161
116	NC_019892	CCCGA	2	10	177619	177628	20 %	0 %	20 %	60 %	430741164
117	NC_019892	TTCGC	2	10	179404	179413	0 %	40 %	20 %	40 %	430741165
118	NC_019892	GCGGA	2	10	183849	183858	20 %	0 %	60 %	20 %	430741171
119	NC_019892	CTTCG	2	10	187298	187307	0 %	40 %	20 %	40 %	430741172
120	NC_019892	CTCGA	2	10	188271	188280	20 %	20 %	20 %	40 %	430741173
121	NC_019892	CCCAC	2	10	188645	188654	20 %	0 %	0 %	80 %	430741173
122	NC_019892	GCGAA	2	10	189138	189147	40 %	0 %	40 %	20 %	430741174
123	NC_019892	GTGCG	2	10	190543	190552	0 %	20 %	60 %	20 %	430741175
124	NC_019892	GCAGG	2	10	193534	193543	20 %	0 %	60 %	20 %	430741180
125	NC_019892	GCCGC	2	10	199353	199362	0 %	0 %	40 %	60 %	430741185
126	NC_019892	AGCCG	2	10	200791	200800	20 %	0 %	40 %	40 %	430741186
127	NC_019892	ACCGC	2	10	212624	212633	20 %	0 %	20 %	60 %	430741191
128	NC_019892	CACAG	2	10	212716	212725	40 %	0 %	20 %	40 %	430741191
129	NC_019892	CGAGT	2	10	212815	212824	20 %	20 %	40 %	20 %	430741191
130	NC_019892	GTCGG	2	10	218455	218464	0 %	20 %	60 %	20 %	430741195
131	NC_019892	GTCGC	2	10	219979	219988	0 %	20 %	40 %	40 %	430741195
132	NC_019892	AACCG	2	10	220974	220983	40 %	0 %	20 %	40 %	430741196
133	NC_019892	GCGCC	2	10	226924	226933	0 %	0 %	40 %	60 %	430741200
134	NC_019892	GGGGC	2	10	227331	227340	0 %	0 %	80 %	20 %	430741201
135	NC_019892	CTCGG	2	10	229157	229166	0 %	20 %	40 %	40 %	430741202
136	NC_019892	GGCCT	2	10	230454	230463	0 %	20 %	40 %	40 %	430741204
137	NC_019892	CACGG	2	10	231650	231659	20 %	0 %	40 %	40 %	430741205
138	NC_019892	GCCTT	2	10	231856	231865	0 %	40 %	20 %	40 %	430741205
139	NC_019892	CACTC	2	10	232463	232472	20 %	20 %	0 %	60 %	430741205
140	NC_019892	CCAGG	2	10	235686	235695	20 %	0 %	40 %	40 %	430741208
141	NC_019892	GAGCG	2	10	235720	235729	20 %	0 %	60 %	20 %	430741208
142	NC_019892	GTCGA	2	10	237644	237653	20 %	20 %	40 %	20 %	430741210
143	NC_019892	CGCGG	2	10	241788	241797	0 %	0 %	60 %	40 %	430741216
144	NC_019892	CGGCG	2	10	244282	244291	0 %	0 %	60 %	40 %	430741218
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147	NC_019892	GCAGG	2	10	246145	246154	20 %	0 %	60 %	20 %	430741219
148	NC_019892	CTGCG	2	10	248914	248923	0 %	20 %	40 %	40 %	430741222
149	NC_019892	CGAGG	2	10	249849	249858	20 %	0 %	60 %	20 %	430741222
150	NC_019892	CATGC	2	10	250634	250643	20 %	20 %	20 %	40 %	430741222
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152	NC_019892	GCCGG	2	10	258094	258103	0 %	0 %	60 %	40 %	430741225
153	NC_019892	GCCGG	2	10	259160	259169	0 %	0 %	60 %	40 %	430741226
154	NC_019892	ACGGG	2	10	261063	261072	20 %	0 %	60 %	20 %	430741227
155	NC_019892	GGTGA	2	10	262324	262333	20 %	20 %	60 %	0 %	430741227
156	NC_019892	CGCCT	2	10	264467	264476	0 %	20 %	20 %	60 %	430741229
157	NC_019892	CCCTC	2	10	264496	264505	0 %	20 %	0 %	80 %	430741229
158	NC_019892	GCCTG	2	10	264931	264940	0 %	20 %	40 %	40 %	430741230
159	NC_019892	GCCTG	2	10	266539	266548	0 %	20 %	40 %	40 %	430741231
160	NC_019892	CCTGG	2	10	266587	266596	0 %	20 %	40 %	40 %	430741231
161	NC_019892	CGCGG	2	10	267556	267565	0 %	0 %	60 %	40 %	430741231
162	NC_019892	CTCGC	2	10	267590	267599	0 %	20 %	20 %	60 %	430741231
163	NC_019892	CGGTC	2	10	268132	268141	0 %	20 %	40 %	40 %	430741231
164	NC_019892	ACACG	2	10	268312	268321	40 %	0 %	20 %	40 %	430741231
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166	NC_019892	TGGGA	2	10	269887	269896	20 %	20 %	60 %	0 %	430741232
167	NC_019892	GCACG	2	10	276416	276425	20 %	0 %	40 %	40 %	430741233
168	NC_019892	TGCTG	2	10	277680	277689	0 %	40 %	40 %	20 %	430741234
169	NC_019892	TCGAT	2	10	278318	278327	20 %	40 %	20 %	20 %	430741235
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180	NC_019892	GGCCC	2	10	298377	298386	0 %	0 %	40 %	60 %	430741252
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186	NC_019892	CCGAG	2	10	306032	306041	20 %	0 %	40 %	40 %	430741257
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192	NC_019892	AGGGA	2	10	315998	316007	40 %	0 %	60 %	0 %	430741265
193	NC_019892	GCCGC	2	10	316845	316854	0 %	0 %	40 %	60 %	430741266
194	NC_019892	CGATC	2	10	321244	321253	20 %	20 %	20 %	40 %	430741268
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199	NC_019892	GGCTC	2	10	324242	324251	0 %	20 %	40 %	40 %	430741268
200	NC_019892	TTCCG	2	10	324372	324381	0 %	40 %	20 %	40 %	430741269
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211	NC_019892	CCGAG	2	10	337882	337891	20 %	0 %	40 %	40 %	430741281
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213	NC_019892	CCTGC	2	10	338450	338459	0 %	20 %	20 %	60 %	430741281
214	NC_019892	ACTGG	2	10	341169	341178	20 %	20 %	40 %	20 %	430741283
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229	NC_019892	ATGGG	2	10	357362	357371	20 %	20 %	60 %	0 %	430741295
230	NC_019892	AACTG	2	10	358288	358297	40 %	20 %	20 %	20 %	430741295
231	NC_019892	CCTGG	2	10	358395	358404	0 %	20 %	40 %	40 %	430741296
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233	NC_019892	GCCCA	2	10	372813	372822	20 %	0 %	20 %	60 %	430741305
234	NC_019892	TGGTC	2	10	375704	375713	0 %	40 %	40 %	20 %	430741305
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236	NC_019892	GCCAT	2	10	380196	380205	20 %	20 %	20 %	40 %	430741309
237	NC_019892	AAGCG	2	10	382274	382283	40 %	0 %	40 %	20 %	430741311
238	NC_019892	GGCCG	2	10	385145	385154	0 %	0 %	60 %	40 %	430741313
239	NC_019892	GGTTC	2	10	386928	386937	0 %	40 %	40 %	20 %	430741314
240	NC_019892	GAACC	2	10	388541	388550	40 %	0 %	20 %	40 %	430741315
241	NC_019892	CGACC	2	10	393530	393539	20 %	0 %	20 %	60 %	430741320
242	NC_019892	GGCCG	2	10	393541	393550	0 %	0 %	60 %	40 %	430741320
243	NC_019892	GCCTG	2	10	397013	397022	0 %	20 %	40 %	40 %	430741324
244	NC_019892	CAGGC	2	10	406217	406226	20 %	0 %	40 %	40 %	430741330
245	NC_019892	GCCCG	2	10	407095	407104	0 %	0 %	40 %	60 %	430741331
246	NC_019892	TCTCG	2	10	411269	411278	0 %	40 %	20 %	40 %	430741335
247	NC_019892	GTGAC	2	10	413335	413344	20 %	20 %	40 %	20 %	430741335
248	NC_019892	GCGGA	2	10	416079	416088	20 %	0 %	60 %	20 %	430741338
249	NC_019892	GGATC	2	10	416150	416159	20 %	20 %	40 %	20 %	430741338
250	NC_019892	GGCCT	2	10	416307	416316	0 %	20 %	40 %	40 %	430741338
251	NC_019892	CAAGG	2	10	416983	416992	40 %	0 %	40 %	20 %	430741339
252	NC_019892	GGCCG	2	10	419079	419088	0 %	0 %	60 %	40 %	430741341
253	NC_019892	CGGCC	2	10	423652	423661	0 %	0 %	40 %	60 %	430741343
254	NC_019892	GCCCT	2	10	425358	425367	0 %	20 %	20 %	60 %	430741344
255	NC_019892	CCGGG	2	10	425440	425449	0 %	0 %	60 %	40 %	430741344
256	NC_019892	CAATT	2	10	428850	428859	40 %	40 %	0 %	20 %	430741345
257	NC_019892	GATCG	2	10	431328	431337	20 %	20 %	40 %	20 %	430741346
258	NC_019892	GGGTC	2	10	433865	433874	0 %	20 %	60 %	20 %	430741346
259	NC_019892	TCGGC	2	10	434987	434996	0 %	20 %	40 %	40 %	430741346
260	NC_019892	TTCGA	2	10	439330	439339	20 %	40 %	20 %	20 %	430741349
261	NC_019892	GCTTG	2	10	444553	444562	0 %	40 %	40 %	20 %	430741354
262	NC_019892	AAAGC	2	10	450752	450761	60 %	0 %	20 %	20 %	430741358
263	NC_019892	GCTGC	2	10	451830	451839	0 %	20 %	40 %	40 %	430741359
264	NC_019892	GCTCC	2	10	452325	452334	0 %	20 %	20 %	60 %	430741359
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389	NC_019892	TGAGC	2	10	648175	648184	20 %	20 %	40 %	20 %	430741502
390	NC_019892	TGGTC	2	10	648193	648202	0 %	40 %	40 %	20 %	430741502
391	NC_019892	CGTGC	2	10	652809	652818	0 %	20 %	40 %	40 %	430741507
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