MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4d

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019849	GTTTCG	2	12	11304	11315	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019849	TGGGGC	2	12	28713	28724	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019849	CGAAAC	2	12	29497	29508	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019849	GCTGAA	2	12	77231	77242	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019849	GAAAGG	2	12	141590	141601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019849	CGATTG	2	12	165499	165510	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019849	GCCTGT	2	12	198269	198280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019849	TTGCAC	2	12	205359	205370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019849	CGGCGC	2	12	234832	234843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019849	AACTGG	2	12	273047	273058	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019849	GGTGCC	2	12	290892	290903	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019849	TCCGCA	2	12	292754	292765	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019849	CCGCCT	2	12	341281	341292	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_019849	AGCCAC	2	12	406455	406466	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019849	GTCTCG	2	12	407265	407276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019849	GGAATC	2	12	413865	413876	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019849	CGCTAA	2	12	417667	417678	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019849	GTCGCG	2	12	500927	500938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019849	TGCCGT	2	12	504851	504862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019849	CCGGGA	2	12	518066	518077	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019849	GCCTTC	2	12	692371	692382	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019849	GCCTCC	2	12	794310	794321	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_019849	TTCATT	2	12	845346	845357	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019849	GAAGCA	2	12	933837	933848	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_019849	CTGCGG	2	12	1005235	1005246	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019849	TCGCAT	2	12	1022088	1022099	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019849	CTCGAC	2	12	1112694	1112705	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019849	AGTTCA	2	12	1159964	1159975	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019849	GCCAAA	2	12	1166156	1166167	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019849	CCGACA	2	12	1192953	1192964	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019849	TCGCCG	2	12	1215468	1215479	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019849	AGCGGA	2	12	1216823	1216834	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019849	GGAAAG	2	12	1227723	1227734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019849	CCGCTC	2	12	1388970	1388981	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_019849	AGGCGA	2	12	1520127	1520138	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019849	GCTTAT	2	12	1573119	1573130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019849	TAAATT	2	12	1586293	1586304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019849	CACCCT	2	12	1621316	1621327	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_019849	CGCGTG	2	12	1663948	1663959	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.