MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4d

Total Repeats: 1241

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019849	GCATT	2	10	1936	1945	20 %	40 %	20 %	20 %	433610268
2	NC_019849	GCGTG	2	10	5981	5990	0 %	20 %	60 %	20 %	433610271
3	NC_019849	GGCTC	2	10	6087	6096	0 %	20 %	40 %	40 %	433610271
4	NC_019849	TGCCG	2	10	7688	7697	0 %	20 %	40 %	40 %	433610273
5	NC_019849	GCGCC	2	10	9097	9106	0 %	0 %	40 %	60 %	433610274
6	NC_019849	CGATC	2	10	9781	9790	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_019849	GGGGC	2	10	9988	9997	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019849	GGCGT	2	10	10677	10686	0 %	20 %	60 %	20 %	433610275
9	NC_019849	CAAGC	2	10	10826	10835	40 %	0 %	20 %	40 %	433610275
10	NC_019849	GCGCC	2	10	11188	11197	0 %	0 %	40 %	60 %	433610275
11	NC_019849	GTAAT	2	10	15373	15382	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019849	CCGAG	2	10	17519	17528	20 %	0 %	40 %	40 %	433610281
13	NC_019849	GGCTC	2	10	17986	17995	0 %	20 %	40 %	40 %	433610282
14	NC_019849	GTTGC	2	10	18654	18663	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019849	GGATG	2	10	19121	19130	20 %	20 %	60 %	0 %	433610284
16	NC_019849	CGCAG	2	10	19934	19943	20 %	0 %	40 %	40 %	433610285
17	NC_019849	GCCGA	2	10	20443	20452	20 %	0 %	40 %	40 %	433610285
18	NC_019849	GCCGG	2	10	22320	22329	0 %	0 %	60 %	40 %	433610287
19	NC_019849	TGACG	2	10	25442	25451	20 %	20 %	40 %	20 %	433610289
20	NC_019849	GCCAG	2	10	26048	26057	20 %	0 %	40 %	40 %	433610289
21	NC_019849	GAGGG	2	10	28530	28539	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019849	GGTCG	2	10	28884	28893	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019849	GCTCG	2	10	29886	29895	0 %	20 %	40 %	40 %	433610292
24	NC_019849	GCCCT	2	10	31285	31294	0 %	20 %	20 %	60 %	433610292
25	NC_019849	TCCAC	2	10	32823	32832	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_019849	CGATC	2	10	33213	33222	20 %	20 %	20 %	40 %	433610294
27	NC_019849	TCGCC	2	10	40523	40532	0 %	20 %	20 %	60 %	433610300
28	NC_019849	CGGCC	2	10	42113	42122	0 %	0 %	40 %	60 %	433610300
29	NC_019849	GAAAA	2	10	42721	42730	80 %	0 %	20 %	0 %	433610301
30	NC_019849	TCCGG	2	10	43076	43085	0 %	20 %	40 %	40 %	433610301
31	NC_019849	CGGCG	2	10	44597	44606	0 %	0 %	60 %	40 %	433610302
32	NC_019849	TGTCA	2	10	44648	44657	20 %	40 %	20 %	20 %	433610302
33	NC_019849	CGCGG	2	10	44994	45003	0 %	0 %	60 %	40 %	433610303
34	NC_019849	TTCGC	2	10	45502	45511	0 %	40 %	20 %	40 %	433610303
35	NC_019849	ACGAA	2	10	48157	48166	60 %	0 %	20 %	20 %	433610305
36	NC_019849	CCGGT	2	10	48315	48324	0 %	20 %	40 %	40 %	433610305
37	NC_019849	CGGCA	2	10	49418	49427	20 %	0 %	40 %	40 %	433610306
38	NC_019849	GGCGA	2	10	54758	54767	20 %	0 %	60 %	20 %	433610311
39	NC_019849	GCAGG	2	10	57318	57327	20 %	0 %	60 %	20 %	433610313
40	NC_019849	GGATG	2	10	59788	59797	20 %	20 %	60 %	0 %	433610316
41	NC_019849	TGCCG	2	10	60981	60990	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_019849	CGGGT	2	10	63159	63168	0 %	20 %	60 %	20 %	433610319
43	NC_019849	CTCGA	2	10	64479	64488	20 %	20 %	20 %	40 %	433610320
44	NC_019849	CTCGC	2	10	67755	67764	0 %	20 %	20 %	60 %	433610322
45	NC_019849	AACAC	2	10	68994	69003	60 %	0 %	0 %	40 %	433610323
46	NC_019849	CGGCG	2	10	73919	73928	0 %	0 %	60 %	40 %	433610327
47	NC_019849	CGGAG	2	10	75920	75929	20 %	0 %	60 %	20 %	433610330
48	NC_019849	GCCGA	2	10	77220	77229	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019849	GGCCG	2	10	78723	78732	0 %	0 %	60 %	40 %	433610332
50	NC_019849	GGCGG	2	10	81920	81929	0 %	0 %	80 %	20 %	433610335
51	NC_019849	GTGGC	2	10	83354	83363	0 %	20 %	60 %	20 %	433610337
52	NC_019849	TGCGC	2	10	85670	85679	0 %	20 %	40 %	40 %	433610338
53	NC_019849	CTGCC	2	10	87266	87275	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_019849	TGCCG	2	10	88831	88840	0 %	20 %	40 %	40 %	433610341
55	NC_019849	CCGAC	2	10	91465	91474	20 %	0 %	20 %	60 %	433610343
56	NC_019849	GGGAC	2	10	91894	91903	20 %	0 %	60 %	20 %	433610343
57	NC_019849	GATCG	2	10	92715	92724	20 %	20 %	40 %	20 %	433610345
58	NC_019849	GAAAT	2	10	94121	94130	60 %	20 %	20 %	0 %	433610347
59	NC_019849	TGTCG	2	10	95258	95267	0 %	40 %	40 %	20 %	433610348
60	NC_019849	GATGC	2	10	96710	96719	20 %	20 %	40 %	20 %	433610350
61	NC_019849	CGGAG	2	10	97294	97303	20 %	0 %	60 %	20 %	433610350
62	NC_019849	AGGGC	2	10	97726	97735	20 %	0 %	60 %	20 %	433610350
63	NC_019849	TGCCG	2	10	100725	100734	0 %	20 %	40 %	40 %	433610353
64	NC_019849	GGCCG	2	10	102780	102789	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_019849	GGCCC	2	10	105965	105974	0 %	0 %	40 %	60 %	433610359
66	NC_019849	TCGGC	2	10	106598	106607	0 %	20 %	40 %	40 %	433610359
67	NC_019849	GGTCC	2	10	107479	107488	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_019849	GGCGA	2	10	108400	108409	20 %	0 %	60 %	20 %	433610360
69	NC_019849	TCGCC	2	10	108666	108675	0 %	20 %	20 %	60 %	433610360
70	NC_019849	GGCCA	2	10	114652	114661	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_019849	AGATC	2	10	114685	114694	40 %	20 %	20 %	20 %	433610364
72	NC_019849	TCGTC	2	10	116857	116866	0 %	40 %	20 %	40 %	433610365
73	NC_019849	CGCGC	2	10	118655	118664	0 %	0 %	40 %	60 %	433610365
74	NC_019849	AGCGC	2	10	118891	118900	20 %	0 %	40 %	40 %	433610365
75	NC_019849	GCCTT	2	10	119160	119169	0 %	40 %	20 %	40 %	433610366
76	NC_019849	CCGAT	2	10	119780	119789	20 %	20 %	20 %	40 %	433610366
77	NC_019849	TCGCC	2	10	120033	120042	0 %	20 %	20 %	60 %	433610366
78	NC_019849	CAACT	2	10	122331	122340	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_019849	CCGAC	2	10	125455	125464	20 %	0 %	20 %	60 %	433610369
80	NC_019849	GGCGA	2	10	125496	125505	20 %	0 %	60 %	20 %	433610369
81	NC_019849	TGCAG	2	10	126820	126829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019849	TTGCG	2	10	126878	126887	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019849	TCGGC	2	10	127573	127582	0 %	20 %	40 %	40 %	433610372
84	NC_019849	GGCGA	2	10	128455	128464	20 %	0 %	60 %	20 %	433610373
85	NC_019849	GCTCG	2	10	129099	129108	0 %	20 %	40 %	40 %	433610373
86	NC_019849	CCTTG	2	10	133995	134004	0 %	40 %	20 %	40 %	433610378
87	NC_019849	GAGCG	2	10	134392	134401	20 %	0 %	60 %	20 %	433610378
88	NC_019849	GCCGC	2	10	136894	136903	0 %	0 %	40 %	60 %	433610381
89	NC_019849	GCCGC	2	10	137742	137751	0 %	0 %	40 %	60 %	433610381
90	NC_019849	ACGCG	2	10	138289	138298	20 %	0 %	40 %	40 %	433610381
91	NC_019849	TTCCT	2	10	140438	140447	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_019849	GAAAG	2	10	140591	140600	60 %	0 %	40 %	0 %	433610384
93	NC_019849	GCCGG	2	10	141763	141772	0 %	0 %	60 %	40 %	433610385
94	NC_019849	GGGGA	2	10	142076	142085	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019849	TCGCC	2	10	146400	146409	0 %	20 %	20 %	60 %	433610390
96	NC_019849	AAGCG	2	10	147055	147064	40 %	0 %	40 %	20 %	433610390
97	NC_019849	AGCCG	2	10	148664	148673	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_019849	CATCG	2	10	149008	149017	20 %	20 %	20 %	40 %	433610392
99	NC_019849	TACGC	2	10	150031	150040	20 %	20 %	20 %	40 %	433610393
100	NC_019849	CGGCG	2	10	150085	150094	0 %	0 %	60 %	40 %	433610393
101	NC_019849	GCTCG	2	10	150310	150319	0 %	20 %	40 %	40 %	433610393
102	NC_019849	GGAAC	2	10	151361	151370	40 %	0 %	40 %	20 %	433610394
103	NC_019849	GCTCG	2	10	151999	152008	0 %	20 %	40 %	40 %	433610394
104	NC_019849	GCCCG	2	10	153455	153464	0 %	0 %	40 %	60 %	433610395
105	NC_019849	TCGCC	2	10	154335	154344	0 %	20 %	20 %	60 %	433610396
106	NC_019849	CGCGC	2	10	154939	154948	0 %	0 %	40 %	60 %	433610397
107	NC_019849	ACCGG	2	10	155482	155491	20 %	0 %	40 %	40 %	433610398
108	NC_019849	CCGCG	2	10	158169	158178	0 %	0 %	40 %	60 %	433610401
109	NC_019849	CAAAG	2	10	160544	160553	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019849	CGAAG	2	10	161258	161267	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_019849	GCGTC	2	10	163229	163238	0 %	20 %	40 %	40 %	433610404
112	NC_019849	TCGGC	2	10	163860	163869	0 %	20 %	40 %	40 %	433610405
113	NC_019849	TCCGG	2	10	164728	164737	0 %	20 %	40 %	40 %	433610406
114	NC_019849	CGAGG	2	10	164949	164958	20 %	0 %	60 %	20 %	433610406
115	NC_019849	CGATG	2	10	165134	165143	20 %	20 %	40 %	20 %	433610406
116	NC_019849	ACGGC	2	10	168662	168671	20 %	0 %	40 %	40 %	433610409
117	NC_019849	GTGGG	2	10	168695	168704	0 %	20 %	80 %	0 %	433610409
118	NC_019849	CGCGT	2	10	168801	168810	0 %	20 %	40 %	40 %	433610410
119	NC_019849	CGGCG	2	10	171928	171937	0 %	0 %	60 %	40 %	433610412
120	NC_019849	TGTAT	2	10	174413	174422	20 %	60 %	20 %	0 %	433610413
121	NC_019849	GGGTC	2	10	174749	174758	0 %	20 %	60 %	20 %	433610413
122	NC_019849	TTGCG	2	10	174863	174872	0 %	40 %	40 %	20 %	433610413
123	NC_019849	GCCGG	2	10	176050	176059	0 %	0 %	60 %	40 %	433610414
124	NC_019849	GTGCG	2	10	177232	177241	0 %	20 %	60 %	20 %	433610415
125	NC_019849	TGATT	2	10	177281	177290	20 %	60 %	20 %	0 %	433610415
126	NC_019849	TCCTG	2	10	180432	180441	0 %	40 %	20 %	40 %	433610419
127	NC_019849	GCCCG	2	10	181273	181282	0 %	0 %	40 %	60 %	433610419
128	NC_019849	CGGCT	2	10	190483	190492	0 %	20 %	40 %	40 %	433610429
129	NC_019849	CCGGT	2	10	193893	193902	0 %	20 %	40 %	40 %	433610431
130	NC_019849	GGCGC	2	10	194337	194346	0 %	0 %	60 %	40 %	433610431
131	NC_019849	CGATC	2	10	198089	198098	20 %	20 %	20 %	40 %	433610433
132	NC_019849	GCCCA	2	10	198950	198959	20 %	0 %	20 %	60 %	433610434
133	NC_019849	AGGGC	2	10	200342	200351	20 %	0 %	60 %	20 %	433610435
134	NC_019849	GCCCG	2	10	201269	201278	0 %	0 %	40 %	60 %	433610436
135	NC_019849	GCGCG	2	10	202377	202386	0 %	0 %	60 %	40 %	433610438
136	NC_019849	GCGAC	2	10	203118	203127	20 %	0 %	40 %	40 %	433610438
137	NC_019849	GGGCA	2	10	208877	208886	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019849	GAAGC	2	10	209158	209167	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019849	CAGCC	2	10	209502	209511	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_019849	ACCTC	2	10	214422	214431	20 %	20 %	0 %	60 %	433610450
141	NC_019849	CGGCG	2	10	215238	215247	0 %	0 %	60 %	40 %	433610451
142	NC_019849	GCGAT	2	10	215300	215309	20 %	20 %	40 %	20 %	433610451
143	NC_019849	ATCCG	2	10	215336	215345	20 %	20 %	20 %	40 %	433610451
144	NC_019849	CGGCG	2	10	215944	215953	0 %	0 %	60 %	40 %	433610451
145	NC_019849	CTGCC	2	10	216143	216152	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
146	NC_019849	GGCAG	2	10	216303	216312	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019849	TCTTG	2	10	217277	217286	0 %	60 %	20 %	20 %	433610452
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149	NC_019849	CAGAA	2	10	222158	222167	60 %	0 %	20 %	20 %	433610456
150	NC_019849	TGCGC	2	10	222514	222523	0 %	20 %	40 %	40 %	433610457
151	NC_019849	AGCGC	2	10	224166	224175	20 %	0 %	40 %	40 %	433610459
152	NC_019849	GATCA	2	10	230663	230672	40 %	20 %	20 %	20 %	433610464
153	NC_019849	TTGAA	2	10	230838	230847	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019849	AGGGA	2	10	231145	231154	40 %	0 %	60 %	0 %	433610465
155	NC_019849	CGGCG	2	10	231590	231599	0 %	0 %	60 %	40 %	433610466
156	NC_019849	GATGT	2	10	232522	232531	20 %	40 %	40 %	0 %	433610466
157	NC_019849	CAGTG	2	10	233537	233546	20 %	20 %	40 %	20 %	433610467
158	NC_019849	GGCCG	2	10	234383	234392	0 %	0 %	60 %	40 %	433610468
159	NC_019849	AGCGC	2	10	235240	235249	20 %	0 %	40 %	40 %	433610469
160	NC_019849	TGCGA	2	10	236043	236052	20 %	20 %	40 %	20 %	433610469
161	NC_019849	GTCGC	2	10	236238	236247	0 %	20 %	40 %	40 %	433610469
162	NC_019849	GGCCG	2	10	242946	242955	0 %	0 %	60 %	40 %	433610475
163	NC_019849	GCGCC	2	10	246017	246026	0 %	0 %	40 %	60 %	433610478
164	NC_019849	CCGGC	2	10	246711	246720	0 %	0 %	40 %	60 %	433610480
165	NC_019849	GCGAC	2	10	249764	249773	20 %	0 %	40 %	40 %	433610484
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167	NC_019849	GGAGA	2	10	250082	250091	40 %	0 %	60 %	0 %	433610485
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171	NC_019849	GCCTT	2	10	254795	254804	0 %	40 %	20 %	40 %	433610488
172	NC_019849	AGCAC	2	10	256583	256592	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
173	NC_019849	CGGCG	2	10	257385	257394	0 %	0 %	60 %	40 %	433610490
174	NC_019849	CGGCG	2	10	257688	257697	0 %	0 %	60 %	40 %	433610491
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196	NC_019849	GTCGA	2	10	300084	300093	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
197	NC_019849	GCACG	2	10	300852	300861	20 %	0 %	40 %	40 %	433610533
198	NC_019849	GATTG	2	10	306172	306181	20 %	40 %	40 %	0 %	433610538
199	NC_019849	ACGCG	2	10	308622	308631	20 %	0 %	40 %	40 %	433610539
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201	NC_019849	TGGAA	2	10	313930	313939	40 %	20 %	40 %	0 %	433610546
202	NC_019849	TATGC	2	10	314009	314018	20 %	40 %	20 %	20 %	433610546
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207	NC_019849	AGGAC	2	10	324097	324106	40 %	0 %	40 %	20 %	433610552
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209	NC_019849	CAGAA	2	10	326242	326251	60 %	0 %	20 %	20 %	433610555
210	NC_019849	TTGGC	2	10	326794	326803	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
211	NC_019849	CCGGA	2	10	326914	326923	20 %	0 %	40 %	40 %	433610556
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216	NC_019849	CGACC	2	10	338796	338805	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
217	NC_019849	AGTGA	2	10	339032	339041	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
218	NC_019849	CGCCT	2	10	340700	340709	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
219	NC_019849	TCGTC	2	10	341985	341994	0 %	40 %	20 %	40 %	433610572
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221	NC_019849	TGGCA	2	10	346078	346087	20 %	20 %	40 %	20 %	433610579
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233	NC_019849	GAATG	2	10	354343	354352	40 %	20 %	40 %	0 %	433610586
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239	NC_019849	GGGCC	2	10	362896	362905	0 %	0 %	60 %	40 %	433610597
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243	NC_019849	CGTTG	2	10	364914	364923	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
244	NC_019849	ACGAC	2	10	365889	365898	40 %	0 %	20 %	40 %	433610599
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248	NC_019849	CGCTG	2	10	367520	367529	0 %	20 %	40 %	40 %	433610600
249	NC_019849	CGGCA	2	10	368050	368059	20 %	0 %	40 %	40 %	433610600
250	NC_019849	CGGCG	2	10	368687	368696	0 %	0 %	60 %	40 %	433610601
251	NC_019849	CAGGA	2	10	369907	369916	40 %	0 %	40 %	20 %	433610603
252	NC_019849	GTTCC	2	10	373745	373754	0 %	40 %	20 %	40 %	433610609
253	NC_019849	GCCGT	2	10	376185	376194	0 %	20 %	40 %	40 %	433610611
254	NC_019849	GCAGC	2	10	377552	377561	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
255	NC_019849	CCGAG	2	10	379152	379161	20 %	0 %	40 %	40 %	433610614
256	NC_019849	GATCA	2	10	379454	379463	40 %	20 %	20 %	20 %	433610614
257	NC_019849	CGGTG	2	10	380911	380920	0 %	20 %	60 %	20 %	433610615
258	NC_019849	TGCGC	2	10	381576	381585	0 %	20 %	40 %	40 %	433610616
259	NC_019849	GCCTC	2	10	383319	383328	0 %	20 %	20 %	60 %	433610619
260	NC_019849	GGCGA	2	10	383378	383387	20 %	0 %	60 %	20 %	433610619
261	NC_019849	GCCGT	2	10	384969	384978	0 %	20 %	40 %	40 %	433610621
262	NC_019849	CGAGC	2	10	386607	386616	20 %	0 %	40 %	40 %	433610622
263	NC_019849	GGAGA	2	10	386658	386667	40 %	0 %	60 %	0 %	433610622
264	NC_019849	GCCCG	2	10	388506	388515	0 %	0 %	40 %	60 %	433610623
265	NC_019849	GCGCT	2	10	389184	389193	0 %	20 %	40 %	40 %	433610624
266	NC_019849	CGATG	2	10	390514	390523	20 %	20 %	40 %	20 %	433610625
267	NC_019849	GTCGG	2	10	391267	391276	0 %	20 %	60 %	20 %	433610625
268	NC_019849	GTCGC	2	10	396991	397000	0 %	20 %	40 %	40 %	433610631
269	NC_019849	GGATG	2	10	397827	397836	20 %	20 %	60 %	0 %	433610632
270	NC_019849	CCCAT	2	10	406160	406169	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
271	NC_019849	GGGAT	2	10	406175	406184	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
272	NC_019849	CAGAT	2	10	406363	406372	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
273	NC_019849	GCTGC	2	10	406579	406588	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
274	NC_019849	CGAGG	2	10	408983	408992	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
275	NC_019849	GGATC	2	10	411763	411772	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
276	NC_019849	TCGCC	2	10	412060	412069	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
277	NC_019849	TTCCA	2	10	412809	412818	20 %	40 %	0 %	40 %	433610648
278	NC_019849	CGAAG	2	10	415281	415290	40 %	0 %	40 %	20 %	433610650
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392	NC_019849	GAAAC	2	10	590217	590226	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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