MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4d

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019849	CGATC	2	10	9781	9790	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019849	GGGGC	2	10	9988	9997	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019849	GTAAT	2	10	15373	15382	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019849	GTTGC	2	10	18654	18663	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019849	GAGGG	2	10	28530	28539	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019849	GGTCG	2	10	28884	28893	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019849	TCCAC	2	10	32823	32832	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_019849	TGCCG	2	10	60981	60990	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_019849	GCCGA	2	10	77220	77229	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019849	CTGCC	2	10	87266	87275	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_019849	GGCCG	2	10	102780	102789	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_019849	GGTCC	2	10	107479	107488	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019849	GGCCA	2	10	114652	114661	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_019849	CAACT	2	10	122331	122340	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_019849	TGCAG	2	10	126820	126829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019849	TTGCG	2	10	126878	126887	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019849	TTCCT	2	10	140438	140447	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_019849	GGGGA	2	10	142076	142085	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019849	AGCCG	2	10	148664	148673	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_019849	CAAAG	2	10	160544	160553	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019849	CGAAG	2	10	161258	161267	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019849	GGGCA	2	10	208877	208886	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019849	GAAGC	2	10	209158	209167	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019849	CAGCC	2	10	209502	209511	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_019849	CTGCC	2	10	216143	216152	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_019849	GGCAG	2	10	216303	216312	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019849	TTGAA	2	10	230838	230847	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019849	AGCAC	2	10	256583	256592	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_019849	GTCGA	2	10	300084	300093	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019849	AGCGG	2	10	324835	324844	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019849	TTGGC	2	10	326794	326803	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019849	TCCCG	2	10	334986	334995	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_019849	CGACC	2	10	338796	338805	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_019849	AGTGA	2	10	339032	339041	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019849	CGCCT	2	10	340700	340709	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_019849	GGAGG	2	10	344576	344585	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019849	TTGCA	2	10	350475	350484	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019849	GGCCG	2	10	354277	354286	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_019849	GACCT	2	10	360148	360157	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_019849	CGTTG	2	10	364914	364923	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019849	GCAGC	2	10	377552	377561	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_019849	CCCAT	2	10	406160	406169	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_019849	GGGAT	2	10	406175	406184	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019849	CAGAT	2	10	406363	406372	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_019849	GCTGC	2	10	406579	406588	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_019849	CGAGG	2	10	408983	408992	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019849	GGATC	2	10	411763	411772	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019849	TCGCC	2	10	412060	412069	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_019849	TGCAA	2	10	437896	437905	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019849	ACAAA	2	10	459920	459929	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019849	GGTCG	2	10	464239	464248	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019849	GTTTT	2	10	487726	487735	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019849	CGGGA	2	10	498384	498393	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019849	CCGCA	2	10	510691	510700	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_019849	GGGAG	2	10	529918	529927	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019849	CCGGC	2	10	560843	560852	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_019849	ATCAG	2	10	565840	565849	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019849	AAAAC	2	10	584288	584297	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019849	TCGGA	2	10	590201	590210	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019849	GAAAC	2	10	590217	590226	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019849	GTGCG	2	10	606470	606479	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019849	CCTTG	2	10	621251	621260	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_019849	CCCCG	2	10	625961	625970	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_019849	TCCGG	2	10	626591	626600	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_019849	GAGCG	2	10	630963	630972	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_019849	GGGCA	2	10	632983	632992	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019849	TCTAG	2	10	641900	641909	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019849	GAGCG	2	10	646224	646233	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019849	CGCCC	2	10	648805	648814	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
70	NC_019849	AAATC	2	10	672638	672647	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_019849	TCCGG	2	10	694090	694099	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_019849	GGTCG	2	10	710909	710918	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019849	CCTCG	2	10	711588	711597	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_019849	TGCGA	2	10	713353	713362	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019849	GACGT	2	10	739117	739126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019849	GGGCG	2	10	739215	739224	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019849	CTTCG	2	10	751454	751463	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_019849	TTTTA	2	10	757196	757205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019849	GCCCT	2	10	758043	758052	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_019849	GGAGG	2	10	767851	767860	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019849	AGAGC	2	10	773640	773649	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019849	ATTTG	2	10	800851	800860	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019849	CGACC	2	10	818040	818049	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_019849	AGTGA	2	10	822532	822541	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019849	CGCAT	2	10	845399	845408	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_019849	GCCGC	2	10	851021	851030	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_019849	GGCGG	2	10	877481	877490	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019849	GCAAG	2	10	889775	889784	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019849	AAAAT	2	10	906815	906824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019849	CTTCG	2	10	912453	912462	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_019849	TCCCG	2	10	915302	915311	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_019849	TTTCA	2	10	919037	919046	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_019849	ATCAC	2	10	933691	933700	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_019849	TTGCG	2	10	937831	937840	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019849	GTGCA	2	10	948990	948999	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_019849	CGGGT	2	10	955612	955621	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_019849	GTCGC	2	10	998773	998782	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_019849	CGGCC	2	10	998790	998799	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_019849	CGCCC	2	10	1005704	1005713	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
100	NC_019849	ACCGT	2	10	1031619	1031628	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_019849	CCGAG	2	10	1049991	1050000	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_019849	GGATG	2	10	1051470	1051479	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019849	GAAAC	2	10	1051491	1051500	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019849	CAACT	2	10	1053949	1053958	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_019849	GTCCC	2	10	1064053	1064062	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_019849	GCTCT	2	10	1067887	1067896	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_019849	CCGAA	2	10	1068654	1068663	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_019849	CCGGA	2	10	1074309	1074318	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_019849	TGATC	2	10	1074451	1074460	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019849	TCGGC	2	10	1077514	1077523	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_019849	TGCGG	2	10	1078802	1078811	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_019849	CGGTG	2	10	1081803	1081812	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019849	CAAAA	2	10	1082270	1082279	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019849	GTTCG	2	10	1088332	1088341	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019849	CAGAG	2	10	1090734	1090743	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019849	GAAGC	2	10	1090882	1090891	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019849	GCCGC	2	10	1096600	1096609	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_019849	GTTGG	2	10	1102627	1102636	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019849	CTAAC	2	10	1102901	1102910	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_019849	ATCGC	2	10	1103458	1103467	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_019849	GATCG	2	10	1103687	1103696	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019849	CCCGG	2	10	1106102	1106111	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
123	NC_019849	GCCGG	2	10	1107223	1107232	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_019849	GGACA	2	10	1116921	1116930	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_019849	TCCAT	2	10	1153497	1153506	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_019849	GCGCC	2	10	1154640	1154649	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
127	NC_019849	GTCCC	2	10	1161909	1161918	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_019849	AAATC	2	10	1167307	1167316	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_019849	TCTGG	2	10	1176734	1176743	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019849	CGCGC	2	10	1177097	1177106	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_019849	TTGTT	2	10	1184665	1184674	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019849	CCCGG	2	10	1187563	1187572	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
133	NC_019849	GAAAG	2	10	1189579	1189588	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019849	CGGTG	2	10	1191033	1191042	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019849	GCGCC	2	10	1194085	1194094	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_019849	AGCCT	2	10	1197932	1197941	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_019849	CGAAG	2	10	1206980	1206989	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019849	GAGCT	2	10	1209630	1209639	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019849	CGCGC	2	10	1217831	1217840	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_019849	CTTCC	2	10	1224320	1224329	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_019849	CGACG	2	10	1249659	1249668	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_019849	AGACG	2	10	1251134	1251143	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_019849	ACTCC	2	10	1254021	1254030	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
144	NC_019849	GATTC	2	10	1285239	1285248	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019849	TTCCG	2	10	1296553	1296562	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_019849	AAACG	2	10	1301097	1301106	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019849	CGCCA	2	10	1304707	1304716	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
148	NC_019849	GAAAG	2	10	1316882	1316891	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019849	CTGCC	2	10	1319417	1319426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
150	NC_019849	TAGAG	2	10	1324741	1324750	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_019849	GACAG	2	10	1388849	1388858	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_019849	ATCAA	2	10	1468028	1468037	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_019849	CTTTC	2	10	1478492	1478501	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_019849	CCAAG	2	10	1512937	1512946	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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179	NC_019849	CTTCG	2	10	1638730	1638739	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_019849	GGCGC	2	10	1652368	1652377	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
182	NC_019849	TGCCG	2	10	1674372	1674381	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
183	NC_019849	CGACC	2	10	1678414	1678423	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
184	NC_019849	GACCC	2	10	1683336	1683345	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
185	NC_019849	CTCGC	2	10	1683420	1683429	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
186	NC_019849	ATGTT	2	10	1690091	1690100	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.