MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4c

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019848	CTGACG	2	12	8743	8754	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019848	TCCCGA	2	12	29651	29662	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019848	GATGCC	2	12	33231	33242	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019848	CTGCCG	2	12	36773	36784	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019848	ACTGCC	2	12	47649	47660	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019848	CGCGCT	2	12	48047	48058	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019848	TTGCCG	2	12	56846	56857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019848	GGACCG	2	12	92687	92698	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019848	CAGTGA	2	12	108673	108684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019848	CGTTCT	2	12	150741	150752	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019848	TGCAGC	2	12	160109	160120	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019848	TGCCAT	2	12	182081	182092	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019848	TCTGGC	2	12	223633	223644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019848	CGCGGA	2	12	255648	255659	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019848	AAGACG	2	12	272239	272250	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019848	ACCGGA	2	12	290586	290597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019848	CGTCGC	2	12	310910	310921	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019848	CGGACG	2	12	312897	312908	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019848	AGAAAC	2	12	330654	330665	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019848	TTAGAT	2	12	348283	348294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019848	AAAGCA	2	12	388040	388051	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019848	CGGAAA	2	12	392463	392474	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019848	GTTTCG	2	12	394831	394842	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019848	CCCGGA	2	12	404588	404599	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019848	CAGCGG	2	12	453153	453164	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019848	GAATTT	2	12	488354	488365	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019848	TTGGCT	2	12	495784	495795	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019848	GCCAGA	2	12	498136	498147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019848	GACGAA	2	12	553524	553535	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019848	ATCCGG	2	12	561191	561202	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019848	CCAAGG	2	12	575520	575531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019848	TGGAGC	2	12	598691	598702	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019848	TGCGGC	2	12	601080	601091	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019848	GCAGGG	2	12	635708	635719	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019848	CCGGCC	2	12	656909	656920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_019848	TTCGTC	2	12	659524	659535	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019848	CGTCAG	2	12	721889	721900	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019848	GCGCAA	2	12	745847	745858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019848	CGCTGA	2	12	749562	749573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019848	CTGCGG	2	12	763420	763431	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019848	GACGAA	2	12	771920	771931	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019848	GCGTCG	2	12	797367	797378	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019848	AGCTCG	2	12	806023	806034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019848	AGACAG	2	12	838533	838544	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019848	CACTCA	2	12	839968	839979	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019848	TAATCG	2	12	875403	875414	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019848	GATCGA	2	12	894925	894936	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019848	TGCGAG	2	12	899431	899442	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019848	ATCTCG	2	12	903994	904005	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019848	GCCGGA	2	12	905949	905960	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019848	TTCCCT	2	12	908474	908485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019848	GAGCGG	2	12	909170	909181	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019848	CGAGAA	2	12	981994	982005	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019848	ATGCAA	2	12	994855	994866	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019848	CGTCCT	2	12	1002879	1002890	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019848	TGCGAC	2	12	1016210	1016221	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019848	GTCGAC	2	12	1040311	1040322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019848	TTCGTC	2	12	1070807	1070818	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019848	GCGTCG	2	12	1129019	1129030	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019848	TGGGAC	2	12	1129406	1129417	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019848	GAGGAC	2	12	1253342	1253353	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019848	CGGCGC	2	12	1293281	1293292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019848	CCCCCT	2	12	1363691	1363702	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.