MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4c

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019848	GGTTG	2	10	22846	22855	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019848	ATTTT	2	10	24023	24032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019848	TCTAT	2	10	25496	25505	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019848	GATCC	2	10	47613	47622	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_019848	TCTTT	2	10	47910	47919	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019848	CGCGG	2	10	47954	47963	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_019848	TTTTC	2	10	48011	48020	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019848	ACTCG	2	10	56760	56769	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_019848	TACCT	2	10	59075	59084	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019848	CGTTT	2	10	59166	59175	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019848	GGATG	2	10	82163	82172	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019848	GCAAT	2	10	83590	83599	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019848	CAGGA	2	10	85865	85874	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019848	ATTTA	2	10	94205	94214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019848	AAAAT	2	10	94216	94225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019848	GCCGG	2	10	96945	96954	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_019848	CAGAC	2	10	102607	102616	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_019848	AGATG	2	10	105477	105486	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019848	CCCGG	2	10	107456	107465	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_019848	GCTTT	2	10	108566	108575	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019848	GGCGA	2	10	108770	108779	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019848	TGCGT	2	10	115193	115202	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019848	CTAGT	2	10	132886	132895	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019848	ATCAC	2	10	136956	136965	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_019848	ACGAG	2	10	138565	138574	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019848	TCGGA	2	10	142070	142079	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019848	TGGGA	2	10	155893	155902	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019848	CGGTC	2	10	173711	173720	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_019848	CGAGG	2	10	179333	179342	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019848	AACCC	2	10	179969	179978	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_019848	GAATA	2	10	183209	183218	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019848	GTCAT	2	10	189747	189756	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019848	TTGCA	2	10	193584	193593	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019848	ACAGA	2	10	193603	193612	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019848	GCCGG	2	10	202223	202232	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_019848	TCGCG	2	10	202692	202701	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_019848	TGCTT	2	10	203131	203140	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019848	CTATA	2	10	211323	211332	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019848	TGCCA	2	10	212129	212138	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_019848	GATGA	2	10	219420	219429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019848	ATCGT	2	10	221368	221377	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019848	CAACA	2	10	232115	232124	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_019848	ATGAG	2	10	234361	234370	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019848	GCTCG	2	10	237770	237779	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_019848	ATTCA	2	10	251119	251128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019848	GGCGT	2	10	258614	258623	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019848	TTTCG	2	10	258650	258659	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019848	GCTTC	2	10	268883	268892	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019848	GATGC	2	10	272070	272079	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019848	TGAGT	2	10	274256	274265	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019848	CAAGG	2	10	283205	283214	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019848	TGCAG	2	10	295932	295941	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019848	TCGGA	2	10	316703	316712	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019848	GCCGG	2	10	316797	316806	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_019848	AACGG	2	10	324361	324370	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019848	CAAAT	2	10	330766	330775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_019848	GCGGT	2	10	330808	330817	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019848	TCTGC	2	10	339920	339929	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_019848	ACTGT	2	10	340839	340848	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019848	AACTG	2	10	342699	342708	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019848	GCTTG	2	10	346615	346624	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019848	CCGTT	2	10	352646	352655	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_019848	CCAAA	2	10	369245	369254	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_019848	GGCAG	2	10	369875	369884	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_019848	TTTCC	2	10	385595	385604	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019848	AGACG	2	10	388030	388039	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019848	ACGGT	2	10	397062	397071	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019848	CGGAC	2	10	404455	404464	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_019848	GGGCG	2	10	409635	409644	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019848	TATTT	2	10	410221	410230	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019848	GCGTA	2	10	410977	410986	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_019848	CAGAA	2	10	419064	419073	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019848	GCGCT	2	10	421633	421642	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_019848	CCGCT	2	10	422693	422702	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_019848	CGTCT	2	10	426376	426385	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_019848	AGAGG	2	10	453183	453192	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019848	GCTTG	2	10	462853	462862	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019848	AGCAG	2	10	462943	462952	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019848	GACCT	2	10	470457	470466	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_019848	GCTCC	2	10	474074	474083	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_019848	GCGGG	2	10	474171	474180	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019848	CGTTG	2	10	474221	474230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019848	TGGGA	2	10	485759	485768	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019848	CGAAG	2	10	486406	486415	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_019848	TGGCT	2	10	487985	487994	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019848	CCTGA	2	10	489493	489502	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_019848	TTGTT	2	10	502989	502998	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019848	GTCGC	2	10	507195	507204	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_019848	ACGCG	2	10	507578	507587	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_019848	GAGCG	2	10	513002	513011	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_019848	CGAAT	2	10	513883	513892	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_019848	CCCCG	2	10	516353	516362	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
93	NC_019848	GGCGC	2	10	517321	517330	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_019848	GCTCT	2	10	518317	518326	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_019848	CCGCT	2	10	522414	522423	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_019848	CCCGG	2	10	527816	527825	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
97	NC_019848	AAGCG	2	10	528080	528089	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019848	GACAC	2	10	542724	542733	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_019848	GCGCC	2	10	543647	543656	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_019848	CGCGG	2	10	567514	567523	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_019848	AGTTT	2	10	575360	575369	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019848	GCCAC	2	10	580074	580083	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_019848	GGCGA	2	10	603604	603613	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019848	GGGGA	2	10	610828	610837	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019848	CGACG	2	10	622391	622400	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_019848	CAAAA	2	10	638683	638692	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019848	AGCAC	2	10	649402	649411	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_019848	CGACA	2	10	654450	654459	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_019848	AAGGC	2	10	659018	659027	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019848	GACGC	2	10	676972	676981	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_019848	AGGTG	2	10	677226	677235	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019848	TCGAT	2	10	677341	677350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019848	GGCGA	2	10	682188	682197	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019848	GCACC	2	10	711964	711973	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_019848	TCTAT	2	10	722809	722818	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019848	TGGCA	2	10	732328	732337	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019848	GCGCT	2	10	732584	732593	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_019848	TGCTG	2	10	745764	745773	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019848	GCTCT	2	10	745785	745794	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_019848	GGCTG	2	10	749630	749639	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019848	GGCCC	2	10	762883	762892	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_019848	AGGGG	2	10	766267	766276	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019848	CGGGG	2	10	783024	783033	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019848	CCAAG	2	10	783081	783090	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019848	GTCTT	2	10	784617	784626	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_019848	CCAGG	2	10	785646	785655	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_019848	TTGAT	2	10	785960	785969	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019848	ACTAG	2	10	792646	792655	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_019848	CGCGG	2	10	803319	803328	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
130	NC_019848	CGGCC	3	15	805642	805656	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_019848	CTTTG	2	10	807972	807981	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019848	CCGTC	2	10	810679	810688	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_019848	CTTTC	2	10	817898	817907	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_019848	GCGCC	2	10	823478	823487	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
135	NC_019848	GCCGC	2	10	825233	825242	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_019848	CCCGG	2	10	838147	838156	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_019848	CTGGG	2	10	845123	845132	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019848	AGTTG	2	10	863435	863444	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019848	CCATC	2	10	875719	875728	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
140	NC_019848	CCGCT	2	10	878190	878199	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_019848	CGGGG	2	10	878230	878239	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
142	NC_019848	CCTGC	2	10	879362	879371	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_019848	CGTGC	2	10	879982	879991	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_019848	AAAGC	2	10	881725	881734	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019848	CTTCT	2	10	885456	885465	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_019848	CAGCA	2	10	886034	886043	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_019848	AACCG	2	10	886534	886543	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_019848	CGAAA	2	10	897974	897983	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_019848	TCTCC	2	10	904613	904622	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
150	NC_019848	CGGCT	2	10	908994	909003	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_019848	TTCAA	2	10	913199	913208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_019848	GGAAA	2	10	923121	923130	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019848	GAAAG	2	10	929190	929199	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019848	CAGCG	2	10	958145	958154	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
155	NC_019848	GTCGG	2	10	960880	960889	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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158	NC_019848	TCGAA	2	10	984439	984448	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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160	NC_019848	GAGCG	2	10	1006879	1006888	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
161	NC_019848	GACCC	2	10	1009022	1009031	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
162	NC_019848	CTCGC	2	10	1009106	1009115	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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164	NC_019848	TGCGG	2	10	1040602	1040611	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
165	NC_019848	GCCCG	2	10	1052619	1052628	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
166	NC_019848	GTATT	2	10	1054767	1054776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_019848	CGAAA	2	10	1069902	1069911	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_019848	CGATA	2	10	1128076	1128085	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_019848	CCTGG	2	10	1145283	1145292	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_019848	GTCTA	2	10	1156937	1156946	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
182	NC_019848	GACCC	2	10	1160911	1160920	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
183	NC_019848	CTCGC	2	10	1160995	1161004	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
184	NC_019848	GGAAA	2	10	1163860	1163869	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
185	NC_019848	GGCAC	2	10	1172052	1172061	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
186	NC_019848	GGGAC	2	10	1173468	1173477	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
187	NC_019848	GGCCA	2	10	1185355	1185364	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
188	NC_019848	CCCTG	2	10	1189897	1189906	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
189	NC_019848	AAGCG	2	10	1194045	1194054	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
190	NC_019848	GATTG	2	10	1198454	1198463	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
191	NC_019848	GACCC	2	10	1205770	1205779	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
192	NC_019848	CTCGC	2	10	1205854	1205863	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
193	NC_019848	GTGAA	2	10	1211884	1211893	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
194	NC_019848	TCCAG	2	10	1231414	1231423	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
195	NC_019848	TCGAC	2	10	1232206	1232215	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
196	NC_019848	TGAGG	2	10	1243602	1243611	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
197	NC_019848	TAGCG	2	10	1260658	1260667	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
198	NC_019848	AAGTC	2	10	1288984	1288993	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
199	NC_019848	GGTCG	2	10	1301618	1301627	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
200	NC_019848	CTCAT	2	10	1311457	1311466	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
201	NC_019848	TCCGT	2	10	1336916	1336925	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
202	NC_019848	TTGGC	2	10	1367057	1367066	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
203	NC_019848	GCGCC	2	10	1370096	1370105	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
204	NC_019848	TCTTT	2	10	1370154	1370163	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
205	NC_019848	CAATT	2	10	1370230	1370239	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
206	NC_019848	CTGAC	2	10	1397104	1397113	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
207	NC_019848	ACCTT	2	10	1416197	1416206	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
208	NC_019848	GCCCT	2	10	1416495	1416504	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.