MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4b

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019847	CATGC	2	10	11180	11189	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019847	GCTTT	2	10	15588	15597	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019847	GGCGG	2	10	17610	17619	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019847	AAAGG	2	10	41232	41241	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019847	GGTGG	2	10	43978	43987	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019847	TCGGC	2	10	51050	51059	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_019847	GGAAA	2	10	54816	54825	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019847	CGTTT	2	10	61835	61844	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019847	CTTCG	2	10	63029	63038	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019847	AGGGA	2	10	65030	65039	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019847	TGCAT	2	10	65513	65522	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019847	GGAAG	2	10	66092	66101	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019847	CGTTT	2	10	69315	69324	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019847	GACGA	2	10	70145	70154	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019847	CCGTA	2	10	73363	73372	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019847	CCTTC	2	10	75896	75905	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_019847	GAGGG	2	10	79137	79146	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019847	AGCAA	2	10	81135	81144	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019847	GGAGA	2	10	81576	81585	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019847	TTCTT	2	10	83862	83871	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019847	TCCGA	2	10	84604	84613	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_019847	GTTTT	2	10	85320	85329	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019847	GACCG	2	10	86957	86966	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019847	ACCGG	2	10	88474	88483	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_019847	GCCGA	2	10	88579	88588	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019847	CTTGC	2	10	101452	101461	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_019847	GCTTA	2	10	103283	103292	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019847	CCGTC	2	10	108691	108700	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_019847	AAAGG	2	10	118605	118614	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019847	GTTAT	2	10	120176	120185	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019847	ATGGC	2	10	124247	124256	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019847	CAAAA	2	10	128511	128520	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019847	GCCGC	2	10	134910	134919	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_019847	TTTGG	2	10	141418	141427	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019847	CTTTG	2	10	146389	146398	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019847	CGGGA	2	10	146484	146493	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019847	CCCCG	2	10	154644	154653	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
38	NC_019847	AGGTC	2	10	159322	159331	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019847	GCGTG	2	10	159462	159471	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019847	CCGCC	2	10	159476	159485	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
41	NC_019847	TAATT	2	10	180991	181000	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019847	GCGCA	2	10	188633	188642	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_019847	TCGCC	2	10	189235	189244	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_019847	CGAGC	2	10	189742	189751	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_019847	GGGCT	2	10	190055	190064	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019847	GCGCG	2	10	190100	190109	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_019847	GCGTA	2	10	190301	190310	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019847	TTGTT	2	10	201956	201965	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019847	TCGCC	2	10	208064	208073	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_019847	GGCTG	2	10	208922	208931	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019847	AGAAA	2	10	213158	213167	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019847	GCCCG	2	10	215841	215850	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_019847	AGCGG	2	10	220812	220821	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.