MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4b

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019847	AGTT	2	8	6427	6434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019847	CCCG	2	8	8836	8843	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_019847	CTGC	2	8	10839	10846	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019847	CTTC	2	8	11093	11100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019847	CCAA	2	8	11104	11111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019847	TGCG	2	8	12751	12758	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019847	ACCG	2	8	12918	12925	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019847	GCCC	2	8	13038	13045	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_019847	CCGA	2	8	15395	15402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019847	GCCG	2	8	15667	15674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019847	CCCA	2	8	15785	15792	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_019847	GCTC	2	8	17474	17481	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019847	AGCC	2	8	17507	17514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019847	TGGC	2	8	17694	17701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019847	GCTT	2	8	17821	17828	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019847	CGAA	2	8	19802	19809	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019847	CAGC	2	8	22720	22727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019847	CTTC	2	8	24024	24031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019847	GTAT	2	8	30096	30103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019847	GGCG	2	8	30613	30620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019847	GGCC	2	8	31054	31061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019847	AATT	2	8	32794	32801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019847	AGGG	2	8	32920	32927	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019847	TCCG	2	8	34564	34571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019847	TCGC	2	8	37856	37863	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019847	TCGA	2	8	38043	38050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019847	CAAA	2	8	40340	40347	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019847	CCAC	2	8	41365	41372	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_019847	GGGC	2	8	44046	44053	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019847	TCCG	2	8	47423	47430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019847	GACC	2	8	50483	50490	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019847	TCAG	2	8	50688	50695	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019847	CGCC	2	8	50706	50713	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_019847	GACA	2	8	50786	50793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019847	GCCC	2	8	53345	53352	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_019847	CGGG	2	8	53760	53767	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019847	GCCG	2	8	53910	53917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019847	GGCA	2	8	54440	54447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019847	CCAG	2	8	56050	56057	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019847	TTCC	2	8	56464	56471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019847	GTTG	2	8	56480	56487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019847	CCGG	2	8	56813	56820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019847	TTGA	2	8	57294	57301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019847	CCAA	2	8	60080	60087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019847	GAGG	2	8	60207	60214	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019847	TCCG	2	8	60640	60647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019847	CCAT	2	8	60907	60914	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019847	ACCA	2	8	61755	61762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019847	GCGG	2	8	61956	61963	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019847	GTTG	2	8	63420	63427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019847	TTCG	2	8	63488	63495	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019847	TGAG	2	8	63574	63581	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019847	TCGA	2	8	63920	63927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019847	CCGA	2	8	64956	64963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019847	GGCA	2	8	65219	65226	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019847	GGGC	2	8	65728	65735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019847	TTCA	2	8	66036	66043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019847	GTTG	2	8	66321	66328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019847	TTCG	2	8	69037	69044	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019847	GGAC	2	8	69069	69076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019847	TCGC	2	8	70208	70215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019847	GATC	2	8	70263	70270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019847	ATCG	2	8	70621	70628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019847	TCGA	2	8	71115	71122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019847	CAGT	2	8	72943	72950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019847	GCGG	2	8	73107	73114	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019847	ACGA	2	8	73521	73528	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019847	GGGC	2	8	73628	73635	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019847	GACA	2	8	73888	73895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019847	TCGC	2	8	74670	74677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019847	CCCG	2	8	75003	75010	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_019847	CAAA	2	8	75179	75186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019847	ACCG	2	8	75272	75279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019847	GCCC	2	8	76062	76069	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_019847	TCGC	2	8	76156	76163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019847	GGAT	2	8	76215	76222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019847	GCCG	2	8	77949	77956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019847	CAAC	2	8	79849	79856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019847	TCGA	2	8	81029	81036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019847	TGCC	2	8	81094	81101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019847	CCGG	2	8	81666	81673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019847	GGTC	2	8	83647	83654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019847	CGTT	2	8	83788	83795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019847	GGGC	2	8	83897	83904	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019847	GCTG	2	8	84090	84097	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019847	TCGC	2	8	84588	84595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019847	TCCC	2	8	84690	84697	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_019847	GCCG	2	8	85810	85817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019847	CCGA	3	12	88254	88265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019847	TTAG	2	8	88894	88901	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019847	TTCG	2	8	89994	90001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019847	GCTC	2	8	91867	91874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019847	GGAT	2	8	92722	92729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019847	GTCA	2	8	93219	93226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019847	CCTT	2	8	93309	93316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019847	CCGA	2	8	93317	93324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019847	CCTT	2	8	95367	95374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019847	AACC	2	8	96717	96724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019847	TGAT	2	8	97761	97768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019847	CTGC	2	8	100298	100305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019847	TGGC	2	8	100334	100341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019847	GCGG	2	8	101046	101053	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019847	CGGG	2	8	101531	101538	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019847	ATTG	2	8	105319	105326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019847	AGCC	2	8	105595	105602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019847	AGCG	2	8	106919	106926	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019847	CGCT	2	8	107717	107724	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019847	GATC	2	8	107851	107858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019847	GTCC	2	8	117582	117589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019847	TTGG	2	8	118259	118266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019847	TTCG	2	8	118772	118779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019847	GTCC	2	8	119988	119995	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019847	AGCG	2	8	120720	120727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019847	AGCG	2	8	120754	120761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019847	AGTA	2	8	120906	120913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019847	ACAA	2	8	123782	123789	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019847	ACGA	2	8	124337	124344	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019847	GACC	2	8	124948	124955	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019847	TTGT	2	8	125042	125049	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019847	GCCG	2	8	125099	125106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019847	AATA	2	8	131424	131431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019847	AGGT	2	8	132867	132874	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019847	GCTG	2	8	140933	140940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019847	TGAT	2	8	140998	141005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019847	TGAT	2	8	141109	141116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019847	ACCG	2	8	143125	143132	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019847	ATCC	2	8	143233	143240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019847	GGAC	2	8	144219	144226	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019847	GTTT	2	8	145607	145614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019847	ACGT	2	8	146414	146421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019847	TGAC	2	8	146666	146673	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019847	GGAA	2	8	146964	146971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019847	CGGC	2	8	147542	147549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019847	TCGG	2	8	147659	147666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019847	GGCC	2	8	147980	147987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019847	TCCA	2	8	148564	148571	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019847	CTGG	2	8	148684	148691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019847	GCGG	2	8	148808	148815	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019847	AGGA	2	8	150802	150809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019847	TAGC	2	8	154129	154136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019847	GGAC	2	8	154333	154340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019847	GCGA	2	8	154795	154802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019847	ACAA	2	8	158064	158071	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019847	CCGC	2	8	159361	159368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
145	NC_019847	CCCG	2	8	160268	160275	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_019847	ACGA	2	8	160496	160503	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019847	CGGG	2	8	160602	160609	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_019847	ATAC	2	8	162671	162678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_019847	TGCG	2	8	178887	178894	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_019847	TTCA	2	8	179013	179020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019847	TCAG	2	8	180772	180779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_019847	GGTC	2	8	180789	180796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_019847	TGAT	2	8	180835	180842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_019847	TCAG	2	8	189759	189766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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173	NC_019847	GCCG	2	8	218576	218583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
174	NC_019847	CCAG	2	8	225455	225462	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.