MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4b

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019847	ACGA	2	8	312	319	50 %	0 %	25 %	25 %	433615301
2	NC_019847	AGCC	2	8	1300	1307	25 %	0 %	25 %	50 %	433615302
3	NC_019847	TGAA	2	8	1345	1352	50 %	25 %	25 %	0 %	433615302
4	NC_019847	TCAT	2	8	1437	1444	25 %	50 %	0 %	25 %	433615302
5	NC_019847	CGGC	2	8	1610	1617	0 %	0 %	50 %	50 %	433615302
6	NC_019847	CTGA	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	433615302
7	NC_019847	TGTC	2	8	1777	1784	0 %	50 %	25 %	25 %	433615302
8	NC_019847	GCTG	2	8	1882	1889	0 %	25 %	50 %	25 %	433615302
9	NC_019847	AGTT	2	8	2158	2165	25 %	50 %	25 %	0 %	433615302
10	NC_019847	CGAT	2	8	3386	3393	25 %	25 %	25 %	25 %	433615303
11	NC_019847	GATC	2	8	4168	4175	25 %	25 %	25 %	25 %	433615304
12	NC_019847	AGGG	2	8	4325	4332	25 %	0 %	75 %	0 %	433615305
13	NC_019847	GGCC	2	8	5175	5182	0 %	0 %	50 %	50 %	433615307
14	NC_019847	CAGC	2	8	5298	5305	25 %	0 %	25 %	50 %	433615307
15	NC_019847	GTTC	2	8	5349	5356	0 %	50 %	25 %	25 %	433615307
16	NC_019847	GACA	2	8	5396	5403	50 %	0 %	25 %	25 %	433615307
17	NC_019847	CGGC	2	8	5817	5824	0 %	0 %	50 %	50 %	433615307
18	NC_019847	TCAG	2	8	6041	6048	25 %	25 %	25 %	25 %	433615307
19	NC_019847	GTCC	2	8	7362	7369	0 %	25 %	25 %	50 %	433615308
20	NC_019847	GCGG	2	8	7371	7378	0 %	0 %	75 %	25 %	433615308
21	NC_019847	CGAC	2	8	7539	7546	25 %	0 %	25 %	50 %	433615308
22	NC_019847	CAAG	2	8	8389	8396	50 %	0 %	25 %	25 %	433615309
23	NC_019847	TTCC	2	8	9072	9079	0 %	50 %	0 %	50 %	433615310
24	NC_019847	GTTG	2	8	9514	9521	0 %	50 %	50 %	0 %	433615310
25	NC_019847	CTTC	2	8	9707	9714	0 %	50 %	0 %	50 %	433615310
26	NC_019847	TGCT	2	8	9995	10002	0 %	50 %	25 %	25 %	433615310
27	NC_019847	TGAT	2	8	10598	10605	25 %	50 %	25 %	0 %	433615310
28	NC_019847	TCAA	2	8	10685	10692	50 %	25 %	0 %	25 %	433615310
29	NC_019847	ACCG	2	8	13193	13200	25 %	0 %	25 %	50 %	433615311
30	NC_019847	CCAG	2	8	13261	13268	25 %	0 %	25 %	50 %	433615311
31	NC_019847	GTCT	2	8	13340	13347	0 %	50 %	25 %	25 %	433615311
32	NC_019847	GCTG	2	8	13610	13617	0 %	25 %	50 %	25 %	433615311
33	NC_019847	AAGG	2	8	14138	14145	50 %	0 %	50 %	0 %	433615311
34	NC_019847	TCGG	2	8	14242	14249	0 %	25 %	50 %	25 %	433615311
35	NC_019847	CTCG	2	8	14254	14261	0 %	25 %	25 %	50 %	433615311
36	NC_019847	GCCT	2	8	14948	14955	0 %	25 %	25 %	50 %	433615311
37	NC_019847	CCAG	2	8	15256	15263	25 %	0 %	25 %	50 %	433615311
38	NC_019847	TGAT	2	8	16025	16032	25 %	50 %	25 %	0 %	433615312
39	NC_019847	CTTG	2	8	16621	16628	0 %	50 %	25 %	25 %	433615312
40	NC_019847	TGGA	2	8	16649	16656	25 %	25 %	50 %	0 %	433615312
41	NC_019847	GCTG	2	8	16725	16732	0 %	25 %	50 %	25 %	433615312
42	NC_019847	GGCT	2	8	16802	16809	0 %	25 %	50 %	25 %	433615312
43	NC_019847	GGCT	2	8	16982	16989	0 %	25 %	50 %	25 %	433615312
44	NC_019847	TCGC	2	8	18277	18284	0 %	25 %	25 %	50 %	433615313
45	NC_019847	GCGT	2	8	19349	19356	0 %	25 %	50 %	25 %	433615314
46	NC_019847	GCCT	2	8	19978	19985	0 %	25 %	25 %	50 %	433615315
47	NC_019847	GTAA	2	8	20008	20015	50 %	25 %	25 %	0 %	433615315
48	NC_019847	GCTG	2	8	20408	20415	0 %	25 %	50 %	25 %	433615315
49	NC_019847	AGGC	2	8	20583	20590	25 %	0 %	50 %	25 %	433615315
50	NC_019847	GCAA	2	8	20666	20673	50 %	0 %	25 %	25 %	433615315
51	NC_019847	TTCG	2	8	20842	20849	0 %	50 %	25 %	25 %	433615315
52	NC_019847	GAGC	2	8	21712	21719	25 %	0 %	50 %	25 %	433615316
53	NC_019847	CGGG	2	8	22614	22621	0 %	0 %	75 %	25 %	433615316
54	NC_019847	TCAG	2	8	23750	23757	25 %	25 %	25 %	25 %	433615318
55	NC_019847	TTGT	2	8	24146	24153	0 %	75 %	25 %	0 %	433615319
56	NC_019847	CGCC	2	8	24430	24437	0 %	0 %	25 %	75 %	433615319
57	NC_019847	GCCC	2	8	24440	24447	0 %	0 %	25 %	75 %	433615319
58	NC_019847	GGCC	2	8	25008	25015	0 %	0 %	50 %	50 %	433615319
59	NC_019847	GATC	2	8	25077	25084	25 %	25 %	25 %	25 %	433615319
60	NC_019847	CGGC	2	8	25818	25825	0 %	0 %	50 %	50 %	433615319
61	NC_019847	CGGC	2	8	26475	26482	0 %	0 %	50 %	50 %	433615320
62	NC_019847	ACGC	2	8	26584	26591	25 %	0 %	25 %	50 %	433615321
63	NC_019847	GCGG	2	8	26674	26681	0 %	0 %	75 %	25 %	433615321
64	NC_019847	ATCG	2	8	27479	27486	25 %	25 %	25 %	25 %	433615321
65	NC_019847	AAAC	2	8	27775	27782	75 %	0 %	0 %	25 %	433615321
66	NC_019847	CGGA	2	8	27951	27958	25 %	0 %	50 %	25 %	433615321
67	NC_019847	CCGA	2	8	28597	28604	25 %	0 %	25 %	50 %	433615322
68	NC_019847	AAGG	2	8	29912	29919	50 %	0 %	50 %	0 %	433615324
69	NC_019847	AGAA	2	8	30288	30295	75 %	0 %	25 %	0 %	433615325
70	NC_019847	GGCG	2	8	30298	30305	0 %	0 %	75 %	25 %	433615325
71	NC_019847	GGCG	2	8	30661	30668	0 %	0 %	75 %	25 %	433615326
72	NC_019847	CGCT	2	8	30773	30780	0 %	25 %	25 %	50 %	433615326
73	NC_019847	CCCA	2	8	30877	30884	25 %	0 %	0 %	75 %	433615326
74	NC_019847	ATCG	2	8	30931	30938	25 %	25 %	25 %	25 %	433615326
75	NC_019847	CGAC	2	8	32948	32955	25 %	0 %	25 %	50 %	433615329
76	NC_019847	GGTC	2	8	33275	33282	0 %	25 %	50 %	25 %	433615329
77	NC_019847	CGGA	2	8	33628	33635	25 %	0 %	50 %	25 %	433615329
78	NC_019847	GCGG	2	8	33838	33845	0 %	0 %	75 %	25 %	433615330
79	NC_019847	GTCG	2	8	33961	33968	0 %	25 %	50 %	25 %	433615330
80	NC_019847	CGGC	2	8	34430	34437	0 %	0 %	50 %	50 %	433615331
81	NC_019847	CTTC	2	8	35039	35046	0 %	50 %	0 %	50 %	433615332
82	NC_019847	CAGA	2	8	35114	35121	50 %	0 %	25 %	25 %	433615332
83	NC_019847	TTGG	2	8	35186	35193	0 %	50 %	50 %	0 %	433615332
84	NC_019847	CCAG	2	8	35196	35203	25 %	0 %	25 %	50 %	433615332
85	NC_019847	GCTG	2	8	36022	36029	0 %	25 %	50 %	25 %	433615333
86	NC_019847	TTGG	2	8	36284	36291	0 %	50 %	50 %	0 %	433615333
87	NC_019847	ATCG	2	8	36430	36437	25 %	25 %	25 %	25 %	433615333
88	NC_019847	AGGT	2	8	36810	36817	25 %	25 %	50 %	0 %	433615334
89	NC_019847	CAGG	2	8	37031	37038	25 %	0 %	50 %	25 %	433615334
90	NC_019847	GCAT	2	8	39860	39867	25 %	25 %	25 %	25 %	433615338
91	NC_019847	CGAA	2	8	39955	39962	50 %	0 %	25 %	25 %	433615338
92	NC_019847	GATC	2	8	40153	40160	25 %	25 %	25 %	25 %	433615338
93	NC_019847	CGAG	2	8	40243	40250	25 %	0 %	50 %	25 %	433615338
94	NC_019847	CGTT	2	8	40858	40865	0 %	50 %	25 %	25 %	433615340
95	NC_019847	CGGT	2	8	42367	42374	0 %	25 %	50 %	25 %	433615341
96	NC_019847	CACG	2	8	42524	42531	25 %	0 %	25 %	50 %	433615341
97	NC_019847	GGTG	2	8	42788	42795	0 %	25 %	75 %	0 %	433615341
98	NC_019847	GACG	2	8	43029	43036	25 %	0 %	50 %	25 %	433615341
99	NC_019847	GGCC	2	8	43782	43789	0 %	0 %	50 %	50 %	433615341
100	NC_019847	CCGG	2	8	43856	43863	0 %	0 %	50 %	50 %	433615341
101	NC_019847	CCTG	2	8	44234	44241	0 %	25 %	25 %	50 %	433615342
102	NC_019847	GCGG	2	8	44647	44654	0 %	0 %	75 %	25 %	433615342
103	NC_019847	ACCT	2	8	45213	45220	25 %	25 %	0 %	50 %	433615343
104	NC_019847	CTTG	2	8	46096	46103	0 %	50 %	25 %	25 %	433615344
105	NC_019847	CCAA	2	8	46293	46300	50 %	0 %	0 %	50 %	433615344
106	NC_019847	GCAT	2	8	46719	46726	25 %	25 %	25 %	25 %	433615345
107	NC_019847	TCCG	2	8	46823	46830	0 %	25 %	25 %	50 %	433615345
108	NC_019847	GCCT	2	8	48510	48517	0 %	25 %	25 %	50 %	433615347
109	NC_019847	CGAT	2	8	48947	48954	25 %	25 %	25 %	25 %	433615347
110	NC_019847	TGCG	2	8	49420	49427	0 %	25 %	50 %	25 %	433615348
111	NC_019847	GCTC	2	8	49925	49932	0 %	25 %	25 %	50 %	433615348
112	NC_019847	CGAT	2	8	50155	50162	25 %	25 %	25 %	25 %	433615348
113	NC_019847	GCCT	2	8	50167	50174	0 %	25 %	25 %	50 %	433615348
114	NC_019847	GATC	2	8	51217	51224	25 %	25 %	25 %	25 %	433615349
115	NC_019847	ACCG	2	8	51375	51382	25 %	0 %	25 %	50 %	433615349
116	NC_019847	GCGG	2	8	52449	52456	0 %	0 %	75 %	25 %	433615350
117	NC_019847	GAAG	2	8	52566	52573	50 %	0 %	50 %	0 %	433615350
118	NC_019847	GGCC	2	8	55631	55638	0 %	0 %	50 %	50 %	433615353
119	NC_019847	GCCA	2	8	56363	56370	25 %	0 %	25 %	50 %	433615356
120	NC_019847	CTGA	2	8	58157	58164	25 %	25 %	25 %	25 %	433615357
121	NC_019847	GCCT	2	8	58475	58482	0 %	25 %	25 %	50 %	433615357
122	NC_019847	GAAT	2	8	58561	58568	50 %	25 %	25 %	0 %	433615357
123	NC_019847	ATCA	2	8	58983	58990	50 %	25 %	0 %	25 %	433615358
124	NC_019847	CAGG	2	8	61533	61540	25 %	0 %	50 %	25 %	433615362
125	NC_019847	TGCG	2	8	62058	62065	0 %	25 %	50 %	25 %	433615363
126	NC_019847	ACCT	2	8	62522	62529	25 %	25 %	0 %	50 %	433615363
127	NC_019847	CCGC	2	8	66444	66451	0 %	0 %	25 %	75 %	433615365
128	NC_019847	GCCG	2	8	66585	66592	0 %	0 %	50 %	50 %	433615365
129	NC_019847	GCCC	2	8	66621	66628	0 %	0 %	25 %	75 %	433615365
130	NC_019847	CTCG	2	8	67574	67581	0 %	25 %	25 %	50 %	433615366
131	NC_019847	ATCA	2	8	68653	68660	50 %	25 %	0 %	25 %	433615367
132	NC_019847	ATTC	2	8	70130	70137	25 %	50 %	0 %	25 %	433615368
133	NC_019847	CGAG	2	8	71531	71538	25 %	0 %	50 %	25 %	433615369
134	NC_019847	CGGT	2	8	71674	71681	0 %	25 %	50 %	25 %	433615369
135	NC_019847	CGGC	2	8	71702	71709	0 %	0 %	50 %	50 %	433615369
136	NC_019847	CGGC	2	8	71831	71838	0 %	0 %	50 %	50 %	433615369
137	NC_019847	TCGC	2	8	72020	72027	0 %	25 %	25 %	50 %	433615369
138	NC_019847	CGCT	2	8	72125	72132	0 %	25 %	25 %	50 %	433615369
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140	NC_019847	GGTT	2	8	74284	74291	0 %	50 %	50 %	0 %	433615370
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.