MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4b

Total Repeats: 404

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019847	TG	3	6	812	817	0 %	50 %	50 %	0 %	433615301
2	NC_019847	CA	3	6	1294	1299	50 %	0 %	0 %	50 %	433615302
3	NC_019847	CT	3	6	1717	1722	0 %	50 %	0 %	50 %	433615302
4	NC_019847	CA	3	6	2146	2151	50 %	0 %	0 %	50 %	433615302
5	NC_019847	CT	3	6	2293	2298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019847	GC	4	8	2840	2847	0 %	0 %	50 %	50 %	433615303
7	NC_019847	CG	3	6	3685	3690	0 %	0 %	50 %	50 %	433615304
8	NC_019847	CT	3	6	3705	3710	0 %	50 %	0 %	50 %	433615304
9	NC_019847	CT	3	6	4970	4975	0 %	50 %	0 %	50 %	433615306
10	NC_019847	CG	3	6	5437	5442	0 %	0 %	50 %	50 %	433615307
11	NC_019847	GC	3	6	5645	5650	0 %	0 %	50 %	50 %	433615307
12	NC_019847	GC	3	6	5795	5800	0 %	0 %	50 %	50 %	433615307
13	NC_019847	GC	3	6	5846	5851	0 %	0 %	50 %	50 %	433615307
14	NC_019847	CG	3	6	5977	5982	0 %	0 %	50 %	50 %	433615307
15	NC_019847	GC	3	6	6256	6261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019847	GC	3	6	6730	6735	0 %	0 %	50 %	50 %	433615308
17	NC_019847	CG	3	6	7848	7853	0 %	0 %	50 %	50 %	433615308
18	NC_019847	GA	3	6	8863	8868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019847	GT	3	6	8924	8929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019847	GA	3	6	10084	10089	50 %	0 %	50 %	0 %	433615310
21	NC_019847	CG	3	6	10955	10960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019847	GC	3	6	11188	11193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019847	CG	3	6	12284	12289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019847	AC	3	6	12592	12597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019847	GC	3	6	12744	12749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019847	CG	3	6	12963	12968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019847	AT	3	6	13284	13289	50 %	50 %	0 %	0 %	433615311
28	NC_019847	TC	3	6	13522	13527	0 %	50 %	0 %	50 %	433615311
29	NC_019847	CG	3	6	13591	13596	0 %	0 %	50 %	50 %	433615311
30	NC_019847	AC	3	6	13903	13908	50 %	0 %	0 %	50 %	433615311
31	NC_019847	GC	3	6	14545	14550	0 %	0 %	50 %	50 %	433615311
32	NC_019847	GC	4	8	15109	15116	0 %	0 %	50 %	50 %	433615311
33	NC_019847	CG	3	6	15139	15144	0 %	0 %	50 %	50 %	433615311
34	NC_019847	TG	3	6	16530	16535	0 %	50 %	50 %	0 %	433615312
35	NC_019847	AG	3	6	17279	17284	50 %	0 %	50 %	0 %	433615312
36	NC_019847	CT	3	6	18292	18297	0 %	50 %	0 %	50 %	433615313
37	NC_019847	CG	3	6	18322	18327	0 %	0 %	50 %	50 %	433615313
38	NC_019847	CG	3	6	18522	18527	0 %	0 %	50 %	50 %	433615313
39	NC_019847	TG	3	6	18846	18851	0 %	50 %	50 %	0 %	433615313
40	NC_019847	CG	3	6	19999	20004	0 %	0 %	50 %	50 %	433615315
41	NC_019847	AT	3	6	21246	21251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019847	AT	3	6	21315	21320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019847	AG	3	6	21428	21433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019847	GC	3	6	21891	21896	0 %	0 %	50 %	50 %	433615316
45	NC_019847	GC	3	6	21989	21994	0 %	0 %	50 %	50 %	433615316
46	NC_019847	GC	3	6	22012	22017	0 %	0 %	50 %	50 %	433615316
47	NC_019847	AG	3	6	22363	22368	50 %	0 %	50 %	0 %	433615316
48	NC_019847	GC	3	6	22703	22708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019847	CG	3	6	22863	22868	0 %	0 %	50 %	50 %	433615317
50	NC_019847	GC	3	6	22965	22970	0 %	0 %	50 %	50 %	433615317
51	NC_019847	CG	3	6	23071	23076	0 %	0 %	50 %	50 %	433615317
52	NC_019847	CG	3	6	23117	23122	0 %	0 %	50 %	50 %	433615317
53	NC_019847	GC	3	6	23133	23138	0 %	0 %	50 %	50 %	433615317
54	NC_019847	TA	3	6	23921	23926	50 %	50 %	0 %	0 %	433615318
55	NC_019847	TG	4	8	24079	24086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019847	CG	3	6	24391	24396	0 %	0 %	50 %	50 %	433615319
57	NC_019847	GA	3	6	26352	26357	50 %	0 %	50 %	0 %	433615320
58	NC_019847	AG	3	6	26415	26420	50 %	0 %	50 %	0 %	433615320
59	NC_019847	CG	3	6	28192	28197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019847	GC	3	6	28291	28296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019847	GC	3	6	28832	28837	0 %	0 %	50 %	50 %	433615323
62	NC_019847	AG	3	6	31739	31744	50 %	0 %	50 %	0 %	433615327
63	NC_019847	GC	3	6	31856	31861	0 %	0 %	50 %	50 %	433615327
64	NC_019847	CG	3	6	32075	32080	0 %	0 %	50 %	50 %	433615328
65	NC_019847	GC	3	6	32559	32564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019847	GC	3	6	32754	32759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019847	GC	3	6	33050	33055	0 %	0 %	50 %	50 %	433615329
68	NC_019847	GC	3	6	33643	33648	0 %	0 %	50 %	50 %	433615329
69	NC_019847	GC	3	6	33700	33705	0 %	0 %	50 %	50 %	433615330
70	NC_019847	GC	3	6	33932	33937	0 %	0 %	50 %	50 %	433615330
71	NC_019847	GC	3	6	33997	34002	0 %	0 %	50 %	50 %	433615330
72	NC_019847	CA	3	6	34271	34276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019847	CT	3	6	34756	34761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019847	GC	3	6	35616	35621	0 %	0 %	50 %	50 %	433615332
75	NC_019847	CG	3	6	35857	35862	0 %	0 %	50 %	50 %	433615333
76	NC_019847	GC	3	6	35866	35871	0 %	0 %	50 %	50 %	433615333
77	NC_019847	GC	3	6	38191	38196	0 %	0 %	50 %	50 %	433615337
78	NC_019847	TC	3	6	38926	38931	0 %	50 %	0 %	50 %	433615338
79	NC_019847	GC	3	6	38936	38941	0 %	0 %	50 %	50 %	433615338
80	NC_019847	GC	4	8	40783	40790	0 %	0 %	50 %	50 %	433615340
81	NC_019847	GC	3	6	41943	41948	0 %	0 %	50 %	50 %	433615341
82	NC_019847	GA	3	6	42002	42007	50 %	0 %	50 %	0 %	433615341
83	NC_019847	GA	5	10	42069	42078	50 %	0 %	50 %	0 %	433615341
84	NC_019847	CG	3	6	42803	42808	0 %	0 %	50 %	50 %	433615341
85	NC_019847	CT	3	6	43009	43014	0 %	50 %	0 %	50 %	433615341
86	NC_019847	AG	3	6	43259	43264	50 %	0 %	50 %	0 %	433615341
87	NC_019847	CT	3	6	43356	43361	0 %	50 %	0 %	50 %	433615341
88	NC_019847	GC	3	6	43848	43853	0 %	0 %	50 %	50 %	433615341
89	NC_019847	GA	3	6	44184	44189	50 %	0 %	50 %	0 %	433615342
90	NC_019847	GC	3	6	44621	44626	0 %	0 %	50 %	50 %	433615342
91	NC_019847	CG	3	6	44923	44928	0 %	0 %	50 %	50 %	433615343
92	NC_019847	GC	3	6	45587	45592	0 %	0 %	50 %	50 %	433615343
93	NC_019847	GC	3	6	45845	45850	0 %	0 %	50 %	50 %	433615343
94	NC_019847	GC	3	6	45918	45923	0 %	0 %	50 %	50 %	433615343
95	NC_019847	GC	3	6	46416	46421	0 %	0 %	50 %	50 %	433615344
96	NC_019847	GC	3	6	47003	47008	0 %	0 %	50 %	50 %	433615345
97	NC_019847	CG	3	6	47259	47264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019847	GA	3	6	48128	48133	50 %	0 %	50 %	0 %	433615347
99	NC_019847	GA	3	6	49046	49051	50 %	0 %	50 %	0 %	433615348
100	NC_019847	GC	3	6	49494	49499	0 %	0 %	50 %	50 %	433615348
101	NC_019847	TC	3	6	49533	49538	0 %	50 %	0 %	50 %	433615348
102	NC_019847	CG	3	6	49600	49605	0 %	0 %	50 %	50 %	433615348
103	NC_019847	CG	3	6	49691	49696	0 %	0 %	50 %	50 %	433615348
104	NC_019847	GC	3	6	49770	49775	0 %	0 %	50 %	50 %	433615348
105	NC_019847	GC	4	8	50309	50316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019847	CG	3	6	50641	50646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019847	GC	3	6	51209	51214	0 %	0 %	50 %	50 %	433615349
108	NC_019847	GC	3	6	51278	51283	0 %	0 %	50 %	50 %	433615349
109	NC_019847	AT	3	6	51957	51962	50 %	50 %	0 %	0 %	433615349
110	NC_019847	CT	3	6	52193	52198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019847	GC	3	6	52326	52331	0 %	0 %	50 %	50 %	433615350
112	NC_019847	GC	3	6	53239	53244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019847	GC	3	6	53748	53753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019847	GC	3	6	53829	53834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019847	GC	4	8	54415	54422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019847	AG	3	6	54859	54864	50 %	0 %	50 %	0 %	433615352
117	NC_019847	CG	3	6	55046	55051	0 %	0 %	50 %	50 %	433615353
118	NC_019847	GC	3	6	56895	56900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019847	CG	3	6	57514	57519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019847	GA	3	6	57737	57742	50 %	0 %	50 %	0 %	433615357
121	NC_019847	TC	3	6	58019	58024	0 %	50 %	0 %	50 %	433615357
122	NC_019847	GC	3	6	59928	59933	0 %	0 %	50 %	50 %	433615360
123	NC_019847	CT	3	6	59969	59974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019847	AT	3	6	60730	60735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019847	GC	3	6	61397	61402	0 %	0 %	50 %	50 %	433615362
126	NC_019847	GA	3	6	61438	61443	50 %	0 %	50 %	0 %	433615362
127	NC_019847	AG	3	6	61501	61506	50 %	0 %	50 %	0 %	433615362
128	NC_019847	GC	3	6	61592	61597	0 %	0 %	50 %	50 %	433615362
129	NC_019847	GC	3	6	61930	61935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019847	CG	3	6	62232	62237	0 %	0 %	50 %	50 %	433615363
131	NC_019847	CG	3	6	63192	63197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019847	GC	3	6	64200	64205	0 %	0 %	50 %	50 %	433615364
133	NC_019847	GC	3	6	64458	64463	0 %	0 %	50 %	50 %	433615364
134	NC_019847	GC	3	6	64531	64536	0 %	0 %	50 %	50 %	433615364
135	NC_019847	GT	3	6	64779	64784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019847	CA	3	6	66369	66374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019847	TC	3	6	66779	66784	0 %	50 %	0 %	50 %	433615366
138	NC_019847	GC	3	6	66801	66806	0 %	0 %	50 %	50 %	433615366
139	NC_019847	CG	4	8	66977	66984	0 %	0 %	50 %	50 %	433615366
140	NC_019847	GC	3	6	67341	67346	0 %	0 %	50 %	50 %	433615366
141	NC_019847	CG	3	6	67768	67773	0 %	0 %	50 %	50 %	433615366
142	NC_019847	GC	3	6	68779	68784	0 %	0 %	50 %	50 %	433615367
143	NC_019847	GA	3	6	69533	69538	50 %	0 %	50 %	0 %	433615368
144	NC_019847	CG	3	6	70336	70341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019847	GC	3	6	70342	70347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019847	CG	3	6	70349	70354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019847	GC	3	6	70512	70517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.