MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4a

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019846	TCGATC	2	12	458	469	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433615116
2	NC_019846	CTGGCA	2	12	5440	5451	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433615121
3	NC_019846	GGCTCG	2	12	5619	5630	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433615121
4	NC_019846	GACGAG	2	12	6879	6890	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	433615123
5	NC_019846	GACCGA	2	12	6917	6928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615123
6	NC_019846	GGGAGG	2	12	7392	7403	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	433615123
7	NC_019846	CCCGCT	2	12	9221	9232	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	433615126
8	NC_019846	GCGCCC	2	12	19635	19646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615132
9	NC_019846	CGAGGA	2	12	21327	21338	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	433615133
10	NC_019846	TGCGGC	2	12	22913	22924	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433615134
11	NC_019846	CTCGGC	2	12	26688	26699	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433615137
12	NC_019846	TGTCGG	2	12	30780	30791	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433615142
13	NC_019846	CCGTCG	2	12	35980	35991	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433615144
14	NC_019846	ATGCCT	2	12	40898	40909	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433615149
15	NC_019846	CTGATC	2	12	43427	43438	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433615151
16	NC_019846	CGAGGC	2	12	45131	45142	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433615153
17	NC_019846	TGGCGC	2	12	47747	47758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433615156
18	NC_019846	CTCGGC	2	12	48522	48533	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433615157
19	NC_019846	GCCGAA	2	12	50160	50171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615159
20	NC_019846	CCCGGC	2	12	51352	51363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615161
21	NC_019846	CTCGGC	2	12	52081	52092	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433615161
22	NC_019846	GCTCAT	2	12	55351	55362	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433615165
23	NC_019846	GACGGC	2	12	61154	61165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433615169
24	NC_019846	GCCCTC	2	12	63839	63850	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	433615171
25	NC_019846	GGCTGA	2	12	64704	64715	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019846	GAGCCG	2	12	73028	73039	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433615180
27	NC_019846	CTATGC	2	12	80264	80275	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433615189
28	NC_019846	GAGATG	2	12	80895	80906	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	433615189
29	NC_019846	CGCGAC	2	12	82098	82109	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433615189
30	NC_019846	CATCAC	2	12	84161	84172	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	433615192
31	NC_019846	TCCGCT	2	12	85493	85504	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	433615194
32	NC_019846	GGCGGT	2	12	92215	92226	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	433615201
33	NC_019846	CGGCTG	2	12	93003	93014	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433615202
34	NC_019846	AGATCG	2	12	94834	94845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433615204
35	NC_019846	GATCGA	2	12	96544	96555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433615205
36	NC_019846	GCGCCG	2	12	97155	97166	0 %	0 %	50 %	50 %	433615206
37	NC_019846	TAGCGA	2	12	98992	99003	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433615208
38	NC_019846	CGCTGA	2	12	100452	100463	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433615209
39	NC_019846	TCGGCG	2	12	103652	103663	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433615213
40	NC_019846	CGCCGA	2	12	104696	104707	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433615213
41	NC_019846	CCGCTC	2	12	112119	112130	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	433615224
42	NC_019846	CCGAGC	2	12	114044	114055	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433615226
43	NC_019846	GAAGCC	2	12	118541	118552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615232
44	NC_019846	GCTCGC	2	12	120596	120607	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433615236
45	NC_019846	TTGGCC	2	12	123366	123377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615241
46	NC_019846	CGACAA	2	12	128618	128629	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	433615248
47	NC_019846	GACGAT	2	12	133929	133940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433615257
48	NC_019846	GCCGGC	2	12	137724	137735	0 %	0 %	50 %	50 %	433615261
49	NC_019846	GATGCC	2	12	138404	138415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433615263
50	NC_019846	CCACCG	2	12	138901	138912	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433615264
51	NC_019846	CGGCTT	2	12	139784	139795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615264
52	NC_019846	CGATGG	2	12	140461	140472	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433615264
53	NC_019846	GAATTC	2	12	140972	140983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	433615264
54	NC_019846	CGGCTC	2	12	142380	142391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433615265
55	NC_019846	TCGGCT	2	12	146898	146909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615271
56	NC_019846	GCTACT	2	12	147937	147948	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019846	GCAGGA	2	12	153322	153333	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	433615276
58	NC_019846	GGCCGC	2	12	154927	154938	0 %	0 %	50 %	50 %	433615278
59	NC_019846	GACCGC	2	12	158745	158756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433615281
60	NC_019846	GGGTAT	2	12	159700	159711	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	433615283
61	NC_019846	CAGGCG	2	12	160985	160996	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433615285
62	NC_019846	ATGGAA	2	12	162976	162987	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	433615286
63	NC_019846	ATCGTC	2	12	164283	164294	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433615289
64	NC_019846	CTGCGC	2	12	167888	167899	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.