MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4a

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019846	AGCAA	2	10	31637	31646	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019846	CGGCA	2	10	34639	34648	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_019846	AAATG	2	10	36661	36670	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019846	AGCCA	2	10	37760	37769	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_019846	GGGCG	2	10	38813	38822	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019846	CAAGG	2	10	53622	53631	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019846	AGCAT	2	10	58013	58022	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019846	GATCA	2	10	70835	70844	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019846	AAACG	2	10	72190	72199	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019846	GTTTT	2	10	74666	74675	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019846	AGCGG	2	10	78990	78999	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019846	GCACT	2	10	82555	82564	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019846	CGAAA	2	10	106783	106792	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019846	TTTCG	2	10	113897	113906	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019846	AAAGG	2	10	118665	118674	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019846	GTTAT	2	10	119308	119317	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019846	GGAAA	2	10	125624	125633	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019846	ACCCC	2	10	128311	128320	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
19	NC_019846	CTCCC	2	10	128326	128335	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
20	NC_019846	TGAAC	2	10	132185	132194	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019846	GCCCG	2	10	137842	137851	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_019846	GCCTC	2	10	148030	148039	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_019846	CAACG	2	10	154777	154786	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019846	CCCCT	2	10	170247	170256	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_019846	CCAGA	2	10	170532	170541	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.