MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4a

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019846	TCCG	2	8	37896	37903	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019846	GGGA	2	8	38026	38033	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019846	TCCG	2	8	38048	38055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019846	TCGC	2	8	38187	38194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019846	GTTC	2	8	38898	38905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019846	TCCG	2	8	52355	52362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019846	GGGT	2	8	53688	53695	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019846	CCGG	2	8	53733	53740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019846	GCCG	2	8	57578	57585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019846	GTTC	2	8	57891	57898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019846	ATGC	2	8	58046	58053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019846	GGCA	2	8	58088	58095	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019846	GCCA	2	8	58943	58950	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019846	CGTC	2	8	59256	59263	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019846	GCCT	2	8	62841	62848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019846	GGGA	2	8	62956	62963	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019846	AGCG	2	8	71781	71788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019846	CGAA	2	8	75653	75660	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019846	AGGC	2	8	75672	75679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019846	GAGG	2	8	79217	79224	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019846	AATA	2	8	82468	82475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019846	GCCT	2	8	82476	82483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019846	CGTT	2	8	82574	82581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019846	CGAG	2	8	88615	88622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019846	TCGG	2	8	89658	89665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019846	TCGA	2	8	108915	108922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019846	AGGG	2	8	110628	110635	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019846	CACC	2	8	110712	110719	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_019846	TCAA	2	8	113933	113940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019846	GTCC	2	8	117642	117649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019846	TTGG	2	8	118319	118326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019846	GTCC	2	8	119117	119124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019846	CCGG	2	8	121564	121571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019846	TGAA	2	8	123858	123865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019846	CCAG	2	8	124003	124010	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019846	TCCT	2	8	125418	125425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019846	GCTC	2	8	125439	125446	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019846	CGGG	2	8	125506	125513	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019846	CCTC	2	8	125540	125547	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_019846	CCGA	2	8	128042	128049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019846	GGGC	2	8	128181	128188	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019846	ACCG	2	8	128476	128483	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019846	TTCC	2	8	130721	130728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019846	CATA	2	8	131429	131436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019846	GAAC	2	8	131561	131568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019846	GCCA	2	8	143692	143699	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019846	GAAA	2	8	144429	144436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019846	GAAC	2	8	148007	148014	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019846	GCCA	2	8	152088	152095	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019846	CCGC	2	8	154721	154728	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_019846	CGAG	2	8	154830	154837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019846	GGAG	2	8	157624	157631	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019846	TTCC	2	8	157906	157913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019846	TCAG	2	8	158012	158019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019846	GCTG	2	8	158961	158968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019846	CAAC	2	8	163248	163255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019846	GGCT	2	8	167280	167287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019846	CGCC	2	8	167701	167708	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_019846	TTTG	2	8	167912	167919	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019846	TCCT	2	8	167981	167988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019846	GCTC	2	8	168002	168009	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019846	CGGG	2	8	168059	168066	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019846	ATAA	2	8	170591	170598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019846	CCCT	2	8	170619	170626	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_019846	CAAC	2	8	174849	174856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.