MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4a

Total Repeats: 371

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019846	CCGG	2	8	242	249	0 %	0 %	50 %	50 %	433615116
2	NC_019846	AGAA	2	8	1209	1216	75 %	0 %	25 %	0 %	433615117
3	NC_019846	CGCC	2	8	1297	1304	0 %	0 %	25 %	75 %	433615117
4	NC_019846	ATCG	2	8	1349	1356	25 %	25 %	25 %	25 %	433615117
5	NC_019846	GTGC	2	8	1605	1612	0 %	25 %	50 %	25 %	433615117
6	NC_019846	GTCG	2	8	1793	1800	0 %	25 %	50 %	25 %	433615117
7	NC_019846	CGAT	2	8	3389	3396	25 %	25 %	25 %	25 %	433615118
8	NC_019846	GGCC	2	8	4061	4068	0 %	0 %	50 %	50 %	433615119
9	NC_019846	CCGG	2	8	4211	4218	0 %	0 %	50 %	50 %	433615119
10	NC_019846	GTTC	2	8	4235	4242	0 %	50 %	25 %	25 %	433615119
11	NC_019846	CAGG	2	8	4284	4291	25 %	0 %	50 %	25 %	433615119
12	NC_019846	GCCG	2	8	4385	4392	0 %	0 %	50 %	50 %	433615119
13	NC_019846	GGCC	2	8	5218	5225	0 %	0 %	50 %	50 %	433615120
14	NC_019846	CCGC	2	8	5805	5812	0 %	0 %	25 %	75 %	433615121
15	NC_019846	GTCG	2	8	5891	5898	0 %	25 %	50 %	25 %	433615122
16	NC_019846	TGGA	2	8	6411	6418	25 %	25 %	50 %	0 %	433615123
17	NC_019846	CCCA	2	8	6522	6529	25 %	0 %	0 %	75 %	433615123
18	NC_019846	GCCG	2	8	6686	6693	0 %	0 %	50 %	50 %	433615123
19	NC_019846	GCGA	2	8	6947	6954	25 %	0 %	50 %	25 %	433615123
20	NC_019846	CGGC	2	8	7010	7017	0 %	0 %	50 %	50 %	433615123
21	NC_019846	CGGC	2	8	7241	7248	0 %	0 %	50 %	50 %	433615123
22	NC_019846	CGGC	2	8	7306	7313	0 %	0 %	50 %	50 %	433615123
23	NC_019846	GCTG	2	8	7959	7966	0 %	25 %	50 %	25 %	433615124
24	NC_019846	GGCC	2	8	7998	8005	0 %	0 %	50 %	50 %	433615124
25	NC_019846	GCTG	2	8	8793	8800	0 %	25 %	50 %	25 %	433615125
26	NC_019846	AGGC	2	8	9202	9209	25 %	0 %	50 %	25 %	433615126
27	NC_019846	GGCA	2	8	9357	9364	25 %	0 %	50 %	25 %	433615126
28	NC_019846	CCAC	2	8	9939	9946	25 %	0 %	0 %	75 %	433615127
29	NC_019846	CCGA	2	8	9983	9990	25 %	0 %	25 %	50 %	433615127
30	NC_019846	AGGG	2	8	10216	10223	25 %	0 %	75 %	0 %	433615127
31	NC_019846	CGAT	2	8	11085	11092	25 %	25 %	25 %	25 %	433615128
32	NC_019846	CATT	2	8	11535	11542	25 %	50 %	0 %	25 %	433615128
33	NC_019846	ACCA	2	8	11986	11993	50 %	0 %	0 %	50 %	433615128
34	NC_019846	CTCG	2	8	13064	13071	0 %	25 %	25 %	50 %	433615129
35	NC_019846	TGCG	2	8	13649	13656	0 %	25 %	50 %	25 %	433615129
36	NC_019846	CGTG	2	8	13712	13719	0 %	25 %	50 %	25 %	433615129
37	NC_019846	GGCT	2	8	14435	14442	0 %	25 %	50 %	25 %	433615130
38	NC_019846	GTCC	2	8	14985	14992	0 %	25 %	25 %	50 %	433615131
39	NC_019846	GTCC	2	8	15367	15374	0 %	25 %	25 %	50 %	433615131
40	NC_019846	GACC	2	8	15444	15451	25 %	0 %	25 %	50 %	433615131
41	NC_019846	GGCC	2	8	15677	15684	0 %	0 %	50 %	50 %	433615131
42	NC_019846	GCGA	2	8	15696	15703	25 %	0 %	50 %	25 %	433615131
43	NC_019846	AGCG	2	8	15843	15850	25 %	0 %	50 %	25 %	433615131
44	NC_019846	CGGC	2	8	15853	15860	0 %	0 %	50 %	50 %	433615131
45	NC_019846	GCCA	2	8	16648	16655	25 %	0 %	25 %	50 %	433615131
46	NC_019846	CTTG	2	8	17085	17092	0 %	50 %	25 %	25 %	433615131
47	NC_019846	GTTG	2	8	17747	17754	0 %	50 %	50 %	0 %	433615131
48	NC_019846	GCAT	2	8	18953	18960	25 %	25 %	25 %	25 %	433615132
49	NC_019846	GCCG	2	8	19020	19027	0 %	0 %	50 %	50 %	433615132
50	NC_019846	CTTC	2	8	19109	19116	0 %	50 %	0 %	50 %	433615132
51	NC_019846	GATC	2	8	19166	19173	25 %	25 %	25 %	25 %	433615132
52	NC_019846	CGAT	2	8	20374	20381	25 %	25 %	25 %	25 %	433615132
53	NC_019846	ATCG	2	8	20589	20596	25 %	25 %	25 %	25 %	433615132
54	NC_019846	CTCA	2	8	20802	20809	25 %	25 %	0 %	50 %	433615132
55	NC_019846	GCAA	2	8	20974	20981	50 %	0 %	25 %	25 %	433615133
56	NC_019846	GACG	2	8	21132	21139	25 %	0 %	50 %	25 %	433615133
57	NC_019846	CAGC	2	8	21744	21751	25 %	0 %	25 %	50 %	433615133
58	NC_019846	GCCG	2	8	21987	21994	0 %	0 %	50 %	50 %	433615134
59	NC_019846	GCGA	2	8	22148	22155	25 %	0 %	50 %	25 %	433615134
60	NC_019846	GATC	2	8	22403	22410	25 %	25 %	25 %	25 %	433615134
61	NC_019846	GGAA	2	8	23469	23476	50 %	0 %	50 %	0 %	433615134
62	NC_019846	TCCG	2	8	23637	23644	0 %	25 %	25 %	50 %	433615134
63	NC_019846	GGCG	2	8	23808	23815	0 %	0 %	75 %	25 %	433615134
64	NC_019846	GGCG	2	8	25033	25040	0 %	0 %	75 %	25 %	433615135
65	NC_019846	CATC	2	8	25080	25087	25 %	25 %	0 %	50 %	433615135
66	NC_019846	AGCC	2	8	25166	25173	25 %	0 %	25 %	50 %	433615135
67	NC_019846	GCCG	2	8	25174	25181	0 %	0 %	50 %	50 %	433615135
68	NC_019846	ACAG	2	8	26031	26038	50 %	0 %	25 %	25 %	433615135
69	NC_019846	GGCA	2	8	26360	26367	25 %	0 %	50 %	25 %	433615136
70	NC_019846	TCAG	2	8	26540	26547	25 %	25 %	25 %	25 %	433615137
71	NC_019846	CCCT	2	8	26735	26742	0 %	25 %	0 %	75 %	433615137
72	NC_019846	CATT	2	8	27713	27720	25 %	50 %	0 %	25 %	433615137
73	NC_019846	GCAA	2	8	27880	27887	50 %	0 %	25 %	25 %	433615137
74	NC_019846	CGGT	2	8	28455	28462	0 %	25 %	50 %	25 %	433615138
75	NC_019846	CACC	2	8	31201	31208	25 %	0 %	0 %	75 %	433615142
76	NC_019846	GACC	2	8	31745	31752	25 %	0 %	25 %	50 %	433615143
77	NC_019846	CCCA	2	8	32489	32496	25 %	0 %	0 %	75 %	433615143
78	NC_019846	CGAA	2	8	32645	32652	50 %	0 %	25 %	25 %	433615143
79	NC_019846	GATA	2	8	32684	32691	50 %	25 %	25 %	0 %	433615143
80	NC_019846	TCCA	2	8	32753	32760	25 %	25 %	0 %	50 %	433615143
81	NC_019846	GGCC	2	8	32993	33000	0 %	0 %	50 %	50 %	433615143
82	NC_019846	TGGG	2	8	33248	33255	0 %	25 %	75 %	0 %	433615143
83	NC_019846	CGGC	2	8	33394	33401	0 %	0 %	50 %	50 %	433615143
84	NC_019846	AAGC	2	8	33579	33586	50 %	0 %	25 %	25 %	433615143
85	NC_019846	GTTC	2	8	34861	34868	0 %	50 %	25 %	25 %	433615144
86	NC_019846	TCCG	2	8	34932	34939	0 %	25 %	25 %	50 %	433615144
87	NC_019846	TGCG	2	8	34964	34971	0 %	25 %	50 %	25 %	433615144
88	NC_019846	CGTG	2	8	35386	35393	0 %	25 %	50 %	25 %	433615144
89	NC_019846	TGAG	2	8	35445	35452	25 %	25 %	50 %	0 %	433615144
90	NC_019846	GATC	2	8	37272	37279	25 %	25 %	25 %	25 %	433615145
91	NC_019846	CTGT	2	8	37604	37611	0 %	50 %	25 %	25 %	433615145
92	NC_019846	TCGA	2	8	41596	41603	25 %	25 %	25 %	25 %	433615150
93	NC_019846	TCGC	2	8	41657	41664	0 %	25 %	25 %	50 %	433615150
94	NC_019846	CGGC	2	8	42369	42376	0 %	0 %	50 %	50 %	433615150
95	NC_019846	GTCG	2	8	42955	42962	0 %	25 %	50 %	25 %	433615151
96	NC_019846	GGCG	2	8	43842	43849	0 %	0 %	75 %	25 %	433615152
97	NC_019846	TCCA	2	8	44017	44024	25 %	25 %	0 %	50 %	433615152
98	NC_019846	TCGC	2	8	44138	44145	0 %	25 %	25 %	50 %	433615152
99	NC_019846	AAGG	2	8	44639	44646	50 %	0 %	50 %	0 %	433615153
100	NC_019846	TGCT	2	8	45013	45020	0 %	50 %	25 %	25 %	433615153
101	NC_019846	GCGG	2	8	45383	45390	0 %	0 %	75 %	25 %	433615153
102	NC_019846	CCCG	2	8	45805	45812	0 %	0 %	25 %	75 %	433615154
103	NC_019846	TATC	2	8	46024	46031	25 %	50 %	0 %	25 %	433615154
104	NC_019846	CGAG	2	8	46150	46157	25 %	0 %	50 %	25 %	433615154
105	NC_019846	CCAC	2	8	46607	46614	25 %	0 %	0 %	75 %	433615155
106	NC_019846	CGAT	2	8	47803	47810	25 %	25 %	25 %	25 %	433615156
107	NC_019846	CGAT	2	8	48400	48407	25 %	25 %	25 %	25 %	433615157
108	NC_019846	CTCG	2	8	48629	48636	0 %	25 %	25 %	50 %	433615157
109	NC_019846	CGAG	2	8	49383	49390	25 %	0 %	50 %	25 %	433615158
110	NC_019846	ACCC	2	8	49517	49524	25 %	0 %	0 %	75 %	433615158
111	NC_019846	TCAT	2	8	50056	50063	25 %	50 %	0 %	25 %	433615159
112	NC_019846	GGCC	2	8	51249	51256	0 %	0 %	50 %	50 %	433615160
113	NC_019846	CGGC	2	8	51383	51390	0 %	0 %	50 %	50 %	433615161
114	NC_019846	GGGC	2	8	51854	51861	0 %	0 %	75 %	25 %	433615161
115	NC_019846	CGCC	2	8	52764	52771	0 %	0 %	25 %	75 %	433615162
116	NC_019846	CGCC	2	8	52830	52837	0 %	0 %	25 %	75 %	433615162
117	NC_019846	CGAC	2	8	52898	52905	25 %	0 %	25 %	50 %	433615162
118	NC_019846	GCCG	3	12	53019	53030	0 %	0 %	50 %	50 %	433615162
119	NC_019846	ATCG	2	8	53537	53544	25 %	25 %	25 %	25 %	433615164
120	NC_019846	TCAA	2	8	54144	54151	50 %	25 %	0 %	25 %	433615165
121	NC_019846	CAGT	2	8	55516	55523	25 %	25 %	25 %	25 %	433615165
122	NC_019846	GGCA	2	8	55637	55644	25 %	0 %	50 %	25 %	433615165
123	NC_019846	CCGC	2	8	55653	55660	0 %	0 %	25 %	75 %	433615165
124	NC_019846	CCAG	2	8	55840	55847	25 %	0 %	25 %	50 %	433615165
125	NC_019846	CAGC	2	8	55885	55892	25 %	0 %	25 %	50 %	433615165
126	NC_019846	CGGT	2	8	55968	55975	0 %	25 %	50 %	25 %	433615165
127	NC_019846	GACA	2	8	56191	56198	50 %	0 %	25 %	25 %	433615165
128	NC_019846	CACC	2	8	56599	56606	25 %	0 %	0 %	75 %	433615165
129	NC_019846	CGCC	2	8	56650	56657	0 %	0 %	25 %	75 %	433615165
130	NC_019846	GGCG	2	8	56863	56870	0 %	0 %	75 %	25 %	433615165
131	NC_019846	GAAC	2	8	58577	58584	50 %	0 %	25 %	25 %	433615166
132	NC_019846	GACC	2	8	58627	58634	25 %	0 %	25 %	50 %	433615166
133	NC_019846	CCAG	2	8	59650	59657	25 %	0 %	25 %	50 %	433615167
134	NC_019846	GGCT	2	8	60185	60192	0 %	25 %	50 %	25 %	433615167
135	NC_019846	CAAA	2	8	61492	61499	75 %	0 %	0 %	25 %	433615169
136	NC_019846	TTCG	2	8	61952	61959	0 %	50 %	25 %	25 %	433615169
137	NC_019846	CGGG	2	8	62348	62355	0 %	0 %	75 %	25 %	433615170
138	NC_019846	GACC	2	8	63730	63737	25 %	0 %	25 %	50 %	433615171
139	NC_019846	GTTG	2	8	64084	64091	0 %	50 %	50 %	0 %	433615171
140	NC_019846	GTCG	2	8	66562	66569	0 %	25 %	50 %	25 %	433615173
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.