MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4a

Total Repeats: 2315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019846	CCG	2	6	112	117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615116
2	NC_019846	GGC	2	6	382	387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615116
3	NC_019846	GAC	2	6	396	401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615116
4	NC_019846	GAC	2	6	550	555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615116
5	NC_019846	AAG	2	6	583	588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615116
6	NC_019846	TCT	2	6	695	700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615116
7	NC_019846	GTC	2	6	704	709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615116
8	NC_019846	TCA	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615116
9	NC_019846	CGC	2	6	767	772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615116
10	NC_019846	GTC	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615116
11	NC_019846	CTG	2	6	871	876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615116
12	NC_019846	ATG	2	6	877	882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615116
13	NC_019846	AAC	2	6	1119	1124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615116
14	NC_019846	GAT	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615116
15	NC_019846	CCT	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615117
16	NC_019846	AGC	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615117
17	NC_019846	GTG	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615117
18	NC_019846	CAA	2	6	1441	1446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615117
19	NC_019846	TCG	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615117
20	NC_019846	GTT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615117
21	NC_019846	GAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615117
22	NC_019846	CGG	2	6	1928	1933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615117
23	NC_019846	AGA	2	6	1937	1942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615117
24	NC_019846	CTG	2	6	1981	1986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615117
25	NC_019846	AGA	2	6	2041	2046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615117
26	NC_019846	GTG	2	6	2106	2111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615117
27	NC_019846	GAC	2	6	2425	2430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615118
28	NC_019846	GCG	2	6	2440	2445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615118
29	NC_019846	GAG	2	6	2630	2635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615118
30	NC_019846	TCG	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615118
31	NC_019846	TCG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615118
32	NC_019846	GCT	2	6	2836	2841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615118
33	NC_019846	GAG	2	6	2852	2857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615118
34	NC_019846	CGC	2	6	2866	2871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615118
35	NC_019846	GCA	2	6	2872	2877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615118
36	NC_019846	GGC	2	6	2881	2886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615118
37	NC_019846	GGA	2	6	2968	2973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615118
38	NC_019846	GAG	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615118
39	NC_019846	TGC	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615118
40	NC_019846	TGC	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615118
41	NC_019846	GGT	2	6	3379	3384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615118
42	NC_019846	CGG	3	9	3456	3464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615118
43	NC_019846	CGG	2	6	3508	3513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615118
44	NC_019846	GCG	2	6	3546	3551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615118
45	NC_019846	GTT	2	6	3580	3585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615118
46	NC_019846	GTT	2	6	3921	3926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615119
47	NC_019846	GCC	2	6	3937	3942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615119
48	NC_019846	CTG	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615119
49	NC_019846	CCG	2	6	4119	4124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615119
50	NC_019846	TCG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615119
51	NC_019846	CTC	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615119
52	NC_019846	GCC	2	6	4366	4371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615119
53	NC_019846	GGC	2	6	4404	4409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615119
54	NC_019846	CTT	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615119
55	NC_019846	AGG	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615119
56	NC_019846	CCG	2	6	4629	4634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615119
57	NC_019846	CCG	2	6	4703	4708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615119
58	NC_019846	GAT	2	6	4754	4759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615119
59	NC_019846	CGA	2	6	4763	4768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615119
60	NC_019846	CAG	3	9	4773	4781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615119
61	NC_019846	CCT	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615119
62	NC_019846	CGT	3	9	4919	4927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615119
63	NC_019846	CAG	2	6	4932	4937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615119
64	NC_019846	TGA	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615120
65	NC_019846	CCG	2	6	5141	5146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615120
66	NC_019846	CGG	2	6	5147	5152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615120
67	NC_019846	GCC	2	6	5182	5187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615120
68	NC_019846	ATC	2	6	5203	5208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615120
69	NC_019846	CTC	2	6	5236	5241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615120
70	NC_019846	CGG	2	6	5294	5299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615120
71	NC_019846	CGA	2	6	5307	5312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615120
72	NC_019846	CGC	2	6	5319	5324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615120
73	NC_019846	ATC	2	6	5357	5362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615120
74	NC_019846	CTG	2	6	5374	5379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615120
75	NC_019846	TGC	2	6	5391	5396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615120
76	NC_019846	CAC	2	6	5512	5517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615121
77	NC_019846	TGC	2	6	5547	5552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615121
78	NC_019846	CGC	2	6	5565	5570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615121
79	NC_019846	CCG	2	6	5600	5605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615121
80	NC_019846	GCC	2	6	5734	5739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615121
81	NC_019846	GCG	2	6	5761	5766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615121
82	NC_019846	TCG	2	6	5769	5774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615121
83	NC_019846	GCC	2	6	5851	5856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615122
84	NC_019846	CGC	2	6	5881	5886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615122
85	NC_019846	TCC	2	6	5910	5915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615122
86	NC_019846	CCA	2	6	6017	6022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615122
87	NC_019846	TCG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615122
88	NC_019846	CGA	2	6	6374	6379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615123
89	NC_019846	TGC	2	6	6490	6495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615123
90	NC_019846	ACG	2	6	6496	6501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615123
91	NC_019846	CGG	2	6	6567	6572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615123
92	NC_019846	CGA	2	6	6647	6652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615123
93	NC_019846	ACC	2	6	6696	6701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615123
94	NC_019846	GGC	2	6	6755	6760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615123
95	NC_019846	CGC	2	6	6800	6805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615123
96	NC_019846	TAT	2	6	6806	6811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433615123
97	NC_019846	TGC	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615123
98	NC_019846	GCA	2	6	6992	6997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615123
99	NC_019846	CGC	2	6	7022	7027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615123
100	NC_019846	TGC	2	6	7033	7038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615123
101	NC_019846	ACG	2	6	7053	7058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615123
102	NC_019846	CGC	2	6	7070	7075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615123
103	NC_019846	GCC	3	9	7111	7119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615123
104	NC_019846	CTG	2	6	7140	7145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615123
105	NC_019846	ATC	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615123
106	NC_019846	GAT	2	6	7220	7225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615123
107	NC_019846	CGC	2	6	7339	7344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615123
108	NC_019846	GCG	2	6	7347	7352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615123
109	NC_019846	TCG	2	6	7360	7365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615123
110	NC_019846	CAA	2	6	7694	7699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615124
111	NC_019846	GAC	2	6	7722	7727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615124
112	NC_019846	GTC	3	9	7728	7736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615124
113	NC_019846	GAA	2	6	7782	7787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615124
114	NC_019846	CGG	2	6	7808	7813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615124
115	NC_019846	TGC	2	6	7852	7857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615124
116	NC_019846	GAC	2	6	7902	7907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615124
117	NC_019846	GTC	2	6	7908	7913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615124
118	NC_019846	ATC	2	6	7992	7997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615124
119	NC_019846	AGC	2	6	8036	8041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615124
120	NC_019846	CAA	2	6	8077	8082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615124
121	NC_019846	TGG	2	6	8262	8267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615125
122	NC_019846	ATC	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615125
123	NC_019846	CGA	2	6	8392	8397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615125
124	NC_019846	GAC	2	6	8497	8502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615125
125	NC_019846	TTC	2	6	8624	8629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615125
126	NC_019846	CGT	2	6	8782	8787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615125
127	NC_019846	GGA	2	6	8809	8814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615125
128	NC_019846	GCG	2	6	8951	8956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615125
129	NC_019846	CGG	2	6	8976	8981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615125
130	NC_019846	AGT	2	6	9068	9073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615125
131	NC_019846	ACG	2	6	9139	9144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615125
132	NC_019846	TGC	2	6	9323	9328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615126
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135	NC_019846	ATG	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615126
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152	NC_019846	ATC	2	6	10317	10322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615127
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159	NC_019846	GGA	2	6	11305	11310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615128
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252	NC_019846	CGG	2	6	19595	19600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615132
253	NC_019846	GTT	2	6	19662	19667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615132
254	NC_019846	CTG	2	6	19719	19724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615132
255	NC_019846	GTC	2	6	19870	19875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615132
256	NC_019846	CGC	2	6	19925	19930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615132
257	NC_019846	GTT	2	6	19974	19979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615132
258	NC_019846	GCG	2	6	20016	20021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615132
259	NC_019846	CCG	3	9	20318	20326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615132
260	NC_019846	ACG	2	6	20359	20364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615132
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262	NC_019846	CAG	2	6	20505	20510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615132
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271	NC_019846	GCG	2	6	21422	21427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615133
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283	NC_019846	GCC	2	6	22267	22272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615134
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285	NC_019846	GCG	2	6	22330	22335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615134
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487	NC_019846	CCA	2	6	37455	37460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615145
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499	NC_019846	CTT	2	6	39564	39569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615148
500	NC_019846	CTG	2	6	39588	39593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615148

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