MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019845	AGTGTC	2	12	3328	3339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019845	TCCCGC	2	12	49789	49800	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019845	ACCGAG	2	12	55020	55031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019845	CGTTTC	2	12	73554	73565	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019845	AGAGAA	2	12	80316	80327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019845	TTTCTC	2	12	82197	82208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019845	ATCCGG	2	12	85336	85347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019845	CAAAAG	2	12	116427	116438	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_019845	TATTTT	2	12	128498	128509	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019845	GCGCGA	2	12	155781	155792	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019845	AGCCGC	2	12	172313	172324	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019845	CAGCGG	2	12	204287	204298	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019845	CTATGC	2	12	240693	240704	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019845	CGCGCT	2	12	247606	247617	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019845	CTGCCC	2	12	248716	248727	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_019845	CAAGGT	2	12	312260	312271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019845	ATGGTG	2	12	317009	317020	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019845	TCGACT	2	12	343956	343967	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019845	CGGGAA	2	12	361222	361233	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019845	GGATAT	2	12	368012	368023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019845	CGCAGG	2	12	431240	431251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019845	GACAGG	2	12	477297	477308	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019845	CGGAGG	2	12	480353	480364	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019845	CAAAAA	2	12	553604	553615	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_019845	CTTCTC	3	18	603435	603452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019845	AGGCGG	2	12	630782	630793	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019845	GCTGTC	2	12	636043	636054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019845	CATCGG	2	12	704872	704883	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019845	CGGCTT	2	12	720020	720031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019845	GCTAAT	2	12	732814	732825	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019845	GACAAG	2	12	741689	741700	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019845	AACAAA	2	12	773909	773920	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019845	CTTCTG	2	12	796791	796802	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019845	TTCGTC	2	12	824567	824578	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019845	GAAGCG	2	12	836258	836269	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019845	CGTCGG	2	12	855775	855786	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019845	TTCGTC	2	12	859540	859551	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019845	CCGAAC	2	12	876540	876551	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019845	GGCCGC	2	12	885528	885539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019845	GGCAGG	2	12	899912	899923	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019845	GATGCG	2	12	931722	931733	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019845	CGGAGG	2	12	986560	986571	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019845	AAATAT	2	12	996982	996993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019845	CGATAG	2	12	1001328	1001339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019845	TATAGG	2	12	1014876	1014887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019845	TCAACG	2	12	1015975	1015986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019845	GGCCAT	2	12	1018803	1018814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019845	GTTAGA	2	12	1023458	1023469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019845	CTGGCT	2	12	1051922	1051933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019845	GCTTGC	2	12	1092851	1092862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019845	TTCGGC	2	12	1095540	1095551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019845	GTTTAC	2	12	1098605	1098616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019845	CTTCCC	2	12	1103117	1103128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019845	GAATCG	2	12	1115260	1115271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019845	GCGCGT	2	12	1123498	1123509	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019845	GTCCCG	2	12	1156618	1156629	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019845	CTCCAG	2	12	1167286	1167297	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019845	TTTCCG	2	12	1202699	1202710	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019845	GTGCCG	2	12	1212944	1212955	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019845	GCCTCA	2	12	1216419	1216430	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019845	TTCGTC	2	12	1270388	1270399	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019845	CGGCGC	2	12	1299895	1299906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019845	GCGGGG	2	12	1421380	1421391	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019845	GACGCG	2	12	1431964	1431975	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019845	CAGGAA	2	12	1448009	1448020	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019845	TGCCGG	2	12	1500104	1500115	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019845	CCGGCC	2	12	1503685	1503696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_019845	CGGCCG	2	12	1560563	1560574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019845	CGAATG	2	12	1567940	1567951	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019845	TTTCCT	2	12	1572698	1572709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019845	AGACGG	2	12	1625546	1625557	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019845	CAAATT	2	12	1653478	1653489	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019845	TCGGAA	2	12	1691835	1691846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019845	CGTTGA	2	12	1701582	1701593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019845	AGGCTG	2	12	1726120	1726131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019845	GGTGCT	2	12	1726168	1726179	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019845	ACCGAA	2	12	1757339	1757350	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019845	GCACCG	2	12	1787292	1787303	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019845	TTCGTC	2	12	1817759	1817770	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019845	TGAGAG	2	12	1826065	1826076	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019845	CGCCGG	2	12	1844915	1844926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019845	GGTCAT	2	12	1902578	1902589	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019845	TTCGTC	2	12	1945815	1945826	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019845	CTGTCG	2	12	1959701	1959712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019845	CGGTGC	2	12	2041747	2041758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019845	AGACCG	2	12	2041788	2041799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019845	ATGCCG	2	12	2077569	2077580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019845	AGAAGG	2	12	2129199	2129210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019845	CGGGAT	2	12	2181461	2181472	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_019845	CAAGGC	2	12	2189762	2189773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019845	TTAATT	2	12	2209095	2209106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019845	CCGCGT	2	12	2240150	2240161	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019845	GCCTCC	2	12	2252972	2252983	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_019845	CATTGG	2	12	2266619	2266630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019845	GTAACT	2	12	2286909	2286920	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019845	GGGCTG	2	12	2295829	2295840	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_019845	CCGGTT	2	12	2323209	2323220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019845	CGGCCG	2	12	2393110	2393121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019845	GAGGCC	2	12	2448545	2448556	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019845	TTTGCT	2	12	2469867	2469878	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019845	GCCGAC	2	12	2516135	2516146	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019845	CCGCGG	2	12	2516160	2516171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019845	TCGAGC	2	12	2517356	2517367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019845	TGATTC	2	12	2567730	2567741	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019845	GGACGA	2	12	2576250	2576261	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_019845	GCGATG	2	12	2605164	2605175	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019845	ATCTCC	2	12	2615542	2615553	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019845	AAATGA	2	12	2709814	2709825	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019845	GCGCTC	2	12	2716703	2716714	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019845	ACGATC	2	12	2716988	2716999	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019845	GCGGCC	2	12	2745608	2745619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019845	TCGCCC	2	12	2758685	2758696	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_019845	GGCTGC	2	12	2835918	2835929	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019845	ATGTGT	2	12	2838186	2838197	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019845	CCGGAT	2	12	2839441	2839452	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019845	GAGAAA	2	12	2842580	2842591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019845	TTTCTC	2	12	2844460	2844471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019845	GAATAA	2	12	2855223	2855234	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019845	GACCGA	2	12	2857569	2857580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019845	ACGTAA	2	12	2883304	2883315	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019845	AGCGGC	2	12	2927933	2927944	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019845	AGAGCG	2	12	2950055	2950066	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_019845	ACGCGC	2	12	2953635	2953646	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019845	GTCTAG	2	12	2983620	2983631	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019845	ACCTAT	2	12	3016170	3016181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019845	AAGGAA	2	12	3016485	3016496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019845	TCATGT	2	12	3077423	3077434	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019845	ACATGA	2	12	3077458	3077469	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_019845	GAAGCG	2	12	3094355	3094366	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_019845	GCGTTC	2	12	3099472	3099483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019845	ATTCCC	2	12	3149010	3149021	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019845	GATTGA	2	12	3172369	3172380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019845	GAAAAG	2	12	3174416	3174427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019845	TCGACC	2	12	3184789	3184800	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019845	CATCGA	2	12	3185633	3185644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019845	CAAGCG	2	12	3223738	3223749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019845	TATGTG	2	12	3250575	3250586	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019845	CCGGAT	2	12	3251880	3251891	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019845	GAGAAA	2	12	3255019	3255030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019845	TTTCTC	2	12	3256899	3256910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019845	CCGAGT	2	12	3280956	3280967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019845	ACGTAA	2	12	3360790	3360801	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_019845	CATGTT	2	12	3419510	3419521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_019845	TTCGTC	2	12	3470284	3470295	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019845	CAGCCC	2	12	3473928	3473939	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_019845	GGGGCC	2	12	3504571	3504582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019845	GAATCG	2	12	3505417	3505428	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_019845	GCATAT	2	12	3516847	3516858	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_019845	CCTCTC	2	12	3532406	3532417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_019845	CTCGGT	2	12	3581145	3581156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_019845	TTCGTC	2	12	3590286	3590297	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019845	CAAATA	2	12	3596130	3596141	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.