MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019842	TTTGAA	2	12	17404	17415	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019842	TCATAT	2	12	65446	65457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019842	AGTCAA	2	12	102040	102051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019842	TTTATT	2	12	208419	208430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019842	GTGAAA	2	12	208507	208518	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019842	AGGCTG	2	12	208655	208666	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019842	GAGAAT	2	12	265077	265088	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019842	GATAAA	2	12	313117	313128	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019842	TATTGA	2	12	314522	314533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019842	ACGATT	2	12	325957	325968	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019842	ATATCA	2	12	329362	329373	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019842	TGATAA	2	12	395353	395364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019842	TTTTTC	2	12	427668	427679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019842	AATAAA	2	12	452807	452818	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019842	CGGCTC	2	12	465753	465764	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019842	ATCATT	2	12	469598	469609	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019842	TAAAGA	2	12	515930	515941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019842	ATCCTC	2	12	523879	523890	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019842	TTTAAG	2	12	525346	525357	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019842	ATGTGA	2	12	556495	556506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019842	TTTCAA	2	12	581073	581084	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019842	TCGGAG	2	12	583868	583879	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019842	AAAAGG	2	12	624741	624752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019842	AGTGAA	2	12	636203	636214	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019842	CATCGT	2	12	636877	636888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019842	TCAATC	2	12	643462	643473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019842	CTTTCT	2	12	655709	655720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019842	TTTCTC	2	12	675657	675668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019842	AAATGA	2	12	706619	706630	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019842	GGTACA	2	12	719587	719598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019842	AAAAAT	2	12	729449	729460	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019842	GGCGGG	2	12	747832	747843	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019842	AGGGCC	2	12	749462	749473	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019842	TTTTTC	2	12	813531	813542	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019842	CTTTTT	2	12	820727	820738	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019842	GGATTT	2	12	821297	821308	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019842	TAAAAA	2	12	823119	823130	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019842	TCATTT	2	12	855048	855059	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019842	CTTTTT	2	12	863525	863536	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019842	AAAAAG	2	12	875153	875164	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019842	TTATAT	2	12	885829	885840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019842	GTGCTG	2	12	888682	888693	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019842	CATCTT	2	12	890533	890544	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019842	CCTTTC	2	12	927913	927924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019842	ATGAAA	2	12	928650	928661	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019842	ATGCTC	2	12	1029951	1029962	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019842	ATAATG	2	12	1040556	1040567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019842	TCTTTT	2	12	1046679	1046690	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019842	GAAAAA	2	12	1049707	1049718	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019842	GAAAAG	2	12	1055539	1055550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019842	TTACTA	2	12	1060700	1060711	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019842	CGCAAA	2	12	1060775	1060786	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019842	AGCGAA	2	12	1074193	1074204	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019842	GGAAGA	2	12	1074208	1074219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019842	GAACGG	2	12	1075057	1075068	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019842	CGCTTG	2	12	1075925	1075936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019842	GGCTGC	2	12	1161807	1161818	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019842	CTTATA	2	12	1176444	1176455	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019842	CCGAAG	2	12	1183885	1183896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019842	GTTAAC	2	12	1251220	1251231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019842	CTGTTT	2	12	1388655	1388666	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019842	TAATTG	2	12	1400408	1400419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019842	ATCATT	2	12	1413817	1413828	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019842	ATCATT	2	12	1417057	1417068	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019842	TCAAAC	2	12	1529295	1529306	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019842	CTTTTT	2	12	1573683	1573694	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019842	GATCGG	2	12	1606838	1606849	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_019842	TCCGGT	2	12	1651635	1651646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019842	TTCATT	2	12	1854637	1854648	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019842	TAAAAA	2	12	1867328	1867339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019842	GCGGAT	2	12	1868845	1868856	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019842	ATAAAA	2	12	1871960	1871971	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019842	AACTGA	2	12	1875322	1875333	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019842	TAATCA	2	12	1881991	1882002	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019842	CATATC	2	12	1882071	1882082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019842	TCCATA	4	24	1882087	1882110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019842	TAAAAA	2	12	1894371	1894382	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019842	TCTCTA	2	12	1926611	1926622	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019842	GTCATT	2	12	1929422	1929433	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019842	AAGAGA	2	12	2036467	2036478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019842	TAAAAA	2	12	2057620	2057631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019842	CTTTTT	2	12	2077108	2077119	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019842	CCTTCC	2	12	2108891	2108902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_019842	GCACTT	2	12	2143228	2143239	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019842	TTTATA	2	12	2149617	2149628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019842	AAATAA	2	12	2180011	2180022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019842	ATCAAA	2	12	2251448	2251459	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019842	CCGCGG	2	12	2268838	2268849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019842	ATAAAA	2	12	2403532	2403543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019842	CGTCAT	2	12	2418682	2418693	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019842	ATATTT	2	12	2422774	2422785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019842	CAATCT	2	12	2466909	2466920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019842	ACCGTT	2	12	2472581	2472592	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019842	TGAAAA	2	12	2475414	2475425	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019842	TTCTAA	2	12	2525306	2525317	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019842	TGACTT	2	12	2551426	2551437	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_019842	GAAGCA	2	12	2573268	2573279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019842	GGAGAA	2	12	2578552	2578563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019842	TTCTCC	2	12	2597069	2597080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019842	GAATCA	2	12	2706245	2706256	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019842	CCCTCT	2	12	2725536	2725547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019842	ATTGGA	2	12	2737644	2737655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019842	ATGTCG	2	12	2741575	2741586	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_019842	GCCGCT	2	12	2742917	2742928	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019842	CTCTTT	2	12	2772043	2772054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019842	CTTATA	2	12	2785147	2785158	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019842	TTTAAG	2	12	2798852	2798863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019842	TCTTTG	2	12	2800515	2800526	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_019842	GGAAAA	2	12	2815927	2815938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019842	CCAAAA	2	12	2827322	2827333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019842	TTCGTT	2	12	2836025	2836036	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019842	TTTTAA	2	12	2849622	2849633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019842	TTTTGC	2	12	2849649	2849660	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_019842	CTTATC	2	12	2865871	2865882	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019842	CTAAAA	2	12	2905880	2905891	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019842	TTAAGA	2	12	2967730	2967741	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019842	CTTCAT	2	12	2998057	2998068	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019842	ATTATC	2	12	3065737	3065748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_019842	ATTTTA	2	12	3076137	3076148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019842	AATGAA	2	12	3078865	3078876	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019842	TAAATG	2	12	3151308	3151319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019842	TAATGA	2	12	3189243	3189254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019842	AATAAC	2	12	3286964	3286975	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_019842	GAGAAA	2	12	3340392	3340403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019842	TTTCAT	2	12	3380432	3380443	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_019842	TCTTAT	2	12	3406789	3406800	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_019842	ATTTCA	2	12	3439783	3439794	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019842	GATGAA	2	12	3477126	3477137	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019842	ATTCCC	2	12	3501067	3501078	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019842	AAATAT	2	12	3530517	3530528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019842	AATCCG	2	12	3555837	3555848	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019842	CAAAAA	2	12	3602817	3602828	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_019842	ACATAT	2	12	3602867	3602878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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135	NC_019842	CAAAAA	2	12	3623159	3623170	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_019842	GCTCCG	2	12	3681853	3681864	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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148	NC_019842	GAAAAA	2	12	3958882	3958893	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.