MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 2636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019842	ATCGG	2	10	774	783	20 %	20 %	40 %	20 %	429503532
2	NC_019842	AATTT	2	10	2270	2279	40 %	60 %	0 %	0 %	429503533
3	NC_019842	CTGAG	2	10	2561	2570	20 %	20 %	40 %	20 %	429503533
4	NC_019842	AGTGA	2	10	4541	4550	40 %	20 %	40 %	0 %	429503535
5	NC_019842	TTGCA	2	10	5642	5651	20 %	40 %	20 %	20 %	429503537
6	NC_019842	TTCGG	2	10	7329	7338	0 %	40 %	40 %	20 %	429503538
7	NC_019842	ACGAT	2	10	8662	8671	40 %	20 %	20 %	20 %	429503538
8	NC_019842	CTTCA	2	10	15374	15383	20 %	40 %	0 %	40 %	429503539
9	NC_019842	AATAA	2	10	15691	15700	80 %	20 %	0 %	0 %	429503539
10	NC_019842	CTGAA	2	10	16665	16674	40 %	20 %	20 %	20 %	429503540
11	NC_019842	AAGAG	2	10	17212	17221	60 %	0 %	40 %	0 %	429503540
12	NC_019842	AGCAC	2	10	18277	18286	40 %	0 %	20 %	40 %	429503541
13	NC_019842	CGGAA	2	10	18289	18298	40 %	0 %	40 %	20 %	429503541
14	NC_019842	AGAGA	2	10	20923	20932	60 %	0 %	40 %	0 %	429503544
15	NC_019842	CCAAG	2	10	21837	21846	40 %	0 %	20 %	40 %	429503544
16	NC_019842	ATCTG	2	10	22403	22412	20 %	40 %	20 %	20 %	429503545
17	NC_019842	CCCGC	2	10	22868	22877	0 %	0 %	20 %	80 %	429503545
18	NC_019842	ACTCC	2	10	24799	24808	20 %	20 %	0 %	60 %	429503547
19	NC_019842	GTTTT	2	10	25763	25772	0 %	80 %	20 %	0 %	429503548
20	NC_019842	ATGAC	2	10	29985	29994	40 %	20 %	20 %	20 %	429503553
21	NC_019842	AGGCA	2	10	30670	30679	40 %	0 %	40 %	20 %	429503555
22	NC_019842	GAAGC	2	10	30862	30871	40 %	0 %	40 %	20 %	429503555
23	NC_019842	TTGCT	2	10	31004	31013	0 %	60 %	20 %	20 %	429503556
24	NC_019842	AAGAA	2	10	36877	36886	80 %	0 %	20 %	0 %	429503558
25	NC_019842	TGCTC	2	10	37114	37123	0 %	40 %	20 %	40 %	429503558
26	NC_019842	AAAGA	2	10	37521	37530	80 %	0 %	20 %	0 %	429503559
27	NC_019842	CTGAT	2	10	37557	37566	20 %	40 %	20 %	20 %	429503559
28	NC_019842	TGTGC	2	10	40208	40217	0 %	40 %	40 %	20 %	429503561
29	NC_019842	GAAAA	2	10	41508	41517	80 %	0 %	20 %	0 %	429503564
30	NC_019842	GCAGA	2	10	43492	43501	40 %	0 %	40 %	20 %	429503566
31	NC_019842	GCGAT	2	10	46497	46506	20 %	20 %	40 %	20 %	429503571
32	NC_019842	TGACA	2	10	48673	48682	40 %	20 %	20 %	20 %	429503572
33	NC_019842	TCAAA	2	10	51326	51335	60 %	20 %	0 %	20 %	429503574
34	NC_019842	TGAAG	2	10	58140	58149	40 %	20 %	40 %	0 %	429503583
35	NC_019842	AAGCA	2	10	58194	58203	60 %	0 %	20 %	20 %	429503583
36	NC_019842	ATTGA	2	10	60346	60355	40 %	40 %	20 %	0 %	429503586
37	NC_019842	AACAC	2	10	61080	61089	60 %	0 %	0 %	40 %	429503587
38	NC_019842	TTTGC	2	10	63112	63121	0 %	60 %	20 %	20 %	429503588
39	NC_019842	AACGG	2	10	63341	63350	40 %	0 %	40 %	20 %	429503588
40	NC_019842	CGGCG	2	10	65864	65873	0 %	0 %	60 %	40 %	429503590
41	NC_019842	ATGAT	2	10	65989	65998	40 %	40 %	20 %	0 %	429503590
42	NC_019842	GACGG	2	10	66327	66336	20 %	0 %	60 %	20 %	429503590
43	NC_019842	TGCCG	2	10	68199	68208	0 %	20 %	40 %	40 %	429503591
44	NC_019842	GGAGA	2	10	68577	68586	40 %	0 %	60 %	0 %	429503591
45	NC_019842	GAAAG	2	10	71121	71130	60 %	0 %	40 %	0 %	429503597
46	NC_019842	GGCCT	2	10	71741	71750	0 %	20 %	40 %	40 %	429503598
47	NC_019842	TTTCA	2	10	71883	71892	20 %	60 %	0 %	20 %	429503598
48	NC_019842	GTTCG	2	10	73009	73018	0 %	40 %	40 %	20 %	429503598
49	NC_019842	CGGGC	2	10	74304	74313	0 %	0 %	60 %	40 %	429503599
50	NC_019842	TTATT	2	10	77707	77716	20 %	80 %	0 %	0 %	429503603
51	NC_019842	TGAAG	2	10	82213	82222	40 %	20 %	40 %	0 %	429503606
52	NC_019842	CGGAG	2	10	82741	82750	20 %	0 %	60 %	20 %	429503607
53	NC_019842	GATCA	2	10	83126	83135	40 %	20 %	20 %	20 %	429503607
54	NC_019842	CGGAA	2	10	83766	83775	40 %	0 %	40 %	20 %	429503608
55	NC_019842	AGCGG	2	10	85218	85227	20 %	0 %	60 %	20 %	429503609
56	NC_019842	GGCCG	2	10	88953	88962	0 %	0 %	60 %	40 %	429503615
57	NC_019842	AGATC	2	10	103040	103049	40 %	20 %	20 %	20 %	429503618
58	NC_019842	GGGAC	2	10	103616	103625	20 %	0 %	60 %	20 %	429503619
59	NC_019842	TCAAA	2	10	103772	103781	60 %	20 %	0 %	20 %	429503619
60	NC_019842	GAACA	2	10	104501	104510	60 %	0 %	20 %	20 %	429503620
61	NC_019842	AAATG	2	10	107499	107508	60 %	20 %	20 %	0 %	429503621
62	NC_019842	CGGAA	2	10	108744	108753	40 %	0 %	40 %	20 %	429503622
63	NC_019842	CCGTA	2	10	109617	109626	20 %	20 %	20 %	40 %	429503623
64	NC_019842	GAAAA	2	10	113761	113770	80 %	0 %	20 %	0 %	429503627
65	NC_019842	GTTTG	2	10	115187	115196	0 %	60 %	40 %	0 %	429503628
66	NC_019842	TGAAT	2	10	118873	118882	40 %	40 %	20 %	0 %	429503635
67	NC_019842	TTGAA	2	10	121270	121279	40 %	40 %	20 %	0 %	429503639
68	NC_019842	GACCG	2	10	121924	121933	20 %	0 %	40 %	40 %	429503640
69	NC_019842	GTGAA	2	10	126251	126260	40 %	20 %	40 %	0 %	429503642
70	NC_019842	ACCGG	2	10	127090	127099	20 %	0 %	40 %	40 %	429503642
71	NC_019842	GAAGA	2	10	127933	127942	60 %	0 %	40 %	0 %	429503642
72	NC_019842	CAAAG	2	10	128203	128212	60 %	0 %	20 %	20 %	429503642
73	NC_019842	GTGCT	2	10	128747	128756	0 %	40 %	40 %	20 %	429503642
74	NC_019842	CTGAC	2	10	129287	129296	20 %	20 %	20 %	40 %	429503642
75	NC_019842	GTCCT	2	10	129524	129533	0 %	40 %	20 %	40 %	429503642
76	NC_019842	AACAT	2	10	130299	130308	60 %	20 %	0 %	20 %	429503644
77	NC_019842	CAATT	2	10	131767	131776	40 %	40 %	0 %	20 %	429503646
78	NC_019842	CTGAA	2	10	131998	132007	40 %	20 %	20 %	20 %	429503646
79	NC_019842	GAGGG	2	10	135368	135377	20 %	0 %	80 %	0 %	429503648
80	NC_019842	CAAAA	2	10	135995	136004	80 %	0 %	0 %	20 %	429503649
81	NC_019842	AATCA	2	10	137322	137331	60 %	20 %	0 %	20 %	429503651
82	NC_019842	TGGTA	2	10	139684	139693	20 %	40 %	40 %	0 %	429503656
83	NC_019842	AAAGT	2	10	140599	140608	60 %	20 %	20 %	0 %	429503658
84	NC_019842	CAAAC	2	10	144595	144604	60 %	0 %	0 %	40 %	429503668
85	NC_019842	TAAAT	2	10	147442	147451	60 %	40 %	0 %	0 %	429503672
86	NC_019842	AAACA	2	10	149012	149021	80 %	0 %	0 %	20 %	429503676
87	NC_019842	TTATC	2	10	150094	150103	20 %	60 %	0 %	20 %	429503677
88	NC_019842	TTAAA	2	10	151773	151782	60 %	40 %	0 %	0 %	429503679
89	NC_019842	CGTTT	2	10	153117	153126	0 %	60 %	20 %	20 %	429503681
90	NC_019842	ATGGA	2	10	153184	153193	40 %	20 %	40 %	0 %	429503681
91	NC_019842	GCACC	2	10	154273	154282	20 %	0 %	20 %	60 %	429503682
92	NC_019842	TGCTT	2	10	155197	155206	0 %	60 %	20 %	20 %	429503684
93	NC_019842	ATTCC	2	10	156020	156029	20 %	40 %	0 %	40 %	429503685
94	NC_019842	AAACA	2	10	159758	159767	80 %	0 %	0 %	20 %	429503690
95	NC_019842	TTTTC	2	10	159930	159939	0 %	80 %	0 %	20 %	429503691
96	NC_019842	ATTAT	2	10	179208	179217	40 %	60 %	0 %	0 %	429503694
97	NC_019842	TTGAA	2	10	179858	179867	40 %	40 %	20 %	0 %	429503695
98	NC_019842	CGGAC	2	10	180622	180631	20 %	0 %	40 %	40 %	429503696
99	NC_019842	AATGG	2	10	180826	180835	40 %	20 %	40 %	0 %	429503696
100	NC_019842	TGGCT	2	10	183970	183979	0 %	40 %	40 %	20 %	429503698
101	NC_019842	GCGGA	2	10	184465	184474	20 %	0 %	60 %	20 %	429503699
102	NC_019842	CTTTT	2	10	185996	186005	0 %	80 %	0 %	20 %	429503701
103	NC_019842	TCCGA	2	10	186157	186166	20 %	20 %	20 %	40 %	429503701
104	NC_019842	TCCTT	2	10	187856	187865	0 %	60 %	0 %	40 %	429503702
105	NC_019842	TAAAA	2	10	197113	197122	80 %	20 %	0 %	0 %	429503709
106	NC_019842	AAGAT	2	10	198673	198682	60 %	20 %	20 %	0 %	429503711
107	NC_019842	CTGAG	2	10	200206	200215	20 %	20 %	40 %	20 %	429503713
108	NC_019842	AGTGA	2	10	200589	200598	40 %	20 %	40 %	0 %	429503713
109	NC_019842	CATTG	2	10	200811	200820	20 %	40 %	20 %	20 %	429503714
110	NC_019842	ATGAA	2	10	203320	203329	60 %	20 %	20 %	0 %	429503715
111	NC_019842	CTGCA	2	10	205743	205752	20 %	20 %	20 %	40 %	429503716
112	NC_019842	TCATT	2	10	207689	207698	20 %	60 %	0 %	20 %	429503718
113	NC_019842	GGATC	2	10	210519	210528	20 %	20 %	40 %	20 %	429503720
114	NC_019842	AATAA	2	10	212069	212078	80 %	20 %	0 %	0 %	429503722
115	NC_019842	AATTT	2	10	213569	213578	40 %	60 %	0 %	0 %	429503724
116	NC_019842	CGGGG	2	10	216105	216114	0 %	0 %	80 %	20 %	429503726
117	NC_019842	TTTTA	2	10	218326	218335	20 %	80 %	0 %	0 %	429503729
118	NC_019842	GATGC	2	10	218819	218828	20 %	20 %	40 %	20 %	429503729
119	NC_019842	AATCA	2	10	218929	218938	60 %	20 %	0 %	20 %	429503729
120	NC_019842	ATTGG	2	10	221898	221907	20 %	40 %	40 %	0 %	429503734
121	NC_019842	ATCGT	2	10	224007	224016	20 %	40 %	20 %	20 %	429503736
122	NC_019842	AAATG	2	10	226382	226391	60 %	20 %	20 %	0 %	429503738
123	NC_019842	CCAAG	2	10	226786	226795	40 %	0 %	20 %	40 %	429503738
124	NC_019842	GAACG	2	10	227858	227867	40 %	0 %	40 %	20 %	429503740
125	NC_019842	TGAGC	2	10	228319	228328	20 %	20 %	40 %	20 %	429503740
126	NC_019842	GCCCG	2	10	228849	228858	0 %	0 %	40 %	60 %	429503740
127	NC_019842	TTTTA	2	10	229902	229911	20 %	80 %	0 %	0 %	429503742
128	NC_019842	CCGCT	2	10	230435	230444	0 %	20 %	20 %	60 %	429503742
129	NC_019842	AAGGG	2	10	232490	232499	40 %	0 %	60 %	0 %	429503744
130	NC_019842	ACGGT	2	10	238677	238686	20 %	20 %	40 %	20 %	429503752
131	NC_019842	GGTCT	2	10	239564	239573	0 %	40 %	40 %	20 %	429503753
132	NC_019842	GACGG	2	10	239766	239775	20 %	0 %	60 %	20 %	429503753
133	NC_019842	AAGAA	2	10	241198	241207	80 %	0 %	20 %	0 %	429503754
134	NC_019842	AATAA	2	10	243169	243178	80 %	20 %	0 %	0 %	429503755
135	NC_019842	AAAAT	2	10	245333	245342	80 %	20 %	0 %	0 %	429503757
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251	NC_019842	AATGG	2	10	422162	422171	40 %	20 %	40 %	0 %	429503909
252	NC_019842	AAGGT	2	10	422820	422829	40 %	20 %	40 %	0 %	429503910
253	NC_019842	GGGGA	2	10	423053	423062	20 %	0 %	80 %	0 %	429503911
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