MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 1552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019842	ATTA	2	8	1905	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019842	TAAA	2	8	9718	9725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019842	AGTC	2	8	9744	9751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019842	CCTG	2	8	9887	9894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019842	GTGA	2	8	10169	10176	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019842	AGCC	2	8	11206	11213	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019842	AAGC	2	8	11731	11738	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019842	CACG	2	8	12427	12434	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019842	GCGA	2	8	13215	13222	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019842	TAGG	2	8	13788	13795	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019842	CGGG	2	8	13884	13891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019842	ATCG	2	8	14549	14556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019842	ATGA	2	8	17448	17455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019842	AAGA	2	8	18807	18814	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019842	ATCT	2	8	18884	18891	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019842	TGAA	2	8	26347	26354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019842	ATTT	2	8	27602	27609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019842	TAAG	2	8	27708	27715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019842	GGAA	2	8	27770	27777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019842	ATAA	2	8	30054	30061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019842	TAAA	2	8	31435	31442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019842	AGTC	2	8	31461	31468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019842	CCTG	2	8	31604	31611	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019842	GTGA	2	8	31886	31893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019842	AGCC	2	8	32940	32947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019842	AAGC	2	8	33195	33202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019842	CACG	2	8	33891	33898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019842	GCGA	2	8	34679	34686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019842	TAGG	2	8	35237	35244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019842	CGGG	2	8	35333	35340	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019842	ATCG	2	8	35976	35983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019842	AATA	2	8	36658	36665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019842	AATG	2	8	40597	40604	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019842	ATTG	2	8	46037	46044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019842	AGTA	2	8	46062	46069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019842	TTTA	2	8	46245	46252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019842	ATAG	2	8	46307	46314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019842	CTTC	2	8	49305	49312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019842	ATTC	2	8	52328	52335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019842	TGTA	2	8	56523	56530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019842	CCCG	2	8	60176	60183	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_019842	GAGG	2	8	60229	60236	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019842	ATAA	2	8	60812	60819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019842	TTTA	2	8	70282	70289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019842	AAAC	2	8	70299	70306	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019842	GCCG	2	8	75515	75522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019842	CTGC	2	8	77577	77584	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019842	TAAA	2	8	91155	91162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019842	AGTC	2	8	91181	91188	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019842	CCTG	2	8	91324	91331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019842	GTGA	2	8	91606	91613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019842	AGCC	2	8	92660	92667	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019842	AAGC	2	8	93011	93018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019842	CACG	2	8	93706	93713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019842	GCGA	2	8	94494	94501	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019842	TAGG	2	8	95068	95075	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019842	CGGG	2	8	95164	95171	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019842	ATCG	2	8	95829	95836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019842	CATT	2	8	96593	96600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019842	TTGA	2	8	96908	96915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019842	TAAA	2	8	96980	96987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019842	AGTC	2	8	97006	97013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019842	CCTG	2	8	97149	97156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019842	GTGA	2	8	97431	97438	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019842	AGCC	2	8	98485	98492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019842	AAGC	2	8	98836	98843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019842	CACG	2	8	99532	99539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019842	GCGA	2	8	100320	100327	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019842	TAGG	2	8	100895	100902	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019842	CGGG	2	8	100991	100998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019842	ATCG	2	8	101656	101663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019842	GTAA	2	8	106648	106655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019842	AGAA	2	8	113165	113172	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019842	TCTA	2	8	117203	117210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019842	AATG	2	8	117944	117951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019842	GGGA	2	8	118472	118479	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019842	AGCT	2	8	119107	119114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019842	TCAT	2	8	119125	119132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019842	TGAT	2	8	126117	126124	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019842	AAAT	2	8	130726	130733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019842	GCTT	2	8	133420	133427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019842	TAAA	2	8	135819	135826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019842	AAAT	2	8	141449	141456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019842	AAGG	2	8	141801	141808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019842	ATCA	2	8	148073	148080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019842	TTTG	2	8	149393	149400	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019842	TTAT	2	8	149442	149449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019842	GTAT	2	8	154381	154388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019842	TTGT	2	8	155428	155435	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019842	TGGC	2	8	156849	156856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019842	GGGA	2	8	157349	157356	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019842	TCCT	2	8	159806	159813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019842	TAAA	2	8	161564	161571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019842	AGTC	2	8	161590	161597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019842	CCTG	2	8	161733	161740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019842	GTGA	2	8	162015	162022	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019842	AGCC	2	8	163068	163075	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019842	AAGC	2	8	163419	163426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019842	CACG	2	8	164115	164122	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019842	GCGA	2	8	164903	164910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019842	TAGG	2	8	165476	165483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019842	CGGG	2	8	165572	165579	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019842	ATCG	2	8	166237	166244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019842	TAAT	2	8	166780	166787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019842	AATA	2	8	166895	166902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019842	ATTG	2	8	167062	167069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019842	AGCC	2	8	167982	167989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019842	AAGC	2	8	168507	168514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019842	CACG	2	8	169203	169210	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019842	GCGA	2	8	169991	169998	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019842	TAGG	2	8	170566	170573	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019842	CGGG	2	8	170662	170669	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019842	ATCG	2	8	171326	171333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019842	TAAA	2	8	171832	171839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019842	AGTC	2	8	171858	171865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019842	CCTG	2	8	172001	172008	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019842	GTGA	2	8	172283	172290	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019842	AGCC	2	8	173337	173344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019842	AAGC	2	8	173688	173695	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019842	CACG	2	8	174384	174391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019842	GCGA	2	8	175172	175179	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019842	TAGG	2	8	175746	175753	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019842	CGGG	2	8	175842	175849	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019842	ATCG	2	8	176507	176514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019842	AAGA	2	8	178150	178157	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019842	TTAT	2	8	181503	181510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019842	AATG	2	8	183199	183206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019842	CATT	2	8	189661	189668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019842	AAAT	2	8	189701	189708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019842	GGAA	2	8	191108	191115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019842	GCCT	2	8	191128	191135	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019842	TGTC	2	8	191144	191151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019842	CCGG	2	8	191515	191522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019842	GCTT	2	8	192112	192119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019842	TCCC	2	8	194286	194293	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_019842	CCTG	2	8	198488	198495	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019842	ATAC	2	8	205867	205874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019842	ATGC	2	8	205992	205999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019842	AATC	2	8	206059	206066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019842	GCAG	2	8	207813	207820	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019842	CCGC	2	8	207821	207828	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_019842	AATC	2	8	207881	207888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019842	TTTC	2	8	208337	208344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019842	ATGA	2	8	208601	208608	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019842	GGAA	2	8	210989	210996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019842	AGGG	2	8	221392	221399	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019842	TATG	2	8	227023	227030	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019842	TCCA	2	8	227108	227115	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019842	AATA	2	8	227207	227214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019842	TTCA	2	8	231917	231924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019842	AGGA	3	12	232241	232252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019842	ATCT	2	8	234590	234597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_019842	AGGG	2	8	234645	234652	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019842	TCAT	2	8	236023	236030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_019842	CGGA	2	8	238449	238456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_019842	GAAA	2	8	240893	240900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019842	AAAG	2	8	241144	241151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019842	CCTT	2	8	244739	244746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_019842	AGTA	2	8	250085	250092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_019842	ACAT	2	8	253966	253973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_019842	ATAA	2	8	263079	263086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_019842	TCTA	2	8	266352	266359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_019842	GGAG	2	8	282484	282491	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_019842	TTGA	2	8	283207	283214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
176	NC_019842	GAAA	2	8	283278	283285	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
177	NC_019842	GAAA	2	8	283323	283330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_019842	TAAA	2	8	283984	283991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_019842	TAAA	2	8	284166	284173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_019842	TTTG	2	8	286900	286907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_019842	AAAG	2	8	323861	323868	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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