MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 46314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019842	CGA	2	6	499	504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503532
2	NC_019842	GAA	2	6	624	629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503532
3	NC_019842	GAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503532
4	NC_019842	GCA	2	6	801	806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503532
5	NC_019842	GTG	2	6	939	944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429503532
6	NC_019842	TCT	2	6	951	956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503532
7	NC_019842	TCA	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503532
8	NC_019842	ATA	2	6	994	999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503532
9	NC_019842	GAT	2	6	1050	1055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503532
10	NC_019842	GAA	2	6	1122	1127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503532
11	NC_019842	CCG	2	6	1158	1163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503532
12	NC_019842	CCG	2	6	1233	1238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503532
13	NC_019842	ATT	2	6	1443	1448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503532
14	NC_019842	TCT	2	6	1452	1457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503532
15	NC_019842	CAG	2	6	1503	1508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503532
16	NC_019842	TTC	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503532
17	NC_019842	GAA	2	6	1629	1634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503532
18	NC_019842	CTG	2	6	1689	1694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503532
19	NC_019842	TGA	2	6	1697	1702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503532
20	NC_019842	AGC	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503532
21	NC_019842	CAG	3	9	1713	1721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503532
22	NC_019842	ATA	2	6	1748	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503532
23	NC_019842	TCG	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503533
24	NC_019842	AGA	3	9	2112	2120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503533
25	NC_019842	TGC	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503533
26	NC_019842	TTC	2	6	2176	2181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503533
27	NC_019842	ATT	2	6	2454	2459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503533
28	NC_019842	TGA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503533
29	NC_019842	TAT	2	6	2648	2653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503533
30	NC_019842	TCT	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503533
31	NC_019842	TCG	2	6	2726	2731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503533
32	NC_019842	CTT	2	6	2768	2773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503533
33	NC_019842	CAA	2	6	2793	2798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503533
34	NC_019842	CGG	2	6	2822	2827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503533
35	NC_019842	TCA	2	6	2842	2847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503533
36	NC_019842	ATG	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503533
37	NC_019842	ATA	2	6	3202	3207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503534
38	NC_019842	CGG	2	6	3284	3289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503534
39	NC_019842	CAA	2	6	3329	3334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503534
40	NC_019842	CGC	2	6	3348	3353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503534
41	NC_019842	GTC	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503534
42	NC_019842	ATC	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503535
43	NC_019842	TGA	2	6	3658	3663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503535
44	NC_019842	AGC	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503535
45	NC_019842	GAG	3	9	3827	3835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503535
46	NC_019842	AGC	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503535
47	NC_019842	GAA	2	6	4092	4097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503535
48	NC_019842	ATT	2	6	4220	4225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503535
49	NC_019842	GAT	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503535
50	NC_019842	CAG	2	6	4296	4301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503535
51	NC_019842	ACG	2	6	4305	4310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503535
52	NC_019842	GAA	2	6	4350	4355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503535
53	NC_019842	GAT	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503535
54	NC_019842	GAT	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503535
55	NC_019842	CAC	2	6	4463	4468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429503535
56	NC_019842	GAC	2	6	4586	4591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503536
57	NC_019842	TCG	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503536
58	NC_019842	GAA	2	6	4658	4663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503536
59	NC_019842	AGT	2	6	4687	4692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503536
60	NC_019842	GAA	2	6	4774	4779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503536
61	NC_019842	CAG	2	6	4876	4881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503537
62	NC_019842	ATG	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503537
63	NC_019842	CAC	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429503537
64	NC_019842	TCG	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503537
65	NC_019842	ACA	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503537
66	NC_019842	GCC	2	6	5135	5140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503537
67	NC_019842	TCA	2	6	5153	5158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503537
68	NC_019842	CGG	2	6	5175	5180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503537
69	NC_019842	CGG	2	6	5211	5216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503537
70	NC_019842	AAC	2	6	5409	5414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503537
71	NC_019842	AAG	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503537
72	NC_019842	AAT	2	6	5692	5697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503537
73	NC_019842	AAG	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503537
74	NC_019842	GAT	2	6	5818	5823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503537
75	NC_019842	ATT	2	6	5845	5850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503537
76	NC_019842	TCT	2	6	5941	5946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503537
77	NC_019842	CTT	2	6	5962	5967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503537
78	NC_019842	TTC	2	6	6111	6116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503537
79	NC_019842	TCA	2	6	6359	6364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503537
80	NC_019842	TTA	2	6	6406	6411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503537
81	NC_019842	TTC	2	6	6415	6420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503537
82	NC_019842	ATC	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503537
83	NC_019842	GCC	2	6	6471	6476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503537
84	NC_019842	GCA	2	6	6489	6494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503537
85	NC_019842	AGC	2	6	6527	6532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503537
86	NC_019842	TGA	2	6	6534	6539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503537
87	NC_019842	TCG	2	6	7210	7215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503538
88	NC_019842	ACC	2	6	7234	7239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429503538
89	NC_019842	TTG	2	6	7309	7314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503538
90	NC_019842	TCC	2	6	7405	7410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429503538
91	NC_019842	GTC	2	6	7473	7478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503538
92	NC_019842	TCC	2	6	7550	7555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429503538
93	NC_019842	CAT	2	6	7756	7761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503538
94	NC_019842	CTG	2	6	8001	8006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503538
95	NC_019842	TTG	2	6	8341	8346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503538
96	NC_019842	ATG	2	6	8440	8445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503538
97	NC_019842	TCA	2	6	8521	8526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503538
98	NC_019842	TTC	2	6	8676	8681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503538
99	NC_019842	TAA	2	6	8684	8689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503538
100	NC_019842	ATT	2	6	8757	8762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503538
101	NC_019842	TAT	2	6	8801	8806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503538
102	NC_019842	TGA	2	6	8822	8827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503538
103	NC_019842	CTT	2	6	8840	8845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503538
104	NC_019842	ATC	3	9	8982	8990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503538
105	NC_019842	GAA	2	6	8996	9001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503538
106	NC_019842	GAT	2	6	9087	9092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503538
107	NC_019842	GTA	2	6	9096	9101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503538
108	NC_019842	GAA	2	6	9117	9122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503538
109	NC_019842	CAA	2	6	9265	9270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503538
110	NC_019842	ATT	2	6	9291	9296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503538
111	NC_019842	GCG	2	6	9304	9309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503538
112	NC_019842	GAA	2	6	9429	9434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503538
113	NC_019842	GAA	2	6	9441	9446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503538
114	NC_019842	GAA	2	6	9450	9455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503538
115	NC_019842	CGG	2	6	14847	14852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503539
116	NC_019842	ATC	2	6	14853	14858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503539
117	NC_019842	ATC	2	6	14864	14869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503539
118	NC_019842	CAG	2	6	14885	14890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503539
119	NC_019842	ACC	2	6	14896	14901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429503539
120	NC_019842	ATC	2	6	14922	14927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503539
121	NC_019842	AAT	2	6	14947	14952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503539
122	NC_019842	ATG	2	6	15122	15127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503539
123	NC_019842	TTC	2	6	15288	15293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503539
124	NC_019842	TTC	2	6	15305	15310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503539
125	NC_019842	AGA	2	6	15480	15485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503539
126	NC_019842	ACA	2	6	15517	15522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503539
127	NC_019842	TTC	2	6	15632	15637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503539
128	NC_019842	AAG	2	6	15873	15878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503540
129	NC_019842	GAT	2	6	15890	15895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503540
130	NC_019842	TCA	2	6	15987	15992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503540
131	NC_019842	GGC	2	6	16049	16054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503540
132	NC_019842	CAG	2	6	16088	16093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503540
133	NC_019842	TTA	2	6	16134	16139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503540
134	NC_019842	CTT	2	6	16147	16152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503540
135	NC_019842	ATC	2	6	16164	16169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503540
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139	NC_019842	TTA	2	6	16443	16448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503540
140	NC_019842	TTG	2	6	16569	16574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503540
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142	NC_019842	CGG	2	6	16873	16878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503540
143	NC_019842	AGA	2	6	16997	17002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503540
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146	NC_019842	CGG	2	6	17158	17163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503540
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150	NC_019842	TGA	2	6	17754	17759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503541
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154	NC_019842	CTT	2	6	18076	18081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503541
155	NC_019842	ACA	2	6	18121	18126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503541
156	NC_019842	TGA	3	9	18159	18167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503541
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158	NC_019842	TGA	2	6	18354	18359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503541
159	NC_019842	ATG	2	6	18695	18700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503541
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161	NC_019842	CGG	2	6	18741	18746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503541
162	NC_019842	TTC	2	6	18748	18753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503541
163	NC_019842	AAT	2	6	18995	19000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503542
164	NC_019842	GGC	2	6	19053	19058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503542
165	NC_019842	TCA	2	6	19060	19065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503542
166	NC_019842	CGG	2	6	19163	19168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503542
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249	NC_019842	TGT	2	6	26944	26949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503549
250	NC_019842	GAA	2	6	27086	27091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503550
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376	NC_019842	CGG	2	6	40923	40928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503562
377	NC_019842	TCC	2	6	40943	40948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429503562
378	NC_019842	TCA	2	6	40962	40967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503562
379	NC_019842	AGC	3	9	41027	41035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503563
380	NC_019842	AGC	2	6	41092	41097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503563
381	NC_019842	AGC	2	6	41281	41286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503563
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384	NC_019842	GAC	2	6	41804	41809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503564
385	NC_019842	GCA	2	6	41814	41819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503564
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390	NC_019842	ATA	2	6	42025	42030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503564
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396	NC_019842	TTG	2	6	42525	42530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503565
397	NC_019842	ATG	2	6	42591	42596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503565
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400	NC_019842	AGA	2	6	42655	42660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503565
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403	NC_019842	CGG	2	6	42895	42900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503565
404	NC_019842	TGC	2	6	42926	42931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503565
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496	NC_019842	AAG	2	6	50261	50266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503573
497	NC_019842	AGA	2	6	50286	50291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503573
498	NC_019842	AGC	2	6	50357	50362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503573
499	NC_019842	TCT	2	6	50383	50388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503573
500	NC_019842	ATT	2	6	50847	50852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503574

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