MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii (ex Angomonas deanei ATCC 30255)

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019815	TTTTAT	2	12	10377	10388	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019815	TTGTGT	2	12	16576	16587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019815	AATACA	2	12	44031	44042	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019815	TAAATT	2	12	60365	60376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019815	AAAATC	2	12	60384	60395	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019815	ATATTT	2	12	96718	96729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019815	AAATAT	2	12	96732	96743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019815	TGTTTT	2	12	116747	116758	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019815	TTCAAT	2	12	163855	163866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019815	TAAATA	2	12	174882	174893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019815	ATTTTA	2	12	193665	193676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019815	ATTTTT	2	12	195593	195604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019815	ATTTTT	2	12	205844	205855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019815	TTAATA	2	12	245708	245719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019815	ATTAAT	2	12	246192	246203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019815	TTTTAT	2	12	248634	248645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019815	ATTTTT	2	12	248716	248727	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019815	TATTTT	2	12	256359	256370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019815	TGTTTT	2	12	256436	256447	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019815	AATAAA	2	12	290876	290887	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019815	AAAGAA	2	12	291600	291611	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019815	TATAAA	2	12	305923	305934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019815	TAAAAA	2	12	321715	321726	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019815	TGTTAT	2	12	336921	336932	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019815	TTAAAT	2	12	337072	337083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019815	ATGCTA	2	12	372330	372341	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019815	ATTTGT	2	12	373600	373611	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019815	TTTAAC	2	12	379637	379648	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019815	TTATAT	2	12	435430	435441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019815	TAAATT	2	12	451692	451703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019815	ATTTAA	2	12	454914	454925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019815	ATATTT	2	12	455265	455276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019815	ATAATT	2	12	463152	463163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019815	CAGAAA	2	12	467809	467820	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019815	AATTAT	2	12	469596	469607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019815	AAAAAG	2	12	474451	474462	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019815	AATTTA	2	12	506914	506925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019815	TAACGA	2	12	509001	509012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019815	ACAAAA	2	12	515846	515857	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019815	TTTTAA	2	12	529130	529141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019815	GTATGT	2	12	567590	567601	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019815	TGATTG	2	12	580056	580067	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019815	ATACTA	2	12	598715	598726	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019815	AAAACT	2	12	623978	623989	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019815	ATTAGA	2	12	624064	624075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019815	ATTTAG	2	12	649503	649514	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019815	AATTTT	2	12	696635	696646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019815	ATATTT	2	12	714508	714519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019815	GTAATA	2	12	764583	764594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019815	TATCTT	2	12	764615	764626	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019815	TATTTT	2	12	767767	767778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019815	TAATAT	2	12	770775	770786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019815	AAATTA	2	12	786684	786695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019815	TACTGT	2	12	792124	792135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019815	CTTTAT	2	12	812939	812950	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.