MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii (ex Angomonas deanei ATCC 30255)

Total Repeats: 355

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019815	TTAGAC	2	12	7491	7502	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429462520
2	NC_019815	AGGTAC	2	12	8030	8041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429462520
3	NC_019815	GATTCT	2	12	9384	9395	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429462520
4	NC_019815	CAAGAT	2	12	10820	10831	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429462522
5	NC_019815	TTTATA	2	12	15309	15320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429462526
6	NC_019815	GATGGA	2	12	18530	18541	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	429462530
7	NC_019815	CTATTG	2	12	31449	31460	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429462540
8	NC_019815	GATGTG	2	12	44890	44901	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	429462543
9	NC_019815	TGCTAA	2	12	45693	45704	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429462544
10	NC_019815	TCTTTA	2	12	52172	52183	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429462547
11	NC_019815	CATAGC	2	12	55476	55487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429462550
12	NC_019815	GGGTGA	2	12	55608	55619	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	429462550
13	NC_019815	ACTAGA	2	12	56272	56283	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429462550
14	NC_019815	GTACAG	2	12	57953	57964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429462552
15	NC_019815	TAATGT	2	12	58245	58256	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462552
16	NC_019815	TTTTTA	2	12	59925	59936	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	429462554
17	NC_019815	CTTTTT	2	12	60448	60459	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	429462555
18	NC_019815	ATAGAA	2	12	62738	62749	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429462555
19	NC_019815	ATAATG	2	12	64417	64428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429462557
20	NC_019815	TTGTTC	2	12	66326	66337	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	429462558
21	NC_019815	ATATCA	2	12	67184	67195	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429462559
22	NC_019815	ATTTCT	2	12	72809	72820	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429462565
23	NC_019815	GCGTTT	2	12	72834	72845	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	429462565
24	NC_019815	ATTAGT	2	12	73435	73446	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462565
25	NC_019815	CATTGC	2	12	73936	73947	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429462565
26	NC_019815	TTAGAA	2	12	78770	78781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429462572
27	NC_019815	CTACAA	2	12	79287	79298	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	429462572
28	NC_019815	TCCTGA	2	12	81565	81576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429462572
29	NC_019815	ATTACA	2	12	81863	81874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429462572
30	NC_019815	TATCTA	2	12	82659	82670	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429462572
31	NC_019815	ATGAAA	2	12	82722	82733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429462572
32	NC_019815	GCCAGA	2	12	83419	83430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429462572
33	NC_019815	TGAGTT	2	12	88588	88599	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429462577
34	NC_019815	ATATTT	2	12	88839	88850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429462577
35	NC_019815	TATTTC	2	12	91264	91275	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429462579
36	NC_019815	TAAGAC	2	12	92136	92147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429462581
37	NC_019815	GCAACT	2	12	92648	92659	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429462581
38	NC_019815	TCATTA	2	12	95209	95220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429462583
39	NC_019815	AAAATA	2	12	96795	96806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462585
40	NC_019815	TACTAA	2	12	97570	97581	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429462585
41	NC_019815	TTTTAT	2	12	103013	103024	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	429462591
42	NC_019815	TCAATT	2	12	103176	103187	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429462591
43	NC_019815	AAATAA	2	12	107138	107149	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462595
44	NC_019815	AAAATA	2	12	111911	111922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462598
45	NC_019815	AAACTA	2	12	112503	112514	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429462599
46	NC_019815	CAATGG	2	12	115997	116008	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429462602
47	NC_019815	ATTCTG	2	12	116488	116499	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429462602
48	NC_019815	AAATAA	2	12	118176	118187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462603
49	NC_019815	TGCTAT	2	12	124503	124514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429462609
50	NC_019815	GTATTT	2	12	124996	125007	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429462609
51	NC_019815	AAACCA	2	12	126326	126337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429462611
52	NC_019815	TAGTTA	2	12	126690	126701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462611
53	NC_019815	ATGAGT	2	12	134543	134554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429462619
54	NC_019815	GTTATG	2	12	141243	141254	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429462625
55	NC_019815	ATTGTT	2	12	141799	141810	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429462626
56	NC_019815	TTGTTT	2	12	142721	142732	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	429462627
57	NC_019815	ATTGGT	2	12	152632	152643	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429462632
58	NC_019815	ATAGAG	2	12	153270	153281	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429462633
59	NC_019815	ACTTGC	2	12	154156	154167	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429462634
60	NC_019815	TTATAT	2	12	159916	159927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429462640
61	NC_019815	CAACTG	2	12	160144	160155	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429462640
62	NC_019815	TTTGGA	2	12	160494	160505	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429462640
63	NC_019815	AGTTGG	2	12	166045	166056	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	429462646
64	NC_019815	ATTTTT	2	12	167864	167875	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	429462648
65	NC_019815	AAATAT	2	12	170153	170164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429462649
66	NC_019815	TCAGCA	2	12	174207	174218	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429462654
67	NC_019815	TGAAAT	2	12	179491	179502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429462659
68	NC_019815	ATTTTT	2	12	181780	181791	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	429462661
69	NC_019815	ATTTAT	2	12	186159	186170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429462667
70	NC_019815	TATAAT	2	12	186742	186753	50 %	50 %	0 %	0 %	429462667
71	NC_019815	TTATCA	2	12	187283	187294	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429462667
72	NC_019815	ATTTAA	2	12	188922	188933	50 %	50 %	0 %	0 %	429462669
73	NC_019815	AGTGAT	2	12	190803	190814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429462671
74	NC_019815	CTTTAG	2	12	190876	190887	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429462671
75	NC_019815	GATAAT	2	12	191445	191456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429462671
76	NC_019815	GAATTT	2	12	192284	192295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462672
77	NC_019815	AAAATA	2	12	194717	194728	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462673
78	NC_019815	CGTCAT	2	12	195146	195157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429462673
79	NC_019815	TTCCAC	2	12	197532	197543	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	429462675
80	NC_019815	ATTTTG	2	12	198206	198217	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429462675
81	NC_019815	GCATCA	2	12	199399	199410	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429462677
82	NC_019815	GCTAGA	2	12	202741	202752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429462679
83	NC_019815	AATTGA	2	12	204738	204749	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429462680
84	NC_019815	ATAAAG	2	12	206741	206752	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429462681
85	NC_019815	AGAGCA	2	12	207142	207153	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	429462681
86	NC_019815	ATCAAA	2	12	211485	211496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429462685
87	NC_019815	AAAATA	2	12	216043	216054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462688
88	NC_019815	TATATG	2	12	218679	218690	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462690
89	NC_019815	AAATAA	2	12	219522	219533	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462691
90	NC_019815	GTTGAA	2	12	221995	222006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429462693
91	NC_019815	ACATAA	2	12	223993	224004	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429462695
92	NC_019815	ATCTTA	2	12	224781	224792	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429462696
93	NC_019815	GGAAAA	2	12	234577	234588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429462706
94	NC_019815	CTGAAG	2	12	235032	235043	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429462706
95	NC_019815	GTAAAG	2	12	236612	236623	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429462706
96	NC_019815	AAAATT	2	12	241502	241513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429462710
97	NC_019815	AAGGAA	2	12	250951	250962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429462716
98	NC_019815	CTGTTG	2	12	251840	251851	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	429462718
99	NC_019815	CAATGT	2	12	252155	252166	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429462719
100	NC_019815	TTTCTA	2	12	254508	254519	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429462722
101	NC_019815	TTTCCA	2	12	255844	255855	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	429462722
102	NC_019815	ATTGAT	2	12	260875	260886	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462727
103	NC_019815	AACAAA	2	12	261487	261498	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	429462728
104	NC_019815	AGAAAA	2	12	262333	262344	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	429462728
105	NC_019815	ATTTTA	2	12	264635	264646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429462732
106	NC_019815	CTGGTA	2	12	266776	266787	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	429462735
107	NC_019815	AAATAA	3	18	271557	271574	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462740
108	NC_019815	GAAATA	2	12	272296	272307	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429462740
109	NC_019815	CAGCTA	2	12	280919	280930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429462750
110	NC_019815	TTTGAT	2	12	281751	281762	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429462751
111	NC_019815	TTGAAT	2	12	284246	284257	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462754
112	NC_019815	TATTTT	2	12	286341	286352	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	429462755
113	NC_019815	GTTGGA	2	12	289550	289561	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	429462757
114	NC_019815	TTAACA	2	12	290138	290149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429462758
115	NC_019815	AAATCA	2	12	291430	291441	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429462759
116	NC_019815	GGGATT	2	12	291689	291700	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	429462760
117	NC_019815	TAGAAA	2	12	292234	292245	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429462761
118	NC_019815	AGAGGA	2	12	293349	293360	50 %	0 %	50 %	0 %	429462761
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235	NC_019815	AAATAA	2	12	529747	529758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462987
236	NC_019815	GGAATA	2	12	530274	530285	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429462987
237	NC_019815	AACTAA	2	12	531375	531386	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429462988
238	NC_019815	ACAGCA	2	12	536369	536380	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	429462992
239	NC_019815	TAATAT	2	12	537914	537925	50 %	50 %	0 %	0 %	429462993
240	NC_019815	AATTGA	2	12	538664	538675	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429462995
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261	NC_019815	ATATTA	2	12	591090	591101	50 %	50 %	0 %	0 %	429463044
262	NC_019815	TTACCA	2	12	594486	594497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463048
263	NC_019815	ATCTAC	2	12	595081	595092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463049
264	NC_019815	GTCCAG	2	12	595733	595744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429463050
265	NC_019815	TTTAAT	2	12	597384	597395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463053
266	NC_019815	GGAACA	2	12	598059	598070	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	429463053
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268	NC_019815	TACCCT	2	12	599808	599819	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	429463057
269	NC_019815	GCTCAT	2	12	600688	600699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429463058
270	NC_019815	AGCTAG	2	12	608371	608382	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429463073
271	NC_019815	AGTAAT	2	12	610951	610962	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429463075
272	NC_019815	TCTTGC	2	12	610970	610981	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	429463075
273	NC_019815	AAACCA	2	12	617575	617586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429463079
274	NC_019815	TCAGCT	2	12	620824	620835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429463080
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301	NC_019815	CTAGCT	2	12	675160	675171	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429463128
302	NC_019815	TCTGGT	2	12	678284	678295	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	429463131
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330	NC_019815	ATTTAC	2	12	773559	773570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429463214
331	NC_019815	ATTGCT	2	12	773714	773725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429463214
332	NC_019815	CATCTA	2	12	775880	775891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463217
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334	NC_019815	AAGATA	2	12	784894	784905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429463221
335	NC_019815	GTAGAT	2	12	790249	790260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429463225
336	NC_019815	TATGAG	2	12	791800	791811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429463226
337	NC_019815	TTGTAA	2	12	793040	793051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429463228
338	NC_019815	CTATAC	2	12	793167	793178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429463228
339	NC_019815	CTGGAA	2	12	793652	793663	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429463228
340	NC_019815	GTTGTG	2	12	793942	793953	0 %	50 %	50 %	0 %	429463228
341	NC_019815	AATGAG	2	12	794626	794637	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429463228
342	NC_019815	TAGAAA	2	12	796184	796195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429463230
343	NC_019815	CTATAG	2	12	797794	797805	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429463231
344	NC_019815	TAAATT	2	12	801554	801565	50 %	50 %	0 %	0 %	429463234
345	NC_019815	TTCATT	2	12	804254	804265	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429463236
346	NC_019815	ATAGGT	2	12	805833	805844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429463236
347	NC_019815	TTGTTT	2	12	807786	807797	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	429463239
348	NC_019815	ATGTTT	2	12	807822	807833	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429463239
349	NC_019815	TTTAGA	2	12	808550	808561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429463240
350	NC_019815	ATGTTA	2	12	810146	810157	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429463241
351	NC_019815	AGATGA	2	12	810588	810599	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429463241
352	NC_019815	TAACAA	2	12	812369	812380	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429463243
353	NC_019815	TAGATA	2	12	817048	817059	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429463248
354	NC_019815	TGATAA	2	12	817301	817312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429463248
355	NC_019815	TTAGAA	2	12	821568	821579	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429463252

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.