MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii (ex Angomonas deanei ATCC 30255)

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019815	TCGTG	2	10	1376	1385	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019815	AATTT	2	10	2165	2174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019815	GGGAG	2	10	2894	2903	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019815	CTCAT	2	10	4895	4904	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_019815	AATAT	2	10	6713	6722	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019815	AATGA	2	10	10146	10155	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019815	TGTAG	2	10	14315	14324	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019815	ATGTT	2	10	26553	26562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019815	CAATA	2	10	26626	26635	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019815	AACAA	2	10	30702	30711	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019815	TTATT	2	10	34545	34554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019815	TCGTG	2	10	39258	39267	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019815	AATTT	2	10	40048	40057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019815	GGGAG	2	10	40777	40786	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019815	CTCAT	2	10	42778	42787	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019815	TTATT	2	10	43951	43960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019815	AAAAT	2	10	46985	46994	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019815	AGGAT	2	10	47097	47106	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019815	GAAAT	2	10	60334	60343	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019815	TTATG	2	10	63851	63860	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019815	TTTAA	2	10	84004	84013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019815	ATTAA	2	10	98541	98550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019815	TAATT	2	10	110814	110823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019815	ATATT	2	10	120697	120706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019815	TTTCG	2	10	120778	120787	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019815	ATTAT	2	10	127940	127949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019815	GCTTT	2	10	128174	128183	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019815	TTTAT	2	10	129190	129199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019815	ATTTA	2	10	132270	132279	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019815	TAAAT	2	10	150618	150627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019815	TTGTA	2	10	154996	155005	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019815	TTATT	2	10	155148	155157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019815	TTTAT	2	10	166253	166262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019815	TTTAT	2	10	169852	169861	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019815	TTTAA	2	10	170037	170046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019815	ATTTT	2	10	195389	195398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019815	TTAAT	2	10	195457	195466	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019815	TATAT	2	10	207476	207485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019815	GTTAA	2	10	209606	209615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019815	TAAAT	2	10	211804	211813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019815	TAATA	2	10	211816	211825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019815	TTAAA	2	10	211975	211984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019815	AACAA	2	10	229910	229919	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019815	TAAAA	2	10	230472	230481	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019815	ATTAT	2	10	240147	240156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019815	ATTTT	2	10	243675	243684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019815	TATAT	2	10	244354	244363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019815	ATTTT	2	10	251637	251646	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019815	TTATA	2	10	256302	256311	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019815	TTATT	2	10	256423	256432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019815	ATATG	2	10	258040	258049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019815	TTAAA	2	10	269314	269323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019815	ATTGT	2	10	273971	273980	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019815	ATATA	2	10	274639	274648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019815	TTTAT	2	10	276573	276582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019815	TAGAT	2	10	277436	277445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019815	TTTGT	2	10	287815	287824	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019815	AATAT	2	10	293660	293669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019815	TAATC	2	10	318197	318206	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019815	ATAAC	2	10	318646	318655	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019815	AGCAT	2	10	369599	369608	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019815	TTTTA	2	10	376753	376762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019815	AAAAT	2	10	380445	380454	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019815	TTAAA	2	10	380788	380797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019815	ATACT	2	10	397322	397331	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_019815	AACTA	2	10	424376	424385	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019815	AATTA	2	10	435055	435064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019815	ACTTT	2	10	435087	435096	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019815	CAAAA	2	10	439199	439208	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019815	GAATA	2	10	448281	448290	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019815	TTCAA	2	10	451883	451892	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_019815	TTTCT	2	10	452203	452212	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019815	AATAC	3	15	455211	455225	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019815	GATGA	2	10	460566	460575	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019815	CTCCC	2	10	462568	462577	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
76	NC_019815	AAATT	2	10	463297	463306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019815	CACGA	2	10	464086	464095	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_019815	ATTTT	2	10	479704	479713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019815	TAAAA	2	10	488976	488985	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019815	ACTAG	2	10	489047	489056	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_019815	CAAAT	2	10	490798	490807	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019815	CAAAA	2	10	499297	499306	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019815	AATTA	2	10	503461	503470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019815	TTAAT	2	10	512310	512319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019815	CTTTT	2	10	516769	516778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019815	ACCTG	2	10	519969	519978	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_019815	TAAAA	2	10	520916	520925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019815	ATCAA	2	10	537335	537344	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019815	GATTT	2	10	537389	537398	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019815	AAATT	2	10	537483	537492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019815	AATAT	2	10	542947	542956	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019815	TAAAA	2	10	544054	544063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019815	AACAT	2	10	563723	563732	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019815	ATATT	2	10	571462	571471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019815	AATTA	2	10	581641	581650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019815	ATACA	2	10	590153	590162	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_019815	TAAAT	2	10	590379	590388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019815	TTTAA	2	10	593437	593446	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019815	TAAAA	2	10	594948	594957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019815	TAAAA	2	10	596842	596851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019815	AAAAC	2	10	621958	621967	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019815	ACAAA	2	10	623868	623877	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019815	AAAAT	2	10	625475	625484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019815	TAAAT	2	10	628488	628497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019815	ATTTA	2	10	631761	631770	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019815	ATTTA	2	10	666916	666925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019815	TTTAA	2	10	670374	670383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019815	AATTT	2	10	671953	671962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019815	ATTAA	2	10	672004	672013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019815	ATTTA	2	10	682998	683007	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019815	GAGAT	2	10	684791	684800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019815	TAATT	2	10	687420	687429	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019815	TTTAT	2	10	699477	699486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019815	TAATT	2	10	715782	715791	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019815	TAATT	2	10	715796	715805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019815	TGATT	2	10	729877	729886	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019815	TTATA	2	10	733817	733826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019815	ATAAA	2	10	746696	746705	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019815	GCGGA	2	10	753959	753968	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019815	CATGC	2	10	754170	754179	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_019815	TAAAT	2	10	754286	754295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019815	TTTGA	2	10	770823	770832	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019815	TTTTA	2	10	772834	772843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019815	TTAAT	2	10	782959	782968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019815	TTTTC	2	10	792029	792038	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_019815	TAAAT	2	10	801965	801974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019815	TTATG	2	10	808349	808358	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019815	TTAAT	2	10	808471	808480	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019815	TATTT	2	10	813171	813180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.