MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium blastocrithidii (ex Strigomonas culicis) chromosome

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019814	TCGATA	3	18	7632	7649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019814	GATTAT	2	12	22288	22299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019814	TAAATT	2	12	39935	39946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019814	TAACAC	2	12	43153	43164	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019814	TTCTGT	2	12	50394	50405	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019814	ATATGA	2	12	62254	62265	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019814	CCCCAG	2	12	68207	68218	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019814	AATTAT	2	12	87923	87934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019814	TTAAAT	2	12	106135	106146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019814	ACAAGA	2	12	113616	113627	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019814	TTTAAA	2	12	128276	128287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019814	AAAACA	2	12	145257	145268	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019814	TATTTT	2	12	198053	198064	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019814	TTTAAT	2	12	221670	221681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019814	TTTTAA	2	12	230079	230090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019814	ATATAA	2	12	250998	251009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019814	ATTAAT	2	12	300506	300517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019814	TAAAAT	2	12	305618	305629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019814	TGATAT	2	12	308797	308808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019814	ATTTTT	2	12	332156	332167	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019814	TTTATT	3	18	332972	332989	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019814	TCGGGG	2	12	340506	340517	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019814	AGCTAT	2	12	340739	340750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019814	TTGAAA	2	12	364353	364364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019814	ATATAG	2	12	366284	366295	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019814	AATTTT	2	12	371940	371951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019814	ATTTTT	2	12	378670	378681	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019814	ACTTAA	2	12	399040	399051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019814	TCTTAT	2	12	405733	405744	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019814	GGTTAT	2	12	405985	405996	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019814	TTTATT	2	12	406363	406374	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019814	AATAAA	2	12	419408	419419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019814	ATATTA	2	12	520095	520106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019814	AAAATA	2	12	557410	557421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019814	TATAAA	2	12	587111	587122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019814	ATTAAT	4	24	588801	588824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019814	AGTAAC	2	12	651828	651839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019814	AATTAT	2	12	661918	661929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019814	TTATAT	2	12	667393	667404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019814	AAGATT	2	12	678317	678328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019814	ACAAAG	2	12	697263	697274	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019814	TACGTT	2	12	738290	738301	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019814	GCAATA	2	12	744851	744862	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019814	GAATAG	2	12	778684	778695	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019814	AATTTC	2	12	779053	779064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019814	CATAGA	2	12	803542	803553	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019814	AATATA	2	12	813396	813407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019814	AATTTC	2	12	814756	814767	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.