MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 chromosome

Total Repeats: 3214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019793	CAGGA	2	10	12	21	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019793	GAACA	2	10	925	934	60 %	0 %	20 %	20 %	429217737
3	NC_019793	AAGCG	2	10	3537	3546	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019793	GGCGT	2	10	4056	4065	0 %	20 %	60 %	20 %	429217740
5	NC_019793	GGACA	2	10	5880	5889	40 %	0 %	40 %	20 %	429217740
6	NC_019793	GATTC	2	10	6587	6596	20 %	40 %	20 %	20 %	429217741
7	NC_019793	GCGCC	2	10	7288	7297	0 %	0 %	40 %	60 %	429217741
8	NC_019793	GCCGG	2	10	7308	7317	0 %	0 %	60 %	40 %	429217741
9	NC_019793	GCCCG	2	10	8469	8478	0 %	0 %	40 %	60 %	429217742
10	NC_019793	TGACG	2	10	11258	11267	20 %	20 %	40 %	20 %	429217744
11	NC_019793	TCACC	2	10	11989	11998	20 %	20 %	0 %	60 %	429217745
12	NC_019793	CGTGG	2	10	12808	12817	0 %	20 %	60 %	20 %	429217746
13	NC_019793	CGGGC	2	10	14028	14037	0 %	0 %	60 %	40 %	429217747
14	NC_019793	GCCGC	2	10	14976	14985	0 %	0 %	40 %	60 %	429217747
15	NC_019793	CTCCC	2	10	16059	16068	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
16	NC_019793	CGGTC	2	10	18550	18559	0 %	20 %	40 %	40 %	429217750
17	NC_019793	CCGTC	2	10	19505	19514	0 %	20 %	20 %	60 %	429217752
18	NC_019793	GGCGG	2	10	19784	19793	0 %	0 %	80 %	20 %	429217752
19	NC_019793	GGTGT	2	10	22486	22495	0 %	40 %	60 %	0 %	429217754
20	NC_019793	CGGGT	2	10	22786	22795	0 %	20 %	60 %	20 %	429217754
21	NC_019793	TGGTC	2	10	23055	23064	0 %	40 %	40 %	20 %	429217754
22	NC_019793	ACGCG	2	10	23500	23509	20 %	0 %	40 %	40 %	429217754
23	NC_019793	CAGCG	2	10	24501	24510	20 %	0 %	40 %	40 %	429217755
24	NC_019793	GCGGA	2	10	24851	24860	20 %	0 %	60 %	20 %	429217755
25	NC_019793	TGGCG	2	10	25816	25825	0 %	20 %	60 %	20 %	429217756
26	NC_019793	GCGCA	2	10	26729	26738	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_019793	CCGCG	2	10	27655	27664	0 %	0 %	40 %	60 %	429217757
28	NC_019793	GAACT	2	10	27748	27757	40 %	20 %	20 %	20 %	429217757
29	NC_019793	ACCGA	2	10	28180	28189	40 %	0 %	20 %	40 %	429217757
30	NC_019793	CTCGG	2	10	28229	28238	0 %	20 %	40 %	40 %	429217757
31	NC_019793	CGGGC	2	10	29350	29359	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_019793	GAGCG	2	10	29706	29715	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019793	CCCTC	2	10	30041	30050	0 %	20 %	0 %	80 %	429217760
34	NC_019793	CCGGC	2	10	33283	33292	0 %	0 %	40 %	60 %	429217763
35	NC_019793	AGGAC	2	10	35487	35496	40 %	0 %	40 %	20 %	429217764
36	NC_019793	TGCGG	2	10	38482	38491	0 %	20 %	60 %	20 %	429217765
37	NC_019793	CGCGG	2	10	38935	38944	0 %	0 %	60 %	40 %	429217765
38	NC_019793	GCGCG	2	10	41603	41612	0 %	0 %	60 %	40 %	429217767
39	NC_019793	CGGAG	2	10	43430	43439	20 %	0 %	60 %	20 %	429217768
40	NC_019793	GGTGT	2	10	44286	44295	0 %	40 %	60 %	0 %	429217769
41	NC_019793	GGCCC	2	10	46480	46489	0 %	0 %	40 %	60 %	429217770
42	NC_019793	GGCAG	2	10	47380	47389	20 %	0 %	60 %	20 %	429217771
43	NC_019793	AGCTG	2	10	48902	48911	20 %	20 %	40 %	20 %	429217771
44	NC_019793	GACCT	2	10	49091	49100	20 %	20 %	20 %	40 %	429217772
45	NC_019793	CGGGT	2	10	49436	49445	0 %	20 %	60 %	20 %	429217772
46	NC_019793	GGCGT	2	10	51027	51036	0 %	20 %	60 %	20 %	429217772
47	NC_019793	CGAGT	2	10	52393	52402	20 %	20 %	40 %	20 %	429217773
48	NC_019793	CGTGC	2	10	53615	53624	0 %	20 %	40 %	40 %	429217774
49	NC_019793	GCCCG	2	10	54251	54260	0 %	0 %	40 %	60 %	429217774
50	NC_019793	CTCAT	2	10	56379	56388	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_019793	GGGGT	2	10	57226	57235	0 %	20 %	80 %	0 %	429217777
52	NC_019793	ACCGC	2	10	57894	57903	20 %	0 %	20 %	60 %	429217778
53	NC_019793	GTCGC	2	10	58337	58346	0 %	20 %	40 %	40 %	429217779
54	NC_019793	CCTCG	2	10	58662	58671	0 %	20 %	20 %	60 %	429217779
55	NC_019793	GATCA	2	10	63297	63306	40 %	20 %	20 %	20 %	429217782
56	NC_019793	GCCCT	2	10	63495	63504	0 %	20 %	20 %	60 %	429217782
57	NC_019793	ACGCG	2	10	64343	64352	20 %	0 %	40 %	40 %	429217782
58	NC_019793	TTCCC	2	10	64592	64601	0 %	40 %	0 %	60 %	429217783
59	NC_019793	CGGCC	2	10	68419	68428	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_019793	GCGAC	2	10	69554	69563	20 %	0 %	40 %	40 %	429217786
61	NC_019793	GGAAA	2	10	69918	69927	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019793	AGCGC	2	10	73118	73127	20 %	0 %	40 %	40 %	429217790
63	NC_019793	CGGCG	2	10	73221	73230	0 %	0 %	60 %	40 %	429217790
64	NC_019793	ACGTG	2	10	73900	73909	20 %	20 %	40 %	20 %	429217791
65	NC_019793	CATCC	2	10	75987	75996	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_019793	CACTC	2	10	76057	76066	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_019793	TCACC	2	10	76805	76814	20 %	20 %	0 %	60 %	429217792
68	NC_019793	GGTCC	2	10	77396	77405	0 %	20 %	40 %	40 %	429217792
69	NC_019793	GACCT	2	10	80820	80829	20 %	20 %	20 %	40 %	429217794
70	NC_019793	CCCTA	2	10	82828	82837	20 %	20 %	0 %	60 %	429217794
71	NC_019793	CACCG	2	10	83223	83232	20 %	0 %	20 %	60 %	429217794
72	NC_019793	GAACG	2	10	85502	85511	40 %	0 %	40 %	20 %	429217797
73	NC_019793	GGCCA	2	10	85559	85568	20 %	0 %	40 %	40 %	429217797
74	NC_019793	CCTGC	2	10	86223	86232	0 %	20 %	20 %	60 %	429217797
75	NC_019793	AGGCC	2	10	86443	86452	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_019793	TCACA	2	10	87039	87048	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_019793	CGCCC	2	10	88417	88426	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
78	NC_019793	CAGAA	2	10	88553	88562	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019793	GCACT	2	10	89025	89034	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_019793	CGGAC	2	10	89708	89717	20 %	0 %	40 %	40 %	429217802
81	NC_019793	ACAGC	2	10	90227	90236	40 %	0 %	20 %	40 %	429217802
82	NC_019793	GACCA	2	10	93198	93207	40 %	0 %	20 %	40 %	429217802
83	NC_019793	TGAAC	2	10	93866	93875	40 %	20 %	20 %	20 %	429217802
84	NC_019793	TCCGG	2	10	94424	94433	0 %	20 %	40 %	40 %	429217803
85	NC_019793	GCGTG	2	10	94765	94774	0 %	20 %	60 %	20 %	429217803
86	NC_019793	GTGCG	2	10	97033	97042	0 %	20 %	60 %	20 %	429217805
87	NC_019793	GCGCG	2	10	97069	97078	0 %	0 %	60 %	40 %	429217805
88	NC_019793	TCGCG	2	10	97580	97589	0 %	20 %	40 %	40 %	429217805
89	NC_019793	CGCTC	2	10	99177	99186	0 %	20 %	20 %	60 %	429217807
90	NC_019793	GAAAA	2	10	99307	99316	80 %	0 %	20 %	0 %	429217808
91	NC_019793	CTGAA	2	10	100606	100615	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_019793	GGCGG	2	10	101874	101883	0 %	0 %	80 %	20 %	429217810
93	NC_019793	CGCGG	2	10	102463	102472	0 %	0 %	60 %	40 %	429217811
94	NC_019793	AAGTG	2	10	105088	105097	40 %	20 %	40 %	0 %	429217812
95	NC_019793	CGGCG	2	10	105608	105617	0 %	0 %	60 %	40 %	429217813
96	NC_019793	GCGCG	2	10	105738	105747	0 %	0 %	60 %	40 %	429217813
97	NC_019793	CGGCC	2	10	110043	110052	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_019793	CAGGG	2	10	110133	110142	20 %	0 %	60 %	20 %	429217817
99	NC_019793	GTGCA	2	10	110268	110277	20 %	20 %	40 %	20 %	429217817
100	NC_019793	GCGTG	2	10	110761	110770	0 %	20 %	60 %	20 %	429217817
101	NC_019793	CTGGA	2	10	111744	111753	20 %	20 %	40 %	20 %	429217818
102	NC_019793	GAAGT	2	10	113307	113316	40 %	20 %	40 %	0 %	429217819
103	NC_019793	GCCGC	2	10	115863	115872	0 %	0 %	40 %	60 %	429217821
104	NC_019793	CGGGT	2	10	117334	117343	0 %	20 %	60 %	20 %	429217822
105	NC_019793	GCGCC	2	10	117689	117698	0 %	0 %	40 %	60 %	429217822
106	NC_019793	TCCGG	2	10	117716	117725	0 %	20 %	40 %	40 %	429217822
107	NC_019793	CCTGA	2	10	117935	117944	20 %	20 %	20 %	40 %	429217822
108	NC_019793	CGGCG	2	10	119260	119269	0 %	0 %	60 %	40 %	429217823
109	NC_019793	CACGT	2	10	120739	120748	20 %	20 %	20 %	40 %	429217824
110	NC_019793	GCTCT	2	10	122140	122149	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_019793	GCGCT	2	10	122713	122722	0 %	20 %	40 %	40 %	429217825
112	NC_019793	ACCTG	2	10	123052	123061	20 %	20 %	20 %	40 %	429217825
113	NC_019793	CGATC	2	10	123783	123792	20 %	20 %	20 %	40 %	429217825
114	NC_019793	GCTGA	2	10	124400	124409	20 %	20 %	40 %	20 %	429217826
115	NC_019793	GAACA	2	10	126830	126839	60 %	0 %	20 %	20 %	429217829
116	NC_019793	ACGCG	2	10	126892	126901	20 %	0 %	40 %	40 %	429217829
117	NC_019793	CCCAC	2	10	126935	126944	20 %	0 %	0 %	80 %	429217829
118	NC_019793	ACCAC	2	10	127046	127055	40 %	0 %	0 %	60 %	429217829
119	NC_019793	CGATC	2	10	128503	128512	20 %	20 %	20 %	40 %	429217830
120	NC_019793	AGCGC	2	10	128803	128812	20 %	0 %	40 %	40 %	429217830
121	NC_019793	TCAAA	2	10	129694	129703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019793	GAGCG	2	10	131406	131415	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019793	GCCCG	2	10	132552	132561	0 %	0 %	40 %	60 %	429217834
124	NC_019793	CGGCG	2	10	132995	133004	0 %	0 %	60 %	40 %	429217835
125	NC_019793	GGGAA	2	10	133510	133519	40 %	0 %	60 %	0 %	429217835
126	NC_019793	GGCCG	2	10	135024	135033	0 %	0 %	60 %	40 %	429217835
127	NC_019793	CGTTC	2	10	135873	135882	0 %	40 %	20 %	40 %	429217835
128	NC_019793	GGACT	2	10	136965	136974	20 %	20 %	40 %	20 %	429217836
129	NC_019793	CCGGT	2	10	137448	137457	0 %	20 %	40 %	40 %	429217837
130	NC_019793	GCTTC	2	10	137651	137660	0 %	40 %	20 %	40 %	429217837
131	NC_019793	GCAAA	2	10	138595	138604	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019793	AGTCG	2	10	141768	141777	20 %	20 %	40 %	20 %	429217839
133	NC_019793	TGCCG	2	10	143363	143372	0 %	20 %	40 %	40 %	429217841
134	NC_019793	GGCGT	2	10	148167	148176	0 %	20 %	60 %	20 %	429217844
135	NC_019793	GCTGC	2	10	149233	149242	0 %	20 %	40 %	40 %	429217845
136	NC_019793	GTTTC	2	10	149421	149430	0 %	60 %	20 %	20 %	429217845
137	NC_019793	CGACC	2	10	152247	152256	20 %	0 %	20 %	60 %	429217847
138	NC_019793	TGGCA	2	10	152257	152266	20 %	20 %	40 %	20 %	429217847
139	NC_019793	CGGGC	2	10	152397	152406	0 %	0 %	60 %	40 %	429217847
140	NC_019793	CGCAC	2	10	152761	152770	20 %	0 %	20 %	60 %	429217848
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142	NC_019793	AGCGC	2	10	153622	153631	20 %	0 %	40 %	40 %	429217850
143	NC_019793	GTAAA	2	10	155998	156007	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019793	GTCGA	2	10	158494	158503	20 %	20 %	40 %	20 %	429217854
145	NC_019793	GGAGC	2	10	158661	158670	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019793	GCCCG	2	10	159721	159730	0 %	0 %	40 %	60 %	429217855
147	NC_019793	ACCCC	2	10	159810	159819	20 %	0 %	0 %	80 %	429217855
148	NC_019793	ATCAG	2	10	160835	160844	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_019793	CAGCG	2	10	161862	161871	20 %	0 %	40 %	40 %	429217858
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151	NC_019793	TCGCT	2	10	162432	162441	0 %	40 %	20 %	40 %	429217858
152	NC_019793	CTCGC	2	10	162756	162765	0 %	20 %	20 %	60 %	429217858
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155	NC_019793	AGGCC	2	10	164121	164130	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
156	NC_019793	TCAGG	2	10	165012	165021	20 %	20 %	40 %	20 %	429217861
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161	NC_019793	GTCTC	2	10	170352	170361	0 %	40 %	20 %	40 %	429217865
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164	NC_019793	CGCTC	2	10	171059	171068	0 %	20 %	20 %	60 %	429217866
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168	NC_019793	TTGCT	2	10	177751	177760	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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173	NC_019793	GCGTC	2	10	188587	188596	0 %	20 %	40 %	40 %	429217877
174	NC_019793	GCGGT	2	10	189545	189554	0 %	20 %	60 %	20 %	429217879
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197	NC_019793	AGGAA	2	10	222449	222458	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
198	NC_019793	TTCAG	2	10	222488	222497	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
199	NC_019793	AGTGC	2	10	222511	222520	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
200	NC_019793	ACCGC	2	10	223128	223137	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
201	NC_019793	GCGCT	2	10	224545	224554	0 %	20 %	40 %	40 %	429217913
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225	NC_019793	CCGCA	2	10	256110	256119	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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233	NC_019793	CCCGG	2	10	263041	263050	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
234	NC_019793	GCGAG	2	10	263218	263227	20 %	0 %	60 %	20 %	429217953
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239	NC_019793	TGGCC	2	10	274252	274261	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
240	NC_019793	GCAGA	2	10	276093	276102	40 %	0 %	40 %	20 %	429217967
241	NC_019793	GCGAG	2	10	276163	276172	20 %	0 %	60 %	20 %	429217967
242	NC_019793	CGCCC	2	10	276670	276679	0 %	0 %	20 %	80 %	429217968
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245	NC_019793	CACGC	2	10	282294	282303	20 %	0 %	20 %	60 %	429217973
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247	NC_019793	GCATG	2	10	284631	284640	20 %	20 %	40 %	20 %	429217974
248	NC_019793	GCGCT	2	10	284741	284750	0 %	20 %	40 %	40 %	429217974
249	NC_019793	GCAAG	2	10	285081	285090	40 %	0 %	40 %	20 %	429217974
250	NC_019793	CACTT	2	10	286706	286715	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
251	NC_019793	CCCCT	2	10	287644	287653	0 %	20 %	0 %	80 %	429217975
252	NC_019793	CGTGG	2	10	288578	288587	0 %	20 %	60 %	20 %	429217975
253	NC_019793	CAGCG	2	10	289130	289139	20 %	0 %	40 %	40 %	429217975
254	NC_019793	AGCTG	2	10	290024	290033	20 %	20 %	40 %	20 %	429217976
255	NC_019793	GGCGC	2	10	290806	290815	0 %	0 %	60 %	40 %	429217977
256	NC_019793	GCTGA	2	10	291056	291065	20 %	20 %	40 %	20 %	429217977
257	NC_019793	TCGCG	2	10	292892	292901	0 %	20 %	40 %	40 %	429217979
258	NC_019793	TCGGC	2	10	294128	294137	0 %	20 %	40 %	40 %	429217979
259	NC_019793	CGCGT	2	10	295122	295131	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
260	NC_019793	GGTCA	2	10	299731	299740	20 %	20 %	40 %	20 %	429217986
261	NC_019793	GCACC	2	10	299997	300006	20 %	0 %	20 %	60 %	429217986
262	NC_019793	CGCGC	2	10	300628	300637	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
263	NC_019793	GATCT	2	10	300886	300895	20 %	40 %	20 %	20 %	429217988
264	NC_019793	AGCGA	2	10	303625	303634	40 %	0 %	40 %	20 %	429217989
265	NC_019793	CTTTT	2	10	307784	307793	0 %	80 %	0 %	20 %	429217993
266	NC_019793	CCCGG	2	10	308858	308867	0 %	0 %	40 %	60 %	429217993
267	NC_019793	CCTCG	2	10	309134	309143	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
268	NC_019793	CAGGG	2	10	309629	309638	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
269	NC_019793	CGGTT	2	10	309716	309725	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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398	NC_019793	ACAAA	2	10	457173	457182	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
399	NC_019793	CGGCG	2	10	458427	458436	0 %	0 %	60 %	40 %	429218143
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