MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 chromosome

Total Repeats: 1408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019793	TTCT	2	8	391	398	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019793	ATCC	2	8	3335	3342	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019793	AAAC	2	8	3605	3612	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019793	ACAG	2	8	6010	6017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019793	TCCT	2	8	6037	6044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019793	GGTG	2	8	13547	13554	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019793	CCGG	2	8	25699	25706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019793	GCCC	2	8	26748	26755	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_019793	CACC	2	8	28908	28915	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_019793	GCCG	2	8	28969	28976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019793	GCTG	2	8	29096	29103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019793	GCAG	2	8	29889	29896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019793	GCCG	2	8	61733	61740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019793	CGAT	2	8	68402	68409	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019793	ACCG	2	8	75721	75728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019793	GCCT	2	8	75798	75805	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019793	CCGG	2	8	75835	75842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019793	CAGC	2	8	76067	76074	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019793	GGCC	2	8	98119	98126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019793	TGGC	2	8	98413	98420	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019793	GGTG	2	8	100624	100631	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019793	ACGA	2	8	122071	122078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019793	TCGT	2	8	122104	122111	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019793	ATCA	2	8	128071	128078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019793	AGAA	2	8	138378	138385	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019793	CCCT	2	8	141109	141116	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_019793	TCAT	2	8	145811	145818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019793	GGCG	2	8	148544	148551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019793	AGTC	2	8	150299	150306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019793	CGTG	2	8	156747	156754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019793	GTCA	2	8	156761	156768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019793	GGGC	2	8	160752	160759	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019793	ACTC	2	8	164751	164758	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019793	ATTC	2	8	174174	174181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019793	TGGC	2	8	174384	174391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019793	GATG	2	8	174645	174652	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019793	GCCA	2	8	174829	174836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019793	TCGT	2	8	174954	174961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019793	GCAG	2	8	175413	175420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019793	TCCG	2	8	176124	176131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019793	TGGC	2	8	178650	178657	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019793	TGCC	2	8	178979	178986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019793	AAAC	2	8	179081	179088	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019793	CGTC	2	8	189098	189105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019793	CGGT	2	8	194533	194540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019793	GCGG	2	8	195245	195252	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019793	AGGC	2	8	196428	196435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019793	GAAC	2	8	201755	201762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019793	GCCA	2	8	203212	203219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019793	ACGC	2	8	208386	208393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019793	GTCC	2	8	211798	211805	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019793	CTGG	2	8	213880	213887	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019793	TTGA	2	8	213906	213913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019793	CAAG	2	8	214109	214116	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019793	AATT	2	8	214168	214175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019793	CTTT	2	8	216023	216030	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019793	ACGC	2	8	217674	217681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019793	CCAC	2	8	220846	220853	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_019793	TCGC	2	8	225181	225188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019793	TTCG	2	8	229590	229597	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019793	GCCC	2	8	229624	229631	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_019793	TCGC	2	8	230581	230588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019793	TCCG	2	8	241588	241595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019793	CTCC	2	8	246095	246102	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_019793	GTGC	2	8	251931	251938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019793	CGCC	2	8	255554	255561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_019793	ATCA	2	8	259702	259709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019793	CGCC	2	8	262984	262991	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_019793	CCGC	2	8	266007	266014	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_019793	CTTG	2	8	272023	272030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019793	GTTC	2	8	274295	274302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019793	GACC	2	8	284345	284352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019793	CGTG	2	8	291850	291857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019793	CTCG	2	8	304803	304810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019793	CGGC	2	8	306262	306269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019793	GCCG	2	8	306744	306751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019793	TTCA	2	8	307221	307228	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019793	GCCC	2	8	307430	307437	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_019793	TCGT	2	8	309601	309608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019793	CTCA	2	8	315211	315218	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019793	CCCT	2	8	322125	322132	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_019793	GCTG	2	8	325305	325312	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019793	CGAA	2	8	328363	328370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019793	CCAT	2	8	328406	328413	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019793	CGCC	2	8	329109	329116	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_019793	AACG	2	8	332972	332979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019793	CGAC	2	8	334421	334428	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019793	TGCC	3	12	339085	339096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019793	CCAC	2	8	340566	340573	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_019793	CACG	2	8	353576	353583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019793	ACTC	2	8	355121	355128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019793	CGGG	2	8	358450	358457	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019793	GGCG	2	8	361553	361560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019793	GCTG	2	8	361576	361583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019793	CCTT	2	8	363334	363341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019793	GACC	2	8	363376	363383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019793	CAGG	2	8	365422	365429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019793	AAGA	2	8	366664	366671	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019793	ACCC	2	8	372685	372692	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_019793	GTGC	2	8	372744	372751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019793	GTTT	2	8	372897	372904	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019793	CCGG	2	8	374104	374111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019793	CGTT	2	8	374149	374156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019793	TTCG	2	8	376276	376283	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019793	GGCA	2	8	381576	381583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019793	CTCG	2	8	384153	384160	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019793	CCCG	2	8	385281	385288	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_019793	CCCG	2	8	393175	393182	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_019793	TTTC	2	8	393957	393964	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019793	CAAG	2	8	393985	393992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019793	GGGC	2	8	394310	394317	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019793	GCCC	2	8	394324	394331	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_019793	ACTG	2	8	403286	403293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019793	CGAG	2	8	406491	406498	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019793	CTTC	2	8	413204	413211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019793	GCCT	2	8	413479	413486	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019793	GGCC	2	8	413524	413531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019793	CGTT	2	8	417158	417165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019793	GCGA	2	8	417956	417963	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019793	CTCG	2	8	429985	429992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019793	CCGC	2	8	430040	430047	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_019793	AACG	2	8	431319	431326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019793	GGCT	2	8	439684	439691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019793	ATGG	2	8	446986	446993	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019793	CCCA	2	8	447197	447204	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_019793	CCAG	2	8	447292	447299	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019793	CACG	2	8	447486	447493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019793	CCGC	2	8	449003	449010	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_019793	ATGA	2	8	449160	449167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019793	GGAA	2	8	449892	449899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019793	GCCC	2	8	450854	450861	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_019793	CAGC	2	8	451916	451923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019793	TCGG	2	8	456193	456200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019793	GCAA	2	8	457014	457021	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019793	AAAT	2	8	458868	458875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019793	TTTA	2	8	458905	458912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019793	CAAT	2	8	459732	459739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019793	GCCT	2	8	459916	459923	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019793	TTCA	2	8	461392	461399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019793	CCGC	2	8	462565	462572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_019793	TGCG	2	8	466717	466724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019793	CCGC	2	8	468840	468847	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_019793	CGCC	2	8	468848	468855	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_019793	GCGG	2	8	474495	474502	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019793	TGCC	2	8	474550	474557	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019793	CGTT	2	8	474571	474578	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019793	CCTC	2	8	474580	474587	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_019793	AATC	2	8	477831	477838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_019793	GCAA	2	8	478582	478589	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_019793	TGAA	2	8	478660	478667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019793	TGCG	2	8	478828	478835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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476	NC_019793	TCGC	2	8	1311463	1311470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
477	NC_019793	GGCA	2	8	1311801	1311808	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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480	NC_019793	GCAG	2	8	1316120	1316127	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
481	NC_019793	CTCC	2	8	1325163	1325170	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
482	NC_019793	CCCG	2	8	1325953	1325960	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
483	NC_019793	AGGG	2	8	1327839	1327846	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
484	NC_019793	GGTC	2	8	1329701	1329708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_019793	AGTG	2	8	1336143	1336150	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_019793	AGCG	2	8	1341423	1341430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_019793	TCAA	2	8	1341461	1341468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
488	NC_019793	CCGG	2	8	1345869	1345876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
489	NC_019793	TGGA	2	8	1347706	1347713	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
490	NC_019793	GGCA	2	8	1351795	1351802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
491	NC_019793	ACCG	2	8	1355196	1355203	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_019793	GTCT	2	8	1357067	1357074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
493	NC_019793	CCTG	2	8	1357575	1357582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
494	NC_019793	GCTC	2	8	1360747	1360754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_019793	GCCC	2	8	1361893	1361900	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NC_019793	CGGC	2	8	1363648	1363655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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498	NC_019793	GATC	2	8	1366539	1366546	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_019793	CACG	2	8	1370531	1370538	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_019793	CCCG	2	8	1382906	1382913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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