MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 chromosome

Total Repeats: 54881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019793	GCG	4	12	217	228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217736
2	NC_019793	GTC	2	6	316	321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217736
3	NC_019793	CAT	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217737
4	NC_019793	TGA	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429217737
5	NC_019793	CCT	2	6	972	977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217737
6	NC_019793	CGC	2	6	1039	1044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217737
7	NC_019793	TCC	2	6	1046	1051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217737
8	NC_019793	AGC	2	6	1314	1319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217738
9	NC_019793	CTG	2	6	1403	1408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217738
10	NC_019793	ACG	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217738
11	NC_019793	GAG	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217738
12	NC_019793	TCG	2	6	1576	1581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217738
13	NC_019793	GAG	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217738
14	NC_019793	TGG	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217738
15	NC_019793	ACG	2	6	1922	1927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217739
16	NC_019793	TGC	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217739
17	NC_019793	GCC	2	6	2002	2007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217739
18	NC_019793	CTG	2	6	2047	2052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217739
19	NC_019793	CTC	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217739
20	NC_019793	GCC	2	6	2108	2113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217739
21	NC_019793	GAA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429217739
22	NC_019793	CCG	2	6	2180	2185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217739
23	NC_019793	GAC	2	6	2209	2214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217739
24	NC_019793	GCG	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217739
25	NC_019793	GCG	2	6	2462	2467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217739
26	NC_019793	ACG	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
27	NC_019793	CTG	3	9	3801	3809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217740
28	NC_019793	GCA	2	6	3834	3839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
29	NC_019793	ACG	2	6	3928	3933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
30	NC_019793	CCG	2	6	3979	3984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
31	NC_019793	CTG	2	6	4029	4034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217740
32	NC_019793	CAT	2	6	4037	4042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217740
33	NC_019793	CGC	2	6	4272	4277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
34	NC_019793	AAC	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217740
35	NC_019793	TCG	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217740
36	NC_019793	GCC	2	6	4370	4375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
37	NC_019793	GTG	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217740
38	NC_019793	GTG	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217740
39	NC_019793	ATC	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217740
40	NC_019793	GAG	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217740
41	NC_019793	CGC	2	6	4562	4567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
42	NC_019793	CGA	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
43	NC_019793	ACC	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217740
44	NC_019793	CGC	2	6	4658	4663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
45	NC_019793	GCG	2	6	4670	4675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
46	NC_019793	GAG	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217740
47	NC_019793	CAC	2	6	4758	4763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217740
48	NC_019793	GCG	2	6	4782	4787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
49	NC_019793	CGA	2	6	4862	4867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
50	NC_019793	GAC	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
51	NC_019793	TCA	2	6	4966	4971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217740
52	NC_019793	GGC	2	6	4980	4985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
53	NC_019793	GCG	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
54	NC_019793	GGC	2	6	5112	5117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
55	NC_019793	CCT	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217740
56	NC_019793	GCC	2	6	5317	5322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
57	NC_019793	CGA	2	6	5366	5371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
58	NC_019793	ACA	2	6	5398	5403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217740
59	NC_019793	CGA	2	6	5420	5425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
60	NC_019793	GCC	2	6	5428	5433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
61	NC_019793	CCG	2	6	5465	5470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
62	NC_019793	TCA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217740
63	NC_019793	GAC	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
64	NC_019793	CGA	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
65	NC_019793	GCC	2	6	5782	5787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
66	NC_019793	GGC	2	6	5912	5917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
67	NC_019793	ACC	2	6	5918	5923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217740
68	NC_019793	AAC	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217740
69	NC_019793	GCC	2	6	6119	6124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217741
70	NC_019793	GCG	2	6	6203	6208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
71	NC_019793	GCG	2	6	6213	6218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
72	NC_019793	GGC	2	6	6236	6241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
73	NC_019793	GCG	2	6	6268	6273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
74	NC_019793	GAG	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217741
75	NC_019793	GCG	2	6	6324	6329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
76	NC_019793	CGG	2	6	6358	6363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
77	NC_019793	GCT	3	9	6388	6396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217741
78	NC_019793	GAG	2	6	6452	6457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217741
79	NC_019793	CGG	2	6	6628	6633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
80	NC_019793	AAG	2	6	6723	6728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429217741
81	NC_019793	TCG	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217741
82	NC_019793	CTG	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217741
83	NC_019793	CTG	2	6	6900	6905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217741
84	NC_019793	GTG	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217741
85	NC_019793	GCC	2	6	6950	6955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217741
86	NC_019793	TGC	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217741
87	NC_019793	CGG	2	6	7028	7033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
88	NC_019793	GTG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217741
89	NC_019793	GTG	2	6	7067	7072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217741
90	NC_019793	GCG	2	6	7087	7092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
91	NC_019793	CCG	2	6	7221	7226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217741
92	NC_019793	GAA	2	6	7298	7303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429217741
93	NC_019793	GCC	2	6	7336	7341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217741
94	NC_019793	AGC	2	6	7364	7369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217741
95	NC_019793	TGG	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217742
96	NC_019793	CTT	2	6	7599	7604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429217742
97	NC_019793	CGG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217742
98	NC_019793	GCT	3	9	7730	7738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217742
99	NC_019793	TGC	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217742
100	NC_019793	CTG	2	6	7758	7763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217742
101	NC_019793	TCA	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217742
102	NC_019793	CTG	2	6	7983	7988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217742
103	NC_019793	CAG	2	6	8331	8336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217742
104	NC_019793	CCT	2	6	8491	8496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217742
105	NC_019793	GAA	2	6	8624	8629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429217743
106	NC_019793	CGA	2	6	8653	8658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217743
107	NC_019793	CAC	2	6	8782	8787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217743
108	NC_019793	CCA	2	6	8832	8837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217743
109	NC_019793	GAA	2	6	9098	9103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429217743
110	NC_019793	CTG	2	6	9293	9298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217743
111	NC_019793	AGC	2	6	9337	9342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217743
112	NC_019793	GGT	2	6	9343	9348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217743
113	NC_019793	CCG	2	6	9367	9372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217743
114	NC_019793	CTG	2	6	9395	9400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217743
115	NC_019793	GCC	2	6	9568	9573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217743
116	NC_019793	CGG	2	6	9577	9582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217743
117	NC_019793	TCT	2	6	9774	9779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429217743
118	NC_019793	GGT	3	9	9871	9879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217743
119	NC_019793	GAG	2	6	9907	9912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217743
120	NC_019793	CGC	2	6	9945	9950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217743
121	NC_019793	TAC	2	6	10049	10054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217743
122	NC_019793	GGT	2	6	10058	10063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217743
123	NC_019793	TAC	2	6	10070	10075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217743
124	NC_019793	CAG	2	6	10130	10135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217743
125	NC_019793	ACG	2	6	10161	10166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217743
126	NC_019793	CTG	2	6	10169	10174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217743
127	NC_019793	GCT	2	6	10634	10639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217744
128	NC_019793	CAC	2	6	10676	10681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217744
129	NC_019793	CGC	2	6	10685	10690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217744
130	NC_019793	TCG	2	6	10744	10749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217744
131	NC_019793	GGC	2	6	10787	10792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217744
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134	NC_019793	GCG	2	6	10927	10932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217744
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253	NC_019793	TCA	2	6	19119	19124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217752
254	NC_019793	GGA	2	6	19165	19170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217752
255	NC_019793	CGG	2	6	19236	19241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217752
256	NC_019793	GGC	2	6	19496	19501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217752
257	NC_019793	GCT	2	6	19531	19536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217752
258	NC_019793	GTC	2	6	19574	19579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217752
259	NC_019793	TCA	2	6	19626	19631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217752
260	NC_019793	TGC	2	6	19683	19688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217752
261	NC_019793	CGC	2	6	19724	19729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217752
262	NC_019793	ACA	2	6	19828	19833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217752
263	NC_019793	GGT	2	6	19891	19896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217753
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266	NC_019793	CAT	2	6	20047	20052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217753
267	NC_019793	GGC	2	6	20072	20077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217753
268	NC_019793	ACG	2	6	20208	20213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217753
269	NC_019793	TGG	3	9	20220	20228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217753
270	NC_019793	CGG	2	6	20302	20307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217753
271	NC_019793	ACG	2	6	20328	20333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217753
272	NC_019793	GCG	2	6	20451	20456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217753
273	NC_019793	GCC	2	6	20531	20536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217753
274	NC_019793	GCC	2	6	20561	20566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217753
275	NC_019793	TGA	2	6	20583	20588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429217753
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277	NC_019793	TCA	2	6	20658	20663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217753
278	NC_019793	GCA	2	6	20676	20681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217753
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281	NC_019793	AGA	2	6	20763	20768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429217753
282	NC_019793	TCT	2	6	20775	20780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429217753
283	NC_019793	GTG	2	6	20825	20830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217753
284	NC_019793	GGC	2	6	20831	20836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217753
285	NC_019793	TGA	2	6	20847	20852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429217753
286	NC_019793	TGC	2	6	20856	20861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217753
287	NC_019793	TGC	2	6	21012	21017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217753
288	NC_019793	TCA	2	6	21069	21074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217753
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291	NC_019793	CCA	2	6	21219	21224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217753
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293	NC_019793	CGG	2	6	21286	21291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217753
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499	NC_019793	GGC	2	6	38900	38905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217765
500	NC_019793	CGA	2	6	38916	38921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217765

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