MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Natronobacterium gregoryi SP2 chromosome

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019792	GGTGTC	2	12	177	188	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019792	TGCGTG	2	12	34817	34828	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019792	TCGGCG	2	12	41353	41364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019792	GTCGGT	2	12	95440	95451	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019792	CACTGA	3	18	108358	108375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019792	TCACGA	2	12	109140	109151	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019792	CGAGGA	2	12	109264	109275	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019792	ACCGAA	2	12	155933	155944	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019792	AGTACT	2	12	189405	189416	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019792	AGTGTC	2	12	206140	206151	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019792	GACTGC	2	12	231217	231228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019792	AAGCGA	2	12	286607	286618	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019792	TGTCGG	2	12	301680	301691	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019792	CGGGTA	2	12	342457	342468	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019792	GCGGCC	2	12	348614	348625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019792	TAGTAC	2	12	372766	372777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019792	CGTTCG	2	12	381596	381607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019792	TGAACG	2	12	392944	392955	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019792	ACAGGT	2	12	397556	397567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019792	CTTCAT	2	12	398700	398711	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019792	TCAGAG	2	12	443922	443933	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019792	GTTGCG	2	12	456873	456884	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019792	TGGTCG	2	12	461013	461024	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019792	CGATTC	2	12	483294	483305	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019792	CAGTCG	2	12	555925	555936	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019792	GACGCG	2	12	562205	562216	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019792	TCGAAC	2	12	569293	569304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019792	ACCCCG	2	12	595746	595757	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019792	TGCCGA	2	12	599625	599636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019792	GGGGGT	2	12	601662	601673	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019792	ATACTG	2	12	624987	624998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019792	CAGTTC	2	12	630580	630591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019792	AGCGAC	2	12	671316	671327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019792	ACACCC	2	12	680899	680910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_019792	AGTACT	2	12	682091	682102	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019792	CGAACG	2	12	710619	710630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019792	CCTGCG	2	12	716360	716371	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019792	CGACAA	2	12	730359	730370	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019792	GTGTCT	2	12	735764	735775	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019792	TCCGTG	2	12	753954	753965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019792	CACGGC	2	12	810407	810418	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019792	GTTTCA	2	12	817118	817129	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019792	GTTCCT	2	12	898408	898419	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019792	CGAACG	2	12	911300	911311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019792	AGTACT	2	12	984088	984099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019792	GTCGAC	2	12	988723	988734	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019792	ACGAGT	2	12	1023951	1023962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019792	TCTGCT	2	12	1028774	1028785	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019792	CAAAGT	2	12	1051295	1051306	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019792	GCGACC	2	12	1078052	1078063	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019792	CGGGAG	2	12	1123631	1123642	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019792	CGCTCG	2	12	1149776	1149787	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019792	GCGGTC	2	12	1153347	1153358	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019792	CCCACC	2	12	1191546	1191557	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
55	NC_019792	GTACTA	2	12	1195540	1195551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019792	CCGACG	2	12	1195926	1195937	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019792	ACTCGA	2	12	1213037	1213048	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019792	CAGTCC	2	12	1226955	1226966	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019792	TTTATA	2	12	1227740	1227751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019792	CGACCG	2	12	1236892	1236903	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019792	CTGCAC	2	12	1261729	1261740	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019792	CGTCTC	2	12	1267891	1267902	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019792	CCCTCA	4	24	1269336	1269359	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_019792	CCCTCG	2	12	1269386	1269397	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_019792	TGTCGG	2	12	1280370	1280381	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019792	CCCCTC	2	12	1290807	1290818	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
67	NC_019792	GAAAGT	2	12	1301869	1301880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019792	TAGTAC	2	12	1359583	1359594	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019792	CGAAGC	2	12	1367314	1367325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019792	GTCGGC	2	12	1374012	1374023	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019792	GAACGA	2	12	1380250	1380261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019792	AGCCGA	2	12	1391452	1391463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019792	TGGGAG	2	12	1418106	1418117	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019792	TATGAT	2	12	1505293	1505304	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019792	GGGATA	2	12	1537893	1537904	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019792	CGGCGT	2	12	1548646	1548657	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019792	GAACCC	2	12	1588849	1588860	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019792	CGACGG	2	12	1594597	1594608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019792	TCGAGT	2	12	1605119	1605130	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019792	GGAGAC	2	12	1609146	1609157	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_019792	CCTCGG	2	12	1609209	1609220	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019792	GAGTCA	2	12	1609241	1609252	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019792	CGAGCG	2	12	1628699	1628710	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019792	CCACCC	2	12	1644762	1644773	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
85	NC_019792	TGTTCG	2	12	1649654	1649665	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019792	CCGGCA	2	12	1678793	1678804	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019792	CGGTTT	2	12	1718485	1718496	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019792	CGCGGT	2	12	1722812	1722823	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019792	CCTGCG	2	12	1731578	1731589	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019792	GCCGAC	2	12	1732319	1732330	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019792	CGGACT	2	12	1746687	1746698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019792	GAATCG	2	12	1751929	1751940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019792	AGTGAA	2	12	1754994	1755005	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019792	GGCAGG	2	12	1767285	1767296	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019792	CTCGCT	2	12	1780801	1780812	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019792	CGGTCT	2	12	1782804	1782815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019792	GGTCGA	2	12	1806489	1806500	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019792	TCGGTT	2	12	1811384	1811395	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019792	CGAAGA	2	12	1836438	1836449	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_019792	AACTAC	2	12	1851563	1851574	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019792	CTCGAT	2	12	1877717	1877728	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019792	GATCGC	2	12	1912704	1912715	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019792	GTCTCG	2	12	1915784	1915795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019792	ATCGTG	2	12	1920307	1920318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019792	AGCTAT	2	12	1925933	1925944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_019792	GTCGCG	2	12	1929771	1929782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019792	ATACTT	2	12	2015603	2015614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_019792	GCCTCG	2	12	2016614	2016625	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019792	AGTACT	2	12	2035048	2035059	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_019792	GAGTGG	2	12	2038087	2038098	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019792	GACCAC	2	12	2060725	2060736	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019792	ACTGCC	2	12	2064019	2064030	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019792	TCGATC	2	12	2126326	2126337	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019792	CACTTT	2	12	2137254	2137265	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019792	TCGAGG	2	12	2165444	2165455	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019792	GCTATC	2	12	2177723	2177734	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019792	GCGAGC	2	12	2201489	2201500	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019792	CCCGTT	2	12	2204186	2204197	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019792	ACCGCG	2	12	2214293	2214304	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019792	ACTGCA	2	12	2214351	2214362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019792	ATCGCT	2	12	2216299	2216310	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019792	AAGAAT	2	12	2233755	2233766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019792	TCGAGA	2	12	2252255	2252266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_019792	ACGTGA	2	12	2261204	2261215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019792	GTTCGG	2	12	2303010	2303021	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_019792	AGTACT	2	12	2312798	2312809	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_019792	CCGACG	2	12	2320493	2320504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019792	GAACGC	2	12	2321941	2321952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019792	CAAACG	2	12	2338224	2338235	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019792	TAGTAC	2	12	2353501	2353512	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_019792	AGTCGG	2	12	2362112	2362123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_019792	AGTCAG	2	12	2363407	2363418	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_019792	GTGGAT	3	18	2377754	2377771	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019792	GGTCGT	2	12	2377943	2377954	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_019792	TCCGCG	2	12	2378941	2378952	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019792	GTATAC	2	12	2394821	2394832	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_019792	CATGAA	2	12	2394944	2394955	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_019792	CTCTCC	2	12	2421571	2421582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_019792	GACGGC	2	12	2431998	2432009	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_019792	GTCGCG	2	12	2437293	2437304	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019792	AGGACA	2	12	2448038	2448049	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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145	NC_019792	TCGGTC	2	12	2458349	2458360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019792	CGACCG	2	12	2489030	2489041	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019792	TCGCTG	2	12	2489079	2489090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_019792	GTTCGC	2	12	2490121	2490132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019792	GAACTC	2	12	2531250	2531261	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_019792	AGTTTG	2	12	2547561	2547572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019792	CATCAG	2	12	2576297	2576308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_019792	CGCCGT	2	12	2602331	2602342	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
154	NC_019792	GAGAGT	2	12	2634281	2634292	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_019792	GTGGAC	2	12	2685519	2685530	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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160	NC_019792	GAAAGT	2	12	2709114	2709125	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019792	GGAGAC	2	12	2709798	2709809	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_019792	CACCGA	2	12	2715217	2715228	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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217	NC_019792	GGACCC	2	12	3719015	3719026	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.