MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Natronobacterium gregoryi SP2 chromosome

Total Repeats: 2197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019792	TCGCG	2	10	2815	2824	0 %	20 %	40 %	40 %	429190048
2	NC_019792	CGCGG	2	10	4612	4621	0 %	0 %	60 %	40 %	429190049
3	NC_019792	CGTCG	2	10	6522	6531	0 %	20 %	40 %	40 %	429190052
4	NC_019792	GCGTC	2	10	12418	12427	0 %	20 %	40 %	40 %	429190056
5	NC_019792	TACGC	2	10	13700	13709	20 %	20 %	20 %	40 %	429190057
6	NC_019792	GACGC	2	10	16097	16106	20 %	0 %	40 %	40 %	429190059
7	NC_019792	GGGAC	2	10	16223	16232	20 %	0 %	60 %	20 %	429190059
8	NC_019792	GCCGC	2	10	16257	16266	0 %	0 %	40 %	60 %	429190059
9	NC_019792	TTGAC	2	10	17883	17892	20 %	40 %	20 %	20 %	429190061
10	NC_019792	CCGAC	2	10	21963	21972	20 %	0 %	20 %	60 %	429190063
11	NC_019792	CCGAC	2	10	22189	22198	20 %	0 %	20 %	60 %	429190063
12	NC_019792	ACCGG	2	10	22438	22447	20 %	0 %	40 %	40 %	429190063
13	NC_019792	CGAAA	2	10	23864	23873	60 %	0 %	20 %	20 %	429190066
14	NC_019792	GGATT	2	10	24649	24658	20 %	40 %	40 %	0 %	429190066
15	NC_019792	CGGCT	2	10	26836	26845	0 %	20 %	40 %	40 %	429190067
16	NC_019792	GGTGA	2	10	30099	30108	20 %	20 %	60 %	0 %	429190073
17	NC_019792	CGGTC	2	10	33866	33875	0 %	20 %	40 %	40 %	429190076
18	NC_019792	CGAAG	2	10	37538	37547	40 %	0 %	40 %	20 %	429190079
19	NC_019792	CGATC	2	10	40705	40714	20 %	20 %	20 %	40 %	429190084
20	NC_019792	CCAGC	2	10	45878	45887	20 %	0 %	20 %	60 %	429190087
21	NC_019792	ACCGA	2	10	48879	48888	40 %	0 %	20 %	40 %	429190090
22	NC_019792	CTCGA	2	10	51425	51434	20 %	20 %	20 %	40 %	429190092
23	NC_019792	CGATC	2	10	53413	53422	20 %	20 %	20 %	40 %	429190094
24	NC_019792	GCGCC	2	10	54088	54097	0 %	0 %	40 %	60 %	429190094
25	NC_019792	CGGCG	2	10	57261	57270	0 %	0 %	60 %	40 %	429190098
26	NC_019792	GAGAG	2	10	58764	58773	40 %	0 %	60 %	0 %	429190101
27	NC_019792	CAGAC	2	10	59831	59840	40 %	0 %	20 %	40 %	429190102
28	NC_019792	GGTCC	2	10	60714	60723	0 %	20 %	40 %	40 %	429190103
29	NC_019792	TTCGG	2	10	61030	61039	0 %	40 %	40 %	20 %	429190103
30	NC_019792	TGGGA	2	10	62696	62705	20 %	20 %	60 %	0 %	429190104
31	NC_019792	TGTCG	2	10	63418	63427	0 %	40 %	40 %	20 %	429190104
32	NC_019792	TGCCG	2	10	63904	63913	0 %	20 %	40 %	40 %	429190104
33	NC_019792	CCCCG	2	10	65253	65262	0 %	0 %	20 %	80 %	429190105
34	NC_019792	CGTCT	2	10	66470	66479	0 %	40 %	20 %	40 %	429190106
35	NC_019792	GGTTG	2	10	66501	66510	0 %	40 %	60 %	0 %	429190106
36	NC_019792	AGTCG	2	10	67286	67295	20 %	20 %	40 %	20 %	429190107
37	NC_019792	GGCTG	2	10	67614	67623	0 %	20 %	60 %	20 %	429190107
38	NC_019792	TTCGG	2	10	67731	67740	0 %	40 %	40 %	20 %	429190107
39	NC_019792	GGCGA	2	10	67986	67995	20 %	0 %	60 %	20 %	429190107
40	NC_019792	GGACG	2	10	70220	70229	20 %	0 %	60 %	20 %	429190110
41	NC_019792	CCGAT	2	10	70608	70617	20 %	20 %	20 %	40 %	429190110
42	NC_019792	TCGCC	2	10	71124	71133	0 %	20 %	20 %	60 %	429190110
43	NC_019792	CGGCG	2	10	71161	71170	0 %	0 %	60 %	40 %	429190110
44	NC_019792	TCGGA	2	10	71614	71623	20 %	20 %	40 %	20 %	429190111
45	NC_019792	ACGAG	2	10	74932	74941	40 %	0 %	40 %	20 %	429190115
46	NC_019792	GGTGA	2	10	75257	75266	20 %	20 %	60 %	0 %	429190115
47	NC_019792	CACGC	2	10	76071	76080	20 %	0 %	20 %	60 %	429190117
48	NC_019792	GACGC	2	10	76161	76170	20 %	0 %	40 %	40 %	429190117
49	NC_019792	AGTCG	2	10	76466	76475	20 %	20 %	40 %	20 %	429190117
50	NC_019792	GGGCG	2	10	77428	77437	0 %	0 %	80 %	20 %	429190118
51	NC_019792	GTCCG	2	10	77569	77578	0 %	20 %	40 %	40 %	429190118
52	NC_019792	GACCG	2	10	79686	79695	20 %	0 %	40 %	40 %	429190119
53	NC_019792	CGAAC	2	10	80100	80109	40 %	0 %	20 %	40 %	429190120
54	NC_019792	GCGGT	2	10	84098	84107	0 %	20 %	60 %	20 %	429190125
55	NC_019792	AGACG	2	10	84348	84357	40 %	0 %	40 %	20 %	429190125
56	NC_019792	CGACG	2	10	86585	86594	20 %	0 %	40 %	40 %	429190126
57	NC_019792	TTCGG	2	10	88671	88680	0 %	40 %	40 %	20 %	429190127
58	NC_019792	GGGAA	2	10	88792	88801	40 %	0 %	60 %	0 %	429190127
59	NC_019792	GATCC	2	10	89898	89907	20 %	20 %	20 %	40 %	429190128
60	NC_019792	GGCGA	2	10	90681	90690	20 %	0 %	60 %	20 %	429190129
61	NC_019792	ACGTT	2	10	92592	92601	20 %	40 %	20 %	20 %	429190131
62	NC_019792	CACCG	2	10	93651	93660	20 %	0 %	20 %	60 %	429190132
63	NC_019792	CGGTC	2	10	94838	94847	0 %	20 %	40 %	40 %	429190133
64	NC_019792	CAGTC	2	10	96732	96741	20 %	20 %	20 %	40 %	429190134
65	NC_019792	GCTGG	2	10	97024	97033	0 %	20 %	60 %	20 %	429190134
66	NC_019792	GCTGC	2	10	98764	98773	0 %	20 %	40 %	40 %	429190136
67	NC_019792	CGCGG	2	10	99094	99103	0 %	0 %	60 %	40 %	429190136
68	NC_019792	GATCG	2	10	99241	99250	20 %	20 %	40 %	20 %	429190136
69	NC_019792	ATCGT	2	10	100608	100617	20 %	40 %	20 %	20 %	429190137
70	NC_019792	TTTTG	2	10	102016	102025	0 %	80 %	20 %	0 %	429190137
71	NC_019792	TTCCA	2	10	103122	103131	20 %	40 %	0 %	40 %	429190138
72	NC_019792	TGACG	2	10	103672	103681	20 %	20 %	40 %	20 %	429190139
73	NC_019792	GTGCC	2	10	106922	106931	0 %	20 %	40 %	40 %	429190143
74	NC_019792	GAGAC	2	10	109640	109649	40 %	0 %	40 %	20 %	429190145
75	NC_019792	GAACG	2	10	112311	112320	40 %	0 %	40 %	20 %	429190149
76	NC_019792	GGACG	2	10	113280	113289	20 %	0 %	60 %	20 %	429190149
77	NC_019792	GCAGG	2	10	113841	113850	20 %	0 %	60 %	20 %	429190150
78	NC_019792	CCCAT	2	10	117322	117331	20 %	20 %	0 %	60 %	429190152
79	NC_019792	AGCCC	2	10	118895	118904	20 %	0 %	20 %	60 %	429190152
80	NC_019792	GCTGG	2	10	120002	120011	0 %	20 %	60 %	20 %	429190152
81	NC_019792	GAACG	2	10	120765	120774	40 %	0 %	40 %	20 %	429190153
82	NC_019792	GTTCG	2	10	122369	122378	0 %	40 %	40 %	20 %	429190155
83	NC_019792	TGGGG	2	10	122662	122671	0 %	20 %	80 %	0 %	429190156
84	NC_019792	GATCT	2	10	123243	123252	20 %	40 %	20 %	20 %	429190156
85	NC_019792	GAAGC	2	10	129123	129132	40 %	0 %	40 %	20 %	429190162
86	NC_019792	CAGCG	2	10	129485	129494	20 %	0 %	40 %	40 %	429190162
87	NC_019792	GACGC	2	10	130875	130884	20 %	0 %	40 %	40 %	429190163
88	NC_019792	ACCGA	2	10	132267	132276	40 %	0 %	20 %	40 %	429190164
89	NC_019792	CTGGT	2	10	133517	133526	0 %	40 %	40 %	20 %	429190165
90	NC_019792	GCGAC	2	10	135313	135322	20 %	0 %	40 %	40 %	429190167
91	NC_019792	TTCGA	2	10	137527	137536	20 %	40 %	20 %	20 %	429190168
92	NC_019792	ACGCG	2	10	137745	137754	20 %	0 %	40 %	40 %	429190169
93	NC_019792	GATCG	2	10	138665	138674	20 %	20 %	40 %	20 %	429190169
94	NC_019792	CCCCG	2	10	139512	139521	0 %	0 %	20 %	80 %	429190170
95	NC_019792	GTTCG	2	10	142094	142103	0 %	40 %	40 %	20 %	429190173
96	NC_019792	GGCGT	2	10	142549	142558	0 %	20 %	60 %	20 %	429190173
97	NC_019792	ACAGC	2	10	143227	143236	40 %	0 %	20 %	40 %	429190173
98	NC_019792	GTCGT	2	10	143903	143912	0 %	40 %	40 %	20 %	429190174
99	NC_019792	CCGGT	2	10	144033	144042	0 %	20 %	40 %	40 %	429190174
100	NC_019792	GTCCG	2	10	145438	145447	0 %	20 %	40 %	40 %	429190175
101	NC_019792	ATCGA	2	10	145555	145564	40 %	20 %	20 %	20 %	429190175
102	NC_019792	CCGTC	2	10	146691	146700	0 %	20 %	20 %	60 %	429190177
103	NC_019792	CGTTC	2	10	146821	146830	0 %	40 %	20 %	40 %	429190177
104	NC_019792	CTGTC	2	10	149156	149165	0 %	40 %	20 %	40 %	429190178
105	NC_019792	CAGTC	2	10	149447	149456	20 %	20 %	20 %	40 %	429190178
106	NC_019792	CGACG	2	10	152768	152777	20 %	0 %	40 %	40 %	429190181
107	NC_019792	GGCGA	2	10	152844	152853	20 %	0 %	60 %	20 %	429190181
108	NC_019792	GCTCG	2	10	154625	154634	0 %	20 %	40 %	40 %	429190182
109	NC_019792	CGAGC	2	10	159567	159576	20 %	0 %	40 %	40 %	429190187
110	NC_019792	CGCCT	2	10	159601	159610	0 %	20 %	20 %	60 %	429190187
111	NC_019792	TCCGA	2	10	162852	162861	20 %	20 %	20 %	40 %	429190188
112	NC_019792	ACCGA	2	10	164059	164068	40 %	0 %	20 %	40 %	429190188
113	NC_019792	CGATC	2	10	169771	169780	20 %	20 %	20 %	40 %	429190195
114	NC_019792	GCGAC	2	10	173016	173025	20 %	0 %	40 %	40 %	429190197
115	NC_019792	CCGAC	2	10	173349	173358	20 %	0 %	20 %	60 %	429190197
116	NC_019792	CGACT	2	10	173830	173839	20 %	20 %	20 %	40 %	429190198
117	NC_019792	GTCCA	2	10	174286	174295	20 %	20 %	20 %	40 %	429190199
118	NC_019792	CGACA	2	10	179546	179555	40 %	0 %	20 %	40 %	429190203
119	NC_019792	ACCGG	2	10	188021	188030	20 %	0 %	40 %	40 %	429190214
120	NC_019792	TCACC	2	10	188508	188517	20 %	20 %	0 %	60 %	429190215
121	NC_019792	GGTCG	2	10	190195	190204	0 %	20 %	60 %	20 %	429190216
122	NC_019792	ACGGA	2	10	190205	190214	40 %	0 %	40 %	20 %	429190216
123	NC_019792	CCGTC	2	10	197637	197646	0 %	20 %	20 %	60 %	429190221
124	NC_019792	TCGAT	2	10	199124	199133	20 %	40 %	20 %	20 %	429190223
125	NC_019792	CCCGA	2	10	200566	200575	20 %	0 %	20 %	60 %	429190223
126	NC_019792	GCGCC	2	10	201488	201497	0 %	0 %	40 %	60 %	429190224
127	NC_019792	CGAGG	2	10	204914	204923	20 %	0 %	60 %	20 %	429190226
128	NC_019792	CGAAC	2	10	205649	205658	40 %	0 %	20 %	40 %	429190226
129	NC_019792	GTGAC	2	10	208693	208702	20 %	20 %	40 %	20 %	429190228
130	NC_019792	CGGCG	2	10	208777	208786	0 %	0 %	60 %	40 %	429190228
131	NC_019792	GCGTC	2	10	208909	208918	0 %	20 %	40 %	40 %	429190228
132	NC_019792	GACGG	2	10	209380	209389	20 %	0 %	60 %	20 %	429190229
133	NC_019792	GCGAC	2	10	210062	210071	20 %	0 %	40 %	40 %	429190229
134	NC_019792	GACCG	2	10	210187	210196	20 %	0 %	40 %	40 %	429190229
135	NC_019792	CGCCA	2	10	212809	212818	20 %	0 %	20 %	60 %	429190231
136	NC_019792	GCGTC	2	10	213018	213027	0 %	20 %	40 %	40 %	429190231
137	NC_019792	GTTGC	2	10	214824	214833	0 %	40 %	40 %	20 %	429190231
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148	NC_019792	CGCTG	2	10	235653	235662	0 %	20 %	40 %	40 %	429190252
149	NC_019792	GCTTG	2	10	235773	235782	0 %	40 %	40 %	20 %	429190252
150	NC_019792	GGCGA	2	10	237872	237881	20 %	0 %	60 %	20 %	429190254
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153	NC_019792	CGATC	2	10	241318	241327	20 %	20 %	20 %	40 %	429190259
154	NC_019792	CGTCG	2	10	241685	241694	0 %	20 %	40 %	40 %	429190259
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161	NC_019792	GACGG	2	10	251449	251458	20 %	0 %	60 %	20 %	429190267
162	NC_019792	GGACA	2	10	255358	255367	40 %	0 %	40 %	20 %	429190270
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169	NC_019792	GGACG	2	10	263812	263821	20 %	0 %	60 %	20 %	429190279
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171	NC_019792	CGGTA	2	10	265075	265084	20 %	20 %	40 %	20 %	429190280
172	NC_019792	CGGCT	2	10	265225	265234	0 %	20 %	40 %	40 %	429190281
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248	NC_019792	GACGC	2	10	411583	411592	20 %	0 %	40 %	40 %	429190440
249	NC_019792	TGCCG	2	10	415746	415755	0 %	20 %	40 %	40 %	429190446
250	NC_019792	CGCCA	2	10	415808	415817	20 %	0 %	20 %	60 %	429190446
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252	NC_019792	GGTCG	2	10	418171	418180	0 %	20 %	60 %	20 %	429190448
253	NC_019792	GATCG	2	10	419726	419735	20 %	20 %	40 %	20 %	429190450
254	NC_019792	ACGCG	2	10	420798	420807	20 %	0 %	40 %	40 %	429190450
255	NC_019792	CGAGT	2	10	422128	422137	20 %	20 %	40 %	20 %	429190450
256	NC_019792	ACGAG	2	10	422315	422324	40 %	0 %	40 %	20 %	429190451
257	NC_019792	CGACT	2	10	422945	422954	20 %	20 %	20 %	40 %	429190452
258	NC_019792	GGTCG	2	10	423076	423085	0 %	20 %	60 %	20 %	429190452
259	NC_019792	ATGGC	2	10	428378	428387	20 %	20 %	40 %	20 %	429190460
260	NC_019792	CGACA	2	10	430226	430235	40 %	0 %	20 %	40 %	429190461
261	NC_019792	GCCGA	2	10	432757	432766	20 %	0 %	40 %	40 %	429190463
262	NC_019792	ACCGC	2	10	433536	433545	20 %	0 %	20 %	60 %	429190464
263	NC_019792	CCGAT	2	10	434245	434254	20 %	20 %	20 %	40 %	429190464
264	NC_019792	GCTCG	2	10	435498	435507	0 %	20 %	40 %	40 %	429190465
265	NC_019792	CGGCA	2	10	436797	436806	20 %	0 %	40 %	40 %	429190467
266	NC_019792	CGGCG	2	10	436830	436839	0 %	0 %	60 %	40 %	429190467
267	NC_019792	TCCGG	2	10	437934	437943	0 %	20 %	40 %	40 %	429190468
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270	NC_019792	CGCTG	2	10	441643	441652	0 %	20 %	40 %	40 %	429190470
271	NC_019792	TCGGA	2	10	444475	444484	20 %	20 %	40 %	20 %	429190474
272	NC_019792	CGACG	2	10	444537	444546	20 %	0 %	40 %	40 %	429190474
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285	NC_019792	GACCC	2	10	459413	459422	20 %	0 %	20 %	60 %	429190489
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293	NC_019792	CGGGA	2	10	472003	472012	20 %	0 %	60 %	20 %	429190500
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380	NC_019792	TCGAG	2	10	618386	618395	20 %	20 %	40 %	20 %	429190637
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382	NC_019792	CGTCC	2	10	622250	622259	0 %	20 %	20 %	60 %	429190640
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385	NC_019792	CCGAT	2	10	628614	628623	20 %	20 %	20 %	40 %	429190648
386	NC_019792	CCGTC	2	10	629396	629405	0 %	20 %	20 %	60 %	429190650
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389	NC_019792	CCGTC	2	10	634805	634814	0 %	20 %	20 %	60 %	429190654
390	NC_019792	GACGA	2	10	636132	636141	40 %	0 %	40 %	20 %	429190656
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