MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Natronobacterium gregoryi SP2 chromosome

Total Repeats: 2367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019792	CGAT	2	8	316	323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019792	CGTC	2	8	3495	3502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019792	TCGA	2	8	3697	3704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019792	TCGC	2	8	8645	8652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019792	GACC	2	8	8895	8902	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019792	ACTC	2	8	17115	17122	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019792	GATG	2	8	17266	17273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019792	CTGG	2	8	17724	17731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019792	TTTC	2	8	19820	19827	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019792	CCAG	2	8	20389	20396	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019792	TCGA	2	8	20550	20557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019792	TCGT	2	8	20896	20903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019792	CTTA	2	8	21159	21166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019792	GATC	2	8	22718	22725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019792	ATTT	2	8	22860	22867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019792	CTGA	2	8	23557	23564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019792	TGCC	2	8	25770	25777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019792	GCTT	2	8	26417	26424	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019792	ACCG	2	8	30940	30947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019792	CTCG	2	8	34879	34886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019792	CGAT	2	8	34976	34983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019792	ACTG	2	8	38629	38636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019792	CGGC	2	8	39003	39010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019792	CGGA	2	8	41394	41401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019792	CGCC	2	8	41545	41552	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_019792	CGCT	2	8	42062	42069	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019792	CTGG	2	8	42276	42283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019792	GCAG	2	8	42518	42525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019792	GACG	2	8	42614	42621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019792	CCGC	2	8	42799	42806	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_019792	GATC	2	8	42966	42973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019792	GGTC	2	8	43053	43060	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019792	CCAC	2	8	43288	43295	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_019792	CAGT	2	8	46657	46664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019792	CGAC	2	8	48696	48703	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019792	CGTG	2	8	49045	49052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019792	CAGT	2	8	50347	50354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019792	GCTG	2	8	50718	50725	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019792	ACTG	2	8	51027	51034	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019792	ACAG	2	8	51239	51246	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019792	CCAG	2	8	56961	56968	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019792	GAAC	2	8	57978	57985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019792	TCAC	2	8	58132	58139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019792	ACTG	2	8	62050	62057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019792	AGTC	2	8	65564	65571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019792	TCGT	2	8	67052	67059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019792	GAAG	2	8	71387	71394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019792	CGCT	2	8	74085	74092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019792	TCCG	2	8	74244	74251	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019792	GACG	2	8	74297	74304	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019792	GTCG	2	8	74332	74339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019792	CGCC	2	8	74416	74423	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_019792	TTCT	2	8	74477	74484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019792	TCGT	2	8	74524	74531	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019792	GCAA	2	8	74596	74603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019792	CTCA	2	8	76983	76990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019792	CGTT	2	8	79105	79112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019792	CGAC	2	8	83531	83538	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019792	CTGG	2	8	87466	87473	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019792	CGGA	2	8	88115	88122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019792	AGAC	2	8	89446	89453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019792	ATCT	2	8	91460	91467	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019792	TAGT	2	8	92522	92529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019792	ACCA	2	8	92548	92555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019792	ATTT	2	8	95542	95549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019792	GTCT	2	8	102358	102365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019792	GGTT	2	8	102576	102583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019792	CAAA	2	8	104251	104258	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019792	CGAG	2	8	108712	108719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019792	CTGG	2	8	108872	108879	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019792	GACG	2	8	114134	114141	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019792	GTTC	2	8	114146	114153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019792	CTAC	2	8	125881	125888	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019792	AGAC	2	8	126446	126453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019792	CGCT	2	8	140669	140676	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019792	CGAA	2	8	145573	145580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019792	GTCG	2	8	147821	147828	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019792	TCAG	2	8	147915	147922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019792	GGAG	2	8	150789	150796	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019792	GCCA	2	8	150836	150843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019792	TCGT	2	8	155966	155973	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019792	ACCG	2	8	155975	155982	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019792	GGGT	2	8	160306	160313	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019792	TGAG	2	8	165230	165237	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019792	ACCC	2	8	165533	165540	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_019792	GACT	2	8	165588	165595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019792	TTGA	3	12	166453	166464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019792	AACA	2	8	174693	174700	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019792	GCTG	2	8	178204	178211	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019792	CGAA	2	8	178366	178373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019792	CACG	2	8	178430	178437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019792	CGAG	2	8	179906	179913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019792	TTCG	2	8	180845	180852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019792	GCGG	2	8	180870	180877	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019792	CACG	2	8	181446	181453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019792	TTCT	2	8	183838	183845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019792	GGGC	2	8	184074	184081	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019792	CAGT	2	8	185368	185375	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019792	CGGT	2	8	187413	187420	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019792	GAGG	2	8	193001	193008	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019792	CCCG	2	8	193068	193075	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_019792	TCGG	2	8	196545	196552	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019792	GTCG	2	8	197170	197177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019792	GTTT	2	8	206034	206041	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019792	AGTG	2	8	206056	206063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019792	CAGT	2	8	206288	206295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019792	TCCG	2	8	206342	206349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019792	GCGA	2	8	206495	206502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019792	GTTC	2	8	206656	206663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019792	GGAA	2	8	209222	209229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019792	GCTC	2	8	212136	212143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019792	GGGA	2	8	221354	221361	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019792	ACTG	2	8	221719	221726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019792	GTCA	2	8	222852	222859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019792	CGAG	2	8	224322	224329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019792	CCGA	2	8	226350	226357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019792	CGAT	2	8	226746	226753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019792	TCGC	3	12	226774	226785	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019792	CTAA	2	8	231159	231166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019792	CGTT	2	8	231252	231259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019792	CCTG	2	8	232193	232200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019792	GTCG	2	8	234973	234980	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019792	TTCG	2	8	234982	234989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019792	CGTT	2	8	236128	236135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019792	GTCA	2	8	237292	237299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019792	ACTC	2	8	237405	237412	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019792	CGAG	2	8	240466	240473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019792	ATCG	2	8	244049	244056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019792	GAGT	2	8	244601	244608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019792	CGAG	2	8	244867	244874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019792	GACG	2	8	244903	244910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019792	GCCG	2	8	248286	248293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019792	CGCC	2	8	248358	248365	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_019792	CAGT	2	8	249271	249278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019792	GGGC	2	8	252392	252399	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019792	CTTT	2	8	255057	255064	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019792	CGAT	2	8	257259	257266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019792	CGAA	2	8	259284	259291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019792	ACTG	2	8	263015	263022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019792	GGCG	2	8	263861	263868	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019792	GCCC	2	8	266263	266270	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_019792	CGAC	2	8	269017	269024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019792	CGAC	2	8	269057	269064	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019792	GTCA	2	8	269198	269205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019792	GCCG	2	8	271037	271044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019792	CGAG	2	8	271049	271056	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019792	TCGA	2	8	275420	275427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_019792	CGGA	2	8	275516	275523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_019792	GACG	2	8	278081	278088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_019792	ATTT	2	8	278092	278099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019792	ACCG	2	8	281688	281695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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160	NC_019792	TCGA	2	8	294587	294594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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