MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019791	TTAAAT	2	12	3856	3867	50 %	50 %	0 %	0 %	429216261
2	NC_019791	TATGGT	2	12	6100	6111	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429216263
3	NC_019791	AAGATA	2	12	7508	7519	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429216265
4	NC_019791	AATTAT	2	12	13167	13178	50 %	50 %	0 %	0 %	429216271
5	NC_019791	AATATC	2	12	19833	19844	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429216278
6	NC_019791	TTTAAG	2	12	26602	26613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429216285
7	NC_019791	ATAATG	2	12	27366	27377	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429216286
8	NC_019791	TTTCTA	2	12	27413	27424	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429216286
9	NC_019791	TAGAGA	2	12	28335	28346	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429216287
10	NC_019791	TTTAAA	2	12	29290	29301	50 %	50 %	0 %	0 %	429216288
11	NC_019791	ATTTGT	2	12	31035	31046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429216290
12	NC_019791	TTGAGA	2	12	34223	34234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216292
13	NC_019791	TCATTA	2	12	34613	34624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429216293
14	NC_019791	ATTTTA	2	12	36019	36030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216295
15	NC_019791	AAATAA	2	12	37301	37312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429216296
16	NC_019791	ATATTT	2	12	39981	39992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216300
17	NC_019791	TATAAA	2	12	42371	42382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216300
18	NC_019791	TAATGG	2	12	43182	43193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216300
19	NC_019791	AGGGCA	2	12	48008	48019	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429216306
20	NC_019791	ATTCAA	2	12	48509	48520	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429216307
21	NC_019791	CAAATC	2	12	50071	50082	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	429216308
22	NC_019791	TGGTAA	2	12	52150	52161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216310
23	NC_019791	ATGAAC	2	12	52660	52671	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429216310
24	NC_019791	AGGTTT	2	12	52675	52686	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429216310
25	NC_019791	TTACCA	2	12	54536	54547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216312
26	NC_019791	TATAAT	2	12	62046	62057	50 %	50 %	0 %	0 %	429216318
27	NC_019791	TTTATG	2	12	64752	64763	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429216319
28	NC_019791	TATATC	2	12	64941	64952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429216319
29	NC_019791	GAACTT	2	12	66962	66973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429216321
30	NC_019791	ATATAA	2	12	77596	77607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216329
31	NC_019791	GAAAAG	2	12	82918	82929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216334
32	NC_019791	AGCTAG	2	12	85442	85453	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429216336
33	NC_019791	CTTATG	2	12	93190	93201	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429216345
34	NC_019791	TAACAA	2	12	93535	93546	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429216345
35	NC_019791	CTTAGC	2	12	94172	94183	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429216345
36	NC_019791	CCTGGG	2	12	96133	96144	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429216347
37	NC_019791	AATATT	2	12	98689	98700	50 %	50 %	0 %	0 %	429216350
38	NC_019791	TATTGG	2	12	99287	99298	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429216351
39	NC_019791	ATAAAA	2	12	101835	101846	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429216353
40	NC_019791	TATATG	2	12	109093	109104	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429216361
41	NC_019791	TCAATG	2	12	109544	109555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429216362
42	NC_019791	GAAATA	2	12	109772	109783	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429216362
43	NC_019791	TTTAAA	2	12	110395	110406	50 %	50 %	0 %	0 %	429216363
44	NC_019791	TATTAA	2	12	118567	118578	50 %	50 %	0 %	0 %	429216369
45	NC_019791	TTTGGT	2	12	118737	118748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216369
46	NC_019791	AAACAG	2	12	120925	120936	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	429216372
47	NC_019791	TTTGAG	2	12	123689	123700	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429216374
48	NC_019791	CCTTAT	2	12	125505	125516	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	429216375
49	NC_019791	TATAGC	2	12	126823	126834	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429216376
50	NC_019791	CATCCA	2	12	128184	128195	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	429216377
51	NC_019791	ATGTTG	2	12	141974	141985	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429216386
52	NC_019791	CGGCTT	2	12	143046	143057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216387
53	NC_019791	AAATGA	2	12	151999	152010	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429216394
54	NC_019791	CATGTA	2	12	152213	152224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429216394
55	NC_019791	TAAATC	2	12	153808	153819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429216396
56	NC_019791	AGCTAA	2	12	155176	155187	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429216396
57	NC_019791	ATAAAA	2	12	155960	155971	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429216397
58	NC_019791	GATGGT	2	12	157783	157794	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	429216398
59	NC_019791	AAAATC	2	12	158307	158318	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429216399
60	NC_019791	AAATGA	2	12	159172	159183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429216400
61	NC_019791	AATTAA	2	12	159712	159723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216401
62	NC_019791	TTGTTT	2	12	161785	161796	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	429216402
63	NC_019791	TTAAAA	2	12	162130	162141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216403
64	NC_019791	TAGCAT	2	12	165237	165248	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429216404
65	NC_019791	AACATA	2	12	167000	167011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429216406
66	NC_019791	CCATTG	2	12	167446	167457	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429216406
67	NC_019791	ATGAAA	2	12	176452	176463	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429216413
68	NC_019791	ATTTTT	2	12	182135	182146	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	429216417
69	NC_019791	AGTAAT	2	12	182604	182615	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429216418
70	NC_019791	GTTGAG	2	12	183040	183051	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	429216418
71	NC_019791	TTTGCA	2	12	183595	183606	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429216418
72	NC_019791	CTATAT	2	12	187632	187643	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429216421
73	NC_019791	AATTTT	2	12	187714	187725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216421
74	NC_019791	ACTCCA	2	12	189468	189479	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	429216423
75	NC_019791	GGTACA	2	12	190041	190052	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429216423
76	NC_019791	AACATA	2	12	193338	193349	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429216425
77	NC_019791	AAAATG	2	12	197346	197357	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429216428
78	NC_019791	TTTCTT	2	12	198239	198250	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	429216429
79	NC_019791	TTTACA	2	12	202712	202723	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429216431
80	NC_019791	TTTATC	2	12	204061	204072	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429216432
81	NC_019791	ATAAGG	2	12	205075	205086	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429216433
82	NC_019791	TAAATT	2	12	206404	206415	50 %	50 %	0 %	0 %	429216434
83	NC_019791	TTTAAA	2	12	207372	207383	50 %	50 %	0 %	0 %	429216435
84	NC_019791	TTAATA	2	12	212005	212016	50 %	50 %	0 %	0 %	429216437
85	NC_019791	TGGTAT	2	12	212302	212313	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429216437
86	NC_019791	ATAAAA	2	12	212937	212948	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429216438
87	NC_019791	AGATAA	2	12	217754	217765	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429216440
88	NC_019791	TCTTTT	2	12	220536	220547	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	429216442
89	NC_019791	AGCATA	2	12	222625	222636	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429216444
90	NC_019791	TACATT	2	12	222712	222723	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429216444
91	NC_019791	TTTGGT	2	12	222914	222925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216444
92	NC_019791	GAAATA	2	12	225532	225543	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429216445
93	NC_019791	AATCAA	2	12	230562	230573	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429216449
94	NC_019791	TTTTGC	2	12	230941	230952	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	429216449
95	NC_019791	TGCTAT	2	12	231670	231681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429216450
96	NC_019791	CTATAG	2	12	231741	231752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429216450
97	NC_019791	CCATCA	2	12	232019	232030	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	429216451
98	NC_019791	ATTTAT	2	12	233174	233185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216452
99	NC_019791	TATCAA	2	12	233359	233370	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429216452
100	NC_019791	TTAACT	2	12	235800	235811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429216455
101	NC_019791	ATACCC	2	12	236205	236216	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	429216455
102	NC_019791	TGCATT	2	12	237430	237441	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429216456
103	NC_019791	TGGATT	2	12	245432	245443	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429216466
104	NC_019791	ACCAAA	2	12	246956	246967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216469
105	NC_019791	TTGATC	2	12	251552	251563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429216474
106	NC_019791	TTTTCC	2	12	252216	252227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216474
107	NC_019791	TTTAAT	2	12	254027	254038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216477
108	NC_019791	TGAAAC	2	12	257844	257855	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429216481
109	NC_019791	CAAGAA	2	12	258966	258977	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	429216483
110	NC_019791	TTTGGG	2	12	261873	261884	0 %	50 %	50 %	0 %	429216486
111	NC_019791	GGAGCA	2	12	262225	262236	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429216486
112	NC_019791	TGAAAA	2	12	263673	263684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429216488
113	NC_019791	TCTATT	2	12	266843	266854	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429216492
114	NC_019791	AATCCT	2	12	267842	267853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216493
115	NC_019791	GTAATT	2	12	269139	269150	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429216494
116	NC_019791	TGCAAA	2	12	273448	273459	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429216496
117	NC_019791	TTTCTT	2	12	274397	274408	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	429216497
118	NC_019791	GCTAAG	2	12	275505	275516	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429216499
119	NC_019791	AATTCT	2	12	278994	279005	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429216503
120	NC_019791	AAATGA	2	12	282429	282440	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429216505
121	NC_019791	AATTTT	2	12	285293	285304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216509
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233	NC_019791	AAGAAT	2	12	537737	537748	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429216775
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352	NC_019791	TTTATA	2	12	787534	787545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429217003
353	NC_019791	ACTATT	2	12	790802	790813	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429217007
354	NC_019791	ACCCAA	2	12	791140	791151	50 %	0 %	0 %	50 %	429217007
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449	NC_019791	TATTGC	2	12	1040508	1040519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429217212
450	NC_019791	TTCCTC	2	12	1041613	1041624	0 %	50 %	0 %	50 %	429217213
451	NC_019791	GGATAT	2	12	1044835	1044846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429217217
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454	NC_019791	AACATC	2	12	1053546	1053557	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	429217228
455	NC_019791	AAATTT	2	12	1055842	1055853	50 %	50 %	0 %	0 %	429217230
456	NC_019791	GGTACA	2	12	1055881	1055892	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429217230
457	NC_019791	CATATT	2	12	1062210	1062221	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429217235
458	NC_019791	TCATTA	2	12	1064348	1064359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429217236
459	NC_019791	CATTTA	2	12	1067055	1067066	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429217238
460	NC_019791	AGTTCT	2	12	1067116	1067127	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429217238
461	NC_019791	GCATAT	2	12	1069024	1069035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429217242
462	NC_019791	TACCGC	2	12	1073011	1073022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	429217248
463	NC_019791	AATGCC	2	12	1073608	1073619	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429217249
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465	NC_019791	ATATTT	2	12	1076582	1076593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429217252
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