MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 1469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019791	TAGGG	2	10	927	936	20 %	20 %	60 %	0 %	429216256
2	NC_019791	CAATA	2	10	2484	2493	60 %	20 %	0 %	20 %	429216258
3	NC_019791	CTTTC	2	10	2897	2906	0 %	60 %	0 %	40 %	429216259
4	NC_019791	AATTT	2	10	4573	4582	40 %	60 %	0 %	0 %	429216261
5	NC_019791	TATAA	2	10	6644	6653	60 %	40 %	0 %	0 %	429216263
6	NC_019791	AATGG	2	10	6668	6677	40 %	20 %	40 %	0 %	429216264
7	NC_019791	ATATT	2	10	7818	7827	40 %	60 %	0 %	0 %	429216265
8	NC_019791	TCTTT	2	10	10052	10061	0 %	80 %	0 %	20 %	429216267
9	NC_019791	TGCAT	2	10	10856	10865	20 %	40 %	20 %	20 %	429216268
10	NC_019791	ATTTA	2	10	11966	11975	40 %	60 %	0 %	0 %	429216269
11	NC_019791	AGTTT	2	10	11988	11997	20 %	60 %	20 %	0 %	429216269
12	NC_019791	TTTTA	2	10	12482	12491	20 %	80 %	0 %	0 %	429216269
13	NC_019791	CCTGT	2	10	18900	18909	0 %	40 %	20 %	40 %	429216278
14	NC_019791	TCCAT	2	10	25637	25646	20 %	40 %	0 %	40 %	429216284
15	NC_019791	TTTTC	2	10	26250	26259	0 %	80 %	0 %	20 %	429216285
16	NC_019791	ATTTG	2	10	26653	26662	20 %	60 %	20 %	0 %	429216285
17	NC_019791	AATAT	2	10	28641	28650	60 %	40 %	0 %	0 %	429216287
18	NC_019791	TTTCC	2	10	28661	28670	0 %	60 %	0 %	40 %	429216287
19	NC_019791	TTTCC	2	10	28686	28695	0 %	60 %	0 %	40 %	429216287
20	NC_019791	TTATT	2	10	28773	28782	20 %	80 %	0 %	0 %	429216287
21	NC_019791	TAAAC	2	10	29932	29941	60 %	20 %	0 %	20 %	429216289
22	NC_019791	ATTTC	2	10	31063	31072	20 %	60 %	0 %	20 %	429216290
23	NC_019791	ATTTA	2	10	32301	32310	40 %	60 %	0 %	0 %	429216291
24	NC_019791	CTAGA	2	10	33890	33899	40 %	20 %	20 %	20 %	429216292
25	NC_019791	TAGAT	2	10	37745	37754	40 %	40 %	20 %	0 %	429216296
26	NC_019791	TTCTT	2	10	38517	38526	0 %	80 %	0 %	20 %	429216297
27	NC_019791	ATTTC	2	10	40012	40021	20 %	60 %	0 %	20 %	429216300
28	NC_019791	ATAGA	2	10	41292	41301	60 %	20 %	20 %	0 %	429216300
29	NC_019791	CTTTA	2	10	42711	42720	20 %	60 %	0 %	20 %	429216300
30	NC_019791	TATAA	2	10	44090	44099	60 %	40 %	0 %	0 %	429216300
31	NC_019791	CTATT	2	10	44483	44492	20 %	60 %	0 %	20 %	429216301
32	NC_019791	ATTTT	2	10	45340	45349	20 %	80 %	0 %	0 %	429216302
33	NC_019791	AAGTA	2	10	52076	52085	60 %	20 %	20 %	0 %	429216310
34	NC_019791	TCCTA	2	10	53041	53050	20 %	40 %	0 %	40 %	429216310
35	NC_019791	TTATC	2	10	54208	54217	20 %	60 %	0 %	20 %	429216311
36	NC_019791	CAAAT	2	10	54763	54772	60 %	20 %	0 %	20 %	429216312
37	NC_019791	ATCCA	2	10	54949	54958	40 %	20 %	0 %	40 %	429216312
38	NC_019791	TTTCT	2	10	55222	55231	0 %	80 %	0 %	20 %	429216313
39	NC_019791	TAATA	2	10	58700	58709	60 %	40 %	0 %	0 %	429216316
40	NC_019791	CAAAA	2	10	61839	61848	80 %	0 %	0 %	20 %	429216318
41	NC_019791	AGCAG	2	10	65371	65380	40 %	0 %	40 %	20 %	429216319
42	NC_019791	TTAAA	2	10	66987	66996	60 %	40 %	0 %	0 %	429216321
43	NC_019791	TATAA	2	10	67630	67639	60 %	40 %	0 %	0 %	429216321
44	NC_019791	AGAAT	2	10	67915	67924	60 %	20 %	20 %	0 %	429216321
45	NC_019791	AATTT	2	10	71715	71724	40 %	60 %	0 %	0 %	429216325
46	NC_019791	AGAGG	2	10	73142	73151	40 %	0 %	60 %	0 %	429216326
47	NC_019791	GCAAC	2	10	80047	80056	40 %	0 %	20 %	40 %	429216331
48	NC_019791	GAAAA	2	10	83410	83419	80 %	0 %	20 %	0 %	429216334
49	NC_019791	TTCTT	2	10	85013	85022	0 %	80 %	0 %	20 %	429216336
50	NC_019791	AGGTA	2	10	88459	88468	40 %	20 %	40 %	0 %	429216339
51	NC_019791	TAATA	2	10	88771	88780	60 %	40 %	0 %	0 %	429216339
52	NC_019791	TTAAA	2	10	89047	89056	60 %	40 %	0 %	0 %	429216340
53	NC_019791	TTGAT	2	10	89451	89460	20 %	60 %	20 %	0 %	429216341
54	NC_019791	ATAAA	2	10	90064	90073	80 %	20 %	0 %	0 %	429216341
55	NC_019791	ATTAA	2	10	90836	90845	60 %	40 %	0 %	0 %	429216342
56	NC_019791	TAAAA	2	10	90849	90858	80 %	20 %	0 %	0 %	429216342
57	NC_019791	GAATT	2	10	90924	90933	40 %	40 %	20 %	0 %	429216343
58	NC_019791	ATGTT	2	10	92188	92197	20 %	60 %	20 %	0 %	429216344
59	NC_019791	AAACA	2	10	92521	92530	80 %	0 %	0 %	20 %	429216344
60	NC_019791	AAAGA	2	10	94454	94463	80 %	0 %	20 %	0 %	429216345
61	NC_019791	AATTC	2	10	94597	94606	40 %	40 %	0 %	20 %	429216345
62	NC_019791	TATTC	2	10	95671	95680	20 %	60 %	0 %	20 %	429216346
63	NC_019791	TATTT	2	10	96066	96075	20 %	80 %	0 %	0 %	429216347
64	NC_019791	ATTAA	2	10	98555	98564	60 %	40 %	0 %	0 %	429216350
65	NC_019791	TTTAT	2	10	99615	99624	20 %	80 %	0 %	0 %	429216351
66	NC_019791	TTAAA	2	10	99852	99861	60 %	40 %	0 %	0 %	429216352
67	NC_019791	TTTTC	2	10	99870	99879	0 %	80 %	0 %	20 %	429216352
68	NC_019791	TTTAT	2	10	100733	100742	20 %	80 %	0 %	0 %	429216352
69	NC_019791	GAAAA	2	10	102046	102055	80 %	0 %	20 %	0 %	429216354
70	NC_019791	GTAAT	2	10	102972	102981	40 %	40 %	20 %	0 %	429216355
71	NC_019791	TAAAT	2	10	103719	103728	60 %	40 %	0 %	0 %	429216356
72	NC_019791	TAATA	2	10	103740	103749	60 %	40 %	0 %	0 %	429216356
73	NC_019791	AAGAA	2	10	106053	106062	80 %	0 %	20 %	0 %	429216358
74	NC_019791	TAAAA	2	10	106751	106760	80 %	20 %	0 %	0 %	429216359
75	NC_019791	AAGAG	2	10	107458	107467	60 %	0 %	40 %	0 %	429216360
76	NC_019791	AAATA	2	10	108394	108403	80 %	20 %	0 %	0 %	429216360
77	NC_019791	ATTAG	2	10	108642	108651	40 %	40 %	20 %	0 %	429216361
78	NC_019791	TGCTT	2	10	109738	109747	0 %	60 %	20 %	20 %	429216362
79	NC_019791	GGGAT	2	10	110105	110114	20 %	20 %	60 %	0 %	429216362
80	NC_019791	TATTT	2	10	111946	111955	20 %	80 %	0 %	0 %	429216364
81	NC_019791	ATTTT	2	10	112089	112098	20 %	80 %	0 %	0 %	429216364
82	NC_019791	TTTAA	2	10	112898	112907	40 %	60 %	0 %	0 %	429216365
83	NC_019791	AAAAT	2	10	112974	112983	80 %	20 %	0 %	0 %	429216365
84	NC_019791	GGAAG	2	10	113232	113241	40 %	0 %	60 %	0 %	429216365
85	NC_019791	AAAAT	2	10	113622	113631	80 %	20 %	0 %	0 %	429216365
86	NC_019791	GAAAT	2	10	113679	113688	60 %	20 %	20 %	0 %	429216365
87	NC_019791	TAATC	2	10	114262	114271	40 %	40 %	0 %	20 %	429216366
88	NC_019791	CTTTT	2	10	114434	114443	0 %	80 %	0 %	20 %	429216366
89	NC_019791	CAATT	2	10	116715	116724	40 %	40 %	0 %	20 %	429216368
90	NC_019791	TTATA	2	10	118413	118422	40 %	60 %	0 %	0 %	429216369
91	NC_019791	AATAT	2	10	118608	118617	60 %	40 %	0 %	0 %	429216369
92	NC_019791	ATAAA	2	10	118854	118863	80 %	20 %	0 %	0 %	429216369
93	NC_019791	TAAGT	2	10	121046	121055	40 %	40 %	20 %	0 %	429216372
94	NC_019791	TTCTT	2	10	121310	121319	0 %	80 %	0 %	20 %	429216373
95	NC_019791	CCATA	2	10	126239	126248	40 %	20 %	0 %	40 %	429216375
96	NC_019791	AACTA	2	10	126454	126463	60 %	20 %	0 %	20 %	429216375
97	NC_019791	ATTTT	2	10	126476	126485	20 %	80 %	0 %	0 %	429216375
98	NC_019791	GATAT	2	10	126774	126783	40 %	40 %	20 %	0 %	429216376
99	NC_019791	TAATT	2	10	128249	128258	40 %	60 %	0 %	0 %	429216377
100	NC_019791	AAATG	2	10	129045	129054	60 %	20 %	20 %	0 %	429216378
101	NC_019791	TAGCT	2	10	130983	130992	20 %	40 %	20 %	20 %	429216380
102	NC_019791	TAACA	2	10	131445	131454	60 %	20 %	0 %	20 %	429216380
103	NC_019791	GCCAA	2	10	132319	132328	40 %	0 %	20 %	40 %	429216381
104	NC_019791	TTTAA	2	10	132876	132885	40 %	60 %	0 %	0 %	429216381
105	NC_019791	TCATT	2	10	133033	133042	20 %	60 %	0 %	20 %	429216381
106	NC_019791	ATAAC	2	10	135163	135172	60 %	20 %	0 %	20 %	429216383
107	NC_019791	TAAGA	2	10	135629	135638	60 %	20 %	20 %	0 %	429216383
108	NC_019791	GAAAT	2	10	136267	136276	60 %	20 %	20 %	0 %	429216383
109	NC_019791	AAATC	2	10	136764	136773	60 %	20 %	0 %	20 %	429216383
110	NC_019791	TATCA	2	10	137517	137526	40 %	40 %	0 %	20 %	429216384
111	NC_019791	TATAT	2	10	137586	137595	40 %	60 %	0 %	0 %	429216384
112	NC_019791	TAATT	2	10	138883	138892	40 %	60 %	0 %	0 %	429216385
113	NC_019791	AGTGA	2	10	140199	140208	40 %	20 %	40 %	0 %	429216386
114	NC_019791	TCTTA	2	10	141084	141093	20 %	60 %	0 %	20 %	429216386
115	NC_019791	TGTTA	2	10	141681	141690	20 %	60 %	20 %	0 %	429216386
116	NC_019791	AAAAG	2	10	144725	144734	80 %	0 %	20 %	0 %	429216388
117	NC_019791	AATTA	2	10	144809	144818	60 %	40 %	0 %	0 %	429216388
118	NC_019791	TAAAT	2	10	145202	145211	60 %	40 %	0 %	0 %	429216388
119	NC_019791	ATATT	2	10	145423	145432	40 %	60 %	0 %	0 %	429216389
120	NC_019791	TTTAT	2	10	148711	148720	20 %	80 %	0 %	0 %	429216391
121	NC_019791	TTTTC	2	10	149702	149711	0 %	80 %	0 %	20 %	429216392
122	NC_019791	AAAGA	2	10	150499	150508	80 %	0 %	20 %	0 %	429216392
123	NC_019791	TTGTA	2	10	150526	150535	20 %	60 %	20 %	0 %	429216392
124	NC_019791	CATAA	2	10	154405	154414	60 %	20 %	0 %	20 %	429216396
125	NC_019791	TTATT	2	10	154821	154830	20 %	80 %	0 %	0 %	429216396
126	NC_019791	AGAAA	2	10	156116	156125	80 %	0 %	20 %	0 %	429216397
127	NC_019791	TGAAT	2	10	156148	156157	40 %	40 %	20 %	0 %	429216397
128	NC_019791	TCCAG	2	10	156739	156748	20 %	20 %	20 %	40 %	429216398
129	NC_019791	GAAAT	2	10	157592	157601	60 %	20 %	20 %	0 %	429216398
130	NC_019791	AAATT	2	10	158382	158391	60 %	40 %	0 %	0 %	429216399
131	NC_019791	ATTTA	2	10	158457	158466	40 %	60 %	0 %	0 %	429216399
132	NC_019791	TTGAT	2	10	159187	159196	20 %	60 %	20 %	0 %	429216400
133	NC_019791	TAATT	2	10	159868	159877	40 %	60 %	0 %	0 %	429216401
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135	NC_019791	GGTTT	2	10	160792	160801	0 %	60 %	40 %	0 %	429216402
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