MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 22075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019791	TGA	2	6	75	80	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
2	NC_019791	GCA	2	6	91	96	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216256
3	NC_019791	TAT	2	6	128	133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216256
4	NC_019791	TTC	2	6	155	160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216256
5	NC_019791	GAT	2	6	169	174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
6	NC_019791	AGA	2	6	300	305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216256
7	NC_019791	ATT	2	6	398	403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216256
8	NC_019791	GAT	2	6	538	543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
9	NC_019791	TTA	2	6	544	549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216256
10	NC_019791	ATA	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216256
11	NC_019791	AGC	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216256
12	NC_019791	GAA	3	9	667	675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216256
13	NC_019791	ATG	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
14	NC_019791	GCA	2	6	784	789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216256
15	NC_019791	GCT	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216256
16	NC_019791	TGT	2	6	876	881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216256
17	NC_019791	GAT	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
18	NC_019791	GTA	2	6	940	945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
19	NC_019791	TAA	2	6	971	976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216256
20	NC_019791	ATT	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216256
21	NC_019791	AGA	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216256
22	NC_019791	AAG	2	6	1089	1094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216256
23	NC_019791	ATC	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216256
24	NC_019791	AAT	2	6	1146	1151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216256
25	NC_019791	GGC	2	6	1191	1196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429216256
26	NC_019791	AGA	2	6	1227	1232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216256
27	NC_019791	ATG	2	6	1268	1273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
28	NC_019791	ATA	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216256
29	NC_019791	TGA	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
30	NC_019791	TAT	2	6	1425	1430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216257
31	NC_019791	TGT	2	6	1468	1473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216257
32	NC_019791	AGA	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216257
33	NC_019791	ATA	2	6	1793	1798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216257
34	NC_019791	ATT	2	6	1817	1822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216257
35	NC_019791	TTC	2	6	1969	1974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216258
36	NC_019791	TAG	2	6	1983	1988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216258
37	NC_019791	ATT	2	6	2003	2008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216258
38	NC_019791	ATA	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216258
39	NC_019791	TTA	2	6	2051	2056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216258
40	NC_019791	ATA	3	9	2078	2086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216258
41	NC_019791	TAA	2	6	2130	2135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216258
42	NC_019791	ATT	2	6	2186	2191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216258
43	NC_019791	GAT	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216258
44	NC_019791	CAT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216258
45	NC_019791	ATT	2	6	2377	2382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216258
46	NC_019791	AGG	2	6	2419	2424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216258
47	NC_019791	GAC	2	6	2994	2999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216259
48	NC_019791	GAA	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216260
49	NC_019791	ATT	2	6	3311	3316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216260
50	NC_019791	GGA	2	6	3363	3368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216260
51	NC_019791	CTT	2	6	3442	3447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216261
52	NC_019791	ACT	2	6	3510	3515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216261
53	NC_019791	AGG	2	6	3575	3580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216261
54	NC_019791	ATA	2	6	3584	3589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216261
55	NC_019791	TTC	2	6	3638	3643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216261
56	NC_019791	TAT	2	6	3662	3667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216261
57	NC_019791	AGA	2	6	3749	3754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216261
58	NC_019791	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216261
59	NC_019791	GAT	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216261
60	NC_019791	TTA	2	6	3930	3935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216261
61	NC_019791	ATC	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216261
62	NC_019791	TGA	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216261
63	NC_019791	TTC	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216261
64	NC_019791	TAT	2	6	4210	4215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216261
65	NC_019791	AAG	2	6	4301	4306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216261
66	NC_019791	TAT	2	6	4309	4314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216261
67	NC_019791	AGG	2	6	4370	4375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216261
68	NC_019791	GCT	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216261
69	NC_019791	ATC	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216261
70	NC_019791	TTC	2	6	4646	4651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216261
71	NC_019791	AGG	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216261
72	NC_019791	CTT	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216261
73	NC_019791	GAA	2	6	4951	4956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216262
74	NC_019791	TAA	2	6	4962	4967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216262
75	NC_019791	CTC	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429216262
76	NC_019791	GAA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216262
77	NC_019791	AAC	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216262
78	NC_019791	GAG	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216262
79	NC_019791	AGG	2	6	5367	5372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216262
80	NC_019791	TAG	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216262
81	NC_019791	TAG	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216262
82	NC_019791	ATT	2	6	5646	5651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216262
83	NC_019791	TCA	2	6	5664	5669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216262
84	NC_019791	CTG	2	6	5762	5767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216262
85	NC_019791	GGA	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216262
86	NC_019791	TAG	2	6	5780	5785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216262
87	NC_019791	AAG	2	6	5817	5822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216262
88	NC_019791	TTG	2	6	5849	5854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216262
89	NC_019791	TAA	2	6	5891	5896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216262
90	NC_019791	ATA	2	6	6003	6008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216263
91	NC_019791	AAT	2	6	6032	6037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216263
92	NC_019791	TAT	2	6	6162	6167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216263
93	NC_019791	TAT	2	6	6189	6194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216263
94	NC_019791	TAA	2	6	6196	6201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216263
95	NC_019791	ATT	2	6	6221	6226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216263
96	NC_019791	TAT	2	6	6236	6241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216263
97	NC_019791	TGG	2	6	6311	6316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429216263
98	NC_019791	TAA	2	6	6410	6415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216263
99	NC_019791	CTG	2	6	6427	6432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216263
100	NC_019791	AAT	2	6	6533	6538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216263
101	NC_019791	AGA	2	6	6539	6544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216263
102	NC_019791	TAA	2	6	6610	6615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216263
103	NC_019791	GGA	2	6	6712	6717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216264
104	NC_019791	GAA	2	6	6753	6758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216264
105	NC_019791	AAG	2	6	6811	6816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216264
106	NC_019791	TAG	2	6	6820	6825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216264
107	NC_019791	TAA	2	6	6857	6862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216264
108	NC_019791	ATG	3	9	6931	6939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216264
109	NC_019791	TAA	2	6	6961	6966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216264
110	NC_019791	GCT	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216264
111	NC_019791	AGG	2	6	7121	7126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216264
112	NC_019791	AGA	2	6	7151	7156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216264
113	NC_019791	GAG	2	6	7185	7190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216264
114	NC_019791	TAA	2	6	7212	7217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216264
115	NC_019791	TAA	2	6	7316	7321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216265
116	NC_019791	ATT	2	6	7388	7393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216265
117	NC_019791	TTG	2	6	7400	7405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216265
118	NC_019791	TAA	2	6	7416	7421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216265
119	NC_019791	ATA	2	6	7424	7429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216265
120	NC_019791	ACT	2	6	7445	7450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216265
121	NC_019791	GAT	2	6	7624	7629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216265
122	NC_019791	TTA	2	6	7772	7777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216265
123	NC_019791	ATT	2	6	7783	7788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216265
124	NC_019791	GAA	2	6	7804	7809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216265
125	NC_019791	TTG	2	6	7937	7942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216265
126	NC_019791	TAA	2	6	7985	7990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216265
127	NC_019791	AGA	2	6	7991	7996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216265
128	NC_019791	GGA	2	6	8074	8079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216265
129	NC_019791	TAA	2	6	8159	8164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216265
130	NC_019791	TTA	2	6	8171	8176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216265
131	NC_019791	ATA	2	6	8201	8206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216265
132	NC_019791	TTA	2	6	8215	8220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216265
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