MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 plasmid pDEIPE02

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019790	GTGACG	2	12	2729	2740	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429221855
2	NC_019790	CGCGTA	2	12	3907	3918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429221856
3	NC_019790	GGCAGT	2	12	8869	8880	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429221861
4	NC_019790	CAACGC	2	12	9826	9837	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	429221862
5	NC_019790	CAGCGC	2	12	14959	14970	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	429221866
6	NC_019790	AACTTT	2	12	17413	17424	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429221867
7	NC_019790	GCCGAG	2	12	20610	20621	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019790	GCCGTT	2	12	24628	24639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019790	GTCGAG	2	12	36135	36146	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429221878
10	NC_019790	CCTCTT	2	12	37993	38004	0 %	50 %	0 %	50 %	429221880
11	NC_019790	AGCTGG	2	12	39311	39322	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429221883
12	NC_019790	CGAGGC	2	12	41343	41354	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	429221884
13	NC_019790	CCACAC	2	12	47557	47568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221890
14	NC_019790	CCCGCG	2	12	47724	47735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221890
15	NC_019790	CCATGA	2	12	48380	48391	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429221891
16	NC_019790	CTGGAA	2	12	48499	48510	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429221891
17	NC_019790	CAGGTG	2	12	48706	48717	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429221891
18	NC_019790	ACAGCA	2	12	49312	49323	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	429221892
19	NC_019790	CCACAT	2	12	50049	50060	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	429221893
20	NC_019790	TCGAAG	2	12	51085	51096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429221895
21	NC_019790	TCACCA	2	12	52273	52284	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	429221897
22	NC_019790	GAGGTG	2	12	58453	58464	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	429221906
23	NC_019790	GCCGTG	2	12	58486	58497	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429221906
24	NC_019790	GCGAAC	2	12	61007	61018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221908
25	NC_019790	CGATCT	2	12	63805	63816	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019790	GCTGGC	2	12	65448	65459	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019790	CGAAAC	2	12	67924	67935	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	429221915
28	NC_019790	TGGCGG	2	12	68349	68360	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	429221915
29	NC_019790	TGAACG	2	12	70083	70094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429221916
30	NC_019790	TCAAGC	2	12	72415	72426	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429221918

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.