MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 plasmid pDEIPE02

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019790	CACCT	2	10	604	613	20 %	20 %	0 %	60 %	429221854
2	NC_019790	CGTCC	2	10	904	913	0 %	20 %	20 %	60 %	429221854
3	NC_019790	GTGCG	2	10	1086	1095	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019790	GCGCA	2	10	1826	1835	20 %	0 %	40 %	40 %	429221855
5	NC_019790	CAGGA	2	10	2060	2069	40 %	0 %	40 %	20 %	429221855
6	NC_019790	ACCGT	2	10	2648	2657	20 %	20 %	20 %	40 %	429221855
7	NC_019790	TGGCG	2	10	3417	3426	0 %	20 %	60 %	20 %	429221856
8	NC_019790	CTGGA	2	10	3858	3867	20 %	20 %	40 %	20 %	429221856
9	NC_019790	CCAAC	2	10	5351	5360	40 %	0 %	0 %	60 %	429221858
10	NC_019790	ACGCC	2	10	5807	5816	20 %	0 %	20 %	60 %	429221858
11	NC_019790	AGCTG	2	10	6164	6173	20 %	20 %	40 %	20 %	429221858
12	NC_019790	TCCAT	2	10	6291	6300	20 %	40 %	0 %	40 %	429221858
13	NC_019790	ACCTC	2	10	10474	10483	20 %	20 %	0 %	60 %	429221862
14	NC_019790	CCCGG	2	10	10740	10749	0 %	0 %	40 %	60 %	429221863
15	NC_019790	CCCCG	2	10	12004	12013	0 %	0 %	20 %	80 %	429221864
16	NC_019790	TTCCT	2	10	14723	14732	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_019790	CGGCC	2	10	16898	16907	0 %	0 %	40 %	60 %	429221866
18	NC_019790	ACGGC	2	10	20668	20677	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_019790	CTGCC	2	10	20797	20806	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_019790	GTGGC	2	10	21961	21970	0 %	20 %	60 %	20 %	429221870
21	NC_019790	CTCGG	2	10	23903	23912	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_019790	CCCAG	2	10	24891	24900	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_019790	CGAGT	2	10	25378	25387	20 %	20 %	40 %	20 %	429221871
24	NC_019790	GACGT	2	10	25511	25520	20 %	20 %	40 %	20 %	429221871
25	NC_019790	GTGTG	2	10	26797	26806	0 %	40 %	60 %	0 %	429221872
26	NC_019790	AGGAT	2	10	28827	28836	40 %	20 %	40 %	0 %	429221875
27	NC_019790	GTCAG	2	10	29139	29148	20 %	20 %	40 %	20 %	429221875
28	NC_019790	ACGCA	2	10	30719	30728	40 %	0 %	20 %	40 %	429221876
29	NC_019790	GTGAG	2	10	31668	31677	20 %	20 %	60 %	0 %	429221876
30	NC_019790	CCTAC	2	10	32290	32299	20 %	20 %	0 %	60 %	429221876
31	NC_019790	CCTTC	2	10	32320	32329	0 %	40 %	0 %	60 %	429221876
32	NC_019790	TTCAC	2	10	33249	33258	20 %	40 %	0 %	40 %	429221876
33	NC_019790	CCCGC	2	10	34406	34415	0 %	0 %	20 %	80 %	429221878
34	NC_019790	GCAAG	2	10	35216	35225	40 %	0 %	40 %	20 %	429221878
35	NC_019790	GCGCG	2	10	35294	35303	0 %	0 %	60 %	40 %	429221878
36	NC_019790	TGGTC	2	10	37141	37150	0 %	40 %	40 %	20 %	429221879
37	NC_019790	CTGCG	2	10	38234	38243	0 %	20 %	40 %	40 %	429221880
38	NC_019790	GTCGC	2	10	38452	38461	0 %	20 %	40 %	40 %	429221881
39	NC_019790	TCCCC	2	10	40859	40868	0 %	20 %	0 %	80 %	429221884
40	NC_019790	GGTCA	2	10	41080	41089	20 %	20 %	40 %	20 %	429221884
41	NC_019790	CTCCG	2	10	42714	42723	0 %	20 %	20 %	60 %	429221887
42	NC_019790	GAAGT	2	10	43324	43333	40 %	20 %	40 %	0 %	429221888
43	NC_019790	GCGTC	2	10	43917	43926	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_019790	GCCGT	2	10	45592	45601	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_019790	ACCCC	2	10	46762	46771	20 %	0 %	0 %	80 %	429221890
46	NC_019790	CGTGC	2	10	47923	47932	0 %	20 %	40 %	40 %	429221890
47	NC_019790	TGGCC	2	10	48776	48785	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_019790	CAGCG	2	10	50000	50009	20 %	0 %	40 %	40 %	429221893
49	NC_019790	GAAGC	2	10	50921	50930	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019790	CCAGC	2	10	51453	51462	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_019790	GCTGG	2	10	51738	51747	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019790	GTTGA	2	10	52032	52041	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019790	TCGCT	2	10	53003	53012	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_019790	TCGCT	2	10	53100	53109	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_019790	GCCCG	2	10	54002	54011	0 %	0 %	40 %	60 %	429221899
56	NC_019790	CTGGA	2	10	54795	54804	20 %	20 %	40 %	20 %	429221902
57	NC_019790	TGACC	2	10	56698	56707	20 %	20 %	20 %	40 %	429221904
58	NC_019790	CGAGC	2	10	57217	57226	20 %	0 %	40 %	40 %	429221904
59	NC_019790	GCCAA	2	10	57974	57983	40 %	0 %	20 %	40 %	429221906
60	NC_019790	CCTGA	2	10	58414	58423	20 %	20 %	20 %	40 %	429221906
61	NC_019790	CGAGC	2	10	58537	58546	20 %	0 %	40 %	40 %	429221906
62	NC_019790	TGGTG	2	10	58688	58697	0 %	40 %	60 %	0 %	429221906
63	NC_019790	TTCGC	2	10	58910	58919	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_019790	CAACA	2	10	59435	59444	60 %	0 %	0 %	40 %	429221907
65	NC_019790	CACTC	2	10	60363	60372	20 %	20 %	0 %	60 %	429221908
66	NC_019790	AACCA	2	10	61612	61621	60 %	0 %	0 %	40 %	429221908
67	NC_019790	CTTCG	2	10	62081	62090	0 %	40 %	20 %	40 %	429221909
68	NC_019790	ATTGA	2	10	62221	62230	40 %	40 %	20 %	0 %	429221909
69	NC_019790	GCACC	2	10	63120	63129	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_019790	TGCCG	2	10	63595	63604	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_019790	GAGTT	2	10	65793	65802	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019790	CACCT	2	10	66849	66858	20 %	20 %	0 %	60 %	429221914
73	NC_019790	TGTGG	2	10	68763	68772	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019790	GCACC	2	10	74184	74193	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_019790	TGGCG	2	10	74875	74884	0 %	20 %	60 %	20 %	429221920
76	NC_019790	TTGGC	2	10	75012	75021	0 %	40 %	40 %	20 %	429221920

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.