MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 plasmid pDEIPE02

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019790	ACCC	2	8	990	997	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_019790	ACTC	2	8	1024	1031	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019790	TGCC	2	8	1118	1125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019790	ACTC	2	8	1323	1330	25 %	25 %	0 %	50 %	429221855
5	NC_019790	ATTG	2	8	1881	1888	25 %	50 %	25 %	0 %	429221855
6	NC_019790	CAGT	2	8	2099	2106	25 %	25 %	25 %	25 %	429221855
7	NC_019790	TCGT	2	8	2218	2225	0 %	50 %	25 %	25 %	429221855
8	NC_019790	GGAC	2	8	2277	2284	25 %	0 %	50 %	25 %	429221855
9	NC_019790	GGAC	2	8	2856	2863	25 %	0 %	50 %	25 %	429221855
10	NC_019790	ATGA	2	8	2890	2897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019790	AGTG	2	8	3150	3157	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019790	TGCC	2	8	3251	3258	0 %	25 %	25 %	50 %	429221856
13	NC_019790	GTCG	2	8	3265	3272	0 %	25 %	50 %	25 %	429221856
14	NC_019790	ACGT	2	8	3296	3303	25 %	25 %	25 %	25 %	429221856
15	NC_019790	ACGA	2	8	3350	3357	50 %	0 %	25 %	25 %	429221856
16	NC_019790	CACG	2	8	3457	3464	25 %	0 %	25 %	50 %	429221856
17	NC_019790	TCCG	2	8	3889	3896	0 %	25 %	25 %	50 %	429221856
18	NC_019790	ACAT	2	8	3899	3906	50 %	25 %	0 %	25 %	429221856
19	NC_019790	AGGC	2	8	4104	4111	25 %	0 %	50 %	25 %	429221856
20	NC_019790	ACGG	2	8	4145	4152	25 %	0 %	50 %	25 %	429221856
21	NC_019790	GCGG	2	8	4806	4813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019790	CACG	2	8	5654	5661	25 %	0 %	25 %	50 %	429221858
23	NC_019790	GCGA	2	8	5707	5714	25 %	0 %	50 %	25 %	429221858
24	NC_019790	CACC	2	8	6227	6234	25 %	0 %	0 %	75 %	429221858
25	NC_019790	ACCT	2	8	6789	6796	25 %	25 %	0 %	50 %	429221859
26	NC_019790	CCGG	2	8	7212	7219	0 %	0 %	50 %	50 %	429221859
27	NC_019790	TTGA	2	8	7808	7815	25 %	50 %	25 %	0 %	429221860
28	NC_019790	CTGG	2	8	8068	8075	0 %	25 %	50 %	25 %	429221860
29	NC_019790	GCCC	2	8	9234	9241	0 %	0 %	25 %	75 %	429221861
30	NC_019790	TGAA	2	8	9257	9264	50 %	25 %	25 %	0 %	429221861
31	NC_019790	TCGC	2	8	9845	9852	0 %	25 %	25 %	50 %	429221862
32	NC_019790	CACG	2	8	9984	9991	25 %	0 %	25 %	50 %	429221862
33	NC_019790	ACCC	2	8	10121	10128	25 %	0 %	0 %	75 %	429221862
34	NC_019790	GCCC	2	8	10290	10297	0 %	0 %	25 %	75 %	429221862
35	NC_019790	ACCC	2	8	10562	10569	25 %	0 %	0 %	75 %	429221863
36	NC_019790	TGGC	2	8	10619	10626	0 %	25 %	50 %	25 %	429221863
37	NC_019790	ACCA	2	8	11058	11065	50 %	0 %	0 %	50 %	429221863
38	NC_019790	GCCA	2	8	11073	11080	25 %	0 %	25 %	50 %	429221863
39	NC_019790	CCTG	2	8	11420	11427	0 %	25 %	25 %	50 %	429221863
40	NC_019790	GCCA	2	8	12595	12602	25 %	0 %	25 %	50 %	429221864
41	NC_019790	TCAC	2	8	12643	12650	25 %	25 %	0 %	50 %	429221864
42	NC_019790	GGGC	2	8	12700	12707	0 %	0 %	75 %	25 %	429221864
43	NC_019790	ACGG	2	8	12782	12789	25 %	0 %	50 %	25 %	429221864
44	NC_019790	GAAC	2	8	12948	12955	50 %	0 %	25 %	25 %	429221864
45	NC_019790	TGGG	2	8	13343	13350	0 %	25 %	75 %	0 %	429221865
46	NC_019790	TGGC	2	8	13359	13366	0 %	25 %	50 %	25 %	429221865
47	NC_019790	ATTC	2	8	13486	13493	25 %	50 %	0 %	25 %	429221865
48	NC_019790	AGCG	2	8	13655	13662	25 %	0 %	50 %	25 %	429221865
49	NC_019790	TGGG	2	8	13996	14003	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019790	CGGG	2	8	14071	14078	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019790	ACGC	2	8	14651	14658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019790	GCCC	2	8	15825	15832	0 %	0 %	25 %	75 %	429221866
53	NC_019790	TTTC	2	8	16314	16321	0 %	75 %	0 %	25 %	429221866
54	NC_019790	ACCC	2	8	16406	16413	25 %	0 %	0 %	75 %	429221866
55	NC_019790	ACGC	2	8	16927	16934	25 %	0 %	25 %	50 %	429221866
56	NC_019790	CTGG	2	8	16976	16983	0 %	25 %	50 %	25 %	429221867
57	NC_019790	GACG	2	8	17167	17174	25 %	0 %	50 %	25 %	429221867
58	NC_019790	CAGG	2	8	17606	17613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019790	CCCA	2	8	18215	18222	25 %	0 %	0 %	75 %	429221868
60	NC_019790	GCGT	2	8	19192	19199	0 %	25 %	50 %	25 %	429221869
61	NC_019790	GCCT	2	8	19234	19241	0 %	25 %	25 %	50 %	429221869
62	NC_019790	CCAA	2	8	19767	19774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019790	CCTG	2	8	19962	19969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019790	CACC	2	8	20055	20062	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_019790	ACGC	2	8	21070	21077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019790	TGGC	2	8	21865	21872	0 %	25 %	50 %	25 %	429221870
67	NC_019790	GCCC	2	8	22021	22028	0 %	0 %	25 %	75 %	429221870
68	NC_019790	CGAC	2	8	22619	22626	25 %	0 %	25 %	50 %	429221870
69	NC_019790	TGAT	2	8	22859	22866	25 %	50 %	25 %	0 %	429221870
70	NC_019790	GGGC	2	8	24368	24375	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019790	GAGC	2	8	24704	24711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019790	GGGT	2	8	25721	25728	0 %	25 %	75 %	0 %	429221871
73	NC_019790	GCCT	2	8	25760	25767	0 %	25 %	25 %	50 %	429221871
74	NC_019790	GTGA	2	8	26412	26419	25 %	25 %	50 %	0 %	429221872
75	NC_019790	GGTG	2	8	26786	26793	0 %	25 %	75 %	0 %	429221872
76	NC_019790	AACG	2	8	27050	27057	50 %	0 %	25 %	25 %	429221873
77	NC_019790	CCAC	2	8	27194	27201	25 %	0 %	0 %	75 %	429221873
78	NC_019790	GCGG	2	8	27616	27623	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019790	GAGC	2	8	28400	28407	25 %	0 %	50 %	25 %	429221874
80	NC_019790	ACTT	2	8	28749	28756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019790	GCTG	2	8	29518	29525	0 %	25 %	50 %	25 %	429221875
82	NC_019790	AACC	2	8	29889	29896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019790	GGGT	2	8	30401	30408	0 %	25 %	75 %	0 %	429221876
84	NC_019790	CACG	2	8	31949	31956	25 %	0 %	25 %	50 %	429221876
85	NC_019790	ACGC	2	8	32074	32081	25 %	0 %	25 %	50 %	429221876
86	NC_019790	GGTG	2	8	32242	32249	0 %	25 %	75 %	0 %	429221876
87	NC_019790	CGGT	2	8	32391	32398	0 %	25 %	50 %	25 %	429221876
88	NC_019790	GGTG	2	8	32431	32438	0 %	25 %	75 %	0 %	429221876
89	NC_019790	TGAT	2	8	32775	32782	25 %	50 %	25 %	0 %	429221876
90	NC_019790	CAGT	2	8	33241	33248	25 %	25 %	25 %	25 %	429221876
91	NC_019790	GCCG	2	8	33366	33373	0 %	0 %	50 %	50 %	429221877
92	NC_019790	TGCG	2	8	33768	33775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019790	GCCG	2	8	34103	34110	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
94	NC_019790	ACCC	2	8	34134	34141	25 %	0 %	0 %	75 %	429221878
95	NC_019790	CTGC	2	8	35522	35529	0 %	25 %	25 %	50 %	429221878
96	NC_019790	GCAC	2	8	35668	35675	25 %	0 %	25 %	50 %	429221878
97	NC_019790	CACG	2	8	35792	35799	25 %	0 %	25 %	50 %	429221878
98	NC_019790	TTCA	2	8	36111	36118	25 %	50 %	0 %	25 %	429221878
99	NC_019790	GATC	2	8	37338	37345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019790	CCAG	2	8	37710	37717	25 %	0 %	25 %	50 %	429221880
101	NC_019790	CCGC	2	8	37959	37966	0 %	0 %	25 %	75 %	429221880
102	NC_019790	ATCC	2	8	38567	38574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019790	CAGC	2	8	39118	39125	25 %	0 %	25 %	50 %	429221882
104	NC_019790	TCAC	2	8	39296	39303	25 %	25 %	0 %	50 %	429221883
105	NC_019790	GTAG	2	8	39338	39345	25 %	25 %	50 %	0 %	429221883
106	NC_019790	CGCT	2	8	39422	39429	0 %	25 %	25 %	50 %	429221883
107	NC_019790	GGCT	2	8	39869	39876	0 %	25 %	50 %	25 %	429221883
108	NC_019790	GAGG	2	8	40160	40167	25 %	0 %	75 %	0 %	429221883
109	NC_019790	GCGG	2	8	41238	41245	0 %	0 %	75 %	25 %	429221884
110	NC_019790	CTCG	2	8	41575	41582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019790	ACGC	2	8	41609	41616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019790	AAGG	2	8	41821	41828	50 %	0 %	50 %	0 %	429221885
113	NC_019790	GAGT	2	8	41992	41999	25 %	25 %	50 %	0 %	429221885
114	NC_019790	ACCG	2	8	42084	42091	25 %	0 %	25 %	50 %	429221886
115	NC_019790	AGGC	2	8	42745	42752	25 %	0 %	50 %	25 %	429221887
116	NC_019790	GCTG	2	8	42869	42876	0 %	25 %	50 %	25 %	429221887
117	NC_019790	TGGA	2	8	43176	43183	25 %	25 %	50 %	0 %	429221887
118	NC_019790	TGCA	2	8	43686	43693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019790	GGGA	2	8	44009	44016	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019790	CACC	2	8	44157	44164	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_019790	GCTC	2	8	45335	45342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019790	GCTG	2	8	46203	46210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019790	CACC	2	8	46600	46607	25 %	0 %	0 %	75 %	429221890
124	NC_019790	GGGT	2	8	48290	48297	0 %	25 %	75 %	0 %	429221890
125	NC_019790	CCCA	2	8	49095	49102	25 %	0 %	0 %	75 %	429221892
126	NC_019790	GCCT	2	8	49330	49337	0 %	25 %	25 %	50 %	429221892
127	NC_019790	CTGG	2	8	49676	49683	0 %	25 %	50 %	25 %	429221892
128	NC_019790	GGTC	2	8	49730	49737	0 %	25 %	50 %	25 %	429221892
129	NC_019790	AGTA	2	8	49928	49935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019790	CGAC	2	8	50706	50713	25 %	0 %	25 %	50 %	429221894
131	NC_019790	GATG	2	8	50849	50856	25 %	25 %	50 %	0 %	429221894
132	NC_019790	CGCC	2	8	51277	51284	0 %	0 %	25 %	75 %	429221895
133	NC_019790	GCCG	2	8	51441	51448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019790	CCTG	2	8	51521	51528	0 %	25 %	25 %	50 %	429221896
135	NC_019790	GGTG	2	8	51553	51560	0 %	25 %	75 %	0 %	429221896
136	NC_019790	GGTT	2	8	51768	51775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019790	GCGA	2	8	52014	52021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019790	CCCG	2	8	52506	52513	0 %	0 %	25 %	75 %	429221897
139	NC_019790	GGGA	2	8	53188	53195	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019790	CGAG	2	8	53814	53821	25 %	0 %	50 %	25 %	429221898
141	NC_019790	AGCA	2	8	53901	53908	50 %	0 %	25 %	25 %	429221899
142	NC_019790	CTGG	2	8	53929	53936	0 %	25 %	50 %	25 %	429221899
143	NC_019790	TGGA	2	8	54398	54405	25 %	25 %	50 %	0 %	429221901
144	NC_019790	GCCG	2	8	54952	54959	0 %	0 %	50 %	50 %	429221902
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177	NC_019790	TGAG	2	8	65255	65262	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_019790	GCAC	2	8	66503	66510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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197	NC_019790	CGGT	2	8	73234	73241	0 %	25 %	50 %	25 %	429221918
198	NC_019790	GGCA	2	8	74374	74381	25 %	0 %	50 %	25 %	429221920
199	NC_019790	CAGG	2	8	74581	74588	25 %	0 %	50 %	25 %	429221920

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.