MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 plasmid pDEIPE02

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019790	ACCC	2	8	990	997	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_019790	ACTC	2	8	1024	1031	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019790	TGCC	2	8	1118	1125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019790	ATGA	2	8	2890	2897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019790	AGTG	2	8	3150	3157	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019790	GCGG	2	8	4806	4813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019790	TGGG	2	8	13996	14003	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019790	CGGG	2	8	14071	14078	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019790	ACGC	2	8	14651	14658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019790	CAGG	2	8	17606	17613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019790	CCAA	2	8	19767	19774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019790	CCTG	2	8	19962	19969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019790	CACC	2	8	20055	20062	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_019790	ACGC	2	8	21070	21077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019790	GGGC	2	8	24368	24375	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019790	GAGC	2	8	24704	24711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019790	GCGG	2	8	27616	27623	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019790	ACTT	2	8	28749	28756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019790	AACC	2	8	29889	29896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019790	TGCG	2	8	33768	33775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019790	GATC	2	8	37338	37345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019790	ATCC	2	8	38567	38574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019790	CTCG	2	8	41575	41582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019790	ACGC	2	8	41609	41616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019790	TGCA	2	8	43686	43693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019790	GGGA	2	8	44009	44016	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019790	CACC	2	8	44157	44164	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_019790	GCTC	2	8	45335	45342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019790	GCTG	2	8	46203	46210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019790	AGTA	2	8	49928	49935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019790	GCCG	2	8	51441	51448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019790	GGTT	2	8	51768	51775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019790	GCGA	2	8	52014	52021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019790	GGGA	2	8	53188	53195	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019790	GCAC	2	8	55121	55128	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019790	GCGG	2	8	55330	55337	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019790	CCTG	2	8	55475	55482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019790	GCCT	2	8	57828	57835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019790	CCGA	2	8	62667	62674	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019790	CCCA	2	8	62948	62955	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_019790	GCGT	2	8	63867	63874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019790	TCGG	2	8	65072	65079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019790	CCGG	2	8	65143	65150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019790	TGAG	2	8	65255	65262	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019790	CGGC	2	8	65271	65278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019790	GCTG	2	8	65840	65847	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019790	GCAC	2	8	66376	66383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019790	GCAC	2	8	66503	66510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019790	CAGC	2	8	71863	71870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.