MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 plasmid pDEIPE02

Total Repeats: 1198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019790	GAT	2	6	32	37	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019790	ACC	2	6	87	92	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019790	AGC	2	6	242	247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019790	TTC	2	6	285	290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019790	TGC	2	6	291	296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019790	CAG	2	6	316	321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019790	GCG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019790	CGT	2	6	477	482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221854
9	NC_019790	CAG	2	6	484	489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221854
10	NC_019790	GTT	2	6	517	522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429221854
11	NC_019790	GAC	2	6	550	555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221854
12	NC_019790	GCT	2	6	696	701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221854
13	NC_019790	GCC	3	9	713	721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221854
14	NC_019790	TCG	2	6	749	754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221854
15	NC_019790	ACG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221854
16	NC_019790	GCT	2	6	773	778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221854
17	NC_019790	GCA	2	6	807	812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221854
18	NC_019790	GTG	2	6	823	828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221854
19	NC_019790	GGA	2	6	843	848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221854
20	NC_019790	TCA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221854
21	NC_019790	GAA	2	6	874	879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221854
22	NC_019790	CGG	2	6	1168	1173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019790	CTC	2	6	1209	1214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019790	GGT	2	6	1741	1746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221855
25	NC_019790	TCA	2	6	1809	1814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221855
26	NC_019790	CGC	2	6	1818	1823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221855
27	NC_019790	CAC	2	6	1903	1908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221855
28	NC_019790	TTC	2	6	1958	1963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221855
29	NC_019790	ACC	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221855
30	NC_019790	GTG	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221855
31	NC_019790	GTC	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221855
32	NC_019790	ATG	2	6	2156	2161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429221855
33	NC_019790	GCT	2	6	2205	2210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221855
34	NC_019790	TTC	2	6	2236	2241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221855
35	NC_019790	CAT	2	6	2242	2247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221855
36	NC_019790	CAC	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221855
37	NC_019790	CAG	2	6	2339	2344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221855
38	NC_019790	AGA	2	6	2346	2351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221855
39	NC_019790	GCA	2	6	2370	2375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221855
40	NC_019790	CTT	2	6	2457	2462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221855
41	NC_019790	GCC	2	6	2470	2475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221855
42	NC_019790	CGG	2	6	2520	2525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221855
43	NC_019790	GCC	2	6	2551	2556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221855
44	NC_019790	CGA	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221855
45	NC_019790	GTT	2	6	2623	2628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429221855
46	NC_019790	GCC	2	6	2680	2685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221855
47	NC_019790	TGG	2	6	2715	2720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221855
48	NC_019790	GTG	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221855
49	NC_019790	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221855
50	NC_019790	AGC	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221855
51	NC_019790	CGG	2	6	2849	2854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221855
52	NC_019790	GTT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019790	GAC	2	6	3078	3083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019790	GCA	2	6	3164	3169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019790	AGG	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019790	CCG	2	6	3358	3363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221856
57	NC_019790	CAG	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221856
58	NC_019790	GCA	2	6	3684	3689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221856
59	NC_019790	AGC	2	6	3816	3821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221856
60	NC_019790	ACG	2	6	3824	3829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221856
61	NC_019790	GTT	2	6	3835	3840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429221856
62	NC_019790	GCG	2	6	3934	3939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221856
63	NC_019790	GTG	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221856
64	NC_019790	CGC	2	6	4018	4023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221856
65	NC_019790	CGG	2	6	4209	4214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221856
66	NC_019790	AGG	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221856
67	NC_019790	TGG	2	6	4221	4226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221856
68	NC_019790	GTC	2	6	4279	4284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221856
69	NC_019790	GAT	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429221856
70	NC_019790	ACG	2	6	4388	4393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221856
71	NC_019790	GCT	2	6	4432	4437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221856
72	NC_019790	GCG	2	6	4528	4533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019790	GCC	2	6	4538	4543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_019790	CAG	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221857
75	NC_019790	CCT	2	6	4676	4681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221857
76	NC_019790	GCC	2	6	4717	4722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221857
77	NC_019790	CAC	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221857
78	NC_019790	CAG	2	6	4764	4769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019790	GGC	2	6	4784	4789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019790	CAT	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019790	CGG	2	6	4987	4992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019790	CAG	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019790	GCG	2	6	5099	5104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019790	ATC	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019790	CCA	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_019790	CAC	2	6	5241	5246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221858
87	NC_019790	ACG	2	6	5293	5298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221858
88	NC_019790	GAA	2	6	5304	5309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221858
89	NC_019790	GGC	2	6	5330	5335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221858
90	NC_019790	TCC	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221858
91	NC_019790	CTT	2	6	5444	5449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221858
92	NC_019790	TAC	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221858
93	NC_019790	TCG	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221858
94	NC_019790	ACG	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221858
95	NC_019790	CGA	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221858
96	NC_019790	CGG	2	6	5894	5899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221858
97	NC_019790	CGC	2	6	5906	5911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221858
98	NC_019790	TGC	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221858
99	NC_019790	CAC	2	6	6083	6088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221858
100	NC_019790	TCC	2	6	6099	6104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221858
101	NC_019790	ACA	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221858
102	NC_019790	GCG	2	6	6151	6156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221858
103	NC_019790	GCG	2	6	6255	6260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221858
104	NC_019790	GTC	2	6	6341	6346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019790	AGG	2	6	6373	6378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019790	TGG	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221859
107	NC_019790	AAC	2	6	6447	6452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221859
108	NC_019790	GCC	2	6	6577	6582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221859
109	NC_019790	CGG	2	6	6626	6631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221859
110	NC_019790	GCC	2	6	6660	6665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221859
111	NC_019790	CGA	2	6	6683	6688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221859
112	NC_019790	CAA	2	6	6704	6709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221859
113	NC_019790	AAC	2	6	6756	6761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221859
114	NC_019790	GCC	2	6	6801	6806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221859
115	NC_019790	AAC	2	6	6865	6870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221859
116	NC_019790	CCG	2	6	6928	6933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221859
117	NC_019790	CTG	2	6	7107	7112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221859
118	NC_019790	TCG	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221859
119	NC_019790	TCG	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221859
120	NC_019790	CGT	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221859
121	NC_019790	TTC	2	6	7350	7355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221859
122	NC_019790	CCA	2	6	7378	7383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221859
123	NC_019790	GCA	2	6	7441	7446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221859
124	NC_019790	GCC	2	6	7449	7454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221859
125	NC_019790	CTG	2	6	7455	7460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221859
126	NC_019790	ATC	2	6	7527	7532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221859
127	NC_019790	TCA	2	6	7551	7556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221859
128	NC_019790	CGC	2	6	7664	7669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221860
129	NC_019790	CGG	2	6	7678	7683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221860
130	NC_019790	CTC	2	6	7697	7702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221860
131	NC_019790	CAC	2	6	7711	7716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221860
132	NC_019790	CGC	2	6	7720	7725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221860
133	NC_019790	GCT	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221860
134	NC_019790	CTG	2	6	7787	7792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221860
135	NC_019790	TGC	2	6	7821	7826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221860
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137	NC_019790	CAC	2	6	7855	7860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221860
138	NC_019790	GAC	2	6	7883	7888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221860
139	NC_019790	TGC	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221860
140	NC_019790	TCG	2	6	7935	7940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221860
141	NC_019790	CTG	2	6	8012	8017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221860
142	NC_019790	CGC	2	6	8053	8058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221860
143	NC_019790	TGA	2	6	8112	8117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429221860
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147	NC_019790	TCG	2	6	8235	8240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221860
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150	NC_019790	CGC	2	6	8377	8382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221860
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154	NC_019790	GCT	3	9	8521	8529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221860
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157	NC_019790	TGC	3	9	8630	8638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221861
158	NC_019790	TTC	3	9	8740	8748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221861
159	NC_019790	TGC	2	6	8762	8767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221861
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163	NC_019790	CTG	2	6	8896	8901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221861
164	NC_019790	CCG	2	6	9035	9040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221861
165	NC_019790	GAA	2	6	9070	9075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221861
166	NC_019790	TTC	2	6	9112	9117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221861
167	NC_019790	TGC	2	6	9137	9142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221861
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176	NC_019790	TGC	2	6	9548	9553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221862
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182	NC_019790	CTG	2	6	9877	9882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221862
183	NC_019790	GCT	2	6	9948	9953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221862
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200	NC_019790	GCG	2	6	11048	11053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221863
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240	NC_019790	GAG	2	6	13577	13582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221865
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246	NC_019790	TTC	2	6	13969	13974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_019790	TCG	2	6	14114	14119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_019790	GGA	2	6	14130	14135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_019790	CAG	3	9	14452	14460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_019790	CTC	2	6	14526	14531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
252	NC_019790	GAC	2	6	14701	14706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_019790	CAT	2	6	14752	14757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_019790	GAT	2	6	14804	14809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_019790	TGG	2	6	14907	14912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221866
256	NC_019790	GCA	2	6	14922	14927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221866
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258	NC_019790	GCA	2	6	14946	14951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221866
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386	NC_019790	TAT	2	6	22323	22328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429221870
387	NC_019790	GCG	2	6	22331	22336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221870
388	NC_019790	GCT	2	6	22404	22409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221870
389	NC_019790	ATC	2	6	22445	22450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221870
390	NC_019790	TCA	2	6	22691	22696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221870
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419	NC_019790	CGC	2	6	23856	23861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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421	NC_019790	CTG	2	6	24230	24235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_019790	CAT	2	6	28739	28744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
498	NC_019790	GTC	3	9	28794	28802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221875
499	NC_019790	GCA	2	6	28807	28812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221875
500	NC_019790	CGG	2	6	28903	28908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221875

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