MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 plasmid pDEIPE02

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019790	GC	3	6	947	952	0 %	0 %	50 %	50 %	429221854
2	NC_019790	AC	3	6	3127	3132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019790	CG	4	8	3340	3347	0 %	0 %	50 %	50 %	429221856
4	NC_019790	CG	3	6	3773	3778	0 %	0 %	50 %	50 %	429221856
5	NC_019790	CG	3	6	4657	4662	0 %	0 %	50 %	50 %	429221857
6	NC_019790	CG	3	6	4664	4669	0 %	0 %	50 %	50 %	429221857
7	NC_019790	GC	3	6	4754	4759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019790	CG	3	6	5729	5734	0 %	0 %	50 %	50 %	429221858
9	NC_019790	GC	3	6	6203	6208	0 %	0 %	50 %	50 %	429221858
10	NC_019790	GC	3	6	7146	7151	0 %	0 %	50 %	50 %	429221859
11	NC_019790	CG	3	6	7275	7280	0 %	0 %	50 %	50 %	429221859
12	NC_019790	GC	3	6	7474	7479	0 %	0 %	50 %	50 %	429221859
13	NC_019790	GC	3	6	8206	8211	0 %	0 %	50 %	50 %	429221860
14	NC_019790	GC	3	6	8406	8411	0 %	0 %	50 %	50 %	429221860
15	NC_019790	CG	3	6	8850	8855	0 %	0 %	50 %	50 %	429221861
16	NC_019790	CG	3	6	8905	8910	0 %	0 %	50 %	50 %	429221861
17	NC_019790	GC	3	6	9851	9856	0 %	0 %	50 %	50 %	429221862
18	NC_019790	CG	3	6	10428	10433	0 %	0 %	50 %	50 %	429221862
19	NC_019790	GC	3	6	10643	10648	0 %	0 %	50 %	50 %	429221863
20	NC_019790	GC	3	6	11002	11007	0 %	0 %	50 %	50 %	429221863
21	NC_019790	GC	3	6	11216	11221	0 %	0 %	50 %	50 %	429221863
22	NC_019790	GC	3	6	11448	11453	0 %	0 %	50 %	50 %	429221863
23	NC_019790	CG	3	6	11783	11788	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
24	NC_019790	CG	3	6	11924	11929	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
25	NC_019790	CA	3	6	11998	12003	50 %	0 %	0 %	50 %	429221864
26	NC_019790	CG	3	6	12029	12034	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
27	NC_019790	TC	3	6	12223	12228	0 %	50 %	0 %	50 %	429221864
28	NC_019790	CG	3	6	12254	12259	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
29	NC_019790	GC	3	6	12412	12417	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
30	NC_019790	GC	3	6	12844	12849	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
31	NC_019790	CG	3	6	13100	13105	0 %	0 %	50 %	50 %	429221865
32	NC_019790	CG	3	6	13198	13203	0 %	0 %	50 %	50 %	429221865
33	NC_019790	CG	3	6	13431	13436	0 %	0 %	50 %	50 %	429221865
34	NC_019790	CA	3	6	13990	13995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019790	CG	3	6	14625	14630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019790	GC	3	6	14694	14699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019790	GC	3	6	16541	16546	0 %	0 %	50 %	50 %	429221866
38	NC_019790	GC	3	6	16592	16597	0 %	0 %	50 %	50 %	429221866
39	NC_019790	CG	3	6	16809	16814	0 %	0 %	50 %	50 %	429221866
40	NC_019790	CT	3	6	17095	17100	0 %	50 %	0 %	50 %	429221867
41	NC_019790	CT	3	6	17901	17906	0 %	50 %	0 %	50 %	429221868
42	NC_019790	GC	3	6	17978	17983	0 %	0 %	50 %	50 %	429221868
43	NC_019790	CG	4	8	19259	19266	0 %	0 %	50 %	50 %	429221869
44	NC_019790	CG	3	6	19272	19277	0 %	0 %	50 %	50 %	429221869
45	NC_019790	CG	3	6	19285	19290	0 %	0 %	50 %	50 %	429221869
46	NC_019790	TG	3	6	19353	19358	0 %	50 %	50 %	0 %	429221869
47	NC_019790	CG	3	6	20511	20516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019790	GA	3	6	21064	21069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019790	CA	3	6	21115	21120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019790	CT	3	6	21732	21737	0 %	50 %	0 %	50 %	429221870
51	NC_019790	TC	4	8	21776	21783	0 %	50 %	0 %	50 %	429221870
52	NC_019790	GT	3	6	22199	22204	0 %	50 %	50 %	0 %	429221870
53	NC_019790	GC	3	6	22393	22398	0 %	0 %	50 %	50 %	429221870
54	NC_019790	CG	3	6	23727	23732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019790	AC	3	6	23754	23759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019790	GT	3	6	24331	24336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019790	CT	3	6	25981	25986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019790	GC	3	6	27077	27082	0 %	0 %	50 %	50 %	429221873
59	NC_019790	GC	3	6	28479	28484	0 %	0 %	50 %	50 %	429221874
60	NC_019790	CG	3	6	28878	28883	0 %	0 %	50 %	50 %	429221875
61	NC_019790	CG	3	6	29314	29319	0 %	0 %	50 %	50 %	429221875
62	NC_019790	CG	3	6	29437	29442	0 %	0 %	50 %	50 %	429221875
63	NC_019790	AG	3	6	29669	29674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019790	CG	3	6	29751	29756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019790	TC	3	6	29954	29959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019790	CG	3	6	30350	30355	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
67	NC_019790	CG	4	8	30662	30669	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
68	NC_019790	GC	3	6	30787	30792	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
69	NC_019790	GC	3	6	30875	30880	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
70	NC_019790	CG	3	6	30961	30966	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
71	NC_019790	GC	3	6	31086	31091	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
72	NC_019790	GC	3	6	31535	31540	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
73	NC_019790	GC	3	6	31654	31659	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
74	NC_019790	CG	3	6	31795	31800	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
75	NC_019790	CG	3	6	31976	31981	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
76	NC_019790	GC	3	6	31997	32002	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
77	NC_019790	CG	3	6	32501	32506	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
78	NC_019790	CG	3	6	32564	32569	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
79	NC_019790	CG	3	6	33821	33826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019790	GC	3	6	33926	33931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019790	GC	3	6	34383	34388	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
82	NC_019790	CG	3	6	34735	34740	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
83	NC_019790	CG	4	8	34797	34804	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
84	NC_019790	CG	3	6	34967	34972	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
85	NC_019790	GC	3	6	35031	35036	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
86	NC_019790	GC	3	6	35147	35152	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
87	NC_019790	GC	3	6	35283	35288	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
88	NC_019790	GC	3	6	35335	35340	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
89	NC_019790	CG	3	6	35367	35372	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
90	NC_019790	GC	3	6	35401	35406	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
91	NC_019790	CG	3	6	35559	35564	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
92	NC_019790	CG	3	6	35760	35765	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
93	NC_019790	GC	3	6	35815	35820	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
94	NC_019790	GC	3	6	36100	36105	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
95	NC_019790	GC	3	6	36129	36134	0 %	0 %	50 %	50 %	429221878
96	NC_019790	CG	3	6	36651	36656	0 %	0 %	50 %	50 %	429221879
97	NC_019790	GC	4	8	36789	36796	0 %	0 %	50 %	50 %	429221879
98	NC_019790	CT	3	6	37643	37648	0 %	50 %	0 %	50 %	429221880
99	NC_019790	AC	3	6	37833	37838	50 %	0 %	0 %	50 %	429221880
100	NC_019790	GC	4	8	39754	39761	0 %	0 %	50 %	50 %	429221883
101	NC_019790	GC	3	6	40331	40336	0 %	0 %	50 %	50 %	429221883
102	NC_019790	CG	4	8	40352	40359	0 %	0 %	50 %	50 %	429221883
103	NC_019790	GC	3	6	40948	40953	0 %	0 %	50 %	50 %	429221884
104	NC_019790	CG	3	6	41124	41129	0 %	0 %	50 %	50 %	429221884
105	NC_019790	CG	3	6	41162	41167	0 %	0 %	50 %	50 %	429221884
106	NC_019790	GC	3	6	41976	41981	0 %	0 %	50 %	50 %	429221885
107	NC_019790	CG	3	6	43118	43123	0 %	0 %	50 %	50 %	429221887
108	NC_019790	AG	3	6	43456	43461	50 %	0 %	50 %	0 %	429221888
109	NC_019790	CT	3	6	43586	43591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019790	CG	3	6	43613	43618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019790	GT	3	6	43992	43997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019790	GT	4	8	44202	44209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019790	GC	3	6	45374	45379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019790	AC	3	6	45505	45510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019790	CT	3	6	46701	46706	0 %	50 %	0 %	50 %	429221890
116	NC_019790	GC	4	8	49511	49518	0 %	0 %	50 %	50 %	429221892
117	NC_019790	GC	3	6	51052	51057	0 %	0 %	50 %	50 %	429221895
118	NC_019790	GC	3	6	52422	52427	0 %	0 %	50 %	50 %	429221897
119	NC_019790	GC	3	6	53093	53098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019790	CG	4	8	53233	53240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019790	GT	3	6	53296	53301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019790	GC	3	6	54109	54114	0 %	0 %	50 %	50 %	429221900
123	NC_019790	GC	3	6	54512	54517	0 %	0 %	50 %	50 %	429221901
124	NC_019790	CG	3	6	55391	55396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019790	AC	3	6	55732	55737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019790	AT	3	6	55797	55802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019790	GC	3	6	56575	56580	0 %	0 %	50 %	50 %	429221904
128	NC_019790	AC	3	6	57367	57372	50 %	0 %	0 %	50 %	429221904
129	NC_019790	CG	3	6	58231	58236	0 %	0 %	50 %	50 %	429221906
130	NC_019790	CG	3	6	58744	58749	0 %	0 %	50 %	50 %	429221906
131	NC_019790	CG	4	8	58971	58978	0 %	0 %	50 %	50 %	429221907
132	NC_019790	CG	4	8	59293	59300	0 %	0 %	50 %	50 %	429221907
133	NC_019790	CG	3	6	59303	59308	0 %	0 %	50 %	50 %	429221907
134	NC_019790	CG	3	6	60270	60275	0 %	0 %	50 %	50 %	429221908
135	NC_019790	GC	3	6	60677	60682	0 %	0 %	50 %	50 %	429221908
136	NC_019790	AG	3	6	61623	61628	50 %	0 %	50 %	0 %	429221908
137	NC_019790	GC	3	6	61822	61827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019790	CG	3	6	61841	61846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019790	CG	3	6	62833	62838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019790	CG	4	8	63065	63072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_019790	CG	3	6	63922	63927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019790	GC	3	6	64504	64509	0 %	0 %	50 %	50 %	429221911
143	NC_019790	TG	3	6	65088	65093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019790	AC	3	6	65242	65247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019790	CG	3	6	66897	66902	0 %	0 %	50 %	50 %	429221914
146	NC_019790	GC	3	6	66933	66938	0 %	0 %	50 %	50 %	429221914
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148	NC_019790	GC	4	8	67625	67632	0 %	0 %	50 %	50 %	429221915
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.